Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0SJD0

Protein Details
Accession A0A0L0SJD0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-78ASTSTAPAGKKQKKKKSVAKTTDTNTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
61-69GKKQKKKKS
165-169KKKPR
Subcellular Location(s) cyto 8.5, cyto_nucl 7.5, mito 7, nucl 5.5, extr 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MPKRAQPDSEPVLDRSSAAGVAPPSPKRTKVANPDTPTDQELTNAESSNDAAASTSTAPAGKKQKKKKSVAKTTDTNTIPIHRGKFKLRYLQKHAFLIRRADPAVGLLVSCSPATETRAIGQLRSFADAWLPKLFPDAHAAYPDLEPANDVDLQYVADEEEDDKKKKPRPAAVDKGDKTALFQMADTGSAGLLFLRFRNNVAPSEFVLRLFDFLAASPDKKHAQETDLSFCHRFLPMSHVASAATQTDIVDTFGPLLSNVDTFGLDTSDAPATDGRKRSVAIYVEARNAPAINRQSLTLALGEHLPNTMCVDLKTPDVVILVSVFKSVAGMSIVLGHDYRRLHKFNIQKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.28
3 0.23
4 0.17
5 0.14
6 0.15
7 0.13
8 0.17
9 0.23
10 0.25
11 0.3
12 0.35
13 0.38
14 0.39
15 0.45
16 0.5
17 0.55
18 0.62
19 0.65
20 0.66
21 0.68
22 0.68
23 0.63
24 0.56
25 0.47
26 0.36
27 0.28
28 0.24
29 0.23
30 0.2
31 0.18
32 0.16
33 0.15
34 0.15
35 0.14
36 0.13
37 0.09
38 0.07
39 0.07
40 0.08
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.11
45 0.11
46 0.18
47 0.29
48 0.36
49 0.45
50 0.56
51 0.66
52 0.74
53 0.84
54 0.87
55 0.88
56 0.9
57 0.9
58 0.87
59 0.84
60 0.77
61 0.76
62 0.66
63 0.58
64 0.48
65 0.42
66 0.38
67 0.35
68 0.36
69 0.32
70 0.36
71 0.4
72 0.46
73 0.48
74 0.55
75 0.59
76 0.63
77 0.67
78 0.72
79 0.69
80 0.68
81 0.67
82 0.62
83 0.57
84 0.54
85 0.48
86 0.43
87 0.39
88 0.33
89 0.27
90 0.23
91 0.2
92 0.14
93 0.1
94 0.07
95 0.06
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.1
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.18
106 0.18
107 0.17
108 0.17
109 0.19
110 0.18
111 0.2
112 0.19
113 0.13
114 0.16
115 0.17
116 0.18
117 0.17
118 0.16
119 0.13
120 0.16
121 0.16
122 0.13
123 0.17
124 0.17
125 0.16
126 0.17
127 0.17
128 0.16
129 0.16
130 0.16
131 0.11
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.1
148 0.14
149 0.15
150 0.18
151 0.25
152 0.31
153 0.35
154 0.41
155 0.42
156 0.48
157 0.57
158 0.63
159 0.65
160 0.68
161 0.64
162 0.61
163 0.54
164 0.45
165 0.36
166 0.29
167 0.22
168 0.13
169 0.12
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.06
175 0.05
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.12
186 0.14
187 0.16
188 0.17
189 0.18
190 0.16
191 0.2
192 0.2
193 0.16
194 0.16
195 0.14
196 0.14
197 0.12
198 0.11
199 0.07
200 0.07
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.14
206 0.16
207 0.16
208 0.18
209 0.17
210 0.18
211 0.23
212 0.26
213 0.28
214 0.28
215 0.3
216 0.28
217 0.27
218 0.26
219 0.21
220 0.18
221 0.13
222 0.18
223 0.21
224 0.23
225 0.23
226 0.22
227 0.21
228 0.21
229 0.21
230 0.15
231 0.09
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.11
259 0.13
260 0.19
261 0.23
262 0.23
263 0.24
264 0.24
265 0.25
266 0.29
267 0.29
268 0.27
269 0.3
270 0.32
271 0.34
272 0.34
273 0.33
274 0.28
275 0.26
276 0.22
277 0.23
278 0.24
279 0.23
280 0.23
281 0.23
282 0.23
283 0.23
284 0.24
285 0.17
286 0.14
287 0.11
288 0.13
289 0.13
290 0.12
291 0.12
292 0.11
293 0.11
294 0.12
295 0.12
296 0.1
297 0.11
298 0.14
299 0.14
300 0.16
301 0.16
302 0.15
303 0.15
304 0.14
305 0.14
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.11
320 0.11
321 0.12
322 0.13
323 0.12
324 0.16
325 0.19
326 0.25
327 0.28
328 0.32
329 0.35
330 0.43