Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0T2K5

Protein Details
Accession A0A0L0T2K5    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
147-167REEEERRRRKAAKRERQLQSTBasic
207-233AGNIIDTPKKEKKPKIKAKTEPSSEPQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
150-162EERRRRKAAKRER
215-225KKEKKPKIKAK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR040107  Snu23  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12874  zf-met  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MSDVSFRRTWGKDGRPTGAAAESTSSVPAKRPAPAEPTAPGLLEARKAKIRFDAVVGKTQMVQAGSAAGGVQAGFYCSLCDRLCKDNVAFLDHLNSPMHQKNAGKRLEVKRATVKDVRARILYHKRLRGITKEEYNLAKQVALQKLREEEERRRRKAAKRERQLQSTAGRRALKLGYTSPTKEGEGADEDDDADLSSEYSDYEIDEAGNIIDTPKKEKKPKIKAKTEPSSEPQLAEEEPDAFAEMMGFAGFGGTKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.54
3 0.53
4 0.49
5 0.42
6 0.33
7 0.25
8 0.21
9 0.18
10 0.17
11 0.18
12 0.16
13 0.14
14 0.16
15 0.21
16 0.21
17 0.24
18 0.26
19 0.28
20 0.33
21 0.36
22 0.36
23 0.32
24 0.35
25 0.31
26 0.29
27 0.25
28 0.21
29 0.19
30 0.22
31 0.23
32 0.22
33 0.28
34 0.28
35 0.29
36 0.32
37 0.35
38 0.3
39 0.32
40 0.37
41 0.33
42 0.39
43 0.38
44 0.33
45 0.3
46 0.29
47 0.27
48 0.18
49 0.16
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.07
54 0.06
55 0.04
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.03
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.05
64 0.06
65 0.1
66 0.1
67 0.13
68 0.15
69 0.2
70 0.22
71 0.24
72 0.24
73 0.24
74 0.25
75 0.26
76 0.23
77 0.19
78 0.2
79 0.17
80 0.19
81 0.15
82 0.15
83 0.15
84 0.17
85 0.18
86 0.18
87 0.21
88 0.26
89 0.33
90 0.35
91 0.32
92 0.38
93 0.43
94 0.5
95 0.48
96 0.45
97 0.45
98 0.45
99 0.49
100 0.44
101 0.42
102 0.39
103 0.41
104 0.39
105 0.33
106 0.32
107 0.35
108 0.41
109 0.45
110 0.44
111 0.45
112 0.45
113 0.47
114 0.49
115 0.45
116 0.42
117 0.38
118 0.37
119 0.34
120 0.34
121 0.32
122 0.31
123 0.27
124 0.21
125 0.16
126 0.13
127 0.18
128 0.21
129 0.21
130 0.21
131 0.21
132 0.23
133 0.25
134 0.29
135 0.28
136 0.33
137 0.41
138 0.51
139 0.53
140 0.57
141 0.63
142 0.66
143 0.72
144 0.74
145 0.73
146 0.74
147 0.81
148 0.8
149 0.78
150 0.72
151 0.66
152 0.62
153 0.59
154 0.52
155 0.48
156 0.43
157 0.38
158 0.38
159 0.34
160 0.29
161 0.23
162 0.22
163 0.2
164 0.23
165 0.25
166 0.24
167 0.25
168 0.24
169 0.22
170 0.2
171 0.18
172 0.17
173 0.18
174 0.16
175 0.14
176 0.13
177 0.12
178 0.12
179 0.09
180 0.07
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.05
195 0.06
196 0.05
197 0.06
198 0.09
199 0.1
200 0.17
201 0.26
202 0.34
203 0.43
204 0.53
205 0.63
206 0.72
207 0.82
208 0.85
209 0.88
210 0.89
211 0.91
212 0.91
213 0.87
214 0.82
215 0.77
216 0.75
217 0.65
218 0.56
219 0.46
220 0.39
221 0.32
222 0.27
223 0.23
224 0.15
225 0.15
226 0.14
227 0.14
228 0.11
229 0.11
230 0.09
231 0.08
232 0.07
233 0.06
234 0.05
235 0.04
236 0.04