Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0SSV3

Protein Details
Accession A0A0L0SSV3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-102EPEPVPVPAARKKRNKKGKKGSAASEARHydrophilic
121-151LTPTSSPVKTSKKKKNKKNKGKKQSAASTTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
83-96AARKKRNKKGKKGS
129-143KTSKKKKNKKNKGKK
Subcellular Location(s) mito 17.5, cyto_mito 10.833, nucl 6.5, cyto_nucl 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006994  TCF25/Rqc1  
Pfam View protein in Pfam  
PF04910  Tcf25  
Amino Acid Sequences MSGRAVRRLLREKAPAPAIPAVPAADHSDDQESDDEPAAAPAKAFNPFALLMGDDDANNDDEELASELEHEPEPEPEPVPVPAARKKRNKKGKKGSAASEARDASPALPVSDHGDENDEPLTPTSSPVKTSKKKKNKKNKGKKQSAASTTTAVDDMTLDELDQVLGGLKVDDAAKAQDAATDESSRADQQHRKLFTIEARFMDPEAELARMFGSRVVAQAQHEQQEQQQQQQHQQLRGRARRAAAAAAAAAQQGRGAILVRRSLLATPTDQWPRFESFGLLMQLLCTTDSGIKEYSYVHPARFQEIHRQFLLAVATLDPNNLMGILQIHPYHPDTLLQFSRVLEMMGDHTMARDCVSRALYALERTSTAAFSWSSDLAKPARALPYVVYENRIVFLAMHRRISYLARDACWRTAFEWTKLMLSLDETDPLAMRLVADTYALRAREYDWVVEYATMFPHCATLQFSKALALWLSLP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.55
3 0.51
4 0.5
5 0.42
6 0.35
7 0.34
8 0.26
9 0.21
10 0.21
11 0.2
12 0.18
13 0.18
14 0.18
15 0.2
16 0.2
17 0.22
18 0.21
19 0.18
20 0.17
21 0.18
22 0.16
23 0.13
24 0.15
25 0.15
26 0.13
27 0.12
28 0.13
29 0.14
30 0.17
31 0.18
32 0.15
33 0.17
34 0.17
35 0.18
36 0.16
37 0.14
38 0.12
39 0.13
40 0.13
41 0.1
42 0.1
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.08
48 0.08
49 0.09
50 0.1
51 0.08
52 0.07
53 0.09
54 0.09
55 0.11
56 0.11
57 0.12
58 0.11
59 0.13
60 0.16
61 0.16
62 0.17
63 0.15
64 0.17
65 0.16
66 0.18
67 0.19
68 0.22
69 0.28
70 0.37
71 0.46
72 0.55
73 0.65
74 0.73
75 0.81
76 0.87
77 0.9
78 0.91
79 0.93
80 0.93
81 0.9
82 0.85
83 0.84
84 0.78
85 0.69
86 0.64
87 0.55
88 0.44
89 0.38
90 0.33
91 0.22
92 0.21
93 0.19
94 0.13
95 0.12
96 0.12
97 0.15
98 0.17
99 0.17
100 0.13
101 0.17
102 0.16
103 0.18
104 0.18
105 0.13
106 0.12
107 0.12
108 0.14
109 0.1
110 0.12
111 0.16
112 0.16
113 0.2
114 0.26
115 0.36
116 0.43
117 0.53
118 0.62
119 0.68
120 0.77
121 0.85
122 0.89
123 0.91
124 0.93
125 0.95
126 0.95
127 0.95
128 0.96
129 0.92
130 0.9
131 0.87
132 0.82
133 0.75
134 0.66
135 0.56
136 0.46
137 0.39
138 0.3
139 0.2
140 0.14
141 0.09
142 0.08
143 0.07
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.04
155 0.03
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.09
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.13
172 0.12
173 0.13
174 0.17
175 0.2
176 0.26
177 0.34
178 0.35
179 0.36
180 0.36
181 0.37
182 0.36
183 0.37
184 0.34
185 0.27
186 0.27
187 0.26
188 0.25
189 0.22
190 0.17
191 0.11
192 0.09
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.1
206 0.15
207 0.16
208 0.17
209 0.17
210 0.17
211 0.18
212 0.25
213 0.25
214 0.25
215 0.28
216 0.27
217 0.32
218 0.39
219 0.41
220 0.38
221 0.41
222 0.41
223 0.46
224 0.5
225 0.47
226 0.43
227 0.4
228 0.37
229 0.34
230 0.29
231 0.2
232 0.15
233 0.11
234 0.09
235 0.09
236 0.06
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.03
243 0.04
244 0.05
245 0.07
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.16
256 0.22
257 0.23
258 0.23
259 0.25
260 0.27
261 0.26
262 0.25
263 0.21
264 0.15
265 0.18
266 0.17
267 0.15
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.09
272 0.08
273 0.05
274 0.05
275 0.07
276 0.07
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.12
282 0.13
283 0.18
284 0.18
285 0.17
286 0.22
287 0.23
288 0.26
289 0.28
290 0.27
291 0.32
292 0.35
293 0.38
294 0.33
295 0.33
296 0.29
297 0.27
298 0.26
299 0.16
300 0.12
301 0.09
302 0.1
303 0.09
304 0.09
305 0.07
306 0.07
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.04
311 0.05
312 0.06
313 0.08
314 0.09
315 0.09
316 0.11
317 0.13
318 0.14
319 0.13
320 0.14
321 0.13
322 0.19
323 0.2
324 0.19
325 0.19
326 0.18
327 0.19
328 0.17
329 0.16
330 0.1
331 0.09
332 0.1
333 0.09
334 0.09
335 0.08
336 0.08
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.12
343 0.14
344 0.13
345 0.13
346 0.16
347 0.17
348 0.18
349 0.18
350 0.16
351 0.15
352 0.16
353 0.17
354 0.14
355 0.12
356 0.12
357 0.11
358 0.11
359 0.13
360 0.13
361 0.13
362 0.13
363 0.17
364 0.16
365 0.19
366 0.18
367 0.19
368 0.22
369 0.22
370 0.22
371 0.2
372 0.25
373 0.28
374 0.28
375 0.28
376 0.25
377 0.25
378 0.25
379 0.24
380 0.17
381 0.12
382 0.17
383 0.24
384 0.26
385 0.29
386 0.28
387 0.29
388 0.31
389 0.33
390 0.31
391 0.31
392 0.31
393 0.29
394 0.35
395 0.37
396 0.4
397 0.39
398 0.36
399 0.28
400 0.35
401 0.38
402 0.35
403 0.36
404 0.33
405 0.32
406 0.32
407 0.31
408 0.21
409 0.19
410 0.2
411 0.16
412 0.16
413 0.15
414 0.15
415 0.14
416 0.14
417 0.13
418 0.09
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.09
424 0.09
425 0.11
426 0.16
427 0.16
428 0.15
429 0.15
430 0.17
431 0.23
432 0.25
433 0.24
434 0.22
435 0.23
436 0.24
437 0.24
438 0.23
439 0.17
440 0.17
441 0.15
442 0.13
443 0.12
444 0.14
445 0.13
446 0.14
447 0.18
448 0.2
449 0.23
450 0.24
451 0.25
452 0.24
453 0.24
454 0.25
455 0.21