Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D7BNB0

Protein Details
Accession A0A0D7BNB0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
385-412IVTRGAGFRKEKNKKKRGSYKGGEITMQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
392-402FRKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MDANLATTYTLIHAFLKKQSHNKAADAVKKAIKDQLVLKDDVEAEGKSLDEIVKIWKSLPSPPADDSDSDSDDSSDSSDSSSSSEDSDSSSDSDSDEDTPSPPAKETPQKLPTPDSSDSSDSDDSDDEAPVEATAAAASAKVDDSSDSSDDSSDSSDDSSDSSDSDSDEEETTSKPDAKKADTTKPKKATAAAAAKATNDSDDSSDDSSSDSDSDDEEEKTSKRSATKTLSTGSPSSSSSSDEDSSSEDEEDDKKAAASKHSAPKASKASKTSKAPSSSSSSSSDSSSSDSDSDDEDDAPAPEVTKATKKQRVDESGAAVVTAAVVEQGPLDDGNTGRRGGRKTNTPFQRIKTDTVPEHLILDNRYENKAGPANDYGARAHADLIVTRGAGFRKEKNKKKRGSYKGGEITMQSHSFKFTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.26
3 0.33
4 0.39
5 0.47
6 0.55
7 0.6
8 0.61
9 0.6
10 0.62
11 0.62
12 0.63
13 0.6
14 0.57
15 0.53
16 0.5
17 0.49
18 0.47
19 0.4
20 0.36
21 0.37
22 0.4
23 0.41
24 0.4
25 0.38
26 0.36
27 0.35
28 0.32
29 0.28
30 0.18
31 0.14
32 0.13
33 0.13
34 0.1
35 0.1
36 0.09
37 0.08
38 0.09
39 0.14
40 0.16
41 0.16
42 0.17
43 0.2
44 0.21
45 0.27
46 0.32
47 0.3
48 0.32
49 0.33
50 0.37
51 0.35
52 0.34
53 0.33
54 0.32
55 0.29
56 0.26
57 0.24
58 0.21
59 0.19
60 0.18
61 0.14
62 0.1
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.1
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.12
77 0.13
78 0.12
79 0.11
80 0.12
81 0.11
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.12
86 0.15
87 0.16
88 0.16
89 0.16
90 0.16
91 0.21
92 0.3
93 0.33
94 0.4
95 0.45
96 0.48
97 0.5
98 0.52
99 0.5
100 0.48
101 0.46
102 0.4
103 0.36
104 0.35
105 0.34
106 0.34
107 0.3
108 0.23
109 0.22
110 0.19
111 0.16
112 0.15
113 0.14
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.07
118 0.07
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.03
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.07
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.07
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.13
162 0.12
163 0.16
164 0.19
165 0.21
166 0.28
167 0.32
168 0.41
169 0.48
170 0.54
171 0.59
172 0.62
173 0.62
174 0.56
175 0.52
176 0.46
177 0.43
178 0.43
179 0.35
180 0.31
181 0.29
182 0.28
183 0.26
184 0.23
185 0.15
186 0.09
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.07
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.1
206 0.1
207 0.12
208 0.13
209 0.13
210 0.15
211 0.17
212 0.23
213 0.28
214 0.31
215 0.31
216 0.32
217 0.32
218 0.31
219 0.29
220 0.24
221 0.2
222 0.17
223 0.16
224 0.15
225 0.15
226 0.14
227 0.16
228 0.15
229 0.14
230 0.14
231 0.13
232 0.14
233 0.13
234 0.12
235 0.09
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.1
240 0.09
241 0.08
242 0.12
243 0.13
244 0.14
245 0.17
246 0.23
247 0.31
248 0.34
249 0.38
250 0.36
251 0.42
252 0.49
253 0.5
254 0.48
255 0.46
256 0.49
257 0.52
258 0.58
259 0.57
260 0.54
261 0.52
262 0.5
263 0.47
264 0.47
265 0.42
266 0.39
267 0.37
268 0.32
269 0.29
270 0.29
271 0.26
272 0.19
273 0.19
274 0.17
275 0.15
276 0.13
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.13
281 0.12
282 0.11
283 0.1
284 0.11
285 0.1
286 0.11
287 0.1
288 0.09
289 0.08
290 0.09
291 0.11
292 0.17
293 0.23
294 0.31
295 0.39
296 0.41
297 0.48
298 0.56
299 0.6
300 0.6
301 0.56
302 0.51
303 0.46
304 0.43
305 0.36
306 0.27
307 0.2
308 0.13
309 0.09
310 0.05
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.04
317 0.04
318 0.05
319 0.06
320 0.07
321 0.11
322 0.13
323 0.14
324 0.15
325 0.2
326 0.24
327 0.3
328 0.36
329 0.42
330 0.48
331 0.57
332 0.64
333 0.67
334 0.69
335 0.66
336 0.7
337 0.64
338 0.61
339 0.57
340 0.55
341 0.5
342 0.49
343 0.48
344 0.38
345 0.37
346 0.33
347 0.3
348 0.24
349 0.25
350 0.27
351 0.25
352 0.27
353 0.26
354 0.25
355 0.27
356 0.32
357 0.29
358 0.28
359 0.28
360 0.29
361 0.31
362 0.32
363 0.27
364 0.24
365 0.24
366 0.2
367 0.18
368 0.16
369 0.15
370 0.13
371 0.15
372 0.14
373 0.12
374 0.12
375 0.14
376 0.14
377 0.19
378 0.23
379 0.29
380 0.39
381 0.5
382 0.6
383 0.69
384 0.78
385 0.82
386 0.89
387 0.91
388 0.91
389 0.91
390 0.89
391 0.88
392 0.87
393 0.8
394 0.71
395 0.62
396 0.54
397 0.49
398 0.44
399 0.35
400 0.27