Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6XQ32

Protein Details
Accession W6XQ32    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-24DNERSRDRFRERDSRREPREGRBasic
28-64GTPTERRNRSRSPRDRGSRRDTRYRSRSPYRKDERDGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-121RFRERDSRREPREGRERGGTPTERRNRSRSPRDRGSRRDTRYRSRSPYRKDERDGAGRGGDRARPGAGHDRGRGRDDRRGGGRDDRPSFRDRSPPKGPRGSARGPFGGSAKP
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG bze:COCCADRAFT_106328  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSDNERSRDRFRERDSRREPREGRERGGTPTERRNRSRSPRDRGSRRDTRYRSRSPYRKDERDGAGRGGDRARPGAGHDRGRGRDDRRGGGRDDRPSFRDRSPPKGPRGSARGPFGGSAKPPTGPRSSTDIVKEETPDVEMKDERQKPEDMDDDEWEMLKVMGFGGFKSTKNTKVPGNDKNYGVRKDKQLQARQYMNRQGGFNRPLSPSRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.8
3 0.81
4 0.8
5 0.81
6 0.77
7 0.76
8 0.79
9 0.74
10 0.68
11 0.66
12 0.61
13 0.55
14 0.59
15 0.55
16 0.5
17 0.56
18 0.6
19 0.6
20 0.63
21 0.65
22 0.67
23 0.72
24 0.78
25 0.78
26 0.78
27 0.8
28 0.86
29 0.88
30 0.87
31 0.85
32 0.84
33 0.81
34 0.82
35 0.79
36 0.79
37 0.78
38 0.79
39 0.78
40 0.79
41 0.81
42 0.78
43 0.82
44 0.82
45 0.8
46 0.76
47 0.74
48 0.7
49 0.68
50 0.62
51 0.53
52 0.46
53 0.39
54 0.35
55 0.3
56 0.25
57 0.19
58 0.17
59 0.16
60 0.13
61 0.15
62 0.22
63 0.26
64 0.28
65 0.31
66 0.36
67 0.38
68 0.41
69 0.43
70 0.38
71 0.39
72 0.38
73 0.4
74 0.39
75 0.39
76 0.39
77 0.41
78 0.42
79 0.43
80 0.44
81 0.41
82 0.4
83 0.41
84 0.41
85 0.36
86 0.4
87 0.35
88 0.39
89 0.46
90 0.5
91 0.53
92 0.55
93 0.54
94 0.5
95 0.54
96 0.51
97 0.45
98 0.41
99 0.37
100 0.31
101 0.31
102 0.27
103 0.21
104 0.17
105 0.16
106 0.13
107 0.14
108 0.15
109 0.18
110 0.19
111 0.19
112 0.21
113 0.26
114 0.27
115 0.27
116 0.28
117 0.27
118 0.26
119 0.26
120 0.24
121 0.18
122 0.16
123 0.15
124 0.13
125 0.12
126 0.13
127 0.12
128 0.14
129 0.23
130 0.27
131 0.28
132 0.3
133 0.31
134 0.3
135 0.34
136 0.36
137 0.3
138 0.28
139 0.28
140 0.27
141 0.26
142 0.24
143 0.2
144 0.15
145 0.11
146 0.09
147 0.07
148 0.05
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.12
153 0.14
154 0.15
155 0.21
156 0.25
157 0.29
158 0.33
159 0.36
160 0.36
161 0.44
162 0.52
163 0.55
164 0.59
165 0.58
166 0.56
167 0.62
168 0.64
169 0.61
170 0.59
171 0.56
172 0.56
173 0.6
174 0.64
175 0.66
176 0.67
177 0.69
178 0.71
179 0.75
180 0.74
181 0.74
182 0.76
183 0.71
184 0.66
185 0.6
186 0.54
187 0.54
188 0.52
189 0.46
190 0.42
191 0.4