Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0SCM5

Protein Details
Accession A0A0L0SCM5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-57GHDALFKRSRRKSIPTRSPSPSMHydrophilic
455-477LAPVPRRKRTTSQQQQPRPTSTSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 6, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MTTTSNPGAPAVSGPGAFGASVAGAMSPNLHNVLGHDALFKRSRRKSIPTRSPSPSMAGMGPPGVVFQIPFSLDAPDPWLWSSGALSPTLPLVHMRSRSDSLPVVPTPVNPRGRASSVPRGPAGPSSPRGRYAQAPPRHAAAAHAAYTANGRGRAWNGGDAACPSPLGRPVDASFSSDEDEDLHTRLALSTVPVPAATTTPTSALGLQPPGSAASMLAMSLATPSPPPHGMLAFDLPARMVQLPLPPSTASAAHELIRARSLSPAPTSFARLQGIPEVPATAAAAAAAATARARTASPVDPDVGRSRTRAETCSATPEPAPSLQPPQPISRPSRLQSLETNPIRPASRAATPLLETVEEETPPVQVVSRADRDRPQSPYAGTSAVDFVSHGGEKFETYVRARRPSDASFVRGGTASPPMPAPQATPRRVPRSRSRSVSPPMDKMEEDGDAYVPLLAPVPRRKRTTSQQQQPRPTSTSPPPPATTRRSRSPASNDENEAGGEGGAVGPRKSCHSCGSTKSAQSTWRTGWHESVTLCNQCGLRYNRNGHIHCERCNYIPTKSEAPARMCRVCNLPI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.12
4 0.12
5 0.1
6 0.07
7 0.05
8 0.05
9 0.05
10 0.05
11 0.05
12 0.05
13 0.08
14 0.08
15 0.1
16 0.11
17 0.11
18 0.11
19 0.12
20 0.18
21 0.17
22 0.17
23 0.19
24 0.19
25 0.25
26 0.31
27 0.34
28 0.39
29 0.45
30 0.54
31 0.57
32 0.66
33 0.71
34 0.77
35 0.83
36 0.82
37 0.83
38 0.8
39 0.78
40 0.7
41 0.63
42 0.54
43 0.45
44 0.38
45 0.31
46 0.25
47 0.2
48 0.18
49 0.14
50 0.12
51 0.09
52 0.08
53 0.07
54 0.06
55 0.09
56 0.09
57 0.1
58 0.11
59 0.14
60 0.14
61 0.14
62 0.18
63 0.16
64 0.17
65 0.16
66 0.17
67 0.14
68 0.15
69 0.16
70 0.15
71 0.15
72 0.15
73 0.14
74 0.13
75 0.14
76 0.14
77 0.13
78 0.1
79 0.14
80 0.19
81 0.24
82 0.26
83 0.3
84 0.33
85 0.33
86 0.35
87 0.33
88 0.29
89 0.3
90 0.27
91 0.26
92 0.24
93 0.26
94 0.29
95 0.35
96 0.37
97 0.33
98 0.36
99 0.37
100 0.4
101 0.42
102 0.43
103 0.45
104 0.45
105 0.47
106 0.45
107 0.41
108 0.39
109 0.37
110 0.35
111 0.3
112 0.3
113 0.33
114 0.34
115 0.37
116 0.38
117 0.37
118 0.38
119 0.42
120 0.47
121 0.49
122 0.52
123 0.5
124 0.5
125 0.48
126 0.42
127 0.34
128 0.3
129 0.25
130 0.21
131 0.2
132 0.17
133 0.17
134 0.18
135 0.18
136 0.14
137 0.12
138 0.12
139 0.13
140 0.15
141 0.19
142 0.19
143 0.19
144 0.18
145 0.17
146 0.18
147 0.18
148 0.17
149 0.14
150 0.12
151 0.1
152 0.11
153 0.15
154 0.17
155 0.15
156 0.17
157 0.17
158 0.22
159 0.22
160 0.23
161 0.19
162 0.17
163 0.18
164 0.15
165 0.15
166 0.11
167 0.13
168 0.12
169 0.12
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.09
199 0.08
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.03
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.08
213 0.09
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.11
218 0.12
219 0.13
220 0.11
221 0.11
222 0.1
223 0.09
224 0.08
225 0.09
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.09
230 0.11
231 0.12
232 0.13
233 0.12
234 0.12
235 0.13
236 0.13
237 0.11
238 0.12
239 0.13
240 0.12
241 0.14
242 0.14
