Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B2W1U9

Protein Details
Accession B2W1U9    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-23DDTKSKKRKGASEAAPKAKKBasic
64-85VAEAVKPKKGKKSKAATKVDEVHydrophilic
121-143VEAPKEKVKKTKKTKTADAAPAEHydrophilic
493-519VTEPIADKKTKKDKKRKSDVALDTPAAHydrophilic
529-551AVAEPARKSKRTKKEILPTPELIHydrophilic
560-583NVVEDKKKKTKAVAKPKKAKKAKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-26KSKKRKGASEAAPKAKKARK
69-78KPKKGKKSKA
103-111PKKQGKKAK
126-133EKVKKTKK
158-166PKKAKAAKK
438-448PKGKKGKKAAK
468-478AKKGKKATKAK
500-509KKTKKDKKRK
538-538K
565-583KKKKTKAVAKPKKAKKAKA
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAADDTKSKKRKGASEAAPKAKKARKSDDVAAVVADAKPTRKSARKQAADFMEIDDVVEEEAPVAEAVKPKKGKKSKAATKVDEVAAEPVAEAVEVTEVQEKPKKQGKKAKAAVTEETVVVEAPKEKVKKTKKTKTADAAPAEETTTVVKETITVTKPKKAKAAKKQEAPEPEVQVTEVAVVEDAAEDAEGAEDAEDAEDAAEDDQTAALLAGFSDDDTDADDDLNFDEDAKVPKLSAKQRKAIKEAENAPKSNQPGVIYVGRVPRGFFESQMKKYFSQFGKVNKLRLSRNKKTGASKHYAFVEFQSQEVADIVARTMNNYLLFGHILKVHLIPTDQVHPDLFKGGKDRFKVDPRNKKAGLEMERGAERAQWEKRVETENKRRTSKAKELKETFDYEFEAPALKTVDSVPKQTTLKAAEPQQLLTETLAEEAPVAEAPKGKKGKKAAKAGVESTETLTVTEAVSPAPAKKGKKATKAKAAEEPTVAVEQVTVVTEPIADKKTKKDKKRKSDVALDTPAATVTEEEEPAAVAEPARKSKRTKKEILPTPELIAEEEEEEDNVVEDKKKKTKAVAKPKKAKKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.72
3 0.78
4 0.83
5 0.8
6 0.73
7 0.74
8 0.71
9 0.68
10 0.66
11 0.66
12 0.65
13 0.68
14 0.74
15 0.73
16 0.69
17 0.61
18 0.52
19 0.43
20 0.36
21 0.28
22 0.22
23 0.15
24 0.14
25 0.16
26 0.21
27 0.29
28 0.36
29 0.44
30 0.53
31 0.62
32 0.69
33 0.71
34 0.75
35 0.72
36 0.66
37 0.59
38 0.5
39 0.42
40 0.32
41 0.28
42 0.19
43 0.13
44 0.11
45 0.1
46 0.07
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.05
51 0.06
52 0.08
53 0.13
54 0.16
55 0.24
56 0.31
57 0.36
58 0.47
59 0.55
60 0.62
61 0.67
62 0.76
63 0.78
64 0.82
65 0.87
66 0.82
67 0.79
68 0.75
69 0.66
70 0.56
71 0.47
72 0.38
73 0.28
74 0.23
75 0.16
76 0.1
77 0.09
78 0.07
79 0.06
80 0.04
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.11
85 0.12
86 0.16
87 0.22
88 0.23
89 0.3
90 0.38
91 0.45
92 0.49
93 0.59
94 0.65
95 0.71
96 0.78
97 0.79
98 0.79
99 0.76
100 0.69
101 0.63
102 0.54
103 0.43
104 0.35
105 0.27
106 0.19
107 0.14
108 0.12
109 0.09
110 0.1
111 0.16
112 0.18
113 0.21
114 0.31
115 0.41
116 0.5
117 0.6
118 0.68
119 0.72
120 0.78
121 0.85
122 0.84
123 0.84
124 0.81
125 0.74
126 0.66
127 0.58
128 0.5
129 0.41
130 0.32
131 0.23
132 0.15
133 0.12
134 0.1
135 0.08
136 0.07
137 0.08
138 0.1
139 0.15
140 0.17
141 0.24
142 0.27
143 0.34
144 0.38
145 0.4
146 0.47
147 0.51
148 0.58
149 0.61
150 0.7
151 0.72
152 0.76
153 0.78
154 0.76
155 0.73
156 0.68
157 0.62
158 0.55
159 0.46
160 0.38
161 0.33
162 0.26
163 0.2
164 0.15
165 0.1
166 0.06
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.13
222 0.19
223 0.28
224 0.37
225 0.4
226 0.46
227 0.52
228 0.57
229 0.6
230 0.6
231 0.55
232 0.53
233 0.56
234 0.58
235 0.56
236 0.52
237 0.49
238 0.45
239 0.42
240 0.36
241 0.29
242 0.2
243 0.17
244 0.2
245 0.19
246 0.16
247 0.17
248 0.19
249 0.19
250 0.18
251 0.17
252 0.14
253 0.17
254 0.17
255 0.16
256 0.22
257 0.26
258 0.3
259 0.35
260 0.36
261 0.33
262 0.34
263 0.41
264 0.32
265 0.32
266 0.33
267 0.34
268 0.42
269 0.44
270 0.46
271 0.42
272 0.46
273 0.46
274 0.52
275 0.56
276 0.52
277 0.58
278 0.61
279 0.61
280 0.65
281 0.66
282 0.62
283 0.59
284 0.53
285 0.47
286 0.43
287 0.4
288 0.32
289 0.26
290 0.25
291 0.19
292 0.17
293 0.15
294 0.12
295 0.12
296 0.11
297 0.1
298 0.05
299 0.04
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.13
323 0.12
324 0.13
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.15
329 0.13
330 0.1
331 0.14
332 0.18
333 0.23
334 0.24
335 0.28
336 0.31
337 0.39
338 0.48
339 0.54
340 0.61
341 0.63
342 0.71
343 0.68
344 0.63
345 0.58
346 0.56
347 0.51
348 0.45
349 0.39
350 0.32
351 0.32
352 0.32
353 0.28
354 0.2
355 0.16
356 0.18
357 0.19
358 0.22
359 0.23
360 0.24
361 0.27
362 0.33
363 0.38
364 0.42
365 0.51
366 0.54
367 0.6
368 0.63
369 0.63
370 0.62
371 0.64
372 0.64
373 0.63
374 0.64
375 0.66
376 0.66
377 0.68
378 0.66
379 0.61
380 0.52
381 0.43
382 0.37
383 0.27
384 0.23
385 0.19
386 0.16
387 0.12
388 0.12
389 0.12
390 0.09
391 0.09
392 0.1
393 0.18
394 0.18
395 0.22
396 0.22
397 0.26
398 0.27
399 0.27
400 0.3
401 0.26
402 0.28
403 0.3
404 0.34
405 0.35
406 0.35
407 0.35
408 0.31
409 0.28
410 0.25
411 0.21
412 0.16
413 0.1
414 0.1
415 0.09
416 0.08
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.1
424 0.12
425 0.2
426 0.27
427 0.29
428 0.35
429 0.44
430 0.53
431 0.58
432 0.68
433 0.66
434 0.67
435 0.7
436 0.66
437 0.6
438 0.52
439 0.44
440 0.36
441 0.3
442 0.22
443 0.17
444 0.16
445 0.12
446 0.1
447 0.1
448 0.08
449 0.07
450 0.08
451 0.09
452 0.09
453 0.15
454 0.2
455 0.22
456 0.29
457 0.4
458 0.48
459 0.57
460 0.67
461 0.7
462 0.75
463 0.79
464 0.76
465 0.75
466 0.71
467 0.63
468 0.54
469 0.46
470 0.38
471 0.31
472 0.27
473 0.18
474 0.12
475 0.1
476 0.09
477 0.08
478 0.06
479 0.05
480 0.06
481 0.06
482 0.07
483 0.11
484 0.14
485 0.17
486 0.19
487 0.29
488 0.4
489 0.49
490 0.6
491 0.67
492 0.75
493 0.83
494 0.92
495 0.92
496 0.9
497 0.91
498 0.88
499 0.86
500 0.81
501 0.71
502 0.6
503 0.5
504 0.42
505 0.31
506 0.22
507 0.14
508 0.1
509 0.12
510 0.11
511 0.11
512 0.1
513 0.1
514 0.1
515 0.11
516 0.09
517 0.07
518 0.12
519 0.16
520 0.26
521 0.31
522 0.36
523 0.43
524 0.53
525 0.64
526 0.69
527 0.74
528 0.75
529 0.81
530 0.86
531 0.87
532 0.84
533 0.75
534 0.68
535 0.61
536 0.51
537 0.41
538 0.32
539 0.24
540 0.18
541 0.17
542 0.15
543 0.12
544 0.12
545 0.11
546 0.1
547 0.1
548 0.11
549 0.15
550 0.2
551 0.28
552 0.37
553 0.43
554 0.47
555 0.56
556 0.65
557 0.7
558 0.76
559 0.8
560 0.82
561 0.87
562 0.92
563 0.93