FuNGI

A0A0L0SNB8

Protein Details

Accession

A0A0L0SNB8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
574-598	AIKDASAKPPKPRKAKPARIAAPAE	Hydrophilic
616-647	SASAAPAKKTRPPRPKSKKKPAKEQQAAEESG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
445-474	RKAKEKEEAEKLAAKERAEAKRARRAAVKE
556-593	GRGRRRKPANSTPGPAAAAIKDASAKPPKPRKAKPARI
621-638	PAKKTRPPRPKSKKKPAK

Subcellular Location(s)

cyto 10.5, cyto_nucl 6.5, mito 6, extr 5, pero 2, nucl 1.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043519 NT_sf IPR045862 Trf4-like
Gene Ontology	GO:0031499 C:TRAMP complex GO:0043631 P:RNA polyadenylation

Amino Acid Sequences

MSRPVSPAPAAAAEAVAAARVEPVAPAAPTSPFAPAYFRDQTIPVVADAPLHLGPLPYNAPKWLPTARDRSSIKAFTLHAHLTLELASLAAFLARPRECVFLHDLALDRLRAAVGPFFPEGTQIRAFGSSVSPVASVSSDLDVGILPPGFPHLKFDGKGARKATELLRPLLPAIKALAKHGTIEPVLRHGVKVPIVKYVDRVTNLEVDLSIQWEGFTAVDLVDAAAATYGANLTHVVLTLKALLSLHSLNVARHGGVNGFCTLSLVVAILHRLDAQGIPVRASSCDPTTTPGLVFLTVLHFLGFVLDPARVAIDAAYGGMLVDRTHAACNRYADHAWLVSSIRAQDPPENVGRCLHQYSNLRDLAQFVFLRIVQAMEFPRVEALLTAVFDVPDVYRRAYGTARRVYEGLLERDAEDQSAPRKVKEESVAHKYRADAAEIAATVVRKAKEKEEAEKLAAKERAEAKRARRAAVKEAATRARADANVKVDEEEVEDMVHEHVHVDDLVQDDEEVPVGDDEDVAEGLAAVMQQLVLVESVEAPGAAASSAAAAPQASSGRGRRRKPANSTPGPAAAAIKDASAKPPKPRKAKPARIAAPAEQGDAAAPAARPVNDGDVSASAAPAKKTRPPRPKSKKKPAKEQQAAEESGSAAPPVQSVVV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.1
3	0.08
4	0.06
5	0.05
6	0.05
7	0.05
8	0.06
9	0.05
10	0.07
11	0.09
12	0.09
13	0.1
14	0.11
15	0.12
16	0.14
17	0.15
18	0.16
19	0.16
20	0.16
21	0.19
22	0.2
23	0.26
24	0.29
25	0.29
26	0.29
27	0.29
28	0.3
29	0.3
30	0.29
31	0.22
32	0.19
33	0.17
34	0.16
35	0.15
36	0.16
37	0.13
38	0.12
39	0.12
40	0.1
41	0.11
42	0.14
43	0.18
44	0.17
45	0.19
46	0.21
47	0.22
48	0.24
49	0.28
50	0.3
51	0.31
52	0.36
53	0.44
54	0.46
55	0.53
56	0.53
57	0.55
58	0.57
59	0.55
60	0.49
61	0.44
62	0.41
63	0.35
64	0.39
65	0.33
66	0.27
67	0.25
68	0.23
69	0.19
70	0.18
71	0.15
72	0.09
73	0.08
74	0.06
75	0.05
76	0.05
77	0.04
78	0.05
79	0.05
80	0.12
81	0.12
82	0.15
83	0.17
84	0.21
85	0.21
86	0.25
87	0.3
88	0.25
89	0.26
90	0.25
91	0.24
92	0.23
93	0.25
94	0.21
95	0.15
96	0.13
97	0.12
98	0.11
99	0.11
100	0.12
101	0.11
102	0.14
103	0.14
104	0.15
105	0.14
106	0.18
107	0.18
108	0.19
109	0.19
110	0.17
111	0.17
112	0.17
113	0.17
114	0.14
115	0.14
116	0.12
117	0.11
118	0.11
119	0.1
120	0.09
121	0.1
122	0.09
123	0.09
124	0.08
125	0.09
126	0.08
127	0.08
128	0.08
129	0.07
130	0.07
131	0.08
132	0.07
133	0.06
134	0.05
135	0.09
136	0.11
137	0.11
138	0.15
139	0.17
140	0.22
141	0.22
142	0.27
143	0.33
144	0.35
145	0.42
146	0.4
147	0.38
148	0.34
149	0.37
150	0.36
151	0.34
152	0.33
153	0.3
154	0.29
155	0.27
156	0.27
157	0.28
158	0.24
159	0.17
160	0.16
161	0.17
162	0.16
163	0.18
164	0.21
165	0.17
166	0.19
167	0.19
168	0.2
169	0.17
170	0.19
171	0.17
172	0.17
173	0.19
174	0.18
175	0.17
176	0.16
177	0.19
178	0.21
179	0.25
180	0.22
181	0.26
182	0.28
183	0.28
184	0.29
185	0.29
186	0.28
187	0.26
188	0.27
189	0.22
190	0.23
191	0.22
192	0.2
193	0.16
194	0.13
195	0.11
196	0.11
197	0.1
198	0.07
199	0.06
200	0.06
201	0.07
202	0.06
203	0.06
204	0.05
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.03
212	0.03
213	0.03
214	0.02
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.03
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.08
232	0.08
233	0.08
234	0.1
235	0.11
236	0.11
237	0.14
238	0.14
239	0.12
240	0.12
241	0.12
242	0.1
243	0.1
244	0.12
245	0.1
246	0.09
247	0.09
248	0.09
249	0.08
250	0.07
251	0.06
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.05
256	0.04