243 0.13
244 0.14
245 0.13
246 0.11
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.13
251 0.13
252 0.14
253 0.14
254 0.18
255 0.17
256 0.18
257 0.17
258 0.15
259 0.15
260 0.16
261 0.16
262 0.13
263 0.12
264 0.1
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.05
269 0.04
270 0.03
271 0.03
272 0.02
273 0.03
274 0.02
275 0.02
276 0.02
277 0.02
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.04
282 0.07
283 0.1
284 0.11
285 0.12
286 0.14
287 0.13
288 0.15
289 0.18
290 0.18
291 0.16
292 0.16
293 0.18
294 0.21
295 0.23
296 0.23
297 0.22
298 0.23
299 0.22
300 0.29
301 0.26
302 0.23
303 0.21
304 0.2
305 0.19
306 0.17
307 0.17
308 0.12
309 0.16
310 0.17
311 0.21
312 0.22
313 0.25
314 0.27
315 0.3
316 0.34
317 0.35
318 0.37
319 0.35
320 0.41
321 0.39
322 0.38
323 0.38
324 0.39
325 0.43
326 0.39
327 0.39
328 0.32
329 0.33
330 0.31
331 0.27
332 0.23
333 0.17
334 0.18
335 0.18
336 0.19
337 0.18
338 0.18
339 0.19
340 0.17
341 0.14
342 0.11
343 0.12
344 0.11
345 0.1
346 0.09
347 0.09
348 0.08
349 0.08
350 0.08
351 0.06
352 0.06
353 0.08
354 0.13
355 0.2
356 0.21
357 0.24
358 0.28
359 0.33
360 0.36
361 0.39
362 0.36
363 0.32
364 0.32
365 0.31
366 0.28
367 0.24
368 0.2
369 0.15
370 0.14
371 0.11
372 0.1
373 0.08
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.1
382 0.11
383 0.12
384 0.14
385 0.21
386 0.26
387 0.33
388 0.35
389 0.37
390 0.4
391 0.4
392 0.45
393 0.41
394 0.4
395 0.34
396 0.33
397 0.3
398 0.25
399 0.23
400 0.16
401 0.17
402 0.14
403 0.12
404 0.12
405 0.12
406 0.14
407 0.14
408 0.15
409 0.21
410 0.29
411 0.32
412 0.4
413 0.46
414 0.55
415 0.59
416 0.64
417 0.65
418 0.65
419 0.71
420 0.69
421 0.66
422 0.65
423 0.68
424 0.71
425 0.65
426 0.61
427 0.56
428 0.53
429 0.48
430 0.41
431 0.36
432 0.26
433 0.22
434 0.17
435 0.13
436 0.11
437 0.11
438 0.09
439 0.07
440 0.06
441 0.07
442 0.08
443 0.14
444 0.23
445 0.32
446 0.39
447 0.44
448 0.5
449 0.56
450 0.65
451 0.71
452 0.73
453 0.74
454 0.78
455 0.83
456 0.87
457 0.85
458 0.8
459 0.74
460 0.66
461 0.63
462 0.6
463 0.61
464 0.57
465 0.57
466 0.54
467 0.55
468 0.59
469 0.6
470 0.62
471 0.58
472 0.61
473 0.62
474 0.62
475 0.64
476 0.66
477 0.68
478 0.65
479 0.64
480 0.58
481 0.54
482 0.51
483 0.43
484 0.34
485 0.24
486 0.16
487 0.1
488 0.07
489 0.06
490 0.07
491 0.08
492 0.08
493 0.09
494 0.11
495 0.17
496 0.21
497 0.23
498 0.28
499 0.33
500 0.39
501 0.43
502 0.5
503 0.51
504 0.52
505 0.53
506 0.5
507 0.51
508 0.5
509 0.5
510 0.45
511 0.47
512 0.47
513 0.45
514 0.47
515 0.43
516 0.42
517 0.37
518 0.41
519 0.39
520 0.38
521 0.35
522 0.34
523 0.31
524 0.28
525 0.37
526 0.36
527 0.38
528 0.44
529 0.5
530 0.56
531 0.65
532 0.66
533 0.65
534 0.68
535 0.65
536 0.62
537 0.64
538 0.57
539 0.51
540 0.57
541 0.53
542 0.47
543 0.48
544 0.47
545 0.45
546 0.46
547 0.51
548 0.5
549 0.53
550 0.57
551 0.58
552 0.6
553 0.56
554 0.56