Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D7BQW1

Protein Details
Accession A0A0D7BQW1    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
237-258FAGKAKPTGKPKAKKEDKVFLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-101RKDGGRGRGRGRGRGEGRGRGR
240-253KAKPTGKPKAKKED
265-303RPQRGGGRGGRGEGRGRGRGEGRGRGEGRGRGGNRGGNR
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 13, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSVATKNPFALLDEDGSSTPAPASKPKETPAPAPAANKTSTRGRAPAARSGKYYQRGGSRSATTTDAAVNQDGTQETSERKDGGRGRGRGRGRGEGRGRGRQFDRHSQTGKTDSTKKVHQGWGGDDGETELKQEEAAATDAIAETTDTWGATASGDWGAAPAGEGETAATGKPTEDRPPRREREVEEEDNTLTLEQYLAQKKEAELAGVEKKEARQVEADFGDAVLLAKPEEEETYFAGKAKPTGKPKAKKEDKVFLEIDAHFERPQRGGGRGGRGEGRGRGRGEGRGRGEGRGRGGNRGGNRSAPAPTVDVDDQSAFPSLA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.19
4 0.17
5 0.15
6 0.13
7 0.13
8 0.14
9 0.2
10 0.26
11 0.32
12 0.36
13 0.39
14 0.47
15 0.49
16 0.52
17 0.5
18 0.5
19 0.47
20 0.47
21 0.48
22 0.43
23 0.42
24 0.38
25 0.36
26 0.37
27 0.39
28 0.38
29 0.37
30 0.37
31 0.42
32 0.45
33 0.51
34 0.5
35 0.47
36 0.48
37 0.49
38 0.53
39 0.52
40 0.52
41 0.47
42 0.48
43 0.47
44 0.47
45 0.48
46 0.43
47 0.39
48 0.38
49 0.35
50 0.27
51 0.26
52 0.23
53 0.2
54 0.17
55 0.16
56 0.14
57 0.12
58 0.13
59 0.13
60 0.12
61 0.11
62 0.11
63 0.12
64 0.14
65 0.16
66 0.16
67 0.16
68 0.21
69 0.26
70 0.34
71 0.42
72 0.45
73 0.47
74 0.54
75 0.57
76 0.57
77 0.56
78 0.55
79 0.49
80 0.53
81 0.54
82 0.54
83 0.57
84 0.59
85 0.56
86 0.53
87 0.53
88 0.51
89 0.52
90 0.54
91 0.55
92 0.52
93 0.53
94 0.49
95 0.5
96 0.47
97 0.44
98 0.39
99 0.39
100 0.37
101 0.39
102 0.41
103 0.43
104 0.44
105 0.45
106 0.42
107 0.37
108 0.35
109 0.37
110 0.33
111 0.28
112 0.22
113 0.19
114 0.17
115 0.15
116 0.13
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.03
147 0.04
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.06
160 0.07
161 0.15
162 0.24
163 0.32
164 0.38
165 0.48
166 0.52
167 0.56
168 0.57
169 0.53
170 0.53
171 0.54
172 0.51
173 0.44
174 0.41
175 0.36
176 0.32
177 0.29
178 0.2
179 0.11
180 0.07
181 0.05
182 0.05
183 0.11
184 0.15
185 0.16
186 0.17
187 0.18
188 0.18
189 0.22
190 0.21
191 0.16
192 0.12
193 0.15
194 0.19
195 0.18
196 0.19
197 0.15
198 0.16
199 0.2
200 0.2
201 0.18
202 0.16
203 0.17
204 0.22
205 0.21
206 0.21
207 0.16
208 0.16
209 0.14
210 0.1
211 0.1
212 0.05
213 0.05
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.1
222 0.14
223 0.14
224 0.15
225 0.16
226 0.15
227 0.19
228 0.22
229 0.28
230 0.32
231 0.42
232 0.51
233 0.59
234 0.67
235 0.74
236 0.8
237 0.82
238 0.82
239 0.82
240 0.76
241 0.73
242 0.65
243 0.55
244 0.5
245 0.4
246 0.38
247 0.3
248 0.28
249 0.23
250 0.25
251 0.25
252 0.21
253 0.26
254 0.24
255 0.24
256 0.3
257 0.33
258 0.39
259 0.39
260 0.4
261 0.38
262 0.38
263 0.4
264 0.39
265 0.4
266 0.37
267 0.37
268 0.39
269 0.38
270 0.43
271 0.44
272 0.46
273 0.45
274 0.48
275 0.48
276 0.48
277 0.51
278 0.47
279 0.47
280 0.47
281 0.44
282 0.41
283 0.44
284 0.46
285 0.46
286 0.48
287 0.46
288 0.41
289 0.42
290 0.38
291 0.37
292 0.33
293 0.29
294 0.24
295 0.22
296 0.25
297 0.23
298 0.22
299 0.22
300 0.22
301 0.2
302 0.2