FuNGI

A0A0D7AVF7

Protein Details

Accession

A0A0D7AVF7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
117-142	GEILKRARETREKKRKREEAIGIPVV	Basic
1236-1258	EGNKEQRKECVRRWMPKDTVQKV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
37-52	RSKGKSAFARRREELG
121-133	KRARETREKKRKR

Subcellular Location(s)

cyto 10, mito 9.5, mito_nucl 8, nucl 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MQSSLVGSIFERDSTSKRTAPLAPTPSAKGFPVAQHRSKGKSAFARRREELGKVAGPSRPEAPPVIVPSKPQPKREDDGDWFEEVSKQNAIRVASMTDEEREREKQEIFEQFGADVGEILKRARETREKKRKREEAIGIPVVPMTDEERPRPVSPPLASIKTGSMSTNTSRPSSPMRGSRKLRFAELSPKDVHVYESAPPSPRRKAMLALPPPEPHGSSDTVSLGAFKGTIPSQLQGFPKEDSPEEGTPEDIRRRYFPTAAATNPDLAWMSQSLSAEKSASEASPIDALRFDLSGNLISAEQSLTLPTHLGLHHHAEGSRAGYTIDDIFLLARSTVGAQRAAMMKAMVGLASWLQKGCPGADNAVLEAMKSKTLPLLKRILFAGLEVLPERGSVGARGISVVWQCIVGWEEREIQDMGVNIVDVEQRFGEVELNIRGSTTESPAPSVSALVDAIPFDTVLPQITPLIVSPPDFGTAERDSDITSNQLELLAILHRLAKHSGTIADAIVQSPKLLAGIISTFLVKPVNARPEALRFLSTLARSSRANAQALCDPADALLKFVAIQPPQPDLLIGTLHFFTTLATYGLYTHVATDAQEIWTRLAAHVVSLNTSTNSQDIRIVEAWARLLEAWITCATDPHQTTPEHDITWSRVVAWGWAEDLYNLVVVRGEAQPSVWAAIAAWLEGSRVNGVRGGETEKIRAIEVLQPHFAVAGKAVVSSALLGLQDTLSQGLPSMAGLVNASEYATTLAQVLRLSVAVSPSTPAFDLPLPQISQLCATIVMHPLWTLPDAKGLPGMYARVLCRPLSLLLAYYLRLVRTLPDTSTDSWLAQAFAVIPRLQIGDEDVAVDIMGEVLKNIDAEWAKERALGVPDIIWERGGLGILLPVLQHAVQPSTDVQAAPTVLTPQALKRSTLARLPTDVLLTSEWYPSGLPLQRDWTLTPIDHVLRSGSEGSVFQRSRAFPTGWDSSETEIVRASLLLTNVGREVVRRFAGKLADGACIGRAEAVLACMEVFMLEHGQQEGQAFEVFKDQAVSQFMGQMLLPFQAGAKPRVAGGDDLEEKAKRFLGPSTPFFQFYQDLVGLYDSISFGNPLFAKVLLVPTSARYEHDYRKHLWVDFGHVLKSLGSVGAEELVCEDVRVHLYPTERANEMIKAYIGALMTGSAARGAIRLIALHHVACNIWSDLGRPEDAEEPAKKLWTLIVRGSAELVQEVALYSQVRNGDGDARLPPACLEAVAEGNKEQRKECVRRWMPKDTVQKVLALFV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.32
3	0.31
4	0.33
5	0.38
6	0.41
7	0.45
8	0.5
9	0.5
10	0.48
11	0.49
12	0.51
13	0.49
14	0.46
15	0.4
16	0.34
17	0.31
18	0.33
19	0.4
20	0.44
21	0.46
22	0.53
23	0.57
24	0.6
25	0.63
26	0.6
27	0.58
28	0.59
29	0.65
30	0.67
31	0.71
32	0.74
33	0.71
34	0.75
35	0.7
36	0.63
37	0.58
38	0.54
39	0.49
40	0.43
41	0.43
42	0.38
43	0.36
44	0.35
45	0.33
46	0.28
47	0.27
48	0.26
49	0.26
50	0.29
51	0.33
52	0.35
53	0.32
54	0.34
55	0.42
56	0.5
57	0.53
58	0.55
59	0.55
60	0.58
61	0.64
62	0.66
63	0.65
64	0.61
65	0.63
66	0.59
67	0.54
68	0.47
69	0.41
70	0.4
71	0.32
72	0.28
73	0.24
74	0.21
75	0.22
76	0.25
77	0.26
78	0.23
79	0.23
80	0.22
81	0.19
82	0.21
83	0.2
84	0.2
85	0.21
86	0.21
87	0.24
88	0.26
89	0.27
90	0.29
91	0.29
92	0.3
93	0.35
94	0.4
95	0.4
96	0.38
97	0.37
98	0.32
99	0.31
100	0.28
101	0.2
102	0.14
103	0.09
104	0.09
105	0.09
106	0.1
107	0.11
108	0.13
109	0.16
110	0.23
111	0.33
112	0.41
113	0.52
114	0.63
115	0.71
116	0.79
117	0.87
118	0.89
119	0.87
120	0.88
121	0.86
122	0.84
123	0.83
124	0.77
125	0.66
126	0.57
127	0.49
128	0.38
129	0.29
130	0.2
131	0.14
132	0.17
133	0.2
134	0.22
135	0.28
136	0.32
137	0.34
138	0.36
139	0.36
140	0.37
141	0.35
142	0.4
143	0.41
144	0.4
145	0.39
146	0.37
147	0.35
148	0.3
149	0.29
150	0.23
151	0.19
152	0.19
153	0.21
154	0.25
155	0.26
156	0.26
157	0.26
158	0.28
159	0.33
160	0.36
161	0.4
162	0.44
163	0.51
164	0.58
165	0.65
166	0.7
167	0.72
168	0.67
169	0.65
170	0.59
171	0.55
172	0.56
173	0.53
174	0.5
175	0.43
176	0.42
177	0.39
178	0.36
179	0.33
180	0.24
181	0.22
182	0.2
183	0.24
184	0.25
185	0.29
186	0.33
187	0.37
188	0.42
189	0.44
190	0.44
191	0.41
192	0.43
193	0.46
194	0.51
195	0.53
196	0.51
197	0.51
198	0.47
199	0.48
200	0.46
201	0.38
202	0.3
203	0.25
204	0.24
205	0.21
206	0.22
207	0.19
208	0.18
209	0.17
210	0.16
211	0.12
212	0.1
213	0.09
214	0.07
215	0.09
216	0.09
217	0.12
218	0.13
219	0.14
220	0.16
221	0.21
222	0.23
223	0.24
224	0.26
225	0.24
226	0.25
227	0.27
228	0.26
229	0.25
230	0.29
231	0.27
232	0.28
233	0.27
234	0.25
235	0.25
236	0.3
237	0.32
238	0.29
239	0.3
240	0.3
241	0.35
242	0.38
243	0.37
244	0.35
245	0.36
246	0.37
247	0.36
248	0.38
249	0.33
250	0.31
251	0.28
252	0.26
253	0.19
254	0.15
255	0.14
256	0.1
257	0.1
258	0.11
259	0.12
260	0.12
261	0.13
262	0.14
263	0.12
264	0.12
265	0.12
266	0.11
267	0.1
268	0.11
269	0.1
270	0.1
271	0.14
272	0.14
273	0.13
274	0.12
275	0.13
276	0.12
277	0.12
278	0.11
279	0.08
280	0.09
281	0.09
282	0.09
283	0.09
284	0.08
285	0.08
286	0.08
287	0.07
288	0.07
289	0.06
290	0.07
291	0.06
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.09
296	0.09
297	0.11
298	0.13
299	0.17
300	0.18
301	0.19
302	0.19
303	0.18
304	0.19
305	0.19
306	0.16
307	0.12
308	0.11
309	0.09
310	0.1
311	0.1
312	0.09
313	0.07
314	0.06
315	0.06
316	0.07
317	0.07
318	0.06
319	0.05
320	0.05
321	0.06
322	0.09
323	0.1
324	0.1
325	0.1
326	0.13
327	0.15
328	0.15
329	0.14
330	0.12
331	0.1
332	0.1
333	0.11
334	0.07
335	0.05
336	0.05
337	0.06
338	0.07
339	0.08
340	0.07
341	0.07
342	0.09
343	0.1
344	0.11
345	0.12
346	0.12
347	0.13
348	0.16
349	0.16
350	0.14
351	0.16
352	0.14
353	0.11
354	0.13
355	0.12
356	0.1
357	0.09
358	0.1
359	0.12
360	0.18
361	0.2
362	0.22
363	0.3
364	0.3
365	0.32
366	0.32
367	0.3
368	0.24
369	0.22
370	0.2
371	0.12
372	0.12
373	0.1
374	0.1
375	0.09
376	0.08
377	0.09
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.08
385	0.08
386	0.09
387	0.1
388	0.1
389	0.08
390	0.08
391	0.07
392	0.08
393	0.09
394	0.07
395	0.08
396	0.09
397	0.12
398	0.12
399	0.15
400	0.14
401	0.13
402	0.14
403	0.13
404	0.12
405	0.08
406	0.08
407	0.06
408	0.06
409	0.07
410	0.06
411	0.07
412	0.06
413	0.06
414	0.07
415	0.07
416	0.08
417	0.07
418	0.09
419	0.09
420	0.11
421	0.1
422	0.1
423	0.1
424	0.11
425	0.11
426	0.12
427	0.14
428	0.13
429	0.14
430	0.15
431	0.15
432	0.13
433	0.12
434	0.09
435	0.07
436	0.07
437	0.06
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.04
444	0.04
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.06
451	0.06
452	0.05
453	0.07
454	0.07
455	0.08
456	0.09
457	0.09
458	0.11
459	0.11
460	0.11
461	0.13
462	0.14
463	0.14
464	0.14
465	0.13
466	0.12
467	0.12
468	0.13
469	0.1
470	0.09
471	0.08
472	0.07
473	0.07
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.05
478	0.05
479	0.05
480	0.07
481	0.07
482	0.09
483	0.1
484	0.09
485	0.09
486	0.1
487	0.1
488	0.1
489	0.1
490	0.09
491	0.09
492	0.09
493	0.09
494	0.08
495	0.08
496	0.07
497	0.06
498	0.06
499	0.04
500	0.04
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.05
505	0.05
506	0.06
507	0.06
508	0.06
509	0.07
510	0.06
511	0.08
512	0.12
513	0.17
514	0.17
515	0.18
516	0.19
517	0.23
518	0.26
519	0.24
520	0.2
521	0.15
522	0.17
523	0.19
524	0.18
525	0.17
526	0.15
527	0.16
528	0.16
529	0.17
530	0.22
531	0.22
532	0.24
533	0.21
534	0.22
535	0.23
536	0.24
537	0.23
538	0.17
539	0.13
540	0.11
541	0.14
542	0.11
543	0.09
544	0.08
545	0.06
546	0.07
547	0.08
548	0.11
549	0.09
550	0.11
551	0.12
552	0.13
553	0.14
554	0.13
555	0.12
556	0.09
557	0.1
558	0.08
559	0.07
560	0.07
561	0.07
562	0.07
563	0.07
564	0.06
565	0.05
566	0.06
567	0.06
568	0.05
569	0.05
570	0.05
571	0.06
572	0.06
573	0.07
574	0.06
575	0.06
576	0.06
577	0.06
578	0.06
579	0.07
580	0.07
581	0.07
582	0.09
583	0.09
584	0.09
585	0.1
586	0.1
587	0.09
588	0.1
589	0.08
590	0.07
591	0.09
592	0.09
593	0.08
594	0.08
595	0.09
596	0.08
597	0.08
598	0.09
599	0.08
600	0.08
601	0.08
602	0.1
603	0.1
604	0.12
605	0.12
606	0.12
607	0.12
608	0.12
609	0.12
610	0.09
611	0.09
612	0.06
613	0.06
614	0.06
615	0.05
616	0.05
617	0.05
618	0.06
619	0.05
620	0.06
621	0.07
622	0.12
623	0.12
624	0.13
625	0.16
626	0.16
627	0.19
628	0.24
629	0.24
630	0.19
631	0.19
632	0.18
633	0.17
634	0.19
635	0.16
636	0.11
637	0.12
638	0.12
639	0.12
640	0.11
641	0.09
642	0.07
643	0.08
644	0.08
645	0.05
646	0.06
647	0.05
648	0.05
649	0.05
650	0.04
651	0.04
652	0.04
653	0.06
654	0.06
655	0.07
656	0.06
657	0.06
658	0.07
659	0.07
660	0.08
661	0.05
662	0.05
663	0.04
664	0.06
665	0.06
666	0.06
667	0.06
668	0.05
669	0.05
670	0.05
671	0.06
672	0.05
673	0.05
674	0.06
675	0.08
676	0.08
677	0.08
678	0.09
679	0.12
680	0.14
681	0.14
682	0.15
683	0.14
684	0.15
685	0.14
686	0.13
687	0.12
688	0.12
689	0.15
690	0.16
691	0.15
692	0.14
693	0.14
694	0.14
695	0.13
696	0.1
697	0.07
698	0.06
699	0.05
700	0.05
701	0.05
702	0.05
703	0.04
704	0.04
705	0.04
706	0.03
707	0.03
708	0.03
709	0.04
710	0.04
711	0.04
712	0.04
713	0.05
714	0.04
715	0.04
716	0.05
717	0.04
718	0.04
719	0.04
720	0.05
721	0.04
722	0.05
723	0.05
724	0.05
725	0.05
726	0.05
727	0.05
728	0.03
729	0.03
730	0.04
731	0.04
732	0.05
733	0.05
734	0.05
735	0.07
736	0.07
737	0.06
738	0.06
739	0.06
740	0.06
741	0.06
742	0.07
743	0.06
744	0.06
745	0.07
746	0.06
747	0.07
748	0.07
749	0.06
750	0.07
751	0.07
752	0.09
753	0.09
754	0.12
755	0.11
756	0.12
757	0.12
758	0.11
759	0.12
760	0.1
761	0.09
762	0.07
763	0.07
764	0.08
765	0.1
766	0.1
767	0.09
768	0.09
769	0.09
770	0.09
771	0.09
772	0.09
773	0.07
774	0.11
775	0.11
776	0.12
777	0.13
778	0.13
779	0.12
780	0.12
781	0.12
782	0.09
783	0.11
784	0.11
785	0.12
786	0.14
787	0.13
788	0.13
789	0.14
790	0.14
791	0.13
792	0.13
793	0.1
794	0.1
795	0.11
796	0.11
797	0.11
798	0.11
799	0.1
800	0.1
801	0.09
802	0.09
803	0.12
804	0.13
805	0.12
806	0.15
807	0.17
808	0.19
809	0.22
810	0.22
811	0.18
812	0.17
813	0.17
814	0.14
815	0.12
816	0.1
817	0.08
818	0.08
819	0.1
820	0.09
821	0.08
822	0.08
823	0.09
824	0.09
825	0.08
826	0.08
827	0.07
828	0.07
829	0.08
830	0.07
831	0.06
832	0.06
833	0.06
834	0.04
835	0.03
836	0.03
837	0.03
838	0.03
839	0.03
840	0.03
841	0.04
842	0.04
843	0.07
844	0.08
845	0.1
846	0.13
847	0.14
848	0.14
849	0.15
850	0.16
851	0.14
852	0.16
853	0.14
854	0.12
855	0.1
856	0.12
857	0.13
858	0.12
859	0.1
860	0.08
861	0.08
862	0.08
863	0.07
864	0.06
865	0.04
866	0.04
867	0.04
868	0.04
869	0.04
870	0.04
871	0.04
872	0.05
873	0.05
874	0.06
875	0.07
876	0.07
877	0.08
878	0.09
879	0.1
880	0.11
881	0.1
882	0.1
883	0.11
884	0.11
885	0.1
886	0.1
887	0.09
888	0.08
889	0.09
890	0.09
891	0.1
892	0.18
893	0.19
894	0.19
895	0.2
896	0.23
897	0.25
898	0.29
899	0.31
900	0.25
901	0.27
902	0.28
903	0.27
904	0.24
905	0.21
906	0.18
907	0.14
908	0.14
909	0.13
910	0.11
911	0.1
912	0.1
913	0.1
914	0.09
915	0.14
916	0.15
917	0.16
918	0.17
919	0.22
920	0.24
921	0.25
922	0.26
923	0.23
924	0.21
925	0.2
926	0.2
927	0.19
928	0.19
929	0.17
930	0.17
931	0.15
932	0.13
933	0.15
934	0.15
935	0.11
936	0.1
937	0.11
938	0.12
939	0.2
940	0.2
941	0.19
942	0.24
943	0.25
944	0.29
945	0.32
946	0.31
947	0.24
948	0.3
949	0.33
950	0.29
951	0.31
952	0.27
953	0.25
954	0.3
955	0.28
956	0.23
957	0.18
958	0.17
959	0.14
960	0.13
961	0.12
962	0.09
963	0.09
964	0.11
965	0.11
966	0.11
967	0.11
968	0.12
969	0.11
970	0.1
971	0.13
972	0.14
973	0.17
974	0.17
975	0.18
976	0.21
977	0.23
978	0.22
979	0.23
980	0.2
981	0.19
982	0.19
983	0.18
984	0.15
985	0.13
986	0.12
987	0.09
988	0.07
989	0.07
990	0.06
991	0.07
992	0.06
993	0.06
994	0.06
995	0.05
996	0.05
997	0.04
998	0.04
999	0.04
1000	0.05
1001	0.06
1002	0.07
1003	0.08
1004	0.08
1005	0.09
1006	0.1
1007	0.09
1008	0.09
1009	0.09
1010	0.09
1011	0.09
1012	0.13
1013	0.12
1014	0.12
1015	0.13
1016	0.12
1017	0.14
1018	0.17
1019	0.18
1020	0.14
1021	0.16
1022	0.16
1023	0.15
1024	0.15
1025	0.12
1026	0.1
1027	0.1
1028	0.09
1029	0.07
1030	0.07
1031	0.1
1032	0.13
1033	0.14
1034	0.15
1035	0.15
1036	0.16
1037	0.17
1038	0.18
1039	0.16
1040	0.15
1041	0.2
1042	0.2
1043	0.21
1044	0.23
1045	0.22
1046	0.22
1047	0.23
1048	0.23
1049	0.16
1050	0.16
1051	0.18
1052	0.25
1053	0.31
1054	0.34
1055	0.38
1056	0.38
1057	0.4
1058	0.39
1059	0.39
1060	0.31
1061	0.25
1062	0.25
1063	0.21
1064	0.19
1065	0.17
1066	0.17
1067	0.14
1068	0.12
1069	0.12
1070	0.08
1071	0.07
1072	0.07
1073	0.07
1074	0.07
1075	0.11
1076	0.12
1077	0.12
1078	0.13
1079	0.13
1080	0.13
1081	0.14
1082	0.17
1083	0.13
1084	0.14
1085	0.14
1086	0.15
1087	0.19
1088	0.19
1089	0.2
1090	0.22
1091	0.28
1092	0.35
1093	0.43
1094	0.46
1095	0.45
1096	0.53
1097	0.55
1098	0.51
1099	0.5
1100	0.43
1101	0.42
1102	0.44
1103	0.41
1104	0.34
1105	0.3
1106	0.29
1107	0.24
1108	0.23
1109	0.16
1110	0.1
1111	0.08
1112	0.08
1113	0.07
1114	0.1
1115	0.1
1116	0.09
1117	0.1
1118	0.11
1119	0.1
1120	0.1
1121	0.1
1122	0.08
1123	0.11
1124	0.12
1125	0.13
1126	0.15
1127	0.18
1128	0.22
1129	0.26
1130	0.28
1131	0.26
1132	0.27
1133	0.28
1134	0.27
1135	0.26
1136	0.24
1137	0.2
1138	0.17
1139	0.16
1140	0.16
1141	0.14
1142	0.11
1143	0.1
1144	0.08
1145	0.08
1146	0.08
1147	0.07
1148	0.05
1149	0.05
1150	0.05
1151	0.06
1152	0.06
1153	0.06
1154	0.07
1155	0.07
1156	0.09
1157	0.13
1158	0.14
1159	0.15
1160	0.15
1161	0.15
1162	0.14
1163	0.14
1164	0.16
1165	0.13
1166	0.13
1167	0.12
1168	0.14
1169	0.17
1170	0.2
1171	0.2
1172	0.17
1173	0.19
1174	0.21
1175	0.23
1176	0.28
1177	0.26
1178	0.27
1179	0.28
1180	0.3
1181	0.27
1182	0.24
1183	0.27
1184	0.27
1185	0.29
1186	0.29
1187	0.35
1188	0.34
1189	0.35
1190	0.36
1191	0.32
1192	0.26
1193	0.22
1194	0.18
1195	0.1
1196	0.09
1197	0.09
1198	0.08
1199	0.09
1200	0.09
1201	0.09
1202	0.12
1203	0.13
1204	0.14
1205	0.15
1206	0.16
1207	0.19
1208	0.19
1209	0.22
1210	0.21
1211	0.23
1212	0.22
1213	0.22
1214	0.21
1215	0.18
1216	0.17
1217	0.14
1218	0.13
1219	0.11
1220	0.16
1221	0.18
1222	0.19
1223	0.18
1224	0.26
1225	0.3
1226	0.31
1227	0.3
1228	0.34
1229	0.42
1230	0.49
1231	0.55
1232	0.59
1233	0.65
1234	0.73
1235	0.79
1236	0.8
1237	0.77
1238	0.78
1239	0.81
1240	0.74
1241	0.73
1242	0.64
1243	0.61

A0A0D7AVF7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer