Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0L0SPI1

Protein Details
Accession A0A0L0SPI1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
260-282AFGIVYRRKKKSKRFYPTRLATTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
267-272RKKKSK
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 9, cyto 5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040662  Tfb2_C  
IPR004598  TFIIH_p52/Tfb2  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0001671  F:ATPase activator activity  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF03849  Tfb2  
PF18307  Tfb2_C  
Amino Acid Sequences MNELISSRKTVQNDIASHLRELPAETFHKLYREPATCLAVFRLLPQLSKQLVMRMLYLRQPVTTDELQSWCQPTAYSFLENALDHAQRLQFLVQQGDMWHLNTTFREEFQNALTGRGPATSFGSLAEGTDSHSVDVAFLDNYAKTGWESVLQFMVGQRGERNPHPAVLNILEKSGLMERTGLQPADLVITHSGFQFLLQDINSQVWALLLQYLSMVKDLGMEEDDVLNFIFFLSSLELGSAYSTEVLTETQATVLMDMVAFGIVYRRKKKSKRFYPTRLATTLTNGKAAIRQTESEQEGYILLETNYRLYAYTTSELQIAILKLFVDITFRFPTFVMGVITRESIERALKKNITAEQIIQYLTTNAHPLMRKTSPILPLTVVDQIRLWEMDMNRFTVHAARHVWQFPTRDEYETLRNYAKSINGLLACSDTRWWLVIKAESFQSVATYTRRIMEQRRARKSRSALGAAAAAGAAAGAPGSTDADGMH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.49
3 0.45
4 0.44
5 0.42
6 0.36
7 0.28
8 0.29
9 0.25
10 0.24
11 0.25
12 0.26
13 0.27
14 0.27
15 0.3
16 0.29
17 0.32
18 0.35
19 0.36
20 0.38
21 0.39
22 0.42
23 0.4
24 0.4
25 0.37
26 0.31
27 0.27
28 0.25
29 0.28
30 0.24
31 0.24
32 0.25
33 0.3
34 0.28
35 0.31
36 0.3
37 0.27
38 0.3
39 0.3
40 0.31
41 0.27
42 0.29
43 0.3
44 0.34
45 0.3
46 0.26
47 0.27
48 0.26
49 0.29
50 0.28
51 0.25
52 0.23
53 0.25
54 0.27
55 0.28
56 0.29
57 0.23
58 0.21
59 0.19
60 0.18
61 0.2
62 0.21
63 0.2
64 0.17
65 0.18
66 0.21
67 0.21
68 0.22
69 0.21
70 0.18
71 0.17
72 0.19
73 0.18
74 0.16
75 0.17
76 0.16
77 0.15
78 0.16
79 0.18
80 0.15
81 0.16
82 0.15
83 0.18
84 0.18
85 0.16
86 0.15
87 0.14
88 0.15
89 0.15
90 0.21
91 0.18
92 0.18
93 0.21
94 0.2
95 0.21
96 0.21
97 0.27
98 0.21
99 0.22
100 0.22
101 0.18
102 0.18
103 0.18
104 0.17
105 0.11
106 0.14
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.13
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.07
115 0.09
116 0.11
117 0.11
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.1
123 0.08
124 0.06
125 0.06
126 0.07
127 0.06
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.1
135 0.11
136 0.11
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.14
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.14
146 0.18
147 0.2
148 0.25
149 0.23
150 0.25
151 0.25
152 0.24
153 0.23
154 0.23
155 0.25
156 0.19
157 0.18
158 0.15
159 0.14
160 0.15
161 0.14
162 0.12
163 0.08
164 0.09
165 0.1
166 0.13
167 0.15
168 0.14
169 0.11
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.03
229 0.04
230 0.03
231 0.03
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.02
249 0.06
250 0.09
251 0.14
252 0.2
253 0.26
254 0.35
255 0.44
256 0.55
257 0.63
258 0.71
259 0.77
260 0.82
261 0.85
262 0.87
263 0.85
264 0.8
265 0.7
266 0.61
267 0.5
268 0.45
269 0.42
270 0.32
271 0.26
272 0.21
273 0.2
274 0.21
275 0.21
276 0.19
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.2
281 0.22
282 0.19
283 0.18
284 0.16
285 0.14
286 0.13
287 0.12
288 0.08
289 0.06
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.09
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.13
302 0.13
303 0.13
304 0.12
305 0.13
306 0.1
307 0.08
308 0.08
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.12
316 0.14
317 0.14
318 0.15
319 0.15
320 0.17
321 0.14
322 0.15
323 0.12
324 0.1
325 0.11
326 0.11
327 0.12
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.15
333 0.18
334 0.21
335 0.28
336 0.29
337 0.3
338 0.34
339 0.36
340 0.35
341 0.32
342 0.3
343 0.26
344 0.26
345 0.25
346 0.21
347 0.17
348 0.14
349 0.13
350 0.12
351 0.11
352 0.1
353 0.14
354 0.16
355 0.17
356 0.23
357 0.24
358 0.25
359 0.27
360 0.32
361 0.34
362 0.34
363 0.33
364 0.28
365 0.27
366 0.27
367 0.29
368 0.23
369 0.18
370 0.17
371 0.16
372 0.16
373 0.16
374 0.14
375 0.13
376 0.14
377 0.21
378 0.22
379 0.23
380 0.21
381 0.21
382 0.21
383 0.21
384 0.21
385 0.19
386 0.21
387 0.23
388 0.28
389 0.31
390 0.33
391 0.34
392 0.36
393 0.33
394 0.37
395 0.36
396 0.34
397 0.34
398 0.34
399 0.38
400 0.38
401 0.39
402 0.35
403 0.34
404 0.32
405 0.32
406 0.3
407 0.25
408 0.23
409 0.24
410 0.21
411 0.22
412 0.21
413 0.21
414 0.19
415 0.17
416 0.17
417 0.13
418 0.13
419 0.14
420 0.14
421 0.14
422 0.18
423 0.23
424 0.23
425 0.25
426 0.26
427 0.26
428 0.25
429 0.22
430 0.19
431 0.15
432 0.17
433 0.16
434 0.18
435 0.18
436 0.2
437 0.24
438 0.28
439 0.35
440 0.42
441 0.5
442 0.58
443 0.68
444 0.73
445 0.74
446 0.77
447 0.77
448 0.75
449 0.73
450 0.68
451 0.58
452 0.53
453 0.5
454 0.4
455 0.33
456 0.24
457 0.14
458 0.09
459 0.07
460 0.05
461 0.03
462 0.02
463 0.02
464 0.02
465 0.03
466 0.05
467 0.05