FuNGI

A0A0L0S6N1

Protein Details

Accession

A0A0L0S6N1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
395-420	EPSPASEKSRKGKRANKSVQWRLDRN	Hydrophilic
444-463	APAPEKRTPAKKPSPSPVAS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
402-410	KSRKGKRAN
444-512	APAPEKRTPAKKPSPSPVASTPPAPAPSPKNGKPAPPSRAGRPKVIPTPPVKKAGGKKNGGANKKRKAA

Subcellular Location(s)

mito 12.5, cyto_mito 9.5, nucl 8, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010301 RRP1
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030688 C:preribosome, small subunit precursor GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF05997 Nop52

Amino Acid Sequences

MQSNIGKRLAAVDKHVRDKAVASLRTWLGGQADMSDVDCLKLWRALFYCYWLSDKPAIQEELASNLASMIHALPAGPVRVRFLAAFWKTMISEWHGLDKYRLDKFYKLFRFMHFEAFRLLSQTAWEEETLDQYIEMMMEGPLNSKDVKVPDSLRFHTIEVFIDILEATVDEPVPPQIITTLLMPFIVMMAENPTKGVFERIRTEVFCKLMEIVDREIATTDEDSNGSADAPEKDDDDDQQVVLKTSKLQIYFPEILGILFEIASHPNTRDVNRKRMYALVKEIKDRYAIDLLDGQSDEEDDEESDDGMGSAVYLSDMFDDNTPMATGKGMKRGHDESDEEEEEEEEEMVGGSDDDEGWESADDMDGLDGLDASDDDEAPELVPEAELDDESDDEEPSPASEKSRKGKRANKSVQWRLDRNEVKRYNTREPSSRVSSTESDKAPAPAPEKRTPAKKPSPSPVASTPPAPAPSPKNGKPAPPSRAGRPKVIPTPPVKKAGGKKNGGANKKRKAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.57
3	0.51
4	0.44
5	0.44
6	0.45
7	0.45
8	0.4
9	0.34
10	0.38
11	0.38
12	0.38
13	0.36
14	0.29
15	0.21
16	0.19
17	0.18
18	0.13
19	0.14
20	0.13
21	0.13
22	0.13
23	0.11
24	0.11
25	0.12
26	0.11
27	0.12
28	0.15
29	0.15
30	0.19
31	0.2
32	0.23
33	0.23
34	0.27
35	0.29
36	0.27
37	0.31
38	0.26
39	0.3
40	0.31
41	0.32
42	0.31
43	0.33
44	0.33
45	0.29
46	0.31
47	0.27
48	0.26
49	0.24
50	0.2
51	0.15
52	0.13
53	0.13
54	0.1
55	0.1
56	0.07
57	0.06
58	0.06
59	0.06
60	0.07
61	0.09
62	0.11
63	0.12
64	0.12
65	0.15
66	0.16
67	0.17
68	0.16
69	0.16
70	0.23
71	0.24
72	0.25
73	0.22
74	0.23
75	0.22
76	0.23
77	0.23
78	0.18
79	0.21
80	0.2
81	0.27
82	0.26
83	0.27
84	0.28
85	0.31
86	0.32
87	0.33
88	0.36
89	0.33
90	0.37
91	0.4
92	0.48
93	0.5
94	0.5
95	0.47
96	0.46
97	0.52
98	0.48
99	0.54
100	0.44
101	0.38
102	0.35
103	0.35
104	0.32
105	0.26
106	0.25
107	0.15
108	0.15
109	0.16
110	0.14
111	0.13
112	0.12
113	0.11
114	0.11
115	0.13
116	0.13
117	0.12
118	0.1
119	0.09
120	0.09
121	0.07
122	0.07
123	0.05
124	0.04
125	0.05
126	0.05
127	0.07
128	0.07
129	0.08
130	0.08
131	0.08
132	0.11
133	0.13
134	0.14
135	0.17
136	0.2
137	0.26
138	0.32
139	0.34
140	0.34
141	0.33
142	0.32
143	0.3
144	0.28
145	0.21
146	0.16
147	0.14
148	0.11
149	0.1
150	0.09
151	0.07
152	0.05
153	0.05
154	0.04
155	0.04
156	0.04
157	0.04
158	0.04
159	0.05
160	0.06
161	0.05
162	0.05
163	0.05
164	0.06
165	0.07
166	0.08
167	0.08
168	0.07
169	0.07
170	0.07
171	0.06
172	0.06
173	0.05
174	0.03
175	0.03
176	0.07
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.08
181	0.09
182	0.09
