Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B2VW39

Protein Details
Accession B2VW39    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-22TDKKVFKKASGDEKKAKPSAHydrophilic
87-112ESEAETKPKKSKKASPKKAPVKEDSSHydrophilic
135-157ETAPVKVKKEAKKPKKAKSVSSSHydrophilic
359-378ADAPKSKRSHVENRFQRIKPHydrophilic
406-428VTKGKGFTKEKNKGKRGSYRGGMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-106KPKKSKKASPKKAP
140-152KVKKEAKKPKKAK
228-237KKDKKTKGKK
280-283AKKN
410-422KGFTKEKNKGKRG
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MATDKKVFKKASGDEKKAKPSAVANVQVPLELVKTFLEEKGEKGAAGKLQEFTQWESAKNTPDAPEPMDVDKESASSSDSSSDSSSESEAETKPKKSKKASPKKAPVKEDSSSSSSSSDSSSDSDSSSDSDSDEETAPVKVKKEAKKPKKAKSVSSSSASSSSESSDSSDSDSSSDDSSDEEPANIPLPDSGSSAASSDSESDSESESSSDSSSDSSSESEAEEKVEKKDKKTKGKKAASVASSSASSSSDSDSSDSSDSSDDSDSDSESDASSAKASKAKKNVKKGAASSSESSSSDSSSDSSSDSSSDSDSDSDSGKATKSTALERKTSASDSSMTLPAASPQPSGNKRKFNGSPSADAPKSKRSHVENRFQRIKPDVQVDPKLASNAYVSYDYADRAHAKLIVTKGKGFTKEKNKGKRGSYRGGMIDTSGGKGIKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.75
3 0.8
4 0.75
5 0.67
6 0.6
7 0.54
8 0.54
9 0.53
10 0.51
11 0.43
12 0.43
13 0.42
14 0.38
15 0.34
16 0.25
17 0.18
18 0.12
19 0.12
20 0.08
21 0.11
22 0.12
23 0.13
24 0.19
25 0.18
26 0.2
27 0.26
28 0.26
29 0.23
30 0.23
31 0.26
32 0.23
33 0.26
34 0.26
35 0.21
36 0.21
37 0.24
38 0.25
39 0.25
40 0.3
41 0.28
42 0.28
43 0.31
44 0.33
45 0.35
46 0.34
47 0.32
48 0.27
49 0.3
50 0.31
51 0.29
52 0.29
53 0.27
54 0.28
55 0.28
56 0.26
57 0.22
58 0.2
59 0.18
60 0.15
61 0.13
62 0.12
63 0.1
64 0.11
65 0.12
66 0.12
67 0.13
68 0.14
69 0.14
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.11
74 0.12
75 0.13
76 0.14
77 0.21
78 0.25
79 0.29
80 0.37
81 0.43
82 0.51
83 0.56
84 0.65
85 0.68
86 0.75
87 0.81
88 0.84
89 0.88
90 0.91
91 0.91
92 0.88
93 0.83
94 0.78
95 0.69
96 0.62
97 0.56
98 0.49
99 0.42
100 0.36
101 0.3
102 0.24
103 0.23
104 0.19
105 0.15
106 0.13
107 0.12
108 0.14
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.12
113 0.13
114 0.13
115 0.12
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.11
120 0.11
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.12
125 0.14
126 0.14
127 0.18
128 0.26
129 0.33
130 0.44
131 0.54
132 0.62
133 0.72
134 0.8
135 0.84
136 0.87
137 0.84
138 0.82
139 0.79
140 0.77
141 0.71
142 0.66
143 0.57
144 0.48
145 0.45
146 0.37
147 0.29
148 0.21
149 0.17
150 0.14
151 0.12
152 0.13
153 0.11
154 0.11
155 0.12
156 0.12
157 0.11
158 0.1
159 0.11
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.08
164 0.09
165 0.09
166 0.11
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.11
172 0.09
173 0.08
174 0.06
175 0.08
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.1
211 0.11
212 0.13
213 0.21
214 0.23
215 0.27
216 0.36
217 0.44
218 0.53
219 0.62
220 0.7
221 0.72
222 0.78
223 0.78
224 0.76
225 0.73
226 0.64
227 0.56
228 0.46
229 0.36
230 0.29
231 0.23
232 0.17
233 0.11
234 0.1
235 0.08
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.13
264 0.16
265 0.22
266 0.32
267 0.42
268 0.49
269 0.58
270 0.66
271 0.68
272 0.7
273 0.67
274 0.65
275 0.61
276 0.56
277 0.48
278 0.41
279 0.37
280 0.31
281 0.3
282 0.23
283 0.17
284 0.14
285 0.13
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.09
290 0.1
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.1
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.12
309 0.13
310 0.21
311 0.27
312 0.3
313 0.32
314 0.33
315 0.36
316 0.35
317 0.35
318 0.29
319 0.23
320 0.21
321 0.21
322 0.22
323 0.21
324 0.18
325 0.16
326 0.15
327 0.15
328 0.17
329 0.16
330 0.14
331 0.15
332 0.24
333 0.31
334 0.4
335 0.45
336 0.5
337 0.51
338 0.59
339 0.62
340 0.59
341 0.62
342 0.57
343 0.55
344 0.51
345 0.58
346 0.5
347 0.49
348 0.47
349 0.46
350 0.45
351 0.43
352 0.46
353 0.46
354 0.55
355 0.6
356 0.67
357 0.68
358 0.75
359 0.8
360 0.74
361 0.72
362 0.67
363 0.63
364 0.58
365 0.55
366 0.52
367 0.5
368 0.54
369 0.51
370 0.47
371 0.43
372 0.38
373 0.32
374 0.26
375 0.2
376 0.16
377 0.17
378 0.16
379 0.14
380 0.15
381 0.16
382 0.16
383 0.16
384 0.18
385 0.17
386 0.17
387 0.19
388 0.19
389 0.2
390 0.24
391 0.29
392 0.34
393 0.34
394 0.37
395 0.4
396 0.43
397 0.5
398 0.49
399 0.53
400 0.56
401 0.64
402 0.7
403 0.76
404 0.79
405 0.79
406 0.84
407 0.85
408 0.82
409 0.81
410 0.77
411 0.73
412 0.68
413 0.63
414 0.54
415 0.44
416 0.4
417 0.31
418 0.27
419 0.23
420 0.2
421 0.16