Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0S9C8

Protein Details
Accession A0A0L0S9C8    Localization Confidence High Confidence Score 16.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-119IRRARELERERRERRERSRSRSRDRERNWRGRDRSRSPRRRRDDEDKGEDBasic
315-335GPPGRAAIKFRPRRLWRDRQRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
71-113RRARELERERRERRERSRSRSRDRERNWRGRDRSRSPRRRRDD
319-335RAAIKFRPRRLWRDRQR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MDYRRRDRRSAPAPPPSRSSRDYGRSSRDRDYPSRRTDDYDRARPSSSNADDGAPQYDEFGRVIDRAEVIRRARELERERRERRERSRSRSRDRERNWRGRDRSRSPRRRRDDEDKGEDGAKEKKVEEETKAATTEPAAPEVPEESMEELDEEEQMRRLMGFGGFETTKGPAGTLAESRVDAPVDELLSDATMREMLAQSGWGGGMMQPPPPSRAGQSTSLVREEDTVMDPLAANVRPPQEVFDFIFGAAVAARVGHGVAEDEHAPVVVGDAIVDDAYGIEDAARVRPKMKQTNVTEYTRVDERDVEAVATANAGPPGRAAIKFRPRRLWRDRQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.75
3 0.71
4 0.68
5 0.6
6 0.57
7 0.55
8 0.57
9 0.61
10 0.62
11 0.65
12 0.67
13 0.69
14 0.69
15 0.68
16 0.67
17 0.68
18 0.7
19 0.7
20 0.69
21 0.71
22 0.66
23 0.65
24 0.64
25 0.65
26 0.65
27 0.65
28 0.63
29 0.59
30 0.59
31 0.53
32 0.51
33 0.5
34 0.43
35 0.37
36 0.32
37 0.3
38 0.3
39 0.31
40 0.29
41 0.2
42 0.17
43 0.16
44 0.15
45 0.15
46 0.14
47 0.13
48 0.11
49 0.11
50 0.12
51 0.11
52 0.11
53 0.12
54 0.16
55 0.21
56 0.22
57 0.25
58 0.25
59 0.28
60 0.29
61 0.36
62 0.41
63 0.46
64 0.54
65 0.61
66 0.66
67 0.72
68 0.79
69 0.8
70 0.82
71 0.82
72 0.82
73 0.81
74 0.86
75 0.86
76 0.88
77 0.89
78 0.88
79 0.87
80 0.85
81 0.87
82 0.86
83 0.86
84 0.84
85 0.83
86 0.82
87 0.81
88 0.84
89 0.81
90 0.82
91 0.83
92 0.86
93 0.86
94 0.89
95 0.88
96 0.87
97 0.86
98 0.85
99 0.85
100 0.83
101 0.8
102 0.71
103 0.64
104 0.56
105 0.48
106 0.4
107 0.34
108 0.27
109 0.21
110 0.19
111 0.21
112 0.24
113 0.26
114 0.27
115 0.27
116 0.27
117 0.27
118 0.27
119 0.23
120 0.19
121 0.17
122 0.18
123 0.14
124 0.13
125 0.12
126 0.11
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.08
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.06
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.04
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.07
193 0.07
194 0.09
195 0.11
196 0.12
197 0.15
198 0.16
199 0.16
200 0.16
201 0.2
202 0.21
203 0.23
204 0.25
205 0.27
206 0.28
207 0.28
208 0.27
209 0.22
210 0.2
211 0.17
212 0.15
213 0.13
214 0.12
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.11
220 0.09
221 0.08
222 0.11
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.16
227 0.15
228 0.18
229 0.18
230 0.18
231 0.17
232 0.16
233 0.16
234 0.12
235 0.11
236 0.08
237 0.07
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.03
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.03
263 0.03
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.03
268 0.05
269 0.06
270 0.11
271 0.15
272 0.16
273 0.18
274 0.24
275 0.33
276 0.42
277 0.49
278 0.53
279 0.57
280 0.66
281 0.71
282 0.7
283 0.63
284 0.54
285 0.51
286 0.46
287 0.4
288 0.31
289 0.27
290 0.25
291 0.25
292 0.24
293 0.2
294 0.16
295 0.15
296 0.13
297 0.12
298 0.1
299 0.08
300 0.1
301 0.1
302 0.09
303 0.09
304 0.13
305 0.16
306 0.18
307 0.22
308 0.3
309 0.41
310 0.5
311 0.58
312 0.65
313 0.69
314 0.78
315 0.82