Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7THK0

Protein Details
Accession A7THK0    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-148EEKLDRLLKKPKVRRTRKDEDDLEBasic
317-340ALDSAKNRKKKKSDDGSTAKKSKGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
131-141LLKKPKVRRTR
313-338RKKAALDSAKNRKKKKSDDGSTAKKS
406-411KSKKAK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG vpo:Kpol_1039p73  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MDTQGVSDMLENGVNAEVPPQEGGDVVAVAAAAVAAVDTSSSGDKDESSEVLNGGDDFEDGIRDEQDVDGHLERKRKHIEASDSDNEDNAVGVVNNTLDNIKTLPPSADGEIELDSSTRSRRELEEKLDRLLKKPKVRRTRKDEDDLEQYLDEKILRLKDEMNVAAQLDIETLNKRIETNDKALFAMQKVKLLPKVIDVLSKANLADTILDNNLLQSVRIWLEPLPDGSLPSFEIQKSLFSALDKLPIKTEHLKESGLGRVLIFYTKSKRVEPQLARLAERLIAEWTRPIIGASDNYRDKRIMQLEFDAERFRKKAALDSAKNRKKKKSDDGSTAKKSKGSSAQSLYEQAAARRGRAAAPAQTTTDYKFAPVSNVGMVSTNARSTGVGSTLNNSEMYKRLTSRLNKSKKAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.09
4 0.09
5 0.09
6 0.1
7 0.09
8 0.09
9 0.09
10 0.1
11 0.08
12 0.08
13 0.06
14 0.06
15 0.05
16 0.05
17 0.05
18 0.03
19 0.02
20 0.02
21 0.02
22 0.02
23 0.02
24 0.02
25 0.03
26 0.04
27 0.06
28 0.06
29 0.08
30 0.08
31 0.09
32 0.12
33 0.13
34 0.13
35 0.14
36 0.15
37 0.14
38 0.14
39 0.14
40 0.12
41 0.1
42 0.1
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.1
55 0.13
56 0.15
57 0.18
58 0.21
59 0.27
60 0.29
61 0.36
62 0.41
63 0.4
64 0.43
65 0.48
66 0.53
67 0.54
68 0.61
69 0.59
70 0.56
71 0.53
72 0.48
73 0.4
74 0.31
75 0.23
76 0.15
77 0.09
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.08
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.12
92 0.13
93 0.16
94 0.16
95 0.15
96 0.14
97 0.14
98 0.14
99 0.13
100 0.11
101 0.09
102 0.08
103 0.08
104 0.1
105 0.1
106 0.11
107 0.12
108 0.17
109 0.24
110 0.29
111 0.36
112 0.44
113 0.45
114 0.48
115 0.52
116 0.49
117 0.46
118 0.5
119 0.49
120 0.49
121 0.56
122 0.62
123 0.67
124 0.77
125 0.82
126 0.83
127 0.85
128 0.84
129 0.84
130 0.78
131 0.72
132 0.68
133 0.59
134 0.51
135 0.4
136 0.33
137 0.24
138 0.2
139 0.15
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.12
145 0.13
146 0.14
147 0.18
148 0.17
149 0.16
150 0.14
151 0.14
152 0.13
153 0.11
154 0.09
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.1
164 0.15
165 0.17
166 0.22
167 0.23
168 0.23
169 0.23
170 0.24
171 0.23
172 0.19
173 0.22
174 0.18
175 0.17
176 0.18
177 0.19
178 0.21
179 0.21
180 0.2
181 0.15
182 0.18
183 0.16
184 0.17
185 0.16
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.13
190 0.1
191 0.09
192 0.08
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.07
209 0.09
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.09
214 0.1
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.09
219 0.1
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.12
229 0.11
230 0.19
231 0.19
232 0.18
233 0.19
234 0.19
235 0.23
236 0.27
237 0.29
238 0.27
239 0.27
240 0.27
241 0.26
242 0.28
243 0.27
244 0.21
245 0.19
246 0.14
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.12
251 0.12
252 0.16
253 0.21
254 0.24
255 0.25
256 0.29
257 0.35
258 0.44
259 0.44
260 0.48
261 0.5
262 0.5
263 0.49
264 0.45
265 0.4
266 0.32
267 0.28
268 0.2
269 0.15
270 0.13
271 0.12
272 0.13
273 0.13
274 0.11
275 0.11
276 0.1
277 0.08
278 0.09
279 0.13
280 0.15
281 0.22
282 0.27
283 0.28
284 0.3
285 0.3
286 0.29
287 0.33
288 0.36
289 0.31
290 0.28
291 0.3
292 0.33
293 0.33
294 0.34
295 0.31
296 0.26
297 0.27
298 0.26
299 0.23
300 0.22
301 0.21
302 0.28
303 0.33
304 0.42
305 0.46
306 0.55
307 0.66
308 0.71
309 0.79
310 0.78
311 0.77
312 0.76
313 0.78
314 0.79
315 0.79
316 0.79
317 0.82
318 0.85
319 0.86
320 0.85
321 0.81
322 0.71
323 0.63
324 0.55
325 0.51
326 0.5
327 0.47
328 0.45
329 0.45
330 0.47
331 0.46
332 0.48
333 0.42
334 0.38
335 0.33
336 0.26
337 0.29
338 0.25
339 0.24
340 0.24
341 0.24
342 0.21
343 0.25
344 0.28
345 0.26
346 0.3
347 0.32
348 0.31
349 0.32
350 0.32
351 0.3
352 0.3
353 0.24
354 0.2
355 0.21
356 0.2
357 0.21
358 0.22
359 0.21
360 0.19
361 0.2
362 0.19
363 0.17
364 0.17
365 0.17
366 0.16
367 0.15
368 0.14
369 0.14
370 0.13
371 0.14
372 0.16
373 0.15
374 0.16
375 0.16
376 0.19
377 0.21
378 0.22
379 0.22
380 0.2
381 0.2
382 0.22
383 0.26
384 0.27
385 0.27
386 0.31
387 0.39
388 0.47
389 0.56
390 0.62
391 0.68