Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YRX0

Protein Details
Accession W6YRX0    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MGKSKEKRAAKPESPNKSAKHydrophilic
120-143GLDGTQDKQKKRKRGNKEEIEDAYHydrophilic
151-173EEKEEQQRQKKRKTKEVVNDDEDAcidic
435-470FPPMLPRKLRITRCKAEKKKDKPRGPPPSSQKSPKAHydrophilic
526-550KGSGGGKKKGPNGRKSRSAGWKKSGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-9KRA
128-135QKKRKRGN
441-474RKLRITRCKAEKKKDKPRGPPPSSQKSPKANGKA
515-553SERQGKSGLKFKGSGGGKKKGPNGRKSRSAGWKKSGGKK
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG bze:COCCADRAFT_93881  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKSKEKRAAKPESPNKSAKSSNSFIKVDKAAFDPALASLFASSAGPVQPPPKSRYQARIQKQTTEESSEEEDEGDANDAELSLASGSLPSDDEDEDMSDASGNEEPESEIILAKVRESGLDGTQDKQKKRKRGNKEEIEDAYMRKLAQEEEKEEQQRQKKRKTKEVVNDDEDEDADKDDKSSDDAEDNDIEDGDTKGESGEAEKTFTIPKHESLMEATDGSAAEVEKAARTVFLSNVSTECINSKSAEKTLKKHLESFIADLADNNPPHKIESIRFRSTAFGSSLPKRAAFAKKDIMDATTKSTNAYAVYTTKVAAREAVKRLNGSVLLNRHLHVDSVAHPAKVDHRRCVFVGNLPFVDDESQMPVAEGEKPKKNKPSSDVEEGLWVHLSKCGTIESVRVVRDAKTRVGKGFAYVQFTDENGVEAALQLNEKNFPPMLPRKLRITRCKAEKKKDKPRGPPPSSQKSPKANGKAGYTPKLSEEQKSLQGRARSMLGKVAKAQTKEGFVFEGHRASERQGKSGLKFKGSGGGKKKGPNGRKSRSAGWKKSGGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.79
3 0.74
4 0.7
5 0.67
6 0.63
7 0.61
8 0.57
9 0.58
10 0.59
11 0.57
12 0.52
13 0.52
14 0.49
15 0.42
16 0.4
17 0.35
18 0.31
19 0.28
20 0.27
21 0.21
22 0.18
23 0.17
24 0.15
25 0.12
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.09
33 0.1
34 0.12
35 0.16
36 0.21
37 0.27
38 0.32
39 0.39
40 0.45
41 0.5
42 0.57
43 0.63
44 0.68
45 0.72
46 0.78
47 0.73
48 0.73
49 0.71
50 0.69
51 0.62
52 0.57
53 0.48
54 0.41
55 0.42
56 0.35
57 0.32
58 0.25
59 0.21
60 0.16
61 0.16
62 0.13
63 0.09
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.05
76 0.06
77 0.06
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.1
82 0.11
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.1
90 0.1
91 0.09
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.11
96 0.1
97 0.08
98 0.08
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.12
103 0.11
104 0.1
105 0.13
106 0.14
107 0.13
108 0.19
109 0.2
110 0.2
111 0.28
112 0.34
113 0.37
114 0.44
115 0.51
116 0.55
117 0.65
118 0.73
119 0.77
120 0.82
121 0.88
122 0.89
123 0.86
124 0.84
125 0.75
126 0.7
127 0.6
128 0.49
129 0.4
130 0.31
131 0.25
132 0.18
133 0.16
134 0.14
135 0.19
136 0.23
137 0.26
138 0.29
139 0.36
140 0.38
141 0.41
142 0.46
143 0.48
144 0.53
145 0.57
146 0.63
147 0.65
148 0.71
149 0.77
150 0.79
151 0.81
152 0.82
153 0.83
154 0.81
155 0.77
156 0.71
157 0.61
158 0.52
159 0.42
160 0.32
161 0.22
162 0.15
163 0.11
164 0.09
165 0.08
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.1
170 0.1
171 0.11
172 0.12
173 0.14
174 0.14
175 0.14
176 0.12
177 0.11
178 0.1
179 0.08
180 0.08
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.12
193 0.14
194 0.15
195 0.19
196 0.17
197 0.18
198 0.2
199 0.2
200 0.2
201 0.19
202 0.2
203 0.16
204 0.14
205 0.13
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.07
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.11
225 0.12
226 0.11
227 0.1
228 0.11
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.12
234 0.16
235 0.24
236 0.26
237 0.28
238 0.38
239 0.44
240 0.44
241 0.45
242 0.44
243 0.41
244 0.39
245 0.37
246 0.28
247 0.21
248 0.2
249 0.17
250 0.17
251 0.15
252 0.14
253 0.13
254 0.11
255 0.11
256 0.12
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.22
261 0.29
262 0.31
263 0.31
264 0.31
265 0.32
266 0.31
267 0.3
268 0.22
269 0.17
270 0.18
271 0.2
272 0.24
273 0.23
274 0.22
275 0.2
276 0.24
277 0.28
278 0.27
279 0.28
280 0.31
281 0.31
282 0.32
283 0.32
284 0.28
285 0.23
286 0.21
287 0.21
288 0.17
289 0.16
290 0.14
291 0.14
292 0.14
293 0.12
294 0.12
295 0.09
296 0.08
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.11
302 0.11
303 0.13
304 0.14
305 0.19
306 0.22
307 0.26
308 0.25
309 0.25
310 0.25
311 0.24
312 0.22
313 0.18
314 0.18
315 0.17
316 0.19
317 0.19
318 0.19
319 0.2
320 0.19
321 0.18
322 0.14
323 0.13
324 0.11
325 0.19
326 0.2
327 0.17
328 0.17
329 0.18
330 0.26
331 0.33
332 0.34
333 0.33
334 0.35
335 0.37
336 0.38
337 0.4
338 0.33
339 0.3
340 0.31
341 0.27
342 0.24
343 0.22
344 0.22
345 0.2
346 0.2
347 0.14
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.13
356 0.17
357 0.2
358 0.27
359 0.32
360 0.38
361 0.47
362 0.51
363 0.52
364 0.53
365 0.58
366 0.57
367 0.6
368 0.56
369 0.47
370 0.47
371 0.41
372 0.36
373 0.27
374 0.21
375 0.13
376 0.14
377 0.14
378 0.09
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.11
383 0.12
384 0.14
385 0.18
386 0.18
387 0.19
388 0.2
389 0.21
390 0.26
391 0.28
392 0.29
393 0.33
394 0.35
395 0.35
396 0.38
397 0.35
398 0.32
399 0.37
400 0.33
401 0.31
402 0.29
403 0.29
404 0.26
405 0.26
406 0.25
407 0.17
408 0.15
409 0.09
410 0.09
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.07
415 0.07
416 0.07
417 0.08
418 0.1
419 0.1
420 0.13
421 0.12
422 0.12
423 0.19
424 0.27
425 0.36
426 0.41
427 0.44
428 0.51
429 0.6
430 0.69
431 0.72
432 0.73
433 0.73
434 0.76
435 0.84
436 0.85
437 0.87
438 0.88
439 0.89
440 0.91
441 0.92
442 0.91
443 0.91
444 0.92
445 0.92
446 0.88
447 0.87
448 0.85
449 0.85
450 0.84
451 0.81
452 0.79
453 0.76
454 0.78
455 0.78
456 0.76
457 0.72
458 0.68
459 0.65
460 0.65
461 0.63
462 0.6
463 0.53
464 0.46
465 0.42
466 0.46
467 0.42
468 0.38
469 0.37
470 0.36
471 0.42
472 0.46
473 0.46
474 0.45
475 0.47
476 0.45
477 0.41
478 0.42
479 0.35
480 0.32
481 0.36
482 0.33
483 0.31
484 0.35
485 0.4
486 0.4
487 0.4
488 0.44
489 0.4
490 0.42
491 0.41
492 0.37
493 0.31
494 0.27
495 0.29
496 0.26
497 0.26
498 0.22
499 0.23
500 0.23
501 0.25
502 0.33
503 0.31
504 0.32
505 0.34
506 0.39
507 0.41
508 0.48
509 0.5
510 0.45
511 0.45
512 0.42
513 0.45
514 0.45
515 0.49
516 0.48
517 0.52
518 0.53
519 0.58
520 0.66
521 0.67
522 0.71
523 0.73
524 0.76
525 0.76
526 0.81
527 0.8
528 0.81
529 0.82
530 0.84
531 0.82
532 0.79
533 0.8