Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0T8J4

Protein Details
Accession A0A0L0T8J4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
437-463ASSSSSRTAHKPKRTRRTPKQELAIMTHydrophilic
537-561NSEAPSPPPPAKKRKPYDLDLDRGRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
448-452PKRTR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF00382  TFIIB  
CDD cd20554  CYCLIN_TFIIIB90_rpt2  
Amino Acid Sequences MNKRPQTAAARPCSADGLTDSLVEDAANDQTVCEKAANAGRVAGPSGFTTNSNNAAHKAGKELHCLLAALNIIDNVGGPDTSIRKLGVLLIELTDLVGTSVFKLGMLVSHFRREFPSVVQLDNSDPSMYVARFAGMLDFGTKTTDVANDAMKLVVRMKRDWISDGRRPAGICGACLLIAGRMHGFHRSVKEIVHAVKMSDVTVVARLREFQKTPAAHISTMELRAWATAVQEAKEKRLPVPETDQFGLPPAFVGDRIRENPALAEMVGASSLSTPSSSAATESSAALSLGPTEQADDPVRLEQFILDFSTRILNTSGADPDDREHQLLAQNQLLAQNASTGRSTPDMISAAASAAAAATASGTVLPEHAAVGVGLGITDAAAGNTSPFLTPSMTQEQSGSSSGVALTALSTDGTLPLTPDATQLPPQASQAESLASASSSSSRTAHKPKRTRRTPKQELAIMTQLARTIPRNPAVLGEYRLAAHQAADQAAREIETEEQQQRAAFAEGDDDDEEMMLPGDEDEEEHGASSSSAAATNSEAPSPPPPAKKRKPYDLDLDRGRVHLTETNMRLSDLDDNEEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.34
3 0.26
4 0.23
5 0.19
6 0.19
7 0.18
8 0.15
9 0.15
10 0.13
11 0.11
12 0.08
13 0.08
14 0.09
15 0.09
16 0.09
17 0.11
18 0.12
19 0.13
20 0.12
21 0.11
22 0.15
23 0.21
24 0.24
25 0.22
26 0.23
27 0.23
28 0.24
29 0.25
30 0.2
31 0.15
32 0.14
33 0.16
34 0.15
35 0.15
36 0.19
37 0.21
38 0.27
39 0.28
40 0.28
41 0.27
42 0.3
43 0.32
44 0.28
45 0.3
46 0.31
47 0.32
48 0.37
49 0.37
50 0.35
51 0.34
52 0.33
53 0.27
54 0.23
55 0.21
56 0.15
57 0.12
58 0.1
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.06
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.08
67 0.11
68 0.12
69 0.14
70 0.13
71 0.13
72 0.14
73 0.16
74 0.14
75 0.14
76 0.13
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.11
81 0.08
82 0.06
83 0.05
84 0.05
85 0.04
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.07
92 0.09
93 0.11
94 0.16
95 0.17
96 0.25
97 0.25
98 0.26
99 0.3
100 0.31
101 0.3
102 0.27
103 0.34
104 0.28
105 0.29
106 0.29
107 0.27
108 0.25
109 0.25
110 0.23
111 0.14
112 0.12
113 0.13
114 0.15
115 0.14
116 0.13
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.1
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.09
129 0.08
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.12
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.11
139 0.11
140 0.14
141 0.16
142 0.18
143 0.18
144 0.23
145 0.27
146 0.28
147 0.32
148 0.35
149 0.39
150 0.43
151 0.48
152 0.45
153 0.42
154 0.41
155 0.38
156 0.37
157 0.29
158 0.23
159 0.18
160 0.16
161 0.14
162 0.14
163 0.13
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.08
169 0.09
170 0.11
171 0.13
172 0.14
173 0.17
174 0.2
175 0.21
176 0.2
177 0.22
178 0.23
179 0.23
180 0.24
181 0.21
182 0.18
183 0.18
184 0.18
185 0.16
186 0.12
187 0.11
188 0.07
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.12
194 0.14
195 0.19
196 0.19
197 0.18
198 0.25
199 0.25
200 0.28
201 0.33
202 0.32
203 0.28
204 0.27
205 0.27
206 0.22
207 0.23
208 0.2
209 0.13
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.08
214 0.06
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.14
219 0.14
220 0.18
221 0.2
222 0.21
223 0.2
224 0.26
225 0.27
226 0.26
227 0.33
228 0.33
229 0.34
230 0.34
231 0.33
232 0.25
233 0.26
234 0.22
235 0.15
236 0.11
237 0.07
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.11
243 0.13
244 0.15
245 0.15
246 0.15
247 0.15
248 0.14
249 0.13
250 0.09
251 0.08
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.04
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.05
280 0.05
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.09
285 0.11
286 0.11
287 0.09
288 0.09
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.09
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.11
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.12
309 0.13
310 0.12
311 0.11
312 0.11
313 0.15
314 0.18
315 0.19
316 0.16
317 0.15
318 0.15
319 0.16
320 0.15
321 0.11
322 0.09
323 0.09
324 0.09
325 0.1
326 0.1
327 0.09
328 0.1
329 0.11
330 0.12
331 0.09
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.11
336 0.1
337 0.08
338 0.07
339 0.07
340 0.05
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.02
345 0.02
346 0.02
347 0.02
348 0.02
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.02
364 0.02
365 0.02
366 0.02
367 0.02
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.04
373 0.04
374 0.05
375 0.06
376 0.07
377 0.08
378 0.13
379 0.19
380 0.19
381 0.2
382 0.2
383 0.2
384 0.21
385 0.21
386 0.17
387 0.1
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.07
392 0.05
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.06
404 0.07
405 0.07
406 0.08
407 0.1
408 0.11
409 0.14
410 0.15
411 0.16
412 0.17
413 0.17
414 0.18
415 0.16
416 0.16
417 0.13
418 0.12
419 0.1
420 0.1
421 0.09
422 0.07
423 0.07
424 0.06
425 0.08
426 0.08
427 0.1
428 0.11
429 0.14
430 0.22
431 0.32
432 0.41
433 0.5
434 0.6
435 0.69
436 0.78
437 0.86
438 0.9
439 0.91
440 0.93
441 0.93
442 0.91
443 0.88
444 0.83
445 0.75
446 0.69
447 0.62
448 0.52
449 0.42
450 0.34
451 0.26
452 0.21
453 0.2
454 0.17
455 0.17
456 0.21
457 0.25
458 0.26
459 0.25
460 0.27
461 0.28
462 0.29
463 0.28
464 0.23
465 0.2
466 0.19
467 0.19
468 0.17
469 0.15
470 0.12
471 0.11
472 0.12
473 0.13
474 0.13
475 0.13
476 0.13
477 0.13
478 0.13
479 0.11
480 0.11
481 0.11
482 0.13
483 0.19
484 0.2
485 0.21
486 0.22
487 0.21
488 0.21
489 0.21
490 0.2
491 0.14
492 0.11
493 0.13
494 0.13
495 0.15
496 0.15
497 0.13
498 0.11
499 0.11
500 0.11
501 0.08
502 0.08
503 0.05
504 0.05
505 0.04
506 0.05
507 0.05
508 0.06
509 0.07
510 0.09
511 0.09
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.09
516 0.09
517 0.08
518 0.07
519 0.08
520 0.08
521 0.09
522 0.11
523 0.15
524 0.16
525 0.16
526 0.16
527 0.18
528 0.21
529 0.27
530 0.31
531 0.37
532 0.45
533 0.55
534 0.65
535 0.73
536 0.79
537 0.83
538 0.85
539 0.82
540 0.84
541 0.81
542 0.8
543 0.76
544 0.73
545 0.63
546 0.56
547 0.51
548 0.4
549 0.35
550 0.3
551 0.29
552 0.32
553 0.33
554 0.38
555 0.37
556 0.37
557 0.34
558 0.32
559 0.33
560 0.26