Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0SRP5

Protein Details
Accession A0A0L0SRP5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
269-288PATNDAPVRRRKRRATEPADHydrophilic
384-411VTVRHVVVSKRRKLTKRQGRALRAVERAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
277-299RRRKRRATEPADMAPPAAKRAAR
393-402KRRKLTKRQG
Subcellular Location(s) mito 14, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MTAVTSPNSITASLSPLQLAAQWPAPPSSNAPPTMTPGTATSDMTASAEAARMNLTKLKRLLEFYFSADEIRSLYARVADTMPTARALRDLMDSGWIPLEFLARYKRIKKMIQADNVEAVVIAAARASDQLRVREDGRAVRPVSLIRVPNLSAFFRLNELVVSALPPNVEPSEIAAYFSKYGHVQSVTATTLDGTAPAAEGPDPWLGQFLILFESVTGATLAASQAHVYQGHPLTLSYPRRFHRERQRAKLAAPAADLPSAAASSSTAPATNDAPVRRRKRRATEPADMAPPAAKRAARAATPPASKQDRRDALELMHLGATAPTSAALQAELTPYFGPILRLDTGATMAMVIFQDRVTPEVLAGLGLARNGPVVRMQIGGTDVTVRHVVVSKRRKLTKRQGRALRAVERAVEGVAAMDVDENVKEEGGDVEEGGLAAALERVHVEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.16
3 0.16
4 0.15
5 0.16
6 0.17
7 0.15
8 0.16
9 0.17
10 0.19
11 0.21
12 0.22
13 0.22
14 0.25
15 0.31
16 0.33
17 0.34
18 0.36
19 0.35
20 0.39
21 0.41
22 0.36
23 0.29
24 0.25
25 0.29
26 0.27
27 0.26
28 0.21
29 0.18
30 0.18
31 0.17
32 0.15
33 0.1
34 0.09
35 0.1
36 0.09
37 0.08
38 0.1
39 0.1
40 0.12
41 0.17
42 0.19
43 0.24
44 0.27
45 0.31
46 0.32
47 0.37
48 0.38
49 0.37
50 0.38
51 0.34
52 0.34
53 0.3
54 0.28
55 0.23
56 0.2
57 0.16
58 0.16
59 0.13
60 0.1
61 0.11
62 0.13
63 0.13
64 0.15
65 0.15
66 0.13
67 0.15
68 0.17
69 0.17
70 0.16
71 0.16
72 0.14
73 0.15
74 0.15
75 0.14
76 0.14
77 0.15
78 0.12
79 0.15
80 0.15
81 0.14
82 0.15
83 0.13
84 0.11
85 0.1
86 0.12
87 0.09
88 0.12
89 0.16
90 0.19
91 0.25
92 0.3
93 0.37
94 0.43
95 0.47
96 0.53
97 0.58
98 0.62
99 0.65
100 0.64
101 0.59
102 0.53
103 0.49
104 0.4
105 0.3
106 0.2
107 0.12
108 0.07
109 0.05
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.05
114 0.05
115 0.1
116 0.13
117 0.16
118 0.19
119 0.22
120 0.23
121 0.25
122 0.27
123 0.29
124 0.3
125 0.33
126 0.31
127 0.29
128 0.3
129 0.27
130 0.28
131 0.26
132 0.24
133 0.19
134 0.21
135 0.2
136 0.21
137 0.23
138 0.2
139 0.17
140 0.16
141 0.15
142 0.15
143 0.15
144 0.12
145 0.1
146 0.09
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.08
155 0.07
156 0.08
157 0.07
158 0.09
159 0.12
160 0.11
161 0.13
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.12
167 0.09
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.12
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.06
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.05
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.04
206 0.03
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.1
222 0.17
223 0.23
224 0.23
225 0.28
226 0.29
227 0.37
228 0.4
229 0.47
230 0.51
231 0.56
232 0.62
233 0.66
234 0.73
235 0.68
236 0.66
237 0.63
238 0.53
239 0.43
240 0.35
241 0.27
242 0.19
243 0.17
244 0.16
245 0.1
246 0.08
247 0.07
248 0.06
249 0.04
250 0.04
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.08
257 0.09
258 0.11
259 0.14
260 0.15
261 0.21
262 0.3
263 0.39
264 0.47
265 0.55
266 0.61
267 0.67
268 0.75
269 0.81
270 0.8
271 0.79
272 0.76
273 0.7
274 0.64
275 0.54
276 0.44
277 0.35
278 0.27
279 0.2
280 0.17
281 0.14
282 0.12
283 0.17
284 0.19
285 0.18
286 0.2
287 0.25
288 0.29
289 0.31
290 0.32
291 0.34
292 0.39
293 0.41
294 0.43
295 0.47
296 0.47
297 0.48
298 0.49
299 0.43
300 0.37
301 0.39
302 0.35
303 0.26
304 0.19
305 0.16
306 0.13
307 0.12
308 0.11
309 0.05
310 0.05
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.08
319 0.07
320 0.09
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.09
327 0.13
328 0.13
329 0.13
330 0.13
331 0.13
332 0.13
333 0.11
334 0.1
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.07
343 0.08
344 0.09
345 0.1
346 0.1
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.05
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.09
361 0.1
362 0.11
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.14
367 0.13
368 0.12
369 0.12
370 0.11
371 0.12
372 0.13
373 0.12
374 0.12
375 0.16
376 0.21
377 0.28
378 0.38
379 0.45
380 0.53
381 0.63
382 0.69
383 0.75
384 0.82
385 0.83
386 0.84
387 0.86
388 0.87
389 0.86
390 0.88
391 0.85
392 0.81
393 0.75
394 0.65
395 0.56
396 0.47
397 0.4
398 0.31
399 0.22
400 0.14
401 0.1
402 0.08
403 0.07
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.06
408 0.06
409 0.07
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.08
414 0.09
415 0.1
416 0.11
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.08
422 0.07
423 0.04
424 0.04
425 0.06
426 0.05
427 0.05