Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0TCN3

Protein Details
Accession A0A0L0TCN3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
327-346RTLKAKSKGKGKRAGGKRVGBasic
370-391LDELARPKKRRTLTKAEEERLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
327-346RTLKAKSKGKGKRAGGKRVG
Subcellular Location(s) mito 10, cyto 6.5, cyto_nucl 6.5, nucl 5.5, plas 1, extr 1, pero 1, E.R. 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MASHTLTQLQLRRLLEFYFSDAHLPSLAAHVAKHPSPVPSTTTDKSWVPLSALLTYSRVKKLALGNVNAVVSAIRASSVLETDPDCTAVRRRDLRPVLALDSVVDFSAVHVSDLPLGIAANELRAHFEQFGAIKDFHVTNKRGTAAVVRFVEEQSAERAVASARHVYDGEPFRVAYKTRSVDVPKPKPTSAAAASVAPTSSRKRARNDEPTVLADVVAPSSASTATAVSTDATMKLGYTPGCVVAVTGAAAAVATKVALRPFFEPYGAIKVITLTDLAAYIEYTTPLAADVVSAISASAVRDKFGANASLTALMGDAELTYHGDRARTLKAKSKGKGKRAGGKRVGTATGKSAASKGLVVEFDQDEDEDLDELARPKKRRTLTKAEEERLDALMAGFETVAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.31
3 0.27
4 0.26
5 0.23
6 0.23
7 0.22
8 0.21
9 0.21
10 0.18
11 0.17
12 0.13
13 0.13
14 0.14
15 0.12
16 0.12
17 0.16
18 0.2
19 0.21
20 0.24
21 0.23
22 0.25
23 0.28
24 0.3
25 0.29
26 0.3
27 0.36
28 0.35
29 0.36
30 0.36
31 0.34
32 0.34
33 0.32
34 0.28
35 0.23
36 0.24
37 0.23
38 0.21
39 0.22
40 0.21
41 0.21
42 0.23
43 0.26
44 0.26
45 0.25
46 0.22
47 0.26
48 0.32
49 0.38
50 0.41
51 0.39
52 0.39
53 0.4
54 0.4
55 0.34
56 0.28
57 0.19
58 0.12
59 0.1
60 0.07
61 0.04
62 0.05
63 0.05
64 0.06
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.12
73 0.13
74 0.19
75 0.23
76 0.3
77 0.36
78 0.38
79 0.46
80 0.51
81 0.52
82 0.51
83 0.49
84 0.44
85 0.37
86 0.35
87 0.25
88 0.21
89 0.18
90 0.13
91 0.1
92 0.07
93 0.06
94 0.09
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.06
106 0.05
107 0.06
108 0.07
109 0.07
110 0.1
111 0.11
112 0.13
113 0.12
114 0.12
115 0.13
116 0.12
117 0.15
118 0.15
119 0.14
120 0.13
121 0.14
122 0.15
123 0.17
124 0.23
125 0.23
126 0.22
127 0.25
128 0.26
129 0.24
130 0.24
131 0.27
132 0.22
133 0.26
134 0.24
135 0.23
136 0.22
137 0.22
138 0.22
139 0.16
140 0.15
141 0.11
142 0.11
143 0.09
144 0.08
145 0.09
146 0.08
147 0.09
148 0.1
149 0.11
150 0.1
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.19
155 0.2
156 0.2
157 0.17
158 0.17
159 0.17
160 0.19
161 0.19
162 0.15
163 0.18
164 0.19
165 0.19
166 0.23
167 0.26
168 0.32
169 0.42
170 0.47
171 0.49
172 0.51
173 0.5
174 0.47
175 0.44
176 0.41
177 0.33
178 0.28
179 0.21
180 0.18
181 0.18
182 0.16
183 0.15
184 0.11
185 0.11
186 0.1
187 0.16
188 0.23
189 0.27
190 0.33
191 0.41
192 0.49
193 0.57
194 0.61
195 0.58
196 0.53
197 0.5
198 0.46
199 0.37
200 0.29
201 0.19
202 0.13
203 0.09
204 0.07
205 0.05
206 0.03
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.02
241 0.02
242 0.03
243 0.04
244 0.06
245 0.07
246 0.08
247 0.1
248 0.14
249 0.15
250 0.15
251 0.15
252 0.16
253 0.21
254 0.19
255 0.18
256 0.14
257 0.14
258 0.14
259 0.13
260 0.11
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.03
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.11
289 0.12
290 0.13
291 0.15
292 0.18
293 0.13
294 0.14
295 0.14
296 0.15
297 0.14
298 0.12
299 0.1
300 0.07
301 0.06
302 0.05
303 0.04
304 0.03
305 0.04
306 0.06
307 0.06
308 0.08
309 0.09
310 0.1
311 0.12
312 0.15
313 0.23
314 0.27
315 0.3
316 0.38
317 0.46
318 0.55
319 0.59
320 0.67
321 0.68
322 0.71
323 0.77
324 0.76
325 0.77
326 0.77
327 0.82
328 0.8
329 0.75
330 0.71
331 0.65
332 0.62
333 0.54
334 0.46
335 0.39
336 0.36
337 0.32
338 0.28
339 0.25
340 0.21
341 0.2
342 0.19
343 0.16
344 0.14
345 0.14
346 0.14
347 0.17
348 0.16
349 0.16
350 0.16
351 0.15
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.1
356 0.09
357 0.09
358 0.1
359 0.14
360 0.19
361 0.25
362 0.28
363 0.34
364 0.43
365 0.51
366 0.6
367 0.66
368 0.71
369 0.73
370 0.81
371 0.85
372 0.82
373 0.77
374 0.69
375 0.62
376 0.52
377 0.43
378 0.32
379 0.22
380 0.17
381 0.13
382 0.1