Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0SS37

Protein Details
Accession A0A0L0SS37    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-218DDASGDADRKKRKRKLSQSAAKEEPAHydrophilic
236-262AVEAAGKKDKKKKSKATNDGEKSSKKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
179-188KKSKKSAKKA
200-208DRKKRKRKL
241-265GKKDKKKKSKATNDGEKSSKKRKKE
Subcellular Location(s) cyto 18, cyto_nucl 11.833, cyto_mito 10.333, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MHFHISAELLAFAPTAGARLTGVINKQSPSHIGLLVYNLFNASIPAAQLPDGAFTFQFDDTAAYAPTGENDVDDGAPRFNKGGKKAMINGNWIHAASGSVLEPGHALDFVVTEVVKSHDFISMKGTLVGVEYVPPPPTAVPTTPAAGTTSQRITFGDDDEDEEAMDVEPATTTSAETSKKSKKSAKKAEADGDDASGDADRKKRKRKLSQSAAKEEPADDAAAQQPVEAAALAPAAVEAAGKKDKKKKSKATNDGEKSSKKRKKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.06
4 0.06
5 0.06
6 0.07
7 0.09
8 0.12
9 0.15
10 0.2
11 0.22
12 0.23
13 0.24
14 0.25
15 0.26
16 0.26
17 0.25
18 0.21
19 0.19
20 0.19
21 0.21
22 0.21
23 0.19
24 0.16
25 0.13
26 0.12
27 0.11
28 0.1
29 0.08
30 0.06
31 0.06
32 0.07
33 0.08
34 0.08
35 0.09
36 0.08
37 0.1
38 0.09
39 0.1
40 0.09
41 0.09
42 0.12
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.11
49 0.1
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.08
56 0.06
57 0.07
58 0.08
59 0.07
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.1
66 0.14
67 0.18
68 0.2
69 0.28
70 0.29
71 0.32
72 0.37
73 0.44
74 0.42
75 0.42
76 0.38
77 0.33
78 0.31
79 0.27
80 0.22
81 0.14
82 0.12
83 0.08
84 0.08
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.04
93 0.04
94 0.03
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.03
100 0.04
101 0.06
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.1
106 0.11
107 0.11
108 0.14
109 0.14
110 0.14
111 0.13
112 0.13
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.06
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.12
136 0.13
137 0.12
138 0.13
139 0.13
140 0.15
141 0.14
142 0.14
143 0.13
144 0.11
145 0.12
146 0.13
147 0.12
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.06
152 0.06
153 0.04
154 0.03
155 0.03
156 0.04
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.09
162 0.11
163 0.13
164 0.2
165 0.27
166 0.31
167 0.38
168 0.46
169 0.53
170 0.62
171 0.72
172 0.74
173 0.74
174 0.75
175 0.76
176 0.7
177 0.63
178 0.52
179 0.42
180 0.32
181 0.24
182 0.19
183 0.12
184 0.1
185 0.1
186 0.15
187 0.24
188 0.33
189 0.43
190 0.51
191 0.62
192 0.72
193 0.8
194 0.86
195 0.88
196 0.89
197 0.88
198 0.88
199 0.81
200 0.72
201 0.62
202 0.51
203 0.41
204 0.32
205 0.24
206 0.15
207 0.13
208 0.14
209 0.14
210 0.13
211 0.11
212 0.1
213 0.09
214 0.1
215 0.08
216 0.06
217 0.04
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.03
224 0.04
225 0.04
226 0.09
227 0.16
228 0.19
229 0.27
230 0.37
231 0.47
232 0.57
233 0.68
234 0.74
235 0.78
236 0.87
237 0.9
238 0.92
239 0.93
240 0.9
241 0.87
242 0.84
243 0.81
244 0.78
245 0.78