Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0TCA1

Protein Details
Accession A0A0L0TCA1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
113-137ENDTTAPDKKRKKAPKKSKSGSSLAHydrophilic
176-202STPEPDTKPKRPPTKRRKTKAADPAPSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-131KKRKKAPKKSK
183-196KPKRPPTKRRKTKA
Subcellular Location(s) cyto 16, mito 4, nucl 3, cysk 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013246  SAGA_su_Sgf11  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0070461  C:SAGA-type complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08209  Sgf11  
Amino Acid Sequences MSPADPLAELVYELIEDEVLDLIFAEHRKAKMARRVCSHCGQQCRHFAPPYTDLFAAGHIGDPNASLPAELVKCDTCEKSMGASTFARHLERCMGLPGARSGNRSRAAKSYAENDTTAPDKKRKKAPKKSKSGSSLADAAAAPLPTSLPTPDLDPTSLAATSDLPLATTATATATSTPEPDTKPKRPPTKRRKTKAADPAPSAPALVAIPAGTTVAGKTLPGKTVPGKSVPGKSAPTTVAGKTVPVTVAGKTVPAAVVMGKTVPATMIAGKPVPGQNGAAQDGCGQVGSRNLGQSAAGGRGQEERWCRCGERWVPAHSAGSRVGWVSPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.05
3 0.05
4 0.05
5 0.05
6 0.05
7 0.05
8 0.05
9 0.05
10 0.08
11 0.09
12 0.12
13 0.16
14 0.16
15 0.23
16 0.27
17 0.35
18 0.42
19 0.5
20 0.55
21 0.6
22 0.67
23 0.67
24 0.7
25 0.71
26 0.68
27 0.69
28 0.68
29 0.66
30 0.68
31 0.67
32 0.65
33 0.6
34 0.57
35 0.53
36 0.53
37 0.49
38 0.44
39 0.38
40 0.33
41 0.3
42 0.26
43 0.21
44 0.16
45 0.13
46 0.09
47 0.09
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.06
54 0.06
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.13
59 0.12
60 0.14
61 0.17
62 0.18
63 0.15
64 0.16
65 0.17
66 0.17
67 0.2
68 0.19
69 0.2
70 0.2
71 0.19
72 0.22
73 0.23
74 0.23
75 0.19
76 0.2
77 0.21
78 0.21
79 0.21
80 0.19
81 0.19
82 0.17
83 0.19
84 0.2
85 0.21
86 0.21
87 0.23
88 0.24
89 0.29
90 0.34
91 0.34
92 0.34
93 0.33
94 0.35
95 0.34
96 0.34
97 0.33
98 0.31
99 0.31
100 0.29
101 0.25
102 0.23
103 0.24
104 0.26
105 0.24
106 0.28
107 0.33
108 0.39
109 0.49
110 0.58
111 0.66
112 0.74
113 0.82
114 0.84
115 0.88
116 0.89
117 0.87
118 0.83
119 0.76
120 0.67
121 0.58
122 0.5
123 0.39
124 0.33
125 0.24
126 0.18
127 0.14
128 0.12
129 0.09
130 0.06
131 0.06
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.08
138 0.09
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.08
165 0.1
166 0.12
167 0.2
168 0.26
169 0.31
170 0.4
171 0.48
172 0.58
173 0.66
174 0.75
175 0.79
176 0.83
177 0.88
178 0.88
179 0.9
180 0.86
181 0.85
182 0.85
183 0.83
184 0.77
185 0.71
186 0.66
187 0.57
188 0.5
189 0.4
190 0.29
191 0.2
192 0.14
193 0.09
194 0.06
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.07
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.14
210 0.17
211 0.21
212 0.23
213 0.23
214 0.26
215 0.29
216 0.33
217 0.32
218 0.32
219 0.31
220 0.3
221 0.3
222 0.27
223 0.26
224 0.25
225 0.23
226 0.22
227 0.2
228 0.19
229 0.17
230 0.17
231 0.13
232 0.13
233 0.13
234 0.1
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.11
240 0.09
241 0.08
242 0.08
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.09
254 0.1
255 0.11
256 0.12
257 0.13
258 0.16
259 0.18
260 0.19
261 0.18
262 0.18
263 0.19
264 0.23
265 0.24
266 0.21
267 0.19
268 0.18
269 0.17
270 0.16
271 0.13
272 0.09
273 0.08
274 0.11
275 0.14
276 0.15
277 0.16
278 0.16
279 0.16
280 0.16
281 0.17
282 0.16
283 0.15
284 0.14
285 0.13
286 0.14
287 0.18
288 0.19
289 0.23
290 0.28
291 0.3
292 0.33
293 0.37
294 0.39
295 0.38
296 0.47
297 0.47
298 0.49
299 0.5
300 0.51
301 0.52
302 0.52
303 0.55
304 0.45
305 0.43
306 0.35
307 0.3
308 0.27
309 0.23