Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6XXB9

Protein Details
Accession W6XXB9    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-47KDEPSTKKPRFDPRNPSTLAHydrophilic
301-323GKAVPKKPTNNWAKKKKAQSMEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
247-267KKEMKKAKEAQDKRDAERKAK
314-316KKK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
IPR003169  GYF  
IPR035445  GYF-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
KEGG bze:COCCADRAFT_7965  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02213  GYF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50829  GYF  
Amino Acid Sequences MASSSGTYNPARPKRAGEQFTRTHHLDKDEPSTKKPRFDPRNPSTLAPDADDDEDDPALEADVIGKGAGIKRNAVNIDGYDSDSSTENFDIRAEANHKKEKPAKDDDDDDDMFADEPKEDEQDEELGKDQGKKKKLRFLDNAEIEGQEESSKSGGHVAVDFTKGAKAATDEVESSSDEGDDEERDRLDSDMDEELGAGSKKKHAPKLDAFNMRAEQEEGRFDEAGNYVRKAFDPDAVQDSWLEGISKKEMKKAKEAQDKRDAERKAKERAEDSIVTSEVLSTLISHLEVGETPMEALVRYGKAVPKKPTNNWAKKKKAQSMEVDTDPSQEAAAAKAKQVIDSITECASRLSDRGVEDIYELPRESIMRQYKRETGEDWKNPNPEPVQWEFHWLNAPEGDINGPYDQATMQAWEASGQFAAGAEFRRVGESEWSRLLDFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.65
3 0.66
4 0.63
5 0.64
6 0.67
7 0.71
8 0.71
9 0.64
10 0.58
11 0.55
12 0.53
13 0.5
14 0.47
15 0.5
16 0.52
17 0.53
18 0.55
19 0.62
20 0.6
21 0.63
22 0.66
23 0.67
24 0.69
25 0.75
26 0.8
27 0.76
28 0.81
29 0.75
30 0.69
31 0.64
32 0.59
33 0.51
34 0.42
35 0.36
36 0.29
37 0.28
38 0.26
39 0.21
40 0.17
41 0.15
42 0.12
43 0.11
44 0.09
45 0.08
46 0.07
47 0.06
48 0.05
49 0.06
50 0.06
51 0.05
52 0.05
53 0.07
54 0.11
55 0.16
56 0.16
57 0.19
58 0.21
59 0.26
60 0.27
61 0.26
62 0.24
63 0.2
64 0.23
65 0.21
66 0.21
67 0.16
68 0.16
69 0.15
70 0.15
71 0.15
72 0.13
73 0.13
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.15
80 0.18
81 0.24
82 0.31
83 0.39
84 0.4
85 0.48
86 0.55
87 0.58
88 0.6
89 0.63
90 0.63
91 0.59
92 0.63
93 0.58
94 0.56
95 0.49
96 0.41
97 0.32
98 0.26
99 0.21
100 0.16
101 0.13
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.09
106 0.08
107 0.09
108 0.1
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.13
114 0.15
115 0.2
116 0.26
117 0.3
118 0.38
119 0.46
120 0.5
121 0.57
122 0.63
123 0.67
124 0.68
125 0.7
126 0.72
127 0.66
128 0.63
129 0.54
130 0.47
131 0.38
132 0.3
133 0.21
134 0.11
135 0.08
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.1
145 0.11
146 0.12
147 0.12
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.08
153 0.07
154 0.08
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.09
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.08
170 0.07
171 0.08
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.11
187 0.16
188 0.21
189 0.27
190 0.29
191 0.36
192 0.42
193 0.51
194 0.54
195 0.55
196 0.52
197 0.48
198 0.46
199 0.39
200 0.33
201 0.25
202 0.17
203 0.12
204 0.13
205 0.11
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.14
212 0.13
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.13
217 0.15
218 0.14
219 0.14
220 0.14
221 0.15
222 0.18
223 0.18
224 0.18
225 0.15
226 0.14
227 0.11
228 0.1
229 0.09
230 0.05
231 0.07
232 0.1
233 0.15
234 0.15
235 0.21
236 0.26
237 0.28
238 0.37
239 0.44
240 0.5
241 0.57
242 0.61
243 0.62
244 0.68
245 0.69
246 0.64
247 0.63
248 0.55
249 0.5
250 0.54
251 0.52
252 0.5
253 0.5
254 0.49
255 0.43
256 0.44
257 0.44
258 0.36
259 0.33
260 0.26
261 0.23
262 0.21
263 0.18
264 0.15
265 0.1
266 0.09
267 0.06
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.1
288 0.13
289 0.2
290 0.27
291 0.34
292 0.41
293 0.48
294 0.52
295 0.6
296 0.67
297 0.72
298 0.75
299 0.79
300 0.79
301 0.8
302 0.85
303 0.84
304 0.81
305 0.77
306 0.75
307 0.73
308 0.69
309 0.63
310 0.56
311 0.48
312 0.41
313 0.35
314 0.27
315 0.18
316 0.13
317 0.11
318 0.1
319 0.15
320 0.14
321 0.14
322 0.19
323 0.19
324 0.19
325 0.19
326 0.18
327 0.16
328 0.17
329 0.18
330 0.15
331 0.16
332 0.15
333 0.15
334 0.15
335 0.13
336 0.12
337 0.12
338 0.14
339 0.15
340 0.17
341 0.17
342 0.16
343 0.17
344 0.19
345 0.18
346 0.17
347 0.16
348 0.14
349 0.15
350 0.16
351 0.15
352 0.21
353 0.29
354 0.34
355 0.39
356 0.44
357 0.49
358 0.53
359 0.54
360 0.49
361 0.48
362 0.52
363 0.56
364 0.58
365 0.58
366 0.58
367 0.56
368 0.59
369 0.52
370 0.45
371 0.43
372 0.42
373 0.41
374 0.37
375 0.44
376 0.38
377 0.37
378 0.4
379 0.34
380 0.31
381 0.26
382 0.27
383 0.19
384 0.2
385 0.19
386 0.13
387 0.14
388 0.12
389 0.12
390 0.11
391 0.11
392 0.1
393 0.1
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.11
398 0.11
399 0.12
400 0.12
401 0.11
402 0.11
403 0.09
404 0.08
405 0.07
406 0.08
407 0.09
408 0.1
409 0.11
410 0.13
411 0.13
412 0.16
413 0.16
414 0.18
415 0.26
416 0.28
417 0.31
418 0.34
419 0.36
420 0.34