257	0.04
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.06
263	0.1
264	0.1
265	0.1
266	0.11
267	0.11
268	0.12
269	0.13
270	0.13
271	0.1
272	0.12
273	0.11
274	0.13
275	0.15
276	0.15
277	0.13
278	0.13
279	0.12
280	0.11
281	0.1
282	0.08
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.06
287	0.05
288	0.05
289	0.06
290	0.06
291	0.04
292	0.05
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.05
297	0.04
298	0.04
299	0.03
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.04
311	0.05
312	0.06
313	0.08
314	0.09
315	0.12
316	0.13
317	0.14
318	0.17
319	0.16
320	0.16
321	0.15
322	0.14
323	0.12
324	0.11
325	0.1
326	0.08
327	0.08
328	0.08
329	0.08
330	0.09
331	0.1
332	0.12
333	0.13
334	0.15
335	0.19
336	0.19
337	0.19
338	0.19
339	0.19
340	0.18
341	0.19
342	0.17
343	0.19
344	0.23
345	0.26
346	0.32
347	0.32
348	0.3
349	0.27
350	0.29
351	0.24
352	0.22
353	0.18
354	0.12
355	0.12
356	0.12
357	0.12
358	0.1
359	0.09
360	0.06
361	0.08
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.09
368	0.09
369	0.06
370	0.06
371	0.05
372	0.05
373	0.06
374	0.06
375	0.05
376	0.05
377	0.06
378	0.05
379	0.08
380	0.09
381	0.09
382	0.1
383	0.11
384	0.13
385	0.16
386	0.21
387	0.25
388	0.3
389	0.31
390	0.31
391	0.31
392	0.29
393	0.32
394	0.31
395	0.25
396	0.2
397	0.19
398	0.19
399	0.2
400	0.19
401	0.14
402	0.1
403	0.1
404	0.11
405	0.18
406	0.18
407	0.17
408	0.19
409	0.2
410	0.24
411	0.29
412	0.34
413	0.33
414	0.42
415	0.46
416	0.45
417	0.46
418	0.42
419	0.4
420	0.34
421	0.29
422	0.2
423	0.16
424	0.16
425	0.15
426	0.15
427	0.1
428	0.09
429	0.08
430	0.11
431	0.12
432	0.14
433	0.15
434	0.19
435	0.27
436	0.3
437	0.36
438	0.4
439	0.42
440	0.42
441	0.45
442	0.43
443	0.41
444	0.4
445	0.34
446	0.31
447	0.36
448	0.38
449	0.38
450	0.43
451	0.42
452	0.49
453	0.51
454	0.49
455	0.48
456	0.47
457	0.49
458	0.52
459	0.51
460	0.45
461	0.48
462	0.49
463	0.44
464	0.4
465	0.34
466	0.29
467	0.26
468	0.24
469	0.23
470	0.23
471	0.24
472	0.24
473	0.23
474	0.21
475	0.19
476	0.18
477	0.15
478	0.11
479	0.08
480	0.08
481	0.08
482	0.08
483	0.08
484	0.06
485	0.05
486	0.05
487	0.06
488	0.06
489	0.05
490	0.07
491	0.09
492	0.09
493	0.09
494	0.09
495	0.08
496	0.08
497	0.08
498	0.07
499	0.06
500	0.05
501	0.06
502	0.06
503	0.05
504	0.05
505	0.06
506	0.06
507	0.05
508	0.05
509	0.04
510	0.04
511	0.04
512	0.04
513	0.03
514	0.03
515	0.03
516	0.03
517	0.03
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.05
524	0.05
525	0.04
526	0.04
527	0.04
528	0.04
529	0.04
530	0.03
531	0.03
532	0.04
533	0.04
534	0.04
535	0.05
536	0.04
537	0.05
538	0.07
539	0.08
540	0.09
541	0.13
542	0.2
543	0.31
544	0.4
545	0.44
546	0.51
547	0.61
548	0.69
549	0.74
550	0.78
551	0.78
552	0.77
553	0.78
554	0.73
555	0.66
556	0.57
557	0.48
558	0.38
559	0.28
560	0.22
561	0.17
562	0.14
563	0.14
564	0.14
565	0.2
566	0.27
567	0.31
568	0.39
569	0.5
570	0.59
571	0.66
572	0.75
573	0.79
574	0.81
575	0.88
576	0.87
577	0.88
578	0.85
579	0.82
580	0.79
581	0.71
582	0.68
583	0.58
584	0.5
585	0.38
586	0.32
587	0.24
588	0.19
589	0.16
590	0.09
591	0.08
592	0.09
593	0.12
594	0.12
595	0.13
596	0.14
597	0.18
598	0.17
599	0.18
600	0.18
601	0.16
602	0.18
603	0.17
604	0.16
605	0.13
606	0.15
607	0.17
608	0.19
609	0.23
610	0.29
611	0.4
612	0.5
613	0.59
614	0.65
615	0.74
616	0.82
617	0.89
618	0.92
619	0.93
620	0.93
621	0.93
622	0.95
623	0.95
624	0.95
625	0.93
626	0.89
627	0.87
628	0.84
629	0.76
630	0.65
631	0.55
632	0.45
633	0.36
634	0.29
635	0.19
636	0.13
637	0.11
638	0.1

A0A0L0SNB8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer