FuNGI

B2W7J3

Protein Details

Accession

B2W7J3

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
154-173	RDMEYARKREDKRKNFRGGY	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
101-122	RGRGGTSRGKRGVKLPSFTGRR
151-168	KKRRDMEYARKREDKRKN

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MAPRGQSSTRARGSARGGANAARPSASDATPQTTATDQTAEQVESDSKPAVTGEGITTTTESQASVQAGTSTETSVRPPAQRLGSLQGSVPPSRSASPAVRGRGGTSRGKRGVKLPSFTGRRSKEERDAMVQEQAARDRERTKEQIAADEKKRRDMEYARKREDKRKNFRGGYSGVATGPFSLGNRKNNSRPGYSGFGSGFGSGSGSRAERVKNEDGSYGGSGHQSTRGGGGSSTKREDGGLVSSEEEEEDTEVHQPRMNIDELKISSDDFAGKAPEPTSMAQLPVRAGRKEHQERKPGYNTEASTAKVLEQAEGKTPKLKSESKEVKVEGGSDDETMSDAGKTGLPDAPALKQDPSVEHRPKPKTTDPAQPAFQTDDDRAEWERIQLHRRLIIAEFGPTETPEVDSSGDAVMAGTAEKPTVRTNNVYLFQIPPLMPEVEASIKKEAPDPKPEAKIKLEEGGFSDPTAKPTSVRFGSGLVGKLRVHKSGRTTLDWGGTSFEVTDVRAGSGSRQEVVSMEFTPENQRSAPEDAGDAYSLGPVKGKFVVTPDLETMFK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.47
3	0.41
4	0.39
5	0.38
6	0.42
7	0.39
8	0.34
9	0.26
10	0.24
11	0.26
12	0.27
13	0.25
14	0.24
15	0.24
16	0.28
17	0.29
18	0.29
19	0.25
20	0.23
21	0.24
22	0.21
23	0.21
24	0.16
25	0.18
26	0.2
27	0.19
28	0.17
29	0.18
30	0.18
31	0.17
32	0.19
33	0.17
34	0.14
35	0.15
36	0.14
37	0.13
38	0.11
39	0.12
40	0.11
41	0.12
42	0.13
43	0.13
44	0.14
45	0.13
46	0.14
47	0.13
48	0.12
49	0.1
50	0.13
51	0.13
52	0.12
53	0.12
54	0.12
55	0.13
56	0.14
57	0.14
58	0.11
59	0.12
60	0.13
61	0.14
62	0.18
63	0.22
64	0.24
65	0.27
66	0.32
67	0.34
68	0.35
69	0.36
70	0.38
71	0.36
72	0.34
73	0.31
74	0.29
75	0.3
76	0.28
77	0.27
78	0.22
79	0.21
80	0.22
81	0.23
82	0.23
83	0.23
84	0.31
85	0.35
86	0.37
87	0.38
88	0.37
89	0.38
90	0.39
91	0.41
92	0.42
93	0.41
94	0.47
95	0.52
96	0.54
97	0.53
98	0.53
99	0.59
100	0.56
101	0.54
102	0.49
103	0.51
104	0.54
105	0.55
106	0.59
107	0.53
108	0.53
109	0.57
110	0.58
111	0.57
112	0.59
113	0.58
114	0.55
115	0.55
116	0.49
117	0.46
118	0.4
119	0.33
120	0.28
121	0.28
122	0.26
123	0.23
124	0.24
125	0.25
126	0.28
127	0.33
128	0.36
129	0.35
130	0.38
131	0.37
132	0.43
133	0.45
134	0.49
135	0.5
136	0.54
137	0.52
138	0.54
139	0.55
140	0.48
141	0.48
142	0.49
143	0.52
144	0.55
145	0.64
146	0.63
147	0.7
148	0.73
149	0.77
150	0.79
151	0.79
152	0.79
153	0.79
154	0.82
155	0.77
156	0.75
157	0.7
158	0.61
159	0.54
160	0.45
161	0.36
162	0.26
163	0.22
164	0.2
165	0.14
166	0.13
167	0.09
168	0.07
169	0.14
170	0.18
171	0.25
172	0.31
173	0.36
174	0.41
175	0.48
176	0.52
177	0.48
178	0.46
179	0.44
180	0.43
181	0.39
182	0.36
183	0.28
184	0.25
185	0.23
186	0.2
187	0.15
188	0.1
189	0.1
190	0.07
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.08
195	0.1
196	0.11
197	0.13
198	0.19
199	0.23
200	0.24
201	0.25
202	0.25
203	0.23
204	0.24
205	0.22
206	0.17
207	0.13
208	0.11
209	0.1
210	0.1
211	0.11
212	0.1
213	0.09
214	0.1
215	0.1
216	0.09
217	0.09
218	0.14
219	0.16
220	0.19
221	0.2
222	0.19
223	0.19
224	0.19
225	0.19
226	0.15
227	0.13
228	0.11
229	0.1
230	0.1
231	0.1
232	0.1
233	0.09
234	0.08
235	0.06
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.08
240	0.1
241	0.1
242	0.11
243	0.11
244	0.12
245	0.14
246	0.15
247	0.12
248	0.12
249	0.16
250	0.15
251	0.16
252	0.15
253	0.13
254	0.12
255	0.11
256	0.11
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.08
262	0.08
263	0.08
264	0.1
265	0.1
266	0.12
267	0.11
268	0.12
269	0.12
270	0.12
271	0.12
272	0.15
273	0.17
274	0.15
275	0.17
276	0.19
277	0.29
278	0.38
279	0.46
280	0.49
281	0.55
282	0.59
283	0.64
284	0.67
285	0.59
286	0.52
287	0.48
288	0.41
289	0.35
290	0.33
291	0.26
292	0.2
293	0.18
294	0.16
295	0.14
296	0.13
297	0.11
298	0.11
299	0.12
300	0.17
301	0.18
302	0.19
303	0.21
304	0.21
305	0.23
306	0.27
307	0.3
308	0.26
309	0.36
310	0.44
311	0.43
312	0.48
313	0.46
314	0.42
315	0.38
316	0.37
317	0.26
318	0.19
319	0.16
320	0.11
321	0.11
322	0.08
323	0.08
324	0.08
325	0.07
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.06
330	0.06
331	0.07
332	0.09
333	0.09
334	0.1
335	0.11
336	0.12
337	0.13
338	0.14
339	0.13
340	0.13
341	0.14
342	0.16
343	0.21
344	0.29
345	0.33
346	0.36
347	0.45
348	0.49
349	0.52
350	0.55
351	0.56
352	0.55
353	0.55
354	0.6
355	0.57
356	0.56
357	0.55
358	0.49
359	0.44
360	0.38
361	0.34
362	0.26
363	0.22
364	0.19
365	0.17
366	0.19
367	0.18
368	0.18
369	0.17
370	0.17
371	0.21
372	0.22
373	0.27
374	0.29
375	0.3
376	0.31
377	0.31
378	0.3
379	0.26
380	0.26
381	0.21
382	0.19
383	0.17
384	0.14
385	0.14
386	0.13
387	0.13
388	0.1
389	0.11
390	0.09
391	0.1
392	0.1
393	0.09
394	0.1
395	0.09
396	0.08
397	0.07
398	0.06
399	0.05
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.05
405	0.05
406	0.07
407	0.11
408	0.16
409	0.18
410	0.21
411	0.25
412	0.31
413	0.33
414	0.33
415	0.31
416	0.28
417	0.25
418	0.26
419	0.22
420	0.16
421	0.17
422	0.16
423	0.14
424	0.13
425	0.15
426	0.17
427	0.19
428	0.2
429	0.21
430	0.21
431	0.22
432	0.27
433	0.33
434	0.32
435	0.39
436	0.44
437	0.47
438	0.55
439	0.58
440	0.58
441	0.54
442	0.54
443	0.48
444	0.48
445	0.41
446	0.33
447	0.33
448	0.32
449	0.28
450	0.24
451	0.25
452	0.19
453	0.22
454	0.24
455	0.21
456	0.18
457	0.21
458	0.29
459	0.26
460	0.28
461	0.26
462	0.23
463	0.26
464	0.28
465	0.29
466	0.23
467	0.24
468	0.23
469	0.3
470	0.32
471	0.35
472	0.35
473	0.36
474	0.41
475	0.47
476	0.51
477	0.48
478	0.49
479	0.46
480	0.48
481	0.44
482	0.38
483	0.32
484	0.27
485	0.22
486	0.19
487	0.17
488	0.12
489	0.11
490	0.13
491	0.1
492	0.11
493	0.11
494	0.11
495	0.13
496	0.19
497	0.2
498	0.19
499	0.18
500	0.18
501	0.18
502	0.21
503	0.21
504	0.15
505	0.17
506	0.16
507	0.17
508	0.24
509	0.25
510	0.25
511	0.23
512	0.25
513	0.26
514	0.3
515	0.3
516	0.24
517	0.23
518	0.23
519	0.23
520	0.21
521	0.17
522	0.13
523	0.14
524	0.13
525	0.12
526	0.14
527	0.12
528	0.15
529	0.18
530	0.19
531	0.18
532	0.21
533	0.28
534	0.27
535	0.31
536	0.3

B2W7J3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer