FuNGI

A0A0L0STD6

Protein Details

Accession

A0A0L0STD6

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
387-406	SQGGDKRRKTEPFRRVNPDE	Basic
433-460	LIVTRGKGFRHEKNKKKRGSYRGGAIDT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
279-298	PKPASPKKPASPKKAASPKK
437-451	RGKGFRHEKNKKKRG

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto 5, mito 2, pero 1, E.R. 1, cysk 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MAHNDVLLALVHAYLVEQGHAKAADLLGLDKAAVAAVTKKYARLAELDISPAAAVSSSDSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSDYEPAKKDSDVEMKDASNDASSSGSESDTESSSSSSSSSDDSDSDDEKEVKKEVKKEVKEAAPAAKADSSSSSSSSSDSSSSSSGDSSSSSDEEEAKPKSPVKAAATAAKSDSDSSSSSSSSSSDSSSSSSGDSSSSSDEEEAKPKSPVKSTAVAAKSGSDSSSSSSSSSSESSSSSSSLDSSSEDEAPAPKPASPKKPASPKKAASPKKADASSSSSSDSSSSSDSSSDSESESEKKEAKAASPSSSSSSSSSSGSDSSSSSDSSSSSDSDDDKPAAAASKKRARESDVEPSSSPAPSQGGDKRRKTEPFRRVNPDEVEFLDERLKDNSFQGYGSYGEKAHRDLIVTRGKGFRHEKNKKKRGSYRGGAIDTTVNSIKFEESD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.07
3	0.08
4	0.09
5	0.09
6	0.13
7	0.13
8	0.14
9	0.13
10	0.13
11	0.14
12	0.13
13	0.13
14	0.11
15	0.11
16	0.1
17	0.08
18	0.08
19	0.06
20	0.06
21	0.05
22	0.09
23	0.11
24	0.17
25	0.17
26	0.19
27	0.23
28	0.24
29	0.25
30	0.24
31	0.27
32	0.26
33	0.27
34	0.28
35	0.24
36	0.23
37	0.21
38	0.17
39	0.13
40	0.08
41	0.06
42	0.07
43	0.09
44	0.09
45	0.1
46	0.11
47	0.12
48	0.13
49	0.14
50	0.12
51	0.11
52	0.11
53	0.12
54	0.13
55	0.13
56	0.14
57	0.14
58	0.14
59	0.15
60	0.16
61	0.16
62	0.16
63	0.16
64	0.16
65	0.16
66	0.16
67	0.16
68	0.16
69	0.16
70	0.16
71	0.16
72	0.16
73	0.17
74	0.17
75	0.21
76	0.23
77	0.27
78	0.29
79	0.31
80	0.31
81	0.3
82	0.3
83	0.31
84	0.37
85	0.33
86	0.33
87	0.32
88	0.3
89	0.31
90	0.29
91	0.23
92	0.15
93	0.14
94	0.11
95	0.09
96	0.09
97	0.1
98	0.1
99	0.09
100	0.09
101	0.1
102	0.11
103	0.11
104	0.12
105	0.1
106	0.1
107	0.1
108	0.1
109	0.1
110	0.09
111	0.09
112	0.09
113	0.1
114	0.11
115	0.11
116	0.13
117	0.15
118	0.16
119	0.17
120	0.18
121	0.18
122	0.19
123	0.2
124	0.2
125	0.24
126	0.27
127	0.31
128	0.39
129	0.47
130	0.48
131	0.52
132	0.57
133	0.55
134	0.54
135	0.5
136	0.45
137	0.37
138	0.34
139	0.31
140	0.24
141	0.2
142	0.17
143	0.17
144	0.16
145	0.14
146	0.15
147	0.15
148	0.15
149	0.15
150	0.16
151	0.15
152	0.12
153	0.12
154	0.12
155	0.11
156	0.11
157	0.11
158	0.1
159	0.09
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.1
164	0.09
165	0.09
166	0.1
167	0.11
168	0.12
169	0.16
170	0.17
171	0.17
172	0.19
173	0.2
174	0.22
175	0.22
176	0.25
177	0.24
178	0.28
179	0.28
180	0.32
181	0.31
182	0.3
183	0.28
184	0.24
185	0.21
186	0.16
187	0.15
188	0.11
189	0.1
190	0.11
191	0.12
192	0.11
193	0.11
194	0.11
195	0.11
196	0.11
197	0.11
198	0.1
199	0.1
200	0.1
201	0.11
202	0.12
203	0.12
204	0.11
205	0.1
206	0.09
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.1
211	0.09
212	0.09
213	0.1
214	0.11
215	0.12
216	0.16
217	0.17
218	0.17
219	0.19
220	0.21
221	0.22
222	0.23
223	0.25
224	0.24
225	0.26
226	0.26
227	0.31
228	0.29
229	0.28
230	0.26
231	0.22
232	0.19
233	0.16
234	0.15
235	0.09
236	0.08
237	0.09
238	0.1
239	0.1
240	0.1
241	0.1
242	0.1
243	0.11
244	0.11
245	0.1
246	0.09
247	0.09
248	0.1
249	0.11
250	0.11
251	0.1
252	0.09
253	0.09
254	0.09
255	0.08
256	0.08
257	0.09
258	0.1
259	0.1
260	0.1
261	0.1
262	0.11
263	0.11
264	0.13
265	0.12
266	0.12
267	0.17
268	0.23
269	0.3
270	0.35
271	0.4
272	0.45
273	0.56
274	0.63
275	0.66
276	0.69
277	0.65
278	0.69
279	0.73
280	0.74
281	0.71
282	0.71
283	0.67
284	0.64
285	0.62
286	0.53
287	0.46
288	0.45
289	0.4
290	0.33
291	0.3
292	0.23
293	0.22
294	0.22
295	0.19
296	0.14
297	0.13
298	0.12
299	0.1
300	0.11
301	0.11
302	0.12
303	0.12
304	0.11
305	0.1
306	0.11
307	0.12
308	0.14
309	0.16
310	0.18
311	0.19
312	0.19
313	0.22
314	0.22
315	0.23
316	0.27
317	0.27
318	0.28
319	0.27
320	0.28
321	0.28
322	0.29
323	0.28
324	0.22
325	0.22
326	0.2
327	0.19
328	0.18
329	0.16
330	0.15
331	0.14
332	0.14
333	0.12
334	0.13
335	0.13
336	0.13
337	0.12
338	0.12
339	0.11
340	0.12
341	0.13
342	0.11
343	0.11
344	0.12
345	0.15
346	0.17
347	0.19
348	0.18
349	0.17
350	0.16
351	0.16
352	0.19
353	0.19
354	0.21
355	0.28
356	0.36
357	0.4
358	0.45
359	0.47
360	0.47
361	0.5
362	0.52
363	0.54
364	0.5
365	0.49
366	0.44
367	0.45
368	0.42
369	0.35
370	0.29
371	0.19
372	0.16
373	0.13
374	0.19
375	0.24
376	0.32
377	0.42
378	0.48
379	0.51
380	0.57
381	0.66
382	0.69
383	0.72
384	0.73
385	0.74
386	0.77
387	0.82
388	0.79
389	0.77
390	0.73
391	0.66
392	0.58
393	0.48
394	0.45
395	0.35
396	0.32
397	0.29
398	0.24
399	0.23
400	0.23
401	0.23
402	0.19
403	0.21
404	0.24
405	0.2
406	0.2
407	0.19
408	0.18
409	0.18
410	0.19
411	0.18
412	0.15
413	0.18
414	0.19
415	0.21
416	0.22
417	0.21
418	0.22
419	0.22
420	0.29
421	0.35
422	0.35
423	0.37
424	0.39
425	0.38
426	0.45
427	0.5
428	0.52
429	0.54
430	0.63
431	0.7
432	0.77
433	0.86
434	0.86
435	0.9
436	0.9
437	0.89
438	0.89
439	0.87
440	0.85
441	0.84
442	0.78
443	0.67
444	0.59
445	0.52
446	0.42
447	0.39
448	0.31
449	0.23
450	0.2
451	0.21

A0A0L0STD6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer