FuNGI

W6YPC0

Protein Details

Accession

W6YPC0

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
654-691	QSPSGGGGKNKNRKQRQREKRERERQQQQQQQQQQQQQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
433-437	KAKKR
516-600	RRGMGRGRGPWGDRGRGFRGRGGAGGRGDFGGARGDRGGYGGGNGGRGDFGGGRGDRAGQRGDRGAQGNNRGDKGGGEKGGRAGK
660-676	GGKNKNRKQRQREKRER

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto_nucl 15.5, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
KEGG	bze:COCCADRAFT_85834 -
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MSDSLEPPAKRARLEADAPTQYGTSASSASALDAPGSPVDDMDDDFYDTTPVKPSALPTAVDGTTASSFAAVAPAPAFHLPGLGSTSEAPVAQPQPQPHDGAAAQDEPEDGEFSDGEAFYDDANANAQTGIPVEPSAANQAQAQHDAPQQGMPSPSELPGANLTSAQDAAAAADTPAADTDGELDAALTAAIDQQNETEDASPEGATFDSKAEFLRAAEANRGDQNAEWQLDSDASDSDSDSSSDSSSDDSSDEGELLDPEEQVRLLMAEVADDAGASGPVKVKTLNEMDEKFEKPDITVTEDTKITELGKVESIVGNLVVVKAKMAGDEQVLESGSALCLQNRTVVGKVSEQIGRVEEPRYSFGFNDTAELTTLGIEKDTPIYYVDEHSTFAETEPIRRQKHTDASNLHDEETNEVEFSDDEKEAEYKREQKAKKRARADTNEEQAPVNIPTGPRLHVDAPAPPIYRPMEYQGGGLKYSDDEDEDLGMYKPLARPDHFEQIVGQGAPLEDRSHVRRGMGRGRGPWGDRGRGFRGRGGAGGRGDFGGARGDRGGYGGGNGGRGDFGGGRGDRAGQRGDRGAQGNNRGDKGGGEKGGRAGKNQSDRGKQQEQFQQNNQQQRNGPYQDNRSAASASPARQQQDRSQSYPQQPPSQQSPSGGGGKNKNRKQRQREKRERERQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQSQKQQQQNASPAPSGPSNSNAYTNNSNAGWPVPFSGPSQPAIPYASAPPPPPPAAAASYTPQPSYTPQPPVPAQPQAQPQQNQAANWAAWAQWFQVVGAMSGQQPPQPQLAAQAPAPPPPQPAAQAQYSYPYQGYGQNQAPGMNAPPPGNGQASAQSLQDILRALQGGGAPQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.45
3	0.45
4	0.45
5	0.45
6	0.43
7	0.37
8	0.3
9	0.26
10	0.21
11	0.13
12	0.11
13	0.1
14	0.1
15	0.1
16	0.12
17	0.12
18	0.11
19	0.11
20	0.11
21	0.12
22	0.11
23	0.13
24	0.11
25	0.1
26	0.11
27	0.11
28	0.11
29	0.13
30	0.13
31	0.13
32	0.14
33	0.14
34	0.14
35	0.14
36	0.15
37	0.17
38	0.16
39	0.16
40	0.17
41	0.19
42	0.26
43	0.28
44	0.27
45	0.25
46	0.29
47	0.27
48	0.26
49	0.24
50	0.19
51	0.17
52	0.16
53	0.14
54	0.09
55	0.09
56	0.08
57	0.1
58	0.07
59	0.07
60	0.07
61	0.08
62	0.1
63	0.1
64	0.11
65	0.09
66	0.1
67	0.09
68	0.1
69	0.12
70	0.1
71	0.11
72	0.11
73	0.12
74	0.12
75	0.12
76	0.11
77	0.14
78	0.16
79	0.21
80	0.24
81	0.26
82	0.33
83	0.35
84	0.37
85	0.32
86	0.34
87	0.29
88	0.28
89	0.28
90	0.22
91	0.2
92	0.18
93	0.18
94	0.14
95	0.14
96	0.12
97	0.09
98	0.08
99	0.08
100	0.08
101	0.1
102	0.1
103	0.09
104	0.09
105	0.09
106	0.08
107	0.11
108	0.1
109	0.08
110	0.1
111	0.1
112	0.09
113	0.09
114	0.09
115	0.07
116	0.08
117	0.08
118	0.07
119	0.07
120	0.08
121	0.09
122	0.1
123	0.15
124	0.15
125	0.15
126	0.16
127	0.19
128	0.2
129	0.23
130	0.23
131	0.21
132	0.23
133	0.23
134	0.23
135	0.21
136	0.19
137	0.19
138	0.2
139	0.17
140	0.16
141	0.17
142	0.17
143	0.17
144	0.16
145	0.16
146	0.17
147	0.18
148	0.15
149	0.15
150	0.15
151	0.13
152	0.14
153	0.11
154	0.08
155	0.07
156	0.07
157	0.07
158	0.06
159	0.05
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.06
164	0.06
165	0.05
166	0.05
167	0.07
168	0.07
169	0.07
170	0.07
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.06
175	0.04
176	0.03
177	0.05
178	0.06
179	0.06
180	0.07
181	0.07
182	0.09
183	0.09
184	0.1
185	0.09
186	0.09
187	0.1
188	0.11
189	0.11
190	0.09
191	0.09
192	0.09
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.08
197	0.08
198	0.09
199	0.09
200	0.1
201	0.1
202	0.13
203	0.14
204	0.15
205	0.19
206	0.2
207	0.21
208	0.22
209	0.22
210	0.18
211	0.16
212	0.2
213	0.2
214	0.19
215	0.17
216	0.16
217	0.16
218	0.15
219	0.16
220	0.12
221	0.08
222	0.08
223	0.08
224	0.08
225	0.08
226	0.08
227	0.08
228	0.08
229	0.09
230	0.08
231	0.08
232	0.08
233	0.09
234	0.09
235	0.09
236	0.08
237	0.08
238	0.09
239	0.08
240	0.08
241	0.07
242	0.07
243	0.06
244	0.07
245	0.07
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.06
251	0.06
252	0.05
253	0.04
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.04
261	0.04
262	0.03
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.07
267	0.08
268	0.08
269	0.09
270	0.1
271	0.14
272	0.17
273	0.2
274	0.22
275	0.23
276	0.27
277	0.3
278	0.31
279	0.28
280	0.27
281	0.23
282	0.18
283	0.2
284	0.18
285	0.2
286	0.21
287	0.21
288	0.22
289	0.22
290	0.22
291	0.19
292	0.18
293	0.12
294	0.12
295	0.11
296	0.1
297	0.1
298	0.11
299	0.11
300	0.11
301	0.1
302	0.09
303	0.08
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.05
309	0.05
310	0.06
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.07
315	0.07
316	0.08
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.07
321	0.07
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.07
328	0.07
329	0.09
330	0.1
331	0.12
332	0.11
333	0.12
334	0.13
335	0.14
336	0.14
337	0.15
338	0.15
339	0.15
340	0.15
341	0.14
342	0.14
343	0.14
344	0.14
345	0.13
346	0.13
347	0.15
348	0.15
349	0.15
350	0.14
351	0.15
352	0.16
353	0.15
354	0.15
355	0.13
356	0.12
357	0.11
358	0.11
359	0.09
360	0.07
361	0.08
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.07
370	0.08
371	0.09
372	0.1
373	0.12
374	0.1
375	0.11
376	0.11
377	0.11
378	0.1
379	0.1
380	0.13
381	0.12
382	0.14
383	0.21
384	0.28
385	0.29
386	0.3
387	0.33
388	0.33
389	0.41
390	0.42
391	0.42
392	0.38
393	0.41
394	0.46
395	0.44
396	0.39
397	0.33
398	0.29
399	0.23
400	0.22
401	0.17
402	0.1
403	0.09
404	0.09
405	0.07
406	0.08
407	0.08
408	0.07
409	0.07
410	0.07
411	0.09
412	0.09
413	0.12
414	0.13
415	0.18
416	0.23
417	0.31
418	0.35
419	0.43
420	0.54
421	0.61
422	0.67
423	0.68
424	0.71
425	0.72
426	0.75
427	0.74
428	0.71
429	0.66
430	0.59
431	0.51
432	0.44
433	0.34
434	0.28
435	0.2
436	0.13
437	0.09
438	0.08
439	0.1
440	0.11
441	0.12
442	0.11
443	0.13
444	0.13
445	0.14
446	0.15
447	0.15
448	0.17
449	0.2
450	0.2
451	0.17
452	0.19
453	0.18
454	0.18
455	0.17
456	0.17
457	0.17
458	0.17
459	0.18
460	0.18
461	0.18
462	0.17
463	0.16
464	0.13
465	0.1
466	0.1
467	0.09
468	0.07
469	0.06
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.07
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.07
478	0.08
479	0.12
480	0.15
481	0.15
482	0.2
483	0.25
484	0.33
485	0.32
486	0.3
487	0.27
488	0.26
489	0.26
490	0.2
491	0.16
492	0.08
493	0.07
494	0.07
495	0.08
496	0.06
497	0.06
498	0.09
499	0.12
500	0.16
501	0.16
502	0.18
503	0.21
504	0.25
505	0.32
506	0.36
507	0.36
508	0.35
509	0.38
510	0.4
511	0.37
512	0.4
513	0.36
514	0.34
515	0.33
516	0.36
517	0.38
518	0.41
519	0.41
520	0.35
521	0.35
522	0.3
523	0.3
524	0.27
525	0.24
526	0.19
527	0.18
528	0.16
529	0.13
530	0.13
531	0.1
532	0.09
533	0.1
534	0.09
535	0.09
536	0.09
537	0.09
538	0.09
539	0.1
540	0.1
541	0.05
542	0.06
543	0.08
544	0.08
545	0.08
546	0.08
547	0.08
548	0.07
549	0.07
550	0.08
551	0.05
552	0.06
553	0.09
554	0.1
555	0.1
556	0.1
557	0.13
558	0.13
559	0.15
560	0.17
561	0.14
562	0.16
563	0.18
564	0.19
565	0.21
566	0.21
567	0.23
568	0.25
569	0.32
570	0.35
571	0.35
572	0.35
573	0.31
574	0.29
575	0.26
576	0.26
577	0.22
578	0.2
579	0.18
580	0.18
581	0.22
582	0.28
583	0.28
584	0.25
585	0.26
586	0.29
587	0.36
588	0.42
589	0.45
590	0.45
591	0.49
592	0.55
593	0.58
594	0.55
595	0.55
596	0.57
597	0.59
598	0.58
599	0.6
600	0.62
601	0.59
602	0.66
603	0.6
604	0.56
605	0.51
606	0.5
607	0.53
608	0.47
609	0.47
610	0.44
611	0.48
612	0.49
613	0.47
614	0.44
615	0.37
616	0.34
617	0.29
618	0.28
619	0.25
620	0.21
621	0.24
622	0.27
623	0.28
624	0.3
625	0.33
626	0.35
627	0.42
628	0.46
629	0.45
630	0.48
631	0.54
632	0.59
633	0.63
634	0.61
635	0.58
636	0.56
637	0.56
638	0.56
639	0.54
640	0.47
641	0.41
642	0.4
643	0.36
644	0.39
645	0.37
646	0.35
647	0.39
648	0.47
649	0.56
650	0.58
651	0.65
652	0.69
653	0.77
654	0.83
655	0.85
656	0.87
657	0.88
658	0.93
659	0.94
660	0.95
661	0.95
662	0.95
663	0.94
664	0.93
665	0.93
666	0.92
667	0.91
668	0.88
669	0.87
670	0.86
671	0.84
672	0.82
673	0.79
674	0.77
675	0.75
676	0.75
677	0.72
678	0.71
679	0.7
680	0.7
681	0.7
682	0.7
683	0.69
684	0.68
685	0.69
686	0.69
687	0.71
688	0.72
689	0.73
690	0.72
691	0.72
692	0.71
693	0.69
694	0.68
695	0.63
696	0.57
697	0.48
698	0.42
699	0.38
700	0.33
701	0.28
702	0.23
703	0.21
704	0.23
705	0.23
706	0.27
707	0.26
708	0.29
709	0.31
710	0.3
711	0.29
712	0.25
713	0.24
714	0.21
715	0.21
716	0.16
717	0.13
718	0.15
719	0.13
720	0.14
721	0.16
722	0.21
723	0.22
724	0.22
725	0.23
726	0.22
727	0.22
728	0.23
729	0.21
730	0.17
731	0.18
732	0.22
733	0.23
734	0.23
735	0.26
736	0.29
737	0.29
738	0.28
739	0.26
740	0.24
741	0.24
742	0.26
743	0.24
744	0.22
745	0.26
746	0.27
747	0.26
748	0.24
749	0.22
750	0.23
751	0.29
752	0.33
753	0.35
754	0.36
755	0.42
756	0.43
757	0.49
758	0.51
759	0.5
760	0.46
761	0.44
762	0.5
763	0.51
764	0.57
765	0.53
766	0.51
767	0.53
768	0.54
769	0.48
770	0.43
771	0.4
772	0.31
773	0.29
774	0.26
775	0.17
776	0.15
777	0.16
778	0.14
779	0.12
780	0.12
781	0.11
782	0.13
783	0.13
784	0.13
785	0.13
786	0.13
787	0.12
788	0.15
789	0.16
790	0.15
791	0.17
792	0.19
793	0.21
794	0.2
795	0.19
796	0.22
797	0.26
798	0.27
799	0.25
800	0.3
801	0.29
802	0.33
803	0.35
804	0.31
805	0.29
806	0.29
807	0.31
808	0.26
809	0.31
810	0.31
811	0.33
812	0.33
813	0.31
814	0.34
815	0.32
816	0.31
817	0.25
818	0.22
819	0.2
820	0.24
821	0.27
822	0.29
823	0.32
824	0.33
825	0.34
826	0.33
827	0.32
828	0.28
829	0.27
830	0.23
831	0.22
832	0.19
833	0.2
834	0.22
835	0.24
836	0.24
837	0.23
838	0.21
839	0.23
840	0.27
841	0.26
842	0.24
843	0.21
844	0.2
845	0.19
846	0.19
847	0.16
848	0.12
849	0.13
850	0.14
851	0.13
852	0.15

W6YPC0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer