Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0RYJ0

Protein Details
Accession A0A0L0RYJ0    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
140-196GIPPSPRRRTPSRDRGSRRRTPSRDRSSRRRSPSRDLSSRRRTPSRDRSSRRRSVSHBasic
204-229RDRSPPPRSRSRTRSRSRGRGRARENBasic
340-364PDRRRTPSPDTDRYRKRPRHDDGSDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
142-227PPSPRRRTPSRDRGSRRRTPSRDRSSRRRSPSRDLSSRRRTPSRDRSSRRRSVSHERSRAQSRDRSPPPRSRSRTRSRSRGRGRAR
Subcellular Location(s) mito 9, nucl 8, cyto_mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR006509  RBM39_SF  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MTNALGAGQGTAPAAPAAPALAAQAAQARPADGISPDDMILHLRVRISSNGISVLPPSVERPLVSDIDPAAHAGTAPHTEHLSAIMALIAAATRGPAGSSNSGVPPQVLSALSTRPSGAQMTPTGPPSLPPSLMNRSAAGIPPSPRRRTPSRDRGSRRRTPSRDRSSRRRSPSRDLSSRRRTPSRDRSSRRRSVSHERSRAQSRDRSPPPRSRSRTRSRSRGRGRARENLPAGPEAEAMLDQRWCLSVGNLPFDVHKDEVLRAFSSVGKVAALQFLYRPERNMAFAGWAFLWMANEDGYQRALGMNRTNIGGRSVNVGHRRRTTDFQGSPVRLLIRPPTPDRRRTPSPDTDRYRKRPRHDDGSDMPGTLMTPPTTASAAHSSSGATAAVAAPPSATAAQAPSGAPLTLENLPEGLTRLMVFEEACKTGPVNFVDWGGPDGTVPRYCVVYFRYMDDARRALPKLDQRRVLGAVLRAYLGTPASTPAAAAGVGVPGAAAPMSPVGSANGARMG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.06
3 0.06
4 0.06
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.06
9 0.06
10 0.07
11 0.12
12 0.12
13 0.14
14 0.14
15 0.14
16 0.14
17 0.14
18 0.15
19 0.11
20 0.14
21 0.13
22 0.14
23 0.14
24 0.13
25 0.13
26 0.14
27 0.15
28 0.13
29 0.13
30 0.13
31 0.15
32 0.17
33 0.19
34 0.22
35 0.22
36 0.22
37 0.22
38 0.22
39 0.21
40 0.19
41 0.18
42 0.14
43 0.13
44 0.14
45 0.15
46 0.15
47 0.15
48 0.18
49 0.2
50 0.21
51 0.21
52 0.22
53 0.19
54 0.19
55 0.19
56 0.16
57 0.13
58 0.1
59 0.1
60 0.08
61 0.1
62 0.12
63 0.12
64 0.13
65 0.14
66 0.14
67 0.14
68 0.15
69 0.14
70 0.1
71 0.09
72 0.08
73 0.07
74 0.07
75 0.06
76 0.05
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.03
81 0.03
82 0.04
83 0.06
84 0.09
85 0.11
86 0.13
87 0.15
88 0.17
89 0.18
90 0.18
91 0.16
92 0.13
93 0.12
94 0.12
95 0.1
96 0.1
97 0.11
98 0.13
99 0.14
100 0.15
101 0.14
102 0.13
103 0.15
104 0.15
105 0.14
106 0.15
107 0.16
108 0.18
109 0.19
110 0.2
111 0.2
112 0.18
113 0.19
114 0.2
115 0.21
116 0.2
117 0.19
118 0.24
119 0.28
120 0.31
121 0.31
122 0.26
123 0.25
124 0.25
125 0.25
126 0.22
127 0.2
128 0.21
129 0.29
130 0.36
131 0.39
132 0.42
133 0.46
134 0.52
135 0.57
136 0.65
137 0.66
138 0.69
139 0.75
140 0.8
141 0.85
142 0.86
143 0.86
144 0.85
145 0.84
146 0.82
147 0.82
148 0.84
149 0.84
150 0.86
151 0.85
152 0.87
153 0.86
154 0.87
155 0.87
156 0.86
157 0.81
158 0.8
159 0.83
160 0.81
161 0.81
162 0.79
163 0.8
164 0.8
165 0.81
166 0.78
167 0.74
168 0.71
169 0.71
170 0.75
171 0.75
172 0.76
173 0.76
174 0.81
175 0.84
176 0.87
177 0.82
178 0.76
179 0.72
180 0.73
181 0.75
182 0.75
183 0.74
184 0.67
185 0.68
186 0.69
187 0.66
188 0.6
189 0.57
190 0.52
191 0.53
192 0.59
193 0.62
194 0.61
195 0.66
196 0.68
197 0.71
198 0.73
199 0.72
200 0.73
201 0.76
202 0.8
203 0.78
204 0.82
205 0.8
206 0.84
207 0.83
208 0.84
209 0.82
210 0.81
211 0.78
212 0.77
213 0.71
214 0.68
215 0.61
216 0.52
217 0.45
218 0.36
219 0.31
220 0.22
221 0.19
222 0.11
223 0.09
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.09
235 0.1
236 0.13
237 0.13
238 0.13
239 0.12
240 0.13
241 0.15
242 0.11
243 0.11
244 0.09
245 0.1
246 0.11
247 0.13
248 0.12
249 0.1
250 0.11
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.08
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.07
260 0.06
261 0.07
262 0.11
263 0.15
264 0.15
265 0.16
266 0.17
267 0.17
268 0.19
269 0.19
270 0.15
271 0.13
272 0.13
273 0.12
274 0.1
275 0.09
276 0.08
277 0.07
278 0.07
279 0.05
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.09
291 0.11
292 0.12
293 0.12
294 0.13
295 0.14
296 0.13
297 0.15
298 0.13
299 0.11
300 0.14
301 0.15
302 0.2
303 0.28
304 0.32
305 0.34
306 0.37
307 0.42
308 0.42
309 0.45
310 0.45
311 0.46
312 0.44
313 0.45
314 0.48
315 0.44
316 0.4
317 0.38
318 0.33
319 0.24
320 0.25
321 0.23
322 0.21
323 0.24
324 0.29
325 0.39
326 0.43
327 0.51
328 0.56
329 0.6
330 0.63
331 0.66
332 0.68
333 0.68
334 0.7
335 0.72
336 0.74
337 0.75
338 0.77
339 0.79
340 0.82
341 0.8
342 0.79
343 0.8
344 0.8
345 0.8
346 0.74
347 0.72
348 0.65
349 0.65
350 0.57
351 0.47
352 0.39
353 0.28
354 0.25
355 0.18
356 0.15
357 0.08
358 0.07
359 0.08
360 0.09
361 0.1
362 0.09
363 0.12
364 0.14
365 0.15
366 0.15
367 0.15
368 0.13
369 0.13
370 0.14
371 0.11
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.06
378 0.05
379 0.05
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.08
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.1
390 0.1
391 0.09
392 0.09
393 0.11
394 0.12
395 0.13
396 0.12
397 0.11
398 0.12
399 0.12
400 0.14
401 0.1
402 0.09
403 0.08
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.09
409 0.12
410 0.13
411 0.14
412 0.14
413 0.14
414 0.15
415 0.21
416 0.2
417 0.19
418 0.19
419 0.19
420 0.2
421 0.2
422 0.19
423 0.14
424 0.12
425 0.1
426 0.11
427 0.14
428 0.14
429 0.15
430 0.15
431 0.16
432 0.17
433 0.2
434 0.21
435 0.24
436 0.24
437 0.26
438 0.32
439 0.33
440 0.36
441 0.38
442 0.37
443 0.33
444 0.38
445 0.36
446 0.31
447 0.36
448 0.43
449 0.48
450 0.54
451 0.57
452 0.54
453 0.57
454 0.58
455 0.53
456 0.47
457 0.41
458 0.35
459 0.29
460 0.27
461 0.22
462 0.2
463 0.19
464 0.15
465 0.11
466 0.09
467 0.1
468 0.11
469 0.11
470 0.11
471 0.1
472 0.1
473 0.09
474 0.09
475 0.07
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.05
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.03
484 0.04
485 0.05
486 0.06
487 0.07
488 0.08
489 0.09
490 0.12
491 0.12