Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0SJM3

Protein Details
Accession A0A0L0SJM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
110-132FTATIPRHKRRRTDPHTPDKNQEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 3, mito 2, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026502  SLBP1/SLBP2  
IPR029344  SLBP_RNA_bind  
IPR038294  SLBP_RNA_bind_sf  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF15247  SLBP_RNA_bind  
Amino Acid Sequences MAAAATTPRSPLTIDLKLSAPAFYPGIGFVRDDGAHLSPPATSPIVAARSSPPMSSLTAAMAAAATAPDTSRMPRERPKLGSAPASWDRRLAQRQKQIDYGKNTIGYQNFTATIPRHKRRRTDPHTPDKNQECSTRSWVGQLRRWRRQLHRWDQGPLPTGASGTCLPNCPSASEPYDARDADDEDDDDDNDHGEQSDLDANGIDDDMDDDRDRFPSSPTLRPRGARPPRSTCSCASSAVGTADAWSISGDTDIGTVDSWASSEDAVAMALAADMDDLASNVSSEPALRTTSAPLVVAAFLDPRHPPLVPPPPPPRLPVPECPPSPPAVVRRHFRRGSDSSVASSTRWRGNNKGAAPSETSVSDSEAAVLSAREHAMLAAQEQDVDDIYRIGAIQDYDWHY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.31
3 0.32
4 0.34
5 0.33
6 0.28
7 0.22
8 0.18
9 0.17
10 0.15
11 0.14
12 0.13
13 0.14
14 0.14
15 0.13
16 0.12
17 0.15
18 0.15
19 0.15
20 0.16
21 0.16
22 0.17
23 0.17
24 0.16
25 0.13
26 0.14
27 0.16
28 0.14
29 0.12
30 0.12
31 0.17
32 0.2
33 0.19
34 0.2
35 0.2
36 0.25
37 0.27
38 0.26
39 0.22
40 0.21
41 0.22
42 0.22
43 0.2
44 0.14
45 0.14
46 0.13
47 0.12
48 0.09
49 0.08
50 0.06
51 0.05
52 0.05
53 0.04
54 0.04
55 0.06
56 0.07
57 0.1
58 0.17
59 0.22
60 0.28
61 0.37
62 0.44
63 0.5
64 0.54
65 0.59
66 0.57
67 0.57
68 0.57
69 0.49
70 0.5
71 0.5
72 0.5
73 0.43
74 0.4
75 0.38
76 0.39
77 0.48
78 0.49
79 0.5
80 0.55
81 0.61
82 0.62
83 0.68
84 0.67
85 0.65
86 0.62
87 0.57
88 0.51
89 0.47
90 0.44
91 0.39
92 0.34
93 0.3
94 0.24
95 0.21
96 0.19
97 0.18
98 0.2
99 0.18
100 0.27
101 0.34
102 0.41
103 0.49
104 0.54
105 0.62
106 0.69
107 0.79
108 0.77
109 0.79
110 0.8
111 0.82
112 0.86
113 0.82
114 0.8
115 0.75
116 0.73
117 0.65
118 0.59
119 0.51
120 0.44
121 0.46
122 0.41
123 0.35
124 0.34
125 0.37
126 0.38
127 0.42
128 0.48
129 0.51
130 0.57
131 0.63
132 0.65
133 0.67
134 0.71
135 0.76
136 0.76
137 0.76
138 0.71
139 0.68
140 0.63
141 0.59
142 0.52
143 0.41
144 0.32
145 0.22
146 0.19
147 0.15
148 0.14
149 0.12
150 0.1
151 0.11
152 0.12
153 0.13
154 0.15
155 0.16
156 0.15
157 0.15
158 0.17
159 0.19
160 0.19
161 0.18
162 0.17
163 0.21
164 0.19
165 0.18
166 0.16
167 0.14
168 0.13
169 0.13
170 0.11
171 0.09
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.03
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.08
199 0.09
200 0.08
201 0.1
202 0.16
203 0.2
204 0.28
205 0.32
206 0.37
207 0.39
208 0.4
209 0.43
210 0.46
211 0.52
212 0.53
213 0.55
214 0.57
215 0.6
216 0.64
217 0.63
218 0.54
219 0.49
220 0.42
221 0.36
222 0.29
223 0.24
224 0.19
225 0.16
226 0.15
227 0.1
228 0.08
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.03
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.02
259 0.02
260 0.02
261 0.02
262 0.02
263 0.02
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.05
271 0.06
272 0.07
273 0.08
274 0.09
275 0.1
276 0.12
277 0.15
278 0.15
279 0.14
280 0.13
281 0.12
282 0.11
283 0.1
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.09
288 0.09
289 0.11
290 0.13
291 0.13
292 0.13
293 0.21
294 0.32
295 0.35
296 0.43
297 0.48
298 0.53
299 0.55
300 0.57
301 0.55
302 0.54
303 0.54
304 0.54
305 0.53
306 0.55
307 0.55
308 0.55
309 0.51
310 0.45
311 0.42
312 0.39
313 0.4
314 0.4
315 0.46
316 0.5
317 0.56
318 0.63
319 0.64
320 0.62
321 0.63
322 0.58
323 0.6
324 0.58
325 0.52
326 0.45
327 0.44
328 0.42
329 0.34
330 0.34
331 0.31
332 0.31
333 0.35
334 0.37
335 0.4
336 0.48
337 0.56
338 0.54
339 0.58
340 0.54
341 0.51
342 0.51
343 0.46
344 0.39
345 0.31
346 0.29
347 0.21
348 0.2
349 0.18
350 0.14
351 0.14
352 0.12
353 0.12
354 0.1
355 0.1
356 0.08
357 0.1
358 0.1
359 0.09
360 0.09
361 0.09
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.12
366 0.12
367 0.12
368 0.12
369 0.13
370 0.11
371 0.12
372 0.11
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.1
379 0.09
380 0.09