FuNGI

W6YH07

Protein Details

Accession

W6YH07

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
189-208	PDTTPKPKRRTSASKRPLPA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
KEGG	bze:COCCADRAFT_25088 -
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54

Amino Acid Sequences

MSSPDASRKSTESFEFLSPNPPQGSFAPPSQHDWTSRPNSTGGRYKPRRGSTASSIHSIGGSLDSNFKTTMGAVREQSNNAISTLLTPPIMRTGMVPHTTATATSSHRPPSTKDIPPVTLAHIPHVDPSAFNPYLTQVGNLYDAFQRAKAEAGESAQQPRRASTKDDGPDSLAPSPAGTPNLAAAPFGPDTTPKPKRRTSASKRPLPAITPLSTIPNIYFDENFHIENPRTFDVVSERSEVVRPVRSISSDDPGALDVPQPIGRKALATNAILQEKLSWYMDTVEVHLISAISTASTSFFAALGSLRELQTEAADSVARIKGLREDLKRLDEQMAIGGLKVVEMKRRRENLRRLADSVDQLQAVIIGLSYCDEAVVEGDLETAMTRIEMIERLVTGALDTTDTQGTSWLKTRLPPKLIDLRPLRALDDVFESMTEIKFRIGRGFEARFVDTLLTDLREHVKRVPNQETLERWVAASQKGRGSNQKLKTTLPAYMSTENELRADLRASLYGLSGAQFTNQASTTFREAVLKEMKIIIRKHLPSSSDDDTGSMASVSTRGGRGQSQADKNSILARNLRAMDPGDAEDFFANIFTDIGEALRRLSTLVKVLLDVTSGVTTPPVSAGGLLSPRNSYLNNIDDYLGNGVPPPSSTDLQMEIMQALDMSSLLGQAVDAAQTQITKLLRVRSEATASLPLDRFLRYFTMCRLFADECEAVSGRSGAALKGVVNTHITDFVSKFGDFEKQELARAMDSDRWEPKDFDAEDTEVLARLLKGMESDPPNWAETGNILREIQEPTTNGTSAKTNGGSEDKPKEKNKTTVPAIVDEEKYTISSSSSVVIRGIERFEILVSVMPSMTSEVAASLCEYIKLFNSRLCQLILGAGAIHSAGLKNINTKHLAIASQTLSFIIAILPYIRECFRRRIASASNKSSLGEFDNVKRLLHDQQNQIHEKLTDILSGRATVHMRSLKKVDWDSEAEANKDVSPSMESLTKDTVTMHKVINKYLSEIQVRMIMGPVFESYREQVGKVIKEAPVKTAAGKARLLREAKLFDAKLGPIDGAGNVGSHLIGLVVSKTVAEPKAEPKPESKEAETKQEGKEEKVEVSAEKKANGDMT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.37
3	0.34
4	0.37
5	0.34
6	0.37
7	0.34
8	0.3
9	0.3
10	0.29
11	0.35
12	0.31
13	0.34
14	0.35
15	0.35
16	0.41
17	0.43
18	0.45
19	0.42
20	0.43
21	0.48
22	0.49
23	0.51
24	0.46
25	0.46
26	0.46
27	0.49
28	0.55
29	0.54
30	0.56
31	0.61
32	0.68
33	0.73
34	0.76
35	0.75
36	0.71
37	0.71
38	0.68
39	0.7
40	0.64
41	0.58
42	0.52
43	0.46
44	0.4
45	0.33
46	0.24
47	0.16
48	0.14
49	0.11
50	0.16
51	0.16
52	0.18
53	0.18
54	0.18
55	0.16
56	0.16
57	0.21
58	0.19
59	0.23
60	0.24
61	0.29
62	0.32
63	0.33
64	0.35
65	0.32
66	0.29
67	0.24
68	0.22
69	0.17
70	0.17
71	0.17
72	0.16
73	0.14
74	0.13
75	0.14
76	0.18
77	0.18
78	0.15
79	0.14
80	0.18
81	0.24
82	0.26
83	0.26
84	0.22
85	0.24
86	0.24
87	0.23
88	0.19
89	0.16
90	0.18
91	0.24
92	0.29
93	0.32
94	0.36
95	0.38
96	0.41
97	0.46
98	0.51
99	0.52
100	0.54
101	0.54
102	0.53
103	0.54
104	0.51
105	0.47
106	0.43
107	0.36
108	0.33
109	0.3
110	0.28
111	0.26
112	0.27
113	0.23
114	0.18
115	0.21
116	0.25
117	0.23
118	0.22
119	0.21
120	0.2
121	0.23
122	0.23
123	0.21
124	0.13
125	0.14
126	0.17
127	0.16
128	0.16
129	0.15
130	0.17
131	0.17
132	0.17
133	0.17
134	0.15
135	0.17
136	0.16
137	0.15
138	0.15
139	0.16
140	0.2
141	0.21
142	0.29
143	0.32
144	0.35
145	0.34
146	0.36
147	0.39
148	0.37
149	0.4
150	0.38
151	0.43
152	0.45
153	0.48
154	0.46
155	0.44
156	0.44
157	0.42
158	0.37
159	0.29
160	0.23
161	0.19
162	0.2
163	0.18
164	0.17
165	0.14
166	0.12
167	0.13
168	0.15
169	0.14
170	0.12
171	0.1
172	0.13
173	0.13
174	0.13
175	0.12
176	0.12
177	0.17
178	0.27
179	0.37
180	0.41
181	0.48
182	0.54
183	0.6
184	0.68
185	0.74
186	0.75
187	0.76
188	0.79
189	0.81
190	0.78
191	0.77
192	0.69
193	0.6
194	0.57
195	0.51
196	0.43
197	0.36
198	0.33
199	0.32
200	0.29
201	0.27
202	0.21
203	0.18
204	0.18
205	0.17
206	0.17
207	0.14
208	0.2
209	0.21
210	0.21
211	0.19
212	0.23
213	0.22
214	0.24
215	0.28
216	0.24
217	0.23
218	0.22
219	0.22
220	0.23
221	0.26
222	0.25
223	0.24
224	0.22
225	0.23
226	0.24
227	0.25
228	0.23
229	0.24
230	0.22
231	0.23
232	0.24
233	0.24
234	0.27
235	0.28
236	0.29
237	0.24
238	0.23
239	0.21
240	0.19
241	0.18
242	0.14
243	0.13
244	0.09
245	0.1
246	0.14
247	0.15
248	0.14
249	0.16
250	0.15
251	0.16
252	0.16
253	0.2
254	0.2
255	0.2
256	0.23
257	0.26
258	0.27
259	0.25
260	0.24
261	0.2
262	0.17
263	0.18
264	0.16
265	0.11
266	0.11
267	0.13
268	0.15
269	0.14
270	0.14
271	0.14
272	0.13
273	0.12
274	0.12
275	0.1
276	0.08
277	0.08
278	0.06
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.05
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.07
290	0.07
291	0.08
292	0.1
293	0.09
294	0.1
295	0.1
296	0.1
297	0.1
298	0.1
299	0.08
300	0.07
301	0.08
302	0.07
303	0.1
304	0.11
305	0.11
306	0.09
307	0.1
308	0.13
309	0.2
310	0.27
311	0.26
312	0.32
313	0.35
314	0.4
315	0.4
316	0.38
317	0.34
318	0.27
319	0.25
320	0.19
321	0.17
322	0.12
323	0.11
324	0.1
325	0.07
326	0.07
327	0.09
328	0.09
329	0.15
330	0.2
331	0.26
332	0.34
333	0.42
334	0.5
335	0.57
336	0.66
337	0.69
338	0.74
339	0.71
340	0.65
341	0.61
342	0.56
343	0.49
344	0.41
345	0.32
346	0.22
347	0.18
348	0.16
349	0.12
350	0.09
351	0.07
352	0.04
353	0.03
354	0.03
355	0.03
356	0.04
357	0.03
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.03
371	0.03
372	0.03
373	0.03
374	0.04
375	0.05
376	0.05
377	0.06
378	0.06
379	0.07
380	0.07
381	0.06
382	0.06
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.06
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.1
392	0.11
393	0.12
394	0.15
395	0.16
396	0.17
397	0.21
398	0.27
399	0.31
400	0.34
401	0.33
402	0.35
403	0.43
404	0.43
405	0.47
406	0.45
407	0.41
408	0.42
409	0.41
410	0.36
411	0.27
412	0.26
413	0.19
414	0.18
415	0.15
416	0.11
417	0.1
418	0.1
419	0.1
420	0.1
421	0.09
422	0.07
423	0.07
424	0.09
425	0.09
426	0.12
427	0.13
428	0.15
429	0.2
430	0.22
431	0.23
432	0.24
433	0.25
434	0.21
435	0.2
436	0.18
437	0.12
438	0.11
439	0.09
440	0.08
441	0.07
442	0.08
443	0.13
444	0.14
445	0.15
446	0.2
447	0.27
448	0.29
449	0.36
450	0.4
451	0.4
452	0.41
453	0.44
454	0.4
455	0.38
456	0.36
457	0.3
458	0.24
459	0.21
460	0.2
461	0.2
462	0.21
463	0.18
464	0.2
465	0.23
466	0.25
467	0.3
468	0.36
469	0.42
470	0.45
471	0.49
472	0.46
473	0.44
474	0.47
475	0.42
476	0.38
477	0.31
478	0.27
479	0.24
480	0.25
481	0.25
482	0.22
483	0.21
484	0.18
485	0.16
486	0.14
487	0.11
488	0.09
489	0.09
490	0.07
491	0.07
492	0.07
493	0.07
494	0.07
495	0.07
496	0.06
497	0.06
498	0.05
499	0.06
500	0.05
501	0.05
502	0.06
503	0.06
504	0.07
505	0.07
506	0.08
507	0.08
508	0.1
509	0.13
510	0.12
511	0.13
512	0.14
513	0.13
514	0.18
515	0.2
516	0.18
517	0.16
518	0.18
519	0.19
520	0.22
521	0.23
522	0.22
523	0.25
524	0.26
525	0.28
526	0.28
527	0.28
528	0.25
529	0.31
530	0.29
531	0.24
532	0.23
533	0.21
534	0.19
535	0.17
536	0.15
537	0.09
538	0.05
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.05
543	0.05
544	0.05
545	0.07
546	0.07
547	0.1
548	0.14
549	0.2
550	0.23
551	0.24
552	0.25
553	0.25
554	0.24
555	0.28
556	0.25
557	0.2
558	0.18
559	0.18
560	0.2
561	0.21
562	0.2
563	0.16
564	0.15
565	0.15
566	0.13
567	0.13
568	0.1
569	0.09
570	0.09
571	0.08
572	0.07
573	0.06
574	0.05
575	0.05
576	0.04
577	0.04
578	0.03
579	0.03
580	0.03
581	0.04
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.06
589	0.07
590	0.08
591	0.1
592	0.09
593	0.09
594	0.1
595	0.09
596	0.08
597	0.08
598	0.06
599	0.05
600	0.05
601	0.05
602	0.05
603	0.05
604	0.04
605	0.05
606	0.04
607	0.04
608	0.04
609	0.04
610	0.05
611	0.08
612	0.08
613	0.08
614	0.08
615	0.09
616	0.1
617	0.1
618	0.11
619	0.13
620	0.15
621	0.15
622	0.16
623	0.16
624	0.15
625	0.15
626	0.15
627	0.11
628	0.09
629	0.08
630	0.07
631	0.07
632	0.07
633	0.09
634	0.1
635	0.11
636	0.12
637	0.13
638	0.14
639	0.15
640	0.16
641	0.14
642	0.1
643	0.1
644	0.08
645	0.07
646	0.05
647	0.04
648	0.03
649	0.03
650	0.03
651	0.03
652	0.03
653	0.03
654	0.03
655	0.03
656	0.03
657	0.03
658	0.03
659	0.03
660	0.04
661	0.04
662	0.04
663	0.08
664	0.08
665	0.09
666	0.12
667	0.17
668	0.17
669	0.2
670	0.23
671	0.21
672	0.24
673	0.22
674	0.22
675	0.22
676	0.21
677	0.21
678	0.19
679	0.18
680	0.16
681	0.16
682	0.15
683	0.12
684	0.14
685	0.13
686	0.14
687	0.17
688	0.22
689	0.22
690	0.22
691	0.25
692	0.22
693	0.21
694	0.25
695	0.21
696	0.15
697	0.17
698	0.16
699	0.12
700	0.12
701	0.12
702	0.06
703	0.07
704	0.08
705	0.06
706	0.06
707	0.07
708	0.07
709	0.09
710	0.09
711	0.09
712	0.1
713	0.1
714	0.1
715	0.11
716	0.11
717	0.11
718	0.11
719	0.12
720	0.13
721	0.12
722	0.12
723	0.11
724	0.17
725	0.16
726	0.17
727	0.21
728	0.19
729	0.2
730	0.21
731	0.22
732	0.16
733	0.16
734	0.16
735	0.14
736	0.16
737	0.19
738	0.22
739	0.25
740	0.27
741	0.27
742	0.27
743	0.31
744	0.3
745	0.28
746	0.27
747	0.23
748	0.21
749	0.21
750	0.2
751	0.13
752	0.12
753	0.1
754	0.07
755	0.06
756	0.06
757	0.05
758	0.06
759	0.06
760	0.12
761	0.15
762	0.16
763	0.18
764	0.19
765	0.2
766	0.19
767	0.18
768	0.13
769	0.12
770	0.15
771	0.14
772	0.14
773	0.13
774	0.14
775	0.16
776	0.18
777	0.17
778	0.16
779	0.15
780	0.18
781	0.2
782	0.19
783	0.17
784	0.16
785	0.17
786	0.16
787	0.18
788	0.16
789	0.14
790	0.16
791	0.2
792	0.2
793	0.24
794	0.31
795	0.33
796	0.39
797	0.45
798	0.51
799	0.53
800	0.59
801	0.6
802	0.61
803	0.6
804	0.58
805	0.55
806	0.5
807	0.47
808	0.43
809	0.37
810	0.29
811	0.25
812	0.19
813	0.18
814	0.15
815	0.12
816	0.09
817	0.09
818	0.09
819	0.11
820	0.11
821	0.11
822	0.11
823	0.12
824	0.13
825	0.13
826	0.14
827	0.11
828	0.11
829	0.1
830	0.1
831	0.09
832	0.08
833	0.09
834	0.08
835	0.08
836	0.08
837	0.07
838	0.08
839	0.08
840	0.08
841	0.06
842	0.06
843	0.06
844	0.06
845	0.06
846	0.07
847	0.07
848	0.07
849	0.07
850	0.07
851	0.08
852	0.11
853	0.15
854	0.16
855	0.18
856	0.22
857	0.23
858	0.25
859	0.25
860	0.21
861	0.18
862	0.18
863	0.15
864	0.11
865	0.09
866	0.07
867	0.06
868	0.06
869	0.05
870	0.04
871	0.04
872	0.05
873	0.07
874	0.08
875	0.14
876	0.16
877	0.21
878	0.23
879	0.23
880	0.24
881	0.24
882	0.24
883	0.2
884	0.22
885	0.19
886	0.17
887	0.17
888	0.15
889	0.13
890	0.12
891	0.11
892	0.07
893	0.05
894	0.05
895	0.06
896	0.06
897	0.07
898	0.09
899	0.11
900	0.16
901	0.19
902	0.26
903	0.34
904	0.39
905	0.4
906	0.45
907	0.53
908	0.59
909	0.65
910	0.64
911	0.6
912	0.54
913	0.53
914	0.46
915	0.38
916	0.31
917	0.25
918	0.22
919	0.22
920	0.3
921	0.3
922	0.29
923	0.29
924	0.29
925	0.32
926	0.38
927	0.42
928	0.42
929	0.48
930	0.56
931	0.59
932	0.57
933	0.51
934	0.42
935	0.37
936	0.32
937	0.26
938	0.2
939	0.18
940	0.19
941	0.18
942	0.19
943	0.18
944	0.19
945	0.19
946	0.17
947	0.22
948	0.27
949	0.28
950	0.32
951	0.36
952	0.35
953	0.41
954	0.44
955	0.4
956	0.38
957	0.4
958	0.4
959	0.42
960	0.41
961	0.35
962	0.33
963	0.31
964	0.27
965	0.23
966	0.19
967	0.13
968	0.13
969	0.12
970	0.13
971	0.16
972	0.16
973	0.19
974	0.22
975	0.21
976	0.2
977	0.21
978	0.24
979	0.23
980	0.25
981	0.25
982	0.28
983	0.29
984	0.32
985	0.37
986	0.32
987	0.34
988	0.36
989	0.39
990	0.36
991	0.35
992	0.33
993	0.31
994	0.31
995	0.26
996	0.23
997	0.17
998	0.14
999	0.14
1000	0.14
1001	0.11
1002	0.12
1003	0.14
1004	0.14
1005	0.2
1006	0.21
1007	0.2
1008	0.23
1009	0.29
1010	0.31
1011	0.31
1012	0.34
1013	0.31
1014	0.38
1015	0.38
1016	0.37
1017	0.35
1018	0.33
1019	0.32
1020	0.35
1021	0.36
1022	0.33
1023	0.36
1024	0.37
1025	0.39
1026	0.46
1027	0.46
1028	0.42
1029	0.43
1030	0.43
1031	0.43
1032	0.46
1033	0.4
1034	0.35
1035	0.36
1036	0.34
1037	0.29
1038	0.27
1039	0.23
1040	0.15
1041	0.16
1042	0.13
1043	0.11
1044	0.11
1045	0.08
1046	0.07
1047	0.08
1048	0.07
1049	0.06
1050	0.06
1051	0.04
1052	0.04
1053	0.05
1054	0.05
1055	0.06
1056	0.06
1057	0.06
1058	0.07
1059	0.12
1060	0.14
1061	0.16
1062	0.19
1063	0.26
1064	0.36
1065	0.41
1066	0.42
1067	0.44
1068	0.51
1069	0.56
1070	0.59
1071	0.57
1072	0.57
1073	0.56
1074	0.64
1075	0.65
1076	0.62
1077	0.57
1078	0.59
1079	0.56
1080	0.5
1081	0.52
1082	0.45
1083	0.4
1084	0.37
1085	0.35
1086	0.3
1087	0.32
1088	0.36
1089	0.32
1090	0.31
1091	0.31

W6YH07

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer