Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D7BKT9

Protein Details
Accession A0A0D7BKT9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
338-363VEMAPVPKKKRGRPPKSKVLVNAQANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
272-308KRKAKTTQRQPASPPKRGRPIKTALARPQPRATRKGK
344-355PKKKRGRPPKSK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 9, cyto_nucl 8.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000305  GIY-YIG_endonuc  
IPR035901  GIY-YIG_endonuc_sf  
IPR027520  Slx1  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PF01541  GIY-YIG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50164  GIY_YIG  
CDD cd10455  GIY-YIG_SLX1  
Amino Acid Sequences MSQIHAYPQFYACYLLKSIQTPNSTATYIGSTPNPLRRIRQHNGEISAGAWKTSKRRPWVMQLLVHGFPSKQAALQFEWAWQHPHISRHLKSKASKGRTLTQHIKNLHIMVGSHPFDVQPLRVTIFTDVAQRLWNKLPPSNTTTTLNPGGPAAVDITSKTPHLTPSSDSCSVCSTALPPDPLSTAVCPNCRLPSHLPCLASRFLREEDNGSRRMLPRGGTCAGCGSYTLWGDLVRAMFNRVGSTKAIDDDDREGGISTEEEDILEVEPVPTKRKAKTTQRQPASPPKRGRPIKTALARPQPRATRKGKATVPADSSSEGEAFDFRNIDSNPDLTDSDVEMAPVPKKKRGRPPKSKVLVNAQANADDLADRMTSLTVSSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.23
3 0.24
4 0.26
5 0.31
6 0.33
7 0.35
8 0.33
9 0.35
10 0.35
11 0.33
12 0.3
13 0.25
14 0.22
15 0.21
16 0.22
17 0.2
18 0.21
19 0.26
20 0.33
21 0.37
22 0.36
23 0.43
24 0.49
25 0.58
26 0.6
27 0.65
28 0.66
29 0.67
30 0.68
31 0.62
32 0.53
33 0.44
34 0.42
35 0.32
36 0.25
37 0.19
38 0.19
39 0.24
40 0.33
41 0.4
42 0.42
43 0.51
44 0.56
45 0.64
46 0.71
47 0.71
48 0.67
49 0.65
50 0.62
51 0.54
52 0.49
53 0.4
54 0.29
55 0.24
56 0.23
57 0.17
58 0.14
59 0.15
60 0.18
61 0.19
62 0.23
63 0.22
64 0.22
65 0.24
66 0.23
67 0.24
68 0.21
69 0.24
70 0.24
71 0.27
72 0.33
73 0.38
74 0.41
75 0.48
76 0.53
77 0.55
78 0.56
79 0.63
80 0.64
81 0.63
82 0.64
83 0.59
84 0.62
85 0.62
86 0.66
87 0.65
88 0.63
89 0.64
90 0.6
91 0.59
92 0.52
93 0.47
94 0.39
95 0.3
96 0.23
97 0.18
98 0.23
99 0.2
100 0.18
101 0.17
102 0.16
103 0.17
104 0.17
105 0.16
106 0.11
107 0.11
108 0.12
109 0.12
110 0.13
111 0.13
112 0.14
113 0.13
114 0.16
115 0.15
116 0.14
117 0.17
118 0.17
119 0.19
120 0.2
121 0.23
122 0.21
123 0.24
124 0.26
125 0.27
126 0.33
127 0.33
128 0.33
129 0.32
130 0.31
131 0.32
132 0.31
133 0.27
134 0.21
135 0.18
136 0.15
137 0.12
138 0.11
139 0.08
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.13
150 0.14
151 0.14
152 0.18
153 0.24
154 0.27
155 0.26
156 0.25
157 0.24
158 0.24
159 0.22
160 0.17
161 0.12
162 0.12
163 0.13
164 0.13
165 0.12
166 0.12
167 0.12
168 0.13
169 0.12
170 0.1
171 0.13
172 0.14
173 0.15
174 0.16
175 0.17
176 0.19
177 0.18
178 0.21
179 0.22
180 0.26
181 0.3
182 0.32
183 0.32
184 0.29
185 0.33
186 0.31
187 0.27
188 0.22
189 0.2
190 0.18
191 0.18
192 0.18
193 0.19
194 0.23
195 0.26
196 0.26
197 0.24
198 0.25
199 0.25
200 0.27
201 0.25
202 0.2
203 0.18
204 0.22
205 0.23
206 0.21
207 0.2
208 0.19
209 0.18
210 0.15
211 0.14
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.11
227 0.1
228 0.12
229 0.11
230 0.13
231 0.12
232 0.12
233 0.14
234 0.13
235 0.14
236 0.15
237 0.15
238 0.13
239 0.13
240 0.12
241 0.1
242 0.1
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.06
251 0.07
252 0.05
253 0.05
254 0.09
255 0.1
256 0.14
257 0.19
258 0.22
259 0.26
260 0.35
261 0.44
262 0.52
263 0.62
264 0.69
265 0.75
266 0.78
267 0.78
268 0.77
269 0.79
270 0.76
271 0.75
272 0.72
273 0.7
274 0.73
275 0.76
276 0.75
277 0.71
278 0.69
279 0.7
280 0.69
281 0.7
282 0.68
283 0.71
284 0.71
285 0.68
286 0.69
287 0.69
288 0.67
289 0.67
290 0.64
291 0.63
292 0.63
293 0.67
294 0.63
295 0.62
296 0.6
297 0.57
298 0.56
299 0.48
300 0.45
301 0.37
302 0.34
303 0.27
304 0.24
305 0.18
306 0.13
307 0.12
308 0.12
309 0.12
310 0.11
311 0.1
312 0.16
313 0.16
314 0.19
315 0.2
316 0.2
317 0.19
318 0.21
319 0.22
320 0.16
321 0.17
322 0.15
323 0.15
324 0.14
325 0.14
326 0.13
327 0.15
328 0.19
329 0.24
330 0.27
331 0.33
332 0.42
333 0.5
334 0.6
335 0.69
336 0.75
337 0.8
338 0.86
339 0.89
340 0.9
341 0.88
342 0.83
343 0.82
344 0.81
345 0.74
346 0.7
347 0.6
348 0.52
349 0.46
350 0.39
351 0.29
352 0.2
353 0.15
354 0.11
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.08
359 0.08