FuNGI

A0A0L0SHN1

Protein Details

Accession

A0A0L0SHN1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
414-438	GAGFGKKQGKYEKPKQAPRSFNPAN	Hydrophilic
478-509	EDDSSDKKAKKEKKEKKEKKDKKEKKEKKSKE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
484-509	KKAKKEKKEKKEKKDKKEKKEKKSKE

Subcellular Location(s)

cyto 15.5, cyto_nucl 13.833, nucl 10, cyto_mito 9.166

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045056 Nop56/Nop58 IPR012974 NOP58/56_N IPR042239 Nop_C IPR002687 Nop_dom IPR036070 Nop_dom_sf IPR012976 NOSIC
Gene Ontology	GO:0031428 C:box C/D RNP complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0030515 F:snoRNA binding GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF01798 Nop PF08156 NOP5NT
PROSITE	View protein in PROSITE PS51358 NOP

Amino Acid Sequences

MVLVLFETPAGHALFRVLDDAKLANPDDIASYFATPEDAAKNAKLAAFAKFENTADALASATALIEGKISKALKNFLQTELVDAKLADTLAIADAKLASAVSKKLGISVMPVNATVNELFRGIRGQLEALIQGLPAKDMANMALGLSHSLSRYKLKFSPDKVDTMIVQAVGLLDDLDKELNTYAMRVKEWYGWHFPEMAKIIVDNVAYSKIVAAMGFRSNAESTDLSSILPEELEQEVKEAAEISMGTEISDEDLLNIRALCDQVIHLHAYRAQLYAYLTSRMQAIAPNLTALVGELVGARLIAHAGSLMTLAKHPASTVQILGAEKALFRALKAKKDTPKYGLLYHAGLVGQAQGKNKGKIARALAAKASLSIRVDALAEDATPSAQVGLEARVYVEKRLRDLEARGTGRVSGAGFGKKQGKYEKPKQAPRSFNPANDFVPAAGNKNKRKLDEDEEMADTPAAAPEKKRKTEDAPAEDDSSDKKAKKEKKEKKEKKDKKEKKEKKSKE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.11
3	0.14
4	0.13
5	0.12
6	0.14
7	0.15
8	0.15
9	0.18
10	0.18
11	0.15
12	0.14
13	0.15
14	0.15
15	0.15
16	0.15
17	0.13
18	0.12
19	0.12
20	0.12
21	0.12
22	0.1
23	0.12
24	0.13
25	0.14
26	0.16
27	0.16
28	0.17
29	0.18
30	0.19
31	0.2
32	0.19
33	0.21
34	0.22
35	0.22
36	0.24
37	0.24
38	0.24
39	0.22
40	0.22
41	0.18
42	0.14
43	0.14
44	0.11
45	0.09
46	0.08
47	0.06
48	0.05
49	0.05
50	0.05
51	0.05
52	0.05
53	0.06
54	0.07
55	0.12
56	0.14
57	0.16
58	0.19
59	0.23
60	0.26
61	0.33
62	0.35
63	0.31
64	0.35
65	0.32
66	0.34
67	0.32
68	0.29
69	0.23
70	0.2
71	0.18
72	0.14
73	0.14
74	0.09
75	0.06
76	0.06
77	0.07
78	0.07
79	0.07
80	0.06
81	0.06
82	0.06
83	0.06
84	0.06
85	0.05
86	0.07
87	0.09
88	0.1
89	0.12
90	0.12
91	0.14
92	0.15
93	0.14
94	0.16
95	0.18
96	0.19
97	0.17
98	0.17
99	0.16
100	0.15
101	0.17
102	0.14
103	0.11
104	0.09
105	0.1
106	0.09
107	0.09
108	0.11
109	0.1
110	0.11
111	0.1
112	0.1
113	0.11
114	0.11
115	0.11
116	0.1
117	0.09
118	0.08
119	0.09
120	0.08
121	0.07
122	0.07
123	0.07
124	0.07
125	0.07
126	0.07
127	0.07
128	0.07
129	0.07
130	0.07
131	0.07
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.07
136	0.08
137	0.1
138	0.16
139	0.17
140	0.22
141	0.25
142	0.32
143	0.39
144	0.42
145	0.5
146	0.46
147	0.47
148	0.44
149	0.42
150	0.34
151	0.29
152	0.25
153	0.16
154	0.13
155	0.1
156	0.09
157	0.07
158	0.07
159	0.04
160	0.03
161	0.03
162	0.04
163	0.04
164	0.04
165	0.04
166	0.05
167	0.06
168	0.06
169	0.07
170	0.1
171	0.11
172	0.12
173	0.12
174	0.14
175	0.17
176	0.2
177	0.23
178	0.25
179	0.25
180	0.25
181	0.27
182	0.25
183	0.25
184	0.24
185	0.2
186	0.15
187	0.13
188	0.13
189	0.12
190	0.12
191	0.08
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.06
197	0.05
198	0.06
199	0.05
200	0.05
201	0.06
202	0.07
203	0.08
204	0.08
205	0.09
206	0.09
207	0.09
208	0.11
209	0.1
210	0.1
211	0.11
212	0.11
213	0.1
214	0.09
215	0.09
216	0.07
217	0.06
218	0.05
219	0.05
220	0.06
221	0.06
222	0.06
223	0.07
224	0.07
225	0.07
226	0.07
227	0.05
228	0.05
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.04
241	0.06
242	0.06
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.05
250	0.05
251	0.06
252	0.07
253	0.08
254	0.08
255	0.09
256	0.11
257	0.12
258	0.12
259	0.11
260	0.1
261	0.1
262	0.1
263	0.12
264	0.11
265	0.12
266	0.11
267	0.11
268	0.11
269	0.1
270	0.1
271	0.09
272	0.09
273	0.09
274	0.09
275	0.09
276	0.09
277	0.08
278	0.08
279	0.06
280	0.05
281	0.03
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.03
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.06
300	0.06
301	0.06
302	0.06
303	0.07
304	0.09
305	0.1
306	0.1
307	0.1
308	0.12
309	0.12
310	0.12
311	0.11
312	0.09
313	0.08
314	0.09
315	0.1
316	0.07
317	0.07
318	0.16
319	0.19
320	0.26
321	0.32
322	0.38
323	0.45
324	0.52
325	0.57
326	0.53
327	0.57
328	0.52
329	0.49
330	0.45
331	0.39
332	0.33
333	0.28
334	0.25
335	0.17
336	0.14
337	0.12
338	0.1
339	0.11
340	0.12
341	0.13
342	0.2
343	0.24
344	0.26
345	0.29
346	0.32
347	0.32
348	0.35
349	0.38
350	0.37
351	0.36
352	0.36
353	0.34
354	0.3
355	0.28
356	0.24
357	0.21
358	0.16
359	0.14
360	0.13
361	0.12
362	0.11
363	0.11
364	0.09
365	0.1
366	0.08
367	0.07
368	0.07
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.05
373	0.05
374	0.04
375	0.05
376	0.05
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.08
381	0.12
382	0.12
383	0.17
384	0.21
385	0.21
386	0.23
387	0.27
388	0.29
389	0.29
390	0.31
391	0.35
392	0.39
393	0.39
394	0.37
395	0.35
396	0.32
397	0.29
398	0.27
399	0.19
400	0.13
401	0.14
402	0.17
403	0.17
404	0.22
405	0.3
406	0.29
407	0.34
408	0.41
409	0.47
410	0.54
411	0.64
412	0.7
413	0.72
414	0.81
415	0.86
416	0.87
417	0.87
418	0.82
419	0.82
420	0.76
421	0.72
422	0.67
423	0.61
424	0.53
425	0.45
426	0.4
427	0.29
428	0.3
429	0.25
430	0.24
431	0.27
432	0.35
433	0.4
434	0.48
435	0.53
436	0.51
437	0.56
438	0.58
439	0.58
440	0.58
441	0.56
442	0.51
443	0.49
444	0.46
445	0.42
446	0.34
447	0.26
448	0.18
449	0.16
450	0.14
451	0.13
452	0.17
453	0.26
454	0.36
455	0.43
456	0.47
457	0.51
458	0.56
459	0.65
460	0.71
461	0.68
462	0.65
463	0.62
464	0.6
465	0.54
466	0.47
467	0.39
468	0.35
469	0.34
470	0.3
471	0.32
472	0.39
473	0.49
474	0.59
475	0.68
476	0.73
477	0.78
478	0.87
479	0.92
480	0.94
481	0.96
482	0.96
483	0.96
484	0.96
485	0.96
486	0.96
487	0.96
488	0.95
489	0.95

A0A0L0SHN1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer