Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A059EP93

Protein Details
Accession A0A059EP93    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-64SHIITHCMKKKHKQISIKERIQCNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045055  DNA2/NAM7-like  
IPR041677  DNA2/NAM7_AAA_11  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR018999  UPF1_CH/ZBD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF13086  AAA_11  
PF09416  UPF1_Zn_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51997  UPF1_CH_RICH  
Amino Acid Sequences MIPMEEETILPRCNVCLEASNLVLCLDCDSYLCNNNNGVSSHIITHCMKKKHKQISIKERIQCNLCSDTNLFRLGINLQNEFLCRSCSKEDWKYLINEKCLINEIIESVQINKDKINLTSEDYSSIKKVPVTFTDTKEYQETFSVLLEEEACEERKLKESFKEDNLECFVDGGFVKFYEKPDSEIKINKGDEVIFEKEDYVFNGYVVIKKNELVVVKLKRDSQTICNSLFNRKKLTDVTLKFVWKEVNYSRMNYALENIKKYCSKNLLKTILHGVKENHREMEVNFDLNSSQKLAVQAALSRTLTLIQGPPGTGKTRTSACIVKSLVEQGHKVMVVAPSNIAVDQLSLEISKLNVKILRVLSRNREGTESLVDEICLHSKIKNFLKNESQNGGEVKNVNYDDLDDDTFYNIGKGIIQSADVIACTCITAGSPIFKGMRFSAVLIDEAVQATEPMSLIPLLYR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.18
4 0.21
5 0.24
6 0.25
7 0.24
8 0.23
9 0.21
10 0.19
11 0.14
12 0.13
13 0.1
14 0.09
15 0.09
16 0.12
17 0.16
18 0.23
19 0.25
20 0.25
21 0.26
22 0.27
23 0.3
24 0.28
25 0.26
26 0.23
27 0.22
28 0.24
29 0.23
30 0.26
31 0.26
32 0.34
33 0.39
34 0.45
35 0.51
36 0.57
37 0.66
38 0.72
39 0.79
40 0.8
41 0.83
42 0.85
43 0.88
44 0.87
45 0.85
46 0.79
47 0.75
48 0.69
49 0.61
50 0.54
51 0.5
52 0.41
53 0.38
54 0.35
55 0.34
56 0.33
57 0.32
58 0.27
59 0.21
60 0.22
61 0.21
62 0.24
63 0.22
64 0.21
65 0.2
66 0.21
67 0.21
68 0.22
69 0.19
70 0.18
71 0.15
72 0.19
73 0.22
74 0.26
75 0.34
76 0.4
77 0.46
78 0.47
79 0.5
80 0.51
81 0.56
82 0.57
83 0.52
84 0.48
85 0.42
86 0.39
87 0.38
88 0.33
89 0.25
90 0.19
91 0.17
92 0.13
93 0.13
94 0.12
95 0.1
96 0.14
97 0.15
98 0.16
99 0.15
100 0.18
101 0.19
102 0.2
103 0.22
104 0.19
105 0.22
106 0.25
107 0.25
108 0.25
109 0.24
110 0.24
111 0.22
112 0.22
113 0.19
114 0.18
115 0.19
116 0.19
117 0.22
118 0.29
119 0.32
120 0.34
121 0.39
122 0.37
123 0.37
124 0.37
125 0.34
126 0.27
127 0.23
128 0.21
129 0.15
130 0.14
131 0.13
132 0.1
133 0.1
134 0.09
135 0.07
136 0.08
137 0.09
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.18
143 0.2
144 0.21
145 0.26
146 0.31
147 0.36
148 0.4
149 0.46
150 0.4
151 0.41
152 0.41
153 0.35
154 0.28
155 0.23
156 0.18
157 0.13
158 0.12
159 0.09
160 0.07
161 0.07
162 0.09
163 0.1
164 0.12
165 0.16
166 0.16
167 0.19
168 0.23
169 0.26
170 0.27
171 0.31
172 0.32
173 0.33
174 0.33
175 0.3
176 0.27
177 0.23
178 0.21
179 0.21
180 0.2
181 0.14
182 0.14
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.13
187 0.11
188 0.09
189 0.09
190 0.11
191 0.11
192 0.13
193 0.16
194 0.16
195 0.14
196 0.14
197 0.15
198 0.15
199 0.15
200 0.13
201 0.18
202 0.21
203 0.23
204 0.25
205 0.27
206 0.26
207 0.28
208 0.29
209 0.27
210 0.31
211 0.31
212 0.31
213 0.32
214 0.32
215 0.39
216 0.41
217 0.38
218 0.34
219 0.32
220 0.32
221 0.3
222 0.34
223 0.34
224 0.3
225 0.33
226 0.33
227 0.33
228 0.31
229 0.31
230 0.28
231 0.19
232 0.22
233 0.18
234 0.22
235 0.23
236 0.24
237 0.23
238 0.24
239 0.24
240 0.2
241 0.21
242 0.2
243 0.21
244 0.22
245 0.22
246 0.23
247 0.26
248 0.27
249 0.29
250 0.31
251 0.35
252 0.39
253 0.46
254 0.51
255 0.48
256 0.48
257 0.52
258 0.47
259 0.43
260 0.38
261 0.32
262 0.32
263 0.38
264 0.38
265 0.3
266 0.26
267 0.26
268 0.24
269 0.3
270 0.23
271 0.18
272 0.17
273 0.16
274 0.16
275 0.16
276 0.16
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.11
283 0.11
284 0.13
285 0.12
286 0.15
287 0.13
288 0.12
289 0.12
290 0.12
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.09
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.12
299 0.14
300 0.15
301 0.15
302 0.16
303 0.18
304 0.19
305 0.22
306 0.24
307 0.23
308 0.28
309 0.27
310 0.25
311 0.24
312 0.26
313 0.25
314 0.23
315 0.23
316 0.18
317 0.19
318 0.18
319 0.17
320 0.15
321 0.15
322 0.14
323 0.14
324 0.13
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.1
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.1
339 0.1
340 0.13
341 0.15
342 0.15
343 0.21
344 0.24
345 0.31
346 0.32
347 0.38
348 0.42
349 0.48
350 0.51
351 0.46
352 0.45
353 0.39
354 0.37
355 0.35
356 0.29
357 0.23
358 0.2
359 0.19
360 0.16
361 0.16
362 0.15
363 0.13
364 0.12
365 0.12
366 0.17
367 0.25
368 0.33
369 0.38
370 0.39
371 0.44
372 0.54
373 0.59
374 0.61
375 0.56
376 0.49
377 0.45
378 0.45
379 0.39
380 0.32
381 0.27
382 0.22
383 0.25
384 0.24
385 0.21
386 0.19
387 0.2
388 0.19
389 0.19
390 0.19
391 0.14
392 0.14
393 0.14
394 0.14
395 0.13
396 0.11
397 0.09
398 0.08
399 0.09
400 0.09
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.11
405 0.11
406 0.11
407 0.1
408 0.1
409 0.08
410 0.08
411 0.07
412 0.07
413 0.06
414 0.06
415 0.08
416 0.09
417 0.13
418 0.13
419 0.17
420 0.19
421 0.2
422 0.23
423 0.22
424 0.25
425 0.23
426 0.23
427 0.23
428 0.23
429 0.22
430 0.2
431 0.19
432 0.16
433 0.15
434 0.14
435 0.1
436 0.09
437 0.08
438 0.08
439 0.07
440 0.06
441 0.07
442 0.07