FuNGI

A0A0L0T0C1

Protein Details

Accession

A0A0L0T0C1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
25-48	AVPAPSAQSRKRRTRDPDSDDSDA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
4-37	RSKRTPTRRAPAAAPAPPKARAVPAPSAQSRKRR
336-355	KRRFVPSKWEHKKVMKIVRA

Subcellular Location(s)

mito 21.5, cyto_mito 12.833, cyto 3, cyto_nucl 2.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR028598 BOP1/Erb1 IPR012953 BOP1_N_dom IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005654 C:nucleoplasm GO:0030687 C:preribosome, large subunit precursor GO:0043021 F:ribonucleoprotein complex binding GO:0000466 P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000463 P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF08145 BOP1NT PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MAGRSKRTPTRRAPAAAPAPPKARAVPAPSAQSRKRRTRDPDSDDSDATAAPQAPSSATSAADDDSEDDDDFMAAEIDGGSDSDSDPGSDAGDDDEDEEGDERYAAIDALTPEQFMRIAGPILKERLPYLAKQLAELSDGELDGEGDDEYRPDGDSDEDDAAMDGDDEDDDKEGEDDEEDEDEDEEDAGSDSDEDDERVEAGPKIIPGPEIIPDTDSDDSDADLDHVNTVGNVPMEWYNDYPHIGYDLDGKKVMKPAVGDELDKFLSKMDDPKYWTSVHDKQDQKDVELTEDELAIIQKLQKAEYAADGFDPYQPTVEWFTSKTEIHPLSAAPEPKRRFVPSKWEHKKVMKIVRAIRNGWIVPNKPKAEKPKYFDIWGADTAESRDDHPMHLPAPKMALPGHIESYNPPEEYLFTEEEKQAWLDADPEDRKIDFIPQKFTSLRAVPAYDQFTQNRFQRCLDLYLCPRVRRNRIEVDPDSLIPRLPDPKDLEPFPTALSIAFRGHTGAVRSFALSPTGQFMLSGSDDGALRLWEVATARCLQVWTLGEPVVSVAWNPSKSVAVAAVAFGQDVAILNLGSTTVAFGVATDAKTAKTTTTMLAGDAAPVAAANSASGQRLAPKCEWRRPTRALAAQGVAWTVHHGKPVATVAWHRKGDYFVTTTPNHGAASVMVHQLARKQSQQPFKKNKGLVITAQFHPTKPHLLVATQRYVRIYDLVAQDIVKKLTSGVKWISSMDQHPSGDHVIVGAYDRRLCWWDLELGVKPYKTLRYHQQALRSVAFHPSYPLFASSSDDGTIQIFHGMVYADLMTNPLIVPVKILRAHAPVNSLGALNLRWHPTQPWLISSGADGVIKLWT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.72
2	0.72
3	0.69
4	0.65
5	0.61
6	0.56
7	0.53
8	0.52
9	0.44
10	0.41
11	0.39
12	0.4
13	0.42
14	0.43
15	0.49
16	0.53
17	0.6
18	0.62
19	0.67
20	0.7
21	0.73
22	0.75
23	0.77
24	0.8
25	0.82
26	0.85
27	0.84
28	0.84
29	0.81
30	0.78
31	0.68
32	0.6
33	0.5
34	0.39
35	0.31
36	0.24
37	0.18
38	0.14
39	0.14
40	0.13
41	0.12
42	0.14
43	0.16
44	0.13
45	0.13
46	0.13
47	0.14
48	0.14
49	0.13
50	0.13
51	0.12
52	0.13
53	0.14
54	0.13
55	0.12
56	0.12
57	0.11
58	0.11
59	0.09
60	0.07
61	0.05
62	0.05
63	0.05
64	0.05
65	0.05
66	0.05
67	0.05
68	0.05
69	0.06
70	0.07
71	0.07
72	0.07
73	0.08
74	0.08
75	0.08
76	0.08
77	0.08
78	0.08
79	0.09
80	0.08
81	0.09
82	0.09
83	0.08
84	0.09
85	0.09
86	0.08
87	0.08
88	0.08
89	0.06
90	0.07
91	0.07
92	0.06
93	0.06
94	0.08
95	0.09
96	0.12
97	0.13
98	0.12
99	0.12
100	0.13
101	0.13
102	0.1
103	0.11
104	0.09
105	0.11
106	0.13
107	0.16
108	0.19
109	0.22
110	0.24
111	0.23
112	0.22
113	0.27
114	0.27
115	0.25
116	0.29
117	0.31
118	0.29
119	0.3
120	0.31
121	0.25
122	0.25
123	0.23
124	0.17
125	0.13
126	0.13
127	0.11
128	0.09
129	0.08
130	0.07
131	0.07
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.05
136	0.06
137	0.06
138	0.07
139	0.07
140	0.08
141	0.09
142	0.11
143	0.13
144	0.14
145	0.13
146	0.13
147	0.12
148	0.12
149	0.1
150	0.08
151	0.05
152	0.04
153	0.04
154	0.05
155	0.05
156	0.06
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.06
161	0.07
162	0.07