183	0.15
184	0.12
185	0.15
186	0.19
187	0.22
188	0.24
189	0.25
190	0.27
191	0.25
192	0.25
193	0.21
194	0.18
195	0.16
196	0.15
197	0.16
198	0.15
199	0.13
200	0.13
201	0.13
202	0.13
203	0.12
204	0.12
205	0.1
206	0.09
207	0.08
208	0.07
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.06
214	0.05
215	0.06
216	0.06
217	0.08
218	0.08
219	0.09
220	0.1
221	0.1
222	0.11
223	0.12
224	0.12
225	0.1
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.11
230	0.11
231	0.09
232	0.11
233	0.14
234	0.13
235	0.13
236	0.13
237	0.2
238	0.21
239	0.19
240	0.17
241	0.15
242	0.14
243	0.13
244	0.12
245	0.05
246	0.04
247	0.04
248	0.03
249	0.04
250	0.05
251	0.06
252	0.06
253	0.1
254	0.11
255	0.14
256	0.23
257	0.27
258	0.37
259	0.39
260	0.4
261	0.38
262	0.42
263	0.44
264	0.37
265	0.41
266	0.39
267	0.37
268	0.4
269	0.4
270	0.35
271	0.33
272	0.3
273	0.24
274	0.19
275	0.17
276	0.14
277	0.17
278	0.16
279	0.15
280	0.15
281	0.12
282	0.09
283	0.09
284	0.08
285	0.05
286	0.05
287	0.04
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.03
297	0.03
298	0.03
299	0.03
300	0.03
301	0.03
302	0.04
303	0.04
304	0.05
305	0.05
306	0.06
307	0.06
308	0.07
309	0.07
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.1
314	0.11
315	0.2
316	0.21
317	0.22
318	0.27
319	0.3
320	0.32
321	0.32
322	0.32
323	0.27
324	0.32
325	0.31
326	0.26
327	0.24
328	0.21
329	0.18
330	0.17
331	0.12
332	0.06
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.03
338	0.03
339	0.03
340	0.03
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.06
349	0.05
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.03
355	0.03
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.07
378	0.08
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.1
385	0.09
386	0.13
387	0.19
388	0.26
389	0.35
390	0.45
391	0.54
392	0.61
393	0.69
394	0.75
395	0.81
396	0.84
397	0.84
398	0.85
399	0.85
400	0.85
401	0.84
402	0.8
403	0.73
404	0.73
405	0.71
406	0.65
407	0.67
408	0.63
409	0.61
410	0.64
411	0.67
412	0.67
413	0.68
414	0.69
415	0.65
416	0.66
417	0.67
418	0.65
419	0.6
420	0.52
421	0.49
422	0.47
423	0.45
424	0.46
425	0.39
426	0.34
427	0.33
428	0.33
429	0.31
430	0.32
431	0.31
432	0.31
433	0.37
434	0.42
435	0.47
436	0.52
437	0.58
438	0.61
439	0.67
440	0.71
441	0.74
442	0.75
443	0.78
444	0.8
445	0.74
446	0.72
447	0.68
448	0.65
449	0.58
450	0.51
451	0.44
452	0.4
453	0.39
454	0.35
455	0.34
456	0.32
457	0.39
458	0.47
459	0.49
460	0.54
461	0.55
462	0.61
463	0.64
464	0.68
465	0.65
466	0.66
467	0.66
468	0.67
469	0.74
470	0.7
471	0.69
472	0.66
473	0.68
474	0.68
475	0.7
476	0.67
477	0.66
478	0.71
479	0.69
480	0.69
481	0.63
482	0.62
483	0.65
484	0.68
485	0.69
486	0.65
487	0.65
488	0.68
489	0.73
490	0.75
491	0.76
492	0.76

A0A0L0S6N1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer