Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

W6YK44

Protein Details
Accession W6YK44    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-105PQNWSKVYRKLKKDAEREKQADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
270-288KPRPASGGVAPAPKRKKEE
293-298HTKKRK
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 11, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG bze:COCCADRAFT_22535  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPALTLFELARQRLIKNIDMLRDVGDLPYSFLQPVLRFVRSPDQLIELESNCPQLLGETGEIWLRFIKRDIPDWEKKPHEPRDPQNWSKVYRKLKKDAEREKQADEEALKQHMKAIQKDRAQNKTLIVDSRIGYGSGGSRMFTGRTTTSWGQPSGAPAKTGKAAFDKLKRGMFDHGRERPKASQIPAHLLAQRKRPIQQAPARMVRMAESEAPRSMVLSKQASTSMANRPEPAPSTSRPNITQRPAPQQRNPPPPSRTSLPAGQQFSAPKPRPASGGVAPAPKRKKEEYSMFHTKKRKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.33
3 0.37
4 0.4
5 0.38
6 0.38
7 0.38
8 0.33
9 0.31
10 0.27
11 0.2
12 0.18
13 0.14
14 0.15
15 0.16
16 0.15
17 0.14
18 0.14
19 0.17
20 0.15
21 0.22
22 0.24
23 0.24
24 0.24
25 0.28
26 0.36
27 0.35
28 0.37
29 0.32
30 0.31
31 0.29
32 0.31
33 0.31
34 0.23
35 0.23
36 0.21
37 0.21
38 0.16
39 0.16
40 0.13
41 0.1
42 0.11
43 0.1
44 0.1
45 0.09
46 0.1
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.14
51 0.12
52 0.13
53 0.14
54 0.2
55 0.2
56 0.27
57 0.33
58 0.39
59 0.47
60 0.51
61 0.57
62 0.56
63 0.61
64 0.64
65 0.66
66 0.67
67 0.67
68 0.7
69 0.73
70 0.77
71 0.74
72 0.73
73 0.68
74 0.63
75 0.62
76 0.62
77 0.62
78 0.61
79 0.65
80 0.65
81 0.7
82 0.75
83 0.78
84 0.81
85 0.8
86 0.81
87 0.77
88 0.7
89 0.62
90 0.53
91 0.45
92 0.35
93 0.29
94 0.21
95 0.23
96 0.21
97 0.19
98 0.2
99 0.21
100 0.24
101 0.27
102 0.32
103 0.35
104 0.4
105 0.48
106 0.53
107 0.55
108 0.53
109 0.49
110 0.44
111 0.39
112 0.35
113 0.29
114 0.24
115 0.2
116 0.18
117 0.18
118 0.17
119 0.13
120 0.12
121 0.1
122 0.1
123 0.09
124 0.09
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.15
134 0.16
135 0.19
136 0.2
137 0.2
138 0.19
139 0.18
140 0.21
141 0.19
142 0.18
143 0.16
144 0.14
145 0.15
146 0.17
147 0.17
148 0.15
149 0.14
150 0.17
151 0.21
152 0.26
153 0.3
154 0.31
155 0.33
156 0.32
157 0.31
158 0.34
159 0.35
160 0.35
161 0.39
162 0.43
163 0.45
164 0.46
165 0.48
166 0.44
167 0.45
168 0.43
169 0.37
170 0.34
171 0.31
172 0.36
173 0.34
174 0.34
175 0.31
176 0.33
177 0.34
178 0.38
179 0.41
180 0.37
181 0.39
182 0.42
183 0.44
184 0.47
185 0.5
186 0.5
187 0.52
188 0.55
189 0.53
190 0.48
191 0.43
192 0.35
193 0.3
194 0.24
195 0.22
196 0.18
197 0.19
198 0.19
199 0.2
200 0.19
201 0.18
202 0.17
203 0.14
204 0.17
205 0.18
206 0.18
207 0.18
208 0.19
209 0.2
210 0.2
211 0.22
212 0.25
213 0.28
214 0.29
215 0.29
216 0.29
217 0.31
218 0.32
219 0.31
220 0.28
221 0.24
222 0.32
223 0.34
224 0.38
225 0.39
226 0.44
227 0.49
228 0.5
229 0.55
230 0.52
231 0.6
232 0.66
233 0.69
234 0.69
235 0.72
236 0.77
237 0.8
238 0.79
239 0.76
240 0.71
241 0.68
242 0.67
243 0.61
244 0.56
245 0.5
246 0.51
247 0.5
248 0.52
249 0.51
250 0.45
251 0.44
252 0.42
253 0.43
254 0.48
255 0.43
256 0.42
257 0.43
258 0.44
259 0.43
260 0.43
261 0.43
262 0.36
263 0.42
264 0.39
265 0.43
266 0.45
267 0.51
268 0.55
269 0.55
270 0.57
271 0.55
272 0.58
273 0.6
274 0.67
275 0.65
276 0.67
277 0.73
278 0.73
279 0.75