FuNGI

A0A0L0SWC1

Protein Details

Accession

A0A0L0SWC1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
492-521	AAAEAPKPKEKAKKKRKPRLPKNYDPDVKP	Basic
579-602	AVPTKTQATKKPPAGKKRGGAHAH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
497-513	PKPKEKAKKKRKPRLPK
587-609	TKKPPAGKKRGGAHAHGKGKKKH

Subcellular Location(s)

mito 14, nucl 6.5, cyto_nucl 6.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013699 Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd IPR026270 SRP72 IPR031545 SRP_TPR-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005783 C:endoplasmic reticulum GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
Pfam	View protein in Pfam PF08492 SRP72 PF17004 SRP_TPR_like

Amino Acid Sequences

MPPKSKSKSASAAAALRAQLQPLLDRERYTDAVALCAKSTDPVIQHVHAVALIRLERYDDALEVLDALPAQAFERAYCLYRLNRLDEALVVVDGLDQDDANVQQLKAQILYRLEEWDTCLALHDAMVEAMPEDHPDYDDLRTNHHAVLAARAFSTSTPVVLPTTPITPAVLDSYEAHFNAGTLALAIGQPLLAITHLTTARALVAQQYSHPRDKSILARELAPIAVQLAAAYQAAGHTIEAVNTVRGAAALGNKGIAWALAVNNAMSLATDARAYDWGKQWKRVAKVVAAERVPKWQAKLVERNAFLVALALGKDADVAAAMERVAEDEEEKAVYEGFRQLAKGEPVPSPTTPALLPTLCHLQHLWTHASLDDLTAALSAATSQFPHVTSLAALHARLLRAQGELDAAATALETAGAQVALAALRNDADLWATLVRDQGDDPVRVAEWIAALSSRDAHAAAQYAAAMLPAADEEDVDADVAERGFKAAVTDAAAEAPKPKEKAKKKRKPRLPKNYDPDVKPTGRWLPERLADGERTGTKAEWMMAVSPAPEVMGVGGTGSARILIEGASSAAHTEPAAAVPTKTQATKKPPAGKKRGGAHAHGKGKKKH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.41
3	0.36
4	0.32
5	0.26
6	0.22
7	0.19
8	0.2
9	0.21
10	0.28
11	0.26
12	0.27
13	0.3
14	0.34
15	0.34
16	0.33
17	0.32
18	0.25
19	0.28
20	0.3
21	0.28
22	0.22
23	0.21
24	0.19
25	0.17
26	0.18
27	0.17
28	0.15
29	0.2
30	0.25
31	0.25
32	0.26
33	0.25
34	0.24
35	0.21
36	0.21
37	0.15
38	0.14
39	0.15
40	0.14
41	0.13
42	0.15
43	0.14
44	0.16
45	0.17
46	0.13
47	0.13
48	0.13
49	0.13
50	0.12
51	0.12
52	0.09
53	0.08
54	0.08
55	0.06
56	0.06
57	0.07
58	0.08
59	0.08
60	0.08
61	0.11
62	0.13
63	0.15
64	0.16
65	0.21
66	0.21
67	0.29
68	0.33
69	0.34
70	0.35
71	0.34
72	0.33
73	0.29
74	0.27
75	0.2
76	0.16
77	0.11
78	0.09
79	0.08
80	0.07
81	0.07
82	0.05
83	0.04
84	0.05
85	0.06
86	0.07
87	0.09
88	0.11
89	0.11
90	0.13
91	0.16
92	0.16
93	0.17
94	0.18
95	0.19
96	0.19
97	0.21
98	0.2
99	0.21
100	0.21
101	0.19
102	0.21
103	0.18
104	0.17
105	0.15
106	0.15
107	0.13
108	0.12
109	0.11
110	0.09
111	0.07
112	0.07
113	0.07
114	0.05
115	0.05
116	0.05
117	0.05
118	0.06
119	0.07
120	0.07
121	0.08
122	0.09
123	0.11
124	0.12
125	0.18
126	0.18
127	0.22
128	0.25
129	0.27
130	0.26
131	0.25
132	0.26
133	0.2
134	0.27
135	0.23
136	0.2
137	0.18
138	0.18
139	0.17
140	0.14
141	0.18
142	0.11
143	0.1
144	0.1
145	0.1
146	0.12
147	0.11
148	0.13
149	0.11
150	0.12
151	0.12
152	0.12
153	0.11
154	0.1
155	0.11
156	0.11
157	0.1
158	0.1
159	0.11
160	0.13
161	0.15
162	0.14
163	0.14
164	0.12
165	0.12
166	0.11
167	0.09
168	0.06
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.03
176	0.03
177	0.03
178	0.03
179	0.03
180	0.03
181	0.03
182	0.07
183	0.08
184	0.08
185	0.08
186	0.08
187	0.09
188	0.09
189	0.09
190	0.08
191	0.09
192	0.09
193	0.12
194	0.2
195	0.25
196	0.3
197	0.3
198	0.28
199	0.29
200	0.32
201	0.36
202	0.35
203	0.36
204	0.32
205	0.33
206	0.32
207	0.31
208	0.27
209	0.2
210	0.13
211	0.07
212	0.07
213	0.05
214	0.04
215	0.04
216	0.04
217	0.04
218	0.04
219	0.03
220	0.03
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.04
226	0.05
227	0.06
228	0.07
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.06
237	0.07
238	0.07
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.07
243	0.05
244	0.04
245	0.04
246	0.04
247	0.05
248	0.06
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.04
254	0.05
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.05
260	0.08
261	0.09
262	0.11
263	0.17
264	0.26
265	0.27
266	0.32
267	0.37
268	0.39
269	0.42
270	0.43
271	0.4
272	0.33
273	0.37
274	0.36
275	0.36
276	0.32
277	0.31
278	0.27
279	0.28
280	0.27
281	0.23
282	0.2
283	0.19
284	0.23
285	0.26
286	0.34
287	0.36
288	0.4
289	0.4
290	0.4
291	0.36
292	0.31
293	0.26
294	0.18
295	0.12
296	0.06
297	0.05
298	0.04
299	0.03
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.02
305	0.02
306	0.03
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.07
324	0.08
325	0.08
326	0.08
327	0.09
328	0.11
329	0.13
330	0.14
331	0.15
332	0.15
333	0.17
334	0.2
335	0.19
336	0.2
337	0.19
338	0.18
339	0.15
340	0.16
341	0.15
342	0.13
343	0.13
344	0.11
345	0.16
346	0.15
347	0.15
348	0.14
349	0.14
350	0.16
351	0.19
352	0.18
353	0.14
354	0.14
355	0.13
356	0.14
357	0.13
358	0.11
359	0.08
360	0.06
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.05
371	0.06
372	0.07
373	0.08
374	0.09
375	0.08
376	0.08
377	0.09
378	0.1
379	0.1
380	0.09
381	0.1
382	0.11
383	0.11
384	0.11
385	0.11
386	0.1
387	0.1
388	0.1
389	0.09
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.06
394	0.05
395	0.05
396	0.04
397	0.04
398	0.03
399	0.03
400	0.02
401	0.02
402	0.03
403	0.03
404	0.03
405	0.03
406	0.03
407	0.03
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.06
418	0.07
419	0.07
420	0.07
421	0.09
422	0.09
423	0.1
424	0.1
425	0.14
426	0.17
427	0.17
428	0.17
429	0.17
430	0.16
431	0.15
432	0.15
433	0.1
434	0.07
435	0.07
436	0.06
437	0.06
438	0.06
439	0.06
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.08
444	0.08
445	0.08
446	0.1
447	0.09
448	0.09
449	0.08
450	0.08
451	0.07
452	0.07
453	0.06
454	0.04
455	0.03
456	0.03
457	0.04
458	0.03
459	0.03
460	0.04
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.05
465	0.04
466	0.05
467	0.06
468	0.06
469	0.05
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.07
474	0.07
475	0.08
476	0.09
477	0.1
478	0.1
479	0.11
480	0.11
481	0.11
482	0.14
483	0.16
484	0.19
485	0.21
486	0.27
487	0.36
488	0.47
489	0.58
490	0.66
491	0.74
492	0.8
493	0.89
494	0.94
495	0.95
496	0.96
497	0.96
498	0.94
499	0.94
500	0.92
501	0.91
502	0.88
503	0.79
504	0.75
505	0.71
506	0.63
507	0.53
508	0.51
509	0.48
510	0.46
511	0.46
512	0.44
513	0.42
514	0.44
515	0.47
516	0.44
517	0.4
518	0.35
519	0.34
520	0.34
521	0.29
522	0.27
523	0.25
524	0.21
525	0.19
526	0.19
527	0.18
528	0.15
529	0.15
530	0.14
531	0.14
532	0.14
533	0.13
534	0.11
535	0.1
536	0.09
537	0.07
538	0.06
539	0.05
540	0.05
541	0.05
542	0.04
543	0.05
544	0.05
545	0.05
546	0.05
547	0.06
548	0.05
549	0.05
550	0.05
551	0.05
552	0.05
553	0.06
554	0.06
555	0.06
556	0.06
557	0.07
558	0.07
559	0.07
560	0.07
561	0.07
562	0.08
563	0.09
564	0.12
565	0.12
566	0.12
567	0.13
568	0.17
569	0.2
570	0.24
571	0.28
572	0.33
573	0.41
574	0.51
575	0.59
576	0.65
577	0.71
578	0.78
579	0.84
580	0.84
581	0.83
582	0.82
583	0.83
584	0.78
585	0.76
586	0.75
587	0.74
588	0.76
589	0.74

A0A0L0SWC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer