FuNGI

A0A0D7BLM2

Protein Details

Accession

A0A0D7BLM2

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-29	APKKDPKSFLFHTKKKKQPSQAPSPSAS	Hydrophilic
151-175	ADTKKDAPPGKRKFQKKTRQVFLLP	Hydrophilic
227-246	VPAHRWYKFQKKLNHQQASD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
157-167	APPGKRKFQKK
499-520	SPKPGGAPKIKLNGSGSRPGSP
543-547	GKKRK
560-567	GERKRKRK

Subcellular Location(s)

nucl 17, mito 5, cyto 5, cyto_mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MAPKKDPKSFLFHTKKKKQPSQAPSPSASNGQSSQRKSMPPPPSRPSSATQAEDDDGLDIPPGGFAEYKVLSSALNGWKYDVMKFDSRKPVDIFNWQPPIKLNRKDIRRDDGPQQVGPLTPMIGLDGKPVIGPGGTIVMMDINGRPVNPAADTKKDAPPGKRKFQKKTRQVFLLPEATKQLRKEERYPWVMEDASGQETWLAQLDDASKAETRGFFMPAANDVFKFVPAHRWYKFQKKLNHQQASDTQAMEAAYTRNSKRDPSTWFQKNLGRAPSAATQAMLKGEADDFDFGGNSMVVRTAGPSQAARPLRKVDKGLFGDEDDDGRPLKREDGQEGDYDEIVYDEDFADDDDQMHEDGNEEEKKDLDDRLKREYKQANKTQEGYIDADMEVDKPKMTKTERRMKRLLRAREGNDAYDSDDSQNMDDESSDEEEEAPPPKPPTPEKEKEEAPVASGSQPTTAVQPSSAGGPMVLDTDVRATSPTSPNLGGHSLLAKRATSPKPGGAPKIKLNGSGSRPGSPAHSPPGSRATSPTGSPSPAGVNGKKRKAEDDSTANPAANGERKRKRKAVVTGAPVEITEKILVDWIRERPEATTKECIGYFTPWLQDPATKKNFTKLVAGVAVLKGGSLTLREKYRNTASAAPSPAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.78
2	0.83
3	0.85
4	0.89
5	0.88
6	0.88
7	0.88
8	0.89
9	0.88
10	0.86
11	0.79
12	0.73
13	0.65
14	0.59
15	0.51
16	0.44
17	0.37
18	0.4
19	0.44
20	0.44
21	0.48
22	0.48
23	0.52
24	0.54
25	0.6
26	0.61
27	0.63
28	0.68
29	0.68
30	0.7
31	0.71
32	0.69
33	0.64
34	0.62
35	0.59
36	0.53
37	0.49
38	0.44
39	0.39
40	0.35
41	0.31
42	0.23
43	0.16
44	0.13
45	0.11
46	0.08
47	0.07
48	0.07
49	0.07
50	0.07
51	0.07
52	0.07
53	0.12
54	0.12
55	0.13
56	0.13
57	0.13
58	0.12
59	0.13
60	0.19
61	0.21
62	0.24
63	0.24
64	0.24
65	0.28
66	0.29
67	0.3
68	0.27
69	0.26
70	0.31
71	0.34
72	0.41
73	0.48
74	0.48
75	0.52
76	0.5
77	0.51
78	0.47
79	0.53
80	0.5
81	0.48
82	0.56
83	0.5
84	0.49
85	0.48
86	0.53
87	0.53
88	0.54
89	0.56
90	0.55
91	0.64
92	0.73
93	0.74
94	0.74
95	0.71
96	0.69
97	0.67
98	0.67
99	0.63
100	0.54
101	0.49
102	0.41
103	0.35
104	0.31
105	0.24
106	0.15
107	0.11
108	0.1
109	0.09
110	0.1
111	0.09
112	0.1
113	0.1
114	0.1
115	0.09
116	0.09
117	0.08
118	0.06
119	0.06
120	0.05
121	0.06
122	0.06
123	0.06
124	0.06
125	0.06
126	0.06
127	0.07
128	0.07
129	0.08
130	0.08
131	0.09
132	0.1
133	0.1
134	0.11
135	0.12
136	0.18
137	0.19
138	0.24
139	0.28
140	0.31
141	0.36
142	0.42
143	0.46
144	0.48
145	0.55
146	0.59
147	0.65
148	0.7
149	0.74
150	0.77
151	0.82
152	0.85
153	0.85
154	0.86
155	0.84
156	0.83
157	0.77
158	0.71
159	0.66
160	0.65
161	0.55
162	0.46
163	0.43
164	0.38
165	0.38
166	0.34
167	0.37
168	0.36
169	0.4
170	0.45
171	0.48
172	0.54
173	0.55
174	0.56
175	0.49
176	0.44
177	0.39
178	0.34
179	0.28
180	0.21
181	0.18
182	0.16
183	0.14
184	0.1
185	0.1
186	0.1
187	0.1
188	0.08
189	0.05
190	0.07
191	0.08
192	0.1
193	0.1
194	0.11
195	0.1
196	0.11
197	0.12
198	0.11
199	0.13
200	0.13
201	0.14
202	0.13
203	0.13
204	0.14
205	0.14
206	0.16
207	0.14
208	0.13
209	0.13
210	0.13
211	0.13
212	0.14
213	0.12
214	0.18
215	0.21
216	0.27
217	0.27
218	0.34
219	0.38
220	0.48
221	0.56
222	0.55
223	0.61
224	0.65
225	0.75
226	0.78
227	0.8
228	0.7
229	0.66
230	0.63
231	0.59
232	0.5
233	0.4
234	0.28
235	0.22
236	0.22
237	0.17
238	0.13
239	0.08
240	0.09
241	0.12
242	0.13
243	0.16
244	0.17
245	0.2
246	0.23
247	0.27
248	0.31
249	0.34
250	0.44
251	0.47
252	0.49
253	0.5
254	0.5
255	0.5
256	0.49
257	0.45
258	0.36
259	0.29
260	0.29
261	0.28
262	0.26
263	0.21
264	0.16
265	0.13
266	0.13
267	0.13
268	0.1
269	0.07
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.06
274	0.06
275	0.06
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.05
287	0.06
288	0.06
289	0.07
290	0.08
291	0.08
292	0.15
293	0.2
294	0.2
295	0.21
296	0.26
297	0.28
298	0.31
299	0.33
300	0.28
301	0.32
302	0.33
303	0.32
304	0.28
305	0.24
306	0.23
307	0.2
308	0.18
309	0.1
310	0.09
311	0.08
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.09
316	0.13
317	0.14
318	0.16
319	0.2
320	0.22
321	0.21
322	0.22
323	0.21
324	0.16
325	0.15
326	0.12
327	0.08
328	0.06
329	0.05
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.06
345	0.09
346	0.1
347	0.1
348	0.1
349	0.11
350	0.12
351	0.12
352	0.14
353	0.17
354	0.22
355	0.24
356	0.33
357	0.39
358	0.39
359	0.46
360	0.51
361	0.54
362	0.57
363	0.63
364	0.62
365	0.6
366	0.61
367	0.54
368	0.48
369	0.42
370	0.34
371	0.26
372	0.19
373	0.15
374	0.13
375	0.12
376	0.11
377	0.1
378	0.08
379	0.08
380	0.07
381	0.08
382	0.13
383	0.18
384	0.25
385	0.33
386	0.44
387	0.52
388	0.59
389	0.66
390	0.66
391	0.71
392	0.72
393	0.72
394	0.7
395	0.69
396	0.65
397	0.66
398	0.63
399	0.54
400	0.46
401	0.37
402	0.3
403	0.24
404	0.22
405	0.13
406	0.13
407	0.12
408	0.11
409	0.11
410	0.1
411	0.09
412	0.08
413	0.08
414	0.08
415	0.1
416	0.09
417	0.09
418	0.09
419	0.09
420	0.11
421	0.12
422	0.11
423	0.11
424	0.13
425	0.16
426	0.2
427	0.23
428	0.3
429	0.38
430	0.46
431	0.49
432	0.52
433	0.52
434	0.5
435	0.51
436	0.43
437	0.35
438	0.27
439	0.23
440	0.19
441	0.18
442	0.16
443	0.11
444	0.12
445	0.11
446	0.12
447	0.12
448	0.11
449	0.1
450	0.1
451	0.1
452	0.11
453	0.11
454	0.08
455	0.07
456	0.07
457	0.07
458	0.07
459	0.07
460	0.05
461	0.05
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.07
466	0.07
467	0.12
468	0.16
469	0.18
470	0.19
471	0.2
472	0.21
473	0.23
474	0.23
475	0.19
476	0.16
477	0.18
478	0.16
479	0.18
480	0.18
481	0.16
482	0.17
483	0.25
484	0.28
485	0.3
486	0.32
487	0.34
488	0.41
489	0.45
490	0.5
491	0.49
492	0.51
493	0.5
494	0.55
495	0.52
496	0.48
497	0.48
498	0.47
499	0.44
500	0.47
501	0.43
502	0.37
503	0.37
504	0.35
505	0.35
506	0.31
507	0.3
508	0.29
509	0.31
510	0.29
511	0.31
512	0.38
513	0.36
514	0.33
515	0.33
516	0.33
517	0.31
518	0.31
519	0.33
520	0.28
521	0.28
522	0.27
523	0.26
524	0.22
525	0.24
526	0.3
527	0.29
528	0.37
529	0.45
530	0.52
531	0.55
532	0.55
533	0.56
534	0.57
535	0.57
536	0.55
537	0.54
538	0.51
539	0.53
540	0.52
541	0.46
542	0.39
543	0.34
544	0.3
545	0.29
546	0.31
547	0.35
548	0.43
549	0.52
550	0.61
551	0.67
552	0.7
553	0.72
554	0.76
555	0.77
556	0.76
557	0.75
558	0.72
559	0.65
560	0.59
561	0.49
562	0.41
563	0.3
564	0.23
565	0.15
566	0.11
567	0.09
568	0.14
569	0.14
570	0.15
571	0.2
572	0.23
573	0.27
574	0.28
575	0.29
576	0.28
577	0.37
578	0.38
579	0.39
580	0.41
581	0.38
582	0.41
583	0.41
584	0.39
585	0.33
586	0.31
587	0.3
588	0.26
589	0.27
590	0.25
591	0.27
592	0.26
593	0.29
594	0.3
595	0.37
596	0.42
597	0.45
598	0.44
599	0.5
600	0.54
601	0.51
602	0.52
603	0.44
604	0.42
605	0.37
606	0.37
607	0.31
608	0.26
609	0.25
610	0.18
611	0.16
612	0.1
613	0.08
614	0.08
615	0.09
616	0.12
617	0.17
618	0.24
619	0.29
620	0.32
621	0.39
622	0.46
623	0.48
624	0.5
625	0.52
626	0.51
627	0.54

A0A0D7BLM2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer