Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D7BP72

Protein Details
Accession A0A0D7BP72    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-58DDDKPKNDKKAGRRKIKIEFIQBasic
181-203SDERPGQKRRRRGSNAQQPPRGTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-73PKNDKKAGRRKIKIEFIQDKSRRHITFSKRKAG
188-192KRRRR
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033897  MADS_SRF-like  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000987  F:cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00319  SRF-TF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00350  MADS_BOX_1  
PS50066  MADS_BOX_2  
CDD cd00266  MADS_SRF_like  
Amino Acid Sequences MSAPHDQQLAHPLPPVSNDAFIADVEAQDSGADDDDDDDKPKNDKKAGRRKIKIEFIQDKSRRHITFSKRKAGIMKKAYELSTLTGTQVLLLVVSETGLVYTFTTAKLQPLVTQPEGKNLIQACLNAPQGSLPMPAGPPIARSTGPMPPPPTVPPGSLPPGMSMAGPPGGPQDGDDDDDDSDERPGQKRRRRGSNAQQPPRGTNGSPGVAQASVPSGPQSATPQTPMSAISSPTSPNQIPPGGYRYGGVPPHTEGYPMMQPGAYQYPPTSPMAAGAPQSSLSAAAAAQQQGHWPQQQQQYASR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.3
3 0.23
4 0.21
5 0.21
6 0.18
7 0.18
8 0.17
9 0.17
10 0.13
11 0.11
12 0.1
13 0.09
14 0.08
15 0.07
16 0.08
17 0.06
18 0.06
19 0.06
20 0.06
21 0.08
22 0.1
23 0.11
24 0.13
25 0.14
26 0.15
27 0.21
28 0.26
29 0.31
30 0.37
31 0.44
32 0.53
33 0.62
34 0.71
35 0.76
36 0.79
37 0.8
38 0.82
39 0.84
40 0.8
41 0.79
42 0.78
43 0.73
44 0.76
45 0.74
46 0.69
47 0.65
48 0.67
49 0.57
50 0.54
51 0.56
52 0.56
53 0.61
54 0.65
55 0.68
56 0.62
57 0.64
58 0.67
59 0.66
60 0.66
61 0.62
62 0.58
63 0.52
64 0.53
65 0.51
66 0.44
67 0.36
68 0.28
69 0.24
70 0.2
71 0.17
72 0.14
73 0.14
74 0.12
75 0.11
76 0.09
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.04
87 0.04
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.11
95 0.11
96 0.13
97 0.16
98 0.21
99 0.21
100 0.27
101 0.26
102 0.3
103 0.34
104 0.31
105 0.3
106 0.25
107 0.25
108 0.2
109 0.2
110 0.15
111 0.15
112 0.16
113 0.13
114 0.12
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.1
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.07
125 0.08
126 0.09
127 0.1
128 0.1
129 0.11
130 0.13
131 0.17
132 0.19
133 0.21
134 0.22
135 0.21
136 0.22
137 0.22
138 0.23
139 0.2
140 0.19
141 0.17
142 0.18
143 0.21
144 0.2
145 0.19
146 0.16
147 0.16
148 0.15
149 0.13
150 0.1
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.1
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.13
172 0.21
173 0.3
174 0.37
175 0.46
176 0.54
177 0.63
178 0.7
179 0.76
180 0.78
181 0.8
182 0.84
183 0.83
184 0.81
185 0.72
186 0.66
187 0.6
188 0.52
189 0.41
190 0.35
191 0.3
192 0.26
193 0.25
194 0.23
195 0.19
196 0.17
197 0.16
198 0.11
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.09
206 0.12
207 0.14
208 0.15
209 0.17
210 0.18
211 0.18
212 0.18
213 0.18
214 0.17
215 0.15
216 0.15
217 0.14
218 0.15
219 0.16
220 0.17
221 0.21
222 0.18
223 0.18
224 0.21
225 0.22
226 0.22
227 0.23
228 0.26
229 0.23
230 0.23
231 0.21
232 0.19
233 0.23
234 0.24
235 0.23
236 0.21
237 0.22
238 0.25
239 0.24
240 0.23
241 0.18
242 0.2
243 0.22
244 0.2
245 0.18
246 0.15
247 0.15
248 0.18
249 0.23
250 0.19
251 0.17
252 0.17
253 0.19
254 0.22
255 0.25
256 0.22
257 0.17
258 0.18
259 0.19
260 0.2
261 0.19
262 0.17
263 0.16
264 0.15
265 0.15
266 0.13
267 0.11
268 0.09
269 0.08
270 0.07
271 0.09
272 0.12
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.17
277 0.21
278 0.26
279 0.27
280 0.27
281 0.34
282 0.42
283 0.48