163	0.07
164	0.08
165	0.08
166	0.08
167	0.08
168	0.08
169	0.08
170	0.08
171	0.07
172	0.06
173	0.06
174	0.06
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.06
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.07
184	0.08
185	0.08
186	0.1
187	0.09
188	0.1
189	0.11
190	0.1
191	0.11
192	0.11
193	0.11
194	0.1
195	0.11
196	0.13
197	0.13
198	0.13
199	0.13
200	0.13
201	0.16
202	0.16
203	0.15
204	0.13
205	0.12
206	0.11
207	0.11
208	0.1
209	0.08
210	0.08
211	0.08
212	0.07
213	0.07
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.07
218	0.06
219	0.06
220	0.07
221	0.09
222	0.1
223	0.12
224	0.12
225	0.13
226	0.14
227	0.15
228	0.14
229	0.13
230	0.13
231	0.11
232	0.11
233	0.17
234	0.18
235	0.19
236	0.21
237	0.21
238	0.21
239	0.26
240	0.26
241	0.19
242	0.18
243	0.19
244	0.24
245	0.25
246	0.24
247	0.2
248	0.23
249	0.22
250	0.21
251	0.19
252	0.12
253	0.12
254	0.12
255	0.17
256	0.17
257	0.21
258	0.25
259	0.28
260	0.3
261	0.29
262	0.31
263	0.33
264	0.37
265	0.38
266	0.43
267	0.45
268	0.43
269	0.51
270	0.5
271	0.44
272	0.4
273	0.35
274	0.28
275	0.24
276	0.23
277	0.15
278	0.14
279	0.12
280	0.09
281	0.08
282	0.06
283	0.06
284	0.07
285	0.08
286	0.09
287	0.09
288	0.1
289	0.11
290	0.12
291	0.14
292	0.14
293	0.12
294	0.12
295	0.12
296	0.11
297	0.12
298	0.13
299	0.1
300	0.09
301	0.09
302	0.11
303	0.13
304	0.13
305	0.13
306	0.12
307	0.15
308	0.18
309	0.18
310	0.17
311	0.21
312	0.21
313	0.21
314	0.2
315	0.17
316	0.17
317	0.21
318	0.24
319	0.2
320	0.28
321	0.29
322	0.31
323	0.35
324	0.36
325	0.38
326	0.37
327	0.45
328	0.45
329	0.55
330	0.59
331	0.62
332	0.64
333	0.63
334	0.67
335	0.65
336	0.65
337	0.59
338	0.57
339	0.59
340	0.62
341	0.61
342	0.55
343	0.49
344	0.43
345	0.38
346	0.35
347	0.32
348	0.26
349	0.28
350	0.35
351	0.35
352	0.34
353	0.39
354	0.46
355	0.51
356	0.54
357	0.53
358	0.55
359	0.55
360	0.54
361	0.51
362	0.43
363	0.36
364	0.31
365	0.28
366	0.18
367	0.16
368	0.15
369	0.14
370	0.12
371	0.1
372	0.12
373	0.11
374	0.12
375	0.13
376	0.14
377	0.13
378	0.16
379	0.15
380	0.12
381	0.14
382	0.13
383	0.13
384	0.12
385	0.13
386	0.13
387	0.14
388	0.15
389	0.13
390	0.13
391	0.12
392	0.17
393	0.17
394	0.14
395	0.13
396	0.12
397	0.12
398	0.14
399	0.16
400	0.13
401	0.12
402	0.14
403	0.14
404	0.14
405	0.14
406	0.12
407	0.09
408	0.08
409	0.07
410	0.06
411	0.07
412	0.11
413	0.11
414	0.12
415	0.13
416	0.13
417	0.13
418	0.12
419	0.18
420	0.19
421	0.2
422	0.25
423	0.25
424	0.29
425	0.29
426	0.3
427	0.26
428	0.22
429	0.22
430	0.17
431	0.18
432	0.15
433	0.18
434	0.21
435	0.18
436	0.2
437	0.19
438	0.2
439	0.24
440	0.28
441	0.29
442	0.27
443	0.26
444	0.27
445	0.27
446	0.3
447	0.26
448	0.27
449	0.25
450	0.32
451	0.34
452	0.33
453	0.37
454	0.4
455	0.46
456	0.45
457	0.49
458	0.48
459	0.49
460	0.55
461	0.51
462	0.48
463	0.42
464	0.37
465	0.33
466	0.25
467	0.21
468	0.14
469	0.14
470	0.15
471	0.14
472	0.18
473	0.21
474	0.25
475	0.29
476	0.29
477	0.3
478	0.26
479	0.26
480	0.22
481	0.17
482	0.14
483	0.1
484	0.1
485	0.09
486	0.09
487	0.08
488	0.08
489	0.08
490	0.09
491	0.1
492	0.11
493	0.1
494	0.11
495	0.11
496	0.12
497	0.12
498	0.12
499	0.12
500	0.1
501	0.1
502	0.1
503	0.11
504	0.1
505	0.09
506	0.09
507	0.09
508	0.09
509	0.09
510	0.07
511	0.07
512	0.07
513	0.07
514	0.08
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.06
521	0.06
522	0.08
523	0.09
524	0.09
525	0.09
526	0.1
527	0.09
528	0.12
529	0.13
530	0.12
531	0.12
532	0.12
533	0.11
534	0.11
535	0.11
536	0.08
537	0.07
538	0.05
539	0.06
540	0.09
541	0.1
542	0.1
543	0.11
544	0.11
545	0.12
546	0.12
547	0.1
548	0.08
549	0.08
550	0.08
551	0.07
552	0.07
553	0.06
554	0.05
555	0.05
556	0.04
557	0.04
558	0.04
559	0.04
560	0.03
561	0.04
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.03
566	0.03
567	0.03
568	0.03
569	0.03
570	0.03
571	0.05
572	0.07
573	0.07
574	0.08
575	0.08
576	0.09
577	0.1
578	0.11
579	0.09
580	0.1
581	0.11
582	0.11
583	0.14
584	0.14
585	0.13
586	0.14
587	0.13
588	0.11
589	0.1
590	0.09
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.03
595	0.03
596	0.03
597	0.04
598	0.06
599	0.06
600	0.07
601	0.07
602	0.14
603	0.16
604	0.21
605	0.24
606	0.33
607	0.4
608	0.48
609	0.56
610	0.56
611	0.62
612	0.64
613	0.67
614	0.65
615	0.64
616	0.59
617	0.54
618	0.48
619	0.41
620	0.35
621	0.28
622	0.2
623	0.14
624	0.12
625	0.13
626	0.13
627	0.14
628	0.15
629	0.14
630	0.17
631	0.19
632	0.17
633	0.15
634	0.21
635	0.27
636	0.35
637	0.36
638	0.34
639	0.34
640	0.35
641	0.35
642	0.33
643	0.29
644	0.22
645	0.27
646	0.27
647	0.28
648	0.27
649	0.26
650	0.22
651	0.18
652	0.17
653	0.11
654	0.14
655	0.14
656	0.13
657	0.12
658	0.12
659	0.12
660	0.16
661	0.21
662	0.21
663	0.24
664	0.31
665	0.38
666	0.48
667	0.58
668	0.64
669	0.7
670	0.75
671	0.79
672	0.74
673	0.71
674	0.68
675	0.62
676	0.57
677	0.54
678	0.5
679	0.43
680	0.47
681	0.43
682	0.36
683	0.37
684	0.33
685	0.31
686	0.27
687	0.29
688	0.24
689	0.26
690	0.32
691	0.34
692	0.4
693	0.37
694	0.37
695	0.34
696	0.34
697	0.33
698	0.27
699	0.23
700	0.2
701	0.2
702	0.21
703	0.2
704	0.19
705	0.21
706	0.22
707	0.21
708	0.15
709	0.13
710	0.13
711	0.19
712	0.19
713	0.23
714	0.23
715	0.25
716	0.26
717	0.27
718	0.29
719	0.26
720	0.28
721	0.28
722	0.29
723	0.27
724	0.26
725	0.28
726	0.27
727	0.23
728	0.2
729	0.15
730	0.1
731	0.1
732	0.12
733	0.12
734	0.12
735	0.13
736	0.14
737	0.16
738	0.18
739	0.19
740	0.19
741	0.19
742	0.2
743	0.2
744	0.24
745	0.26
746	0.28
747	0.31
748	0.29
749	0.27
750	0.28
751	0.34
752	0.34
753	0.37
754	0.42
755	0.48
756	0.57
757	0.6
758	0.65
759	0.65
760	0.67
761	0.64
762	0.55
763	0.46
764	0.45
765	0.42
766	0.33
767	0.3
768	0.25
769	0.24
770	0.24
771	0.24
772	0.18
773	0.17
774	0.22
775	0.19
776	0.2
777	0.18
778	0.17
779	0.16
780	0.16
781	0.16
782	0.11
783	0.11
784	0.09
785	0.08
786	0.09
787	0.08
788	0.07
789	0.08
790	0.08
791	0.07
792	0.07
793	0.09
794	0.08
795	0.08
796	0.08
797	0.1
798	0.11
799	0.1
800	0.13
801	0.14
802	0.21
803	0.22
804	0.25
805	0.25
806	0.29
807	0.32
808	0.31
809	0.32
810	0.27
811	0.27
812	0.26
813	0.22
814	0.18
815	0.17
816	0.16
817	0.16
818	0.2
819	0.22
820	0.22
821	0.24
822	0.26
823	0.31
824	0.38
825	0.37
826	0.35
827	0.33
828	0.33
829	0.31
830	0.3
831	0.26
832	0.2
833	0.17
834	0.14

A0A0L0T0C1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer