Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0T8P4

Protein Details
Accession A0A0L0T8P4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-77AEPTAHREPRERRPRHKRAPLTDAERIBasic
247-267GEPRERQPRPRGPSKKERLVTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-68REPRERRPRHKR
196-264KQKRGARKPKTPRAQHGDGEHHAGKPATAEGGEPGSVRRARKPRPATAGEGGEPRERQPRPRGPSKKER
Subcellular Location(s) mito 16.5, cyto_mito 12, cyto 6.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MTESATSPARPKSPVRPAAAAAAATASTSPTQTPLPKSPSPTKTLTSDAPAEPTAHREPRERRPRHKRAPLTDAERIEQDTRRVFVGKLPFKVTIGEVRAHFAAAGAVDDVHLVKKATPERPQGFGFVLFKDAKAVEVAVAQLNGSDLKGANLDVQRIDPERAARKAEARAKAIAEGHIQPRNHHQANDTDGGELKQKRGARKPKTPRAQHGDGEHHAGKPATAEGGEPGSVRRARKPRPATAGEGGEPRERQPRPRGPSKKERLVTDGIPRPKTLYVSNVDKSVDDAALRAFFEKAGYAVTSATITFTRSGLHRQFAFVELGSEKEVEDAVEKLAGADLAGKSIGLKRALMLPPREKPAAAEGEQAAVAAEAHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.6
3 0.59
4 0.57
5 0.57
6 0.54
7 0.43
8 0.32
9 0.25
10 0.19
11 0.15
12 0.13
13 0.09
14 0.08
15 0.09
16 0.09
17 0.1
18 0.15
19 0.2
20 0.27
21 0.33
22 0.4
23 0.43
24 0.5
25 0.58
26 0.59
27 0.59
28 0.57
29 0.53
30 0.5
31 0.5
32 0.46
33 0.41
34 0.4
35 0.35
36 0.34
37 0.31
38 0.29
39 0.25
40 0.28
41 0.31
42 0.32
43 0.34
44 0.39
45 0.46
46 0.55
47 0.65
48 0.68
49 0.72
50 0.78
51 0.86
52 0.89
53 0.92
54 0.91
55 0.88
56 0.88
57 0.86
58 0.82
59 0.78
60 0.69
61 0.6
62 0.51
63 0.46
64 0.4
65 0.34
66 0.31
67 0.27
68 0.26
69 0.26
70 0.26
71 0.23
72 0.25
73 0.33
74 0.34
75 0.34
76 0.37
77 0.36
78 0.35
79 0.36
80 0.32
81 0.28
82 0.24
83 0.24
84 0.21
85 0.23
86 0.22
87 0.21
88 0.19
89 0.13
90 0.11
91 0.07
92 0.07
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.13
103 0.19
104 0.24
105 0.31
106 0.4
107 0.42
108 0.46
109 0.45
110 0.42
111 0.37
112 0.34
113 0.29
114 0.2
115 0.21
116 0.17
117 0.17
118 0.16
119 0.15
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.09
139 0.1
140 0.11
141 0.1
142 0.11
143 0.12
144 0.14
145 0.15
146 0.12
147 0.16
148 0.2
149 0.21
150 0.23
151 0.23
152 0.24
153 0.31
154 0.36
155 0.36
156 0.34
157 0.33
158 0.31
159 0.32
160 0.29
161 0.23
162 0.19
163 0.17
164 0.19
165 0.22
166 0.21
167 0.2
168 0.26
169 0.33
170 0.32
171 0.3
172 0.27
173 0.26
174 0.3
175 0.32
176 0.26
177 0.18
178 0.18
179 0.18
180 0.21
181 0.19
182 0.15
183 0.16
184 0.19
185 0.24
186 0.33
187 0.43
188 0.46
189 0.56
190 0.66
191 0.72
192 0.79
193 0.8
194 0.79
195 0.77
196 0.74
197 0.67
198 0.62
199 0.57
200 0.48
201 0.47
202 0.4
203 0.31
204 0.27
205 0.23
206 0.18
207 0.13
208 0.12
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.07
217 0.11
218 0.14
219 0.16
220 0.23
221 0.31
222 0.37
223 0.48
224 0.54
225 0.57
226 0.62
227 0.64
228 0.62
229 0.58
230 0.54
231 0.45
232 0.41
233 0.35
234 0.3
235 0.27
236 0.23
237 0.27
238 0.26
239 0.31
240 0.39
241 0.46
242 0.51
243 0.61
244 0.69
245 0.69
246 0.79
247 0.81
248 0.81
249 0.76
250 0.71
251 0.66
252 0.6
253 0.55
254 0.53
255 0.52
256 0.49
257 0.46
258 0.43
259 0.4
260 0.38
261 0.36
262 0.29
263 0.27
264 0.26
265 0.32
266 0.33
267 0.33
268 0.31
269 0.29
270 0.28
271 0.25
272 0.19
273 0.12
274 0.11
275 0.1
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.08
293 0.09
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.13
298 0.21
299 0.24
300 0.29
301 0.28
302 0.29
303 0.31
304 0.31
305 0.31
306 0.23
307 0.21
308 0.16
309 0.17
310 0.16
311 0.14
312 0.12
313 0.11
314 0.11
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.08
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.09
323 0.08
324 0.07
325 0.1
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.1
331 0.14
332 0.19
333 0.17
334 0.17
335 0.17
336 0.26
337 0.31
338 0.37
339 0.41
340 0.45
341 0.49
342 0.55
343 0.56
344 0.48
345 0.45
346 0.46
347 0.45
348 0.38
349 0.37
350 0.31
351 0.31
352 0.31
353 0.28
354 0.2
355 0.13