Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6Y6J1

Protein Details
Accession W6Y6J1    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-64PPQSPDSSNSSRKRKRGQNVVESESGHydrophilic
83-110AQAGGDKLSKKQRKKQKKQEQEEAANLEHydrophilic
144-179APQIEEPRKEKKSKKKKKEEEKKKDTKKTLYPQPITBasic
674-693PTPSKRDRQVLKRRGVEARRBasic
702-734SKSGYERKIENMRREKREKARRKESKESGSEGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
90-100LSKKQRKKQKK
150-171PRKEKKSKKKKKEEEKKKDTKK
359-361KKK
678-728KRDRQVLKRRGVEARRTGKASRISSKSGYERKIENMRREKREKARRKESKE
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 8.5, cyto_nucl 6.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044764  DDX52/Rok1_DEADc  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
KEGG bze:COCCADRAFT_26206  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd17957  DEADc_DDX52  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MNVFKLLSRSSQAAQNSHAQKLPSSGAVANPQLFGHNEPPQSPDSSNSSRKRKRGQNVVESESGSAALPADLDFFGGGAGRDAQAGGDKLSKKQRKKQKKQEQEEAANLEKEINNVQQEPYDVEECKRILRSHKLKVAVLGDFAPQIEEPRKEKKSKKKKKEEEKKKDTKKTLYPQPITSFAQLRTRYGISRRLAENIIEQGYKLPTEVQLGALPLLLRKKGEPGLLQDVENLSGAEYNGDIDLLTVAPTGSGKTIAFLIPIIDALLSESKSADAKNGPRAVILAPTRELASQIVNEARKLAKGTAVKATLMRKGMQVVAHDEDEPEETKEDEAKDSSEASDDEGGESESEDEEKEAPKKKTGRRAELVKAAILVSTPLALVNSLKRRDGTVASISSISQLVLDEADVLLNPLFREQTLAVWNACTNLSLRVGLWSATMGSNIESLTISTLNDRWSAISSSQSALPPRPPLIRLVVGLKDSAIPNISHQLTYAATEQGKLLGLRQLLHPTAVHTDSSQPILRPPFLVFTQTIPRAIALHSELLYDIPPEAGGSSRIAVLHADLSSSARDTIMTRFRKGEIWVLITTDLLARGIDFRGLNGVVNYDAPSSAAAYVHRVGRTGRAGRTGGVAVTFYTQDDIPYVKLIANVIRASEALRGVNADEGSVKQWLLDALPTPSKRDRQVLKRRGVEARRTGKASRISSKSGYERKIENMRREKREKARRKESKESGSEGGEREE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.42
3 0.43
4 0.42
5 0.43
6 0.38
7 0.34
8 0.36
9 0.35
10 0.27
11 0.26
12 0.23
13 0.24
14 0.28
15 0.31
16 0.28
17 0.26
18 0.24
19 0.23
20 0.24
21 0.25
22 0.26
23 0.29
24 0.3
25 0.3
26 0.33
27 0.34
28 0.36
29 0.33
30 0.3
31 0.32
32 0.38
33 0.46
34 0.52
35 0.61
36 0.65
37 0.74
38 0.8
39 0.82
40 0.84
41 0.85
42 0.86
43 0.86
44 0.85
45 0.82
46 0.75
47 0.65
48 0.56
49 0.45
50 0.35
51 0.24
52 0.16
53 0.11
54 0.07
55 0.07
56 0.06
57 0.08
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.08
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.17
75 0.18
76 0.25
77 0.36
78 0.45
79 0.51
80 0.6
81 0.69
82 0.75
83 0.85
84 0.9
85 0.9
86 0.93
87 0.94
88 0.95
89 0.94
90 0.89
91 0.84
92 0.78
93 0.7
94 0.59
95 0.49
96 0.41
97 0.32
98 0.26
99 0.23
100 0.21
101 0.2
102 0.21
103 0.21
104 0.2
105 0.2
106 0.21
107 0.22
108 0.21
109 0.19
110 0.19
111 0.23
112 0.23
113 0.25
114 0.27
115 0.27
116 0.31
117 0.41
118 0.48
119 0.53
120 0.59
121 0.6
122 0.57
123 0.59
124 0.55
125 0.45
126 0.38
127 0.29
128 0.23
129 0.19
130 0.18
131 0.14
132 0.1
133 0.13
134 0.16
135 0.2
136 0.23
137 0.32
138 0.39
139 0.47
140 0.57
141 0.64
142 0.71
143 0.78
144 0.85
145 0.87
146 0.91
147 0.94
148 0.96
149 0.96
150 0.96
151 0.96
152 0.96
153 0.95
154 0.94
155 0.91
156 0.88
157 0.87
158 0.85
159 0.84
160 0.84
161 0.77
162 0.72
163 0.68
164 0.65
165 0.57
166 0.51
167 0.44
168 0.36
169 0.4
170 0.36
171 0.33
172 0.32
173 0.31
174 0.31
175 0.32
176 0.37
177 0.32
178 0.37
179 0.37
180 0.36
181 0.36
182 0.33
183 0.31
184 0.27
185 0.26
186 0.2
187 0.19
188 0.17
189 0.17
190 0.16
191 0.13
192 0.1
193 0.09
194 0.12
195 0.13
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.11
202 0.1
203 0.12
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.16
208 0.18
209 0.21
210 0.21
211 0.25
212 0.32
213 0.32
214 0.32
215 0.29
216 0.26
217 0.23
218 0.21
219 0.16
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.13
262 0.16
263 0.23
264 0.26
265 0.25
266 0.24
267 0.25
268 0.23
269 0.24
270 0.22
271 0.17
272 0.15
273 0.15
274 0.16
275 0.15
276 0.15
277 0.1
278 0.1
279 0.08
280 0.09
281 0.13
282 0.13
283 0.13
284 0.14
285 0.13
286 0.13
287 0.14
288 0.13
289 0.15
290 0.16
291 0.18
292 0.22
293 0.22
294 0.22
295 0.24
296 0.25
297 0.23
298 0.23
299 0.22
300 0.17
301 0.18
302 0.19
303 0.17
304 0.16
305 0.16
306 0.17
307 0.17
308 0.16
309 0.15
310 0.13
311 0.13
312 0.13
313 0.1
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.04
337 0.05
338 0.04
339 0.05
340 0.05
341 0.07
342 0.11
343 0.18
344 0.19
345 0.25
346 0.33
347 0.38
348 0.47
349 0.53
350 0.57
351 0.56
352 0.62
353 0.6
354 0.58
355 0.54
356 0.43
357 0.36
358 0.28
359 0.21
360 0.15
361 0.11
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.04
369 0.09
370 0.15
371 0.16
372 0.17
373 0.17
374 0.18
375 0.2
376 0.21
377 0.19
378 0.17
379 0.17
380 0.17
381 0.17
382 0.16
383 0.14
384 0.13
385 0.1
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.04
396 0.03
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.05
402 0.07
403 0.07
404 0.09
405 0.11
406 0.12
407 0.12
408 0.12
409 0.12
410 0.11
411 0.11
412 0.09
413 0.08
414 0.08
415 0.09
416 0.08
417 0.08
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.08
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.07
437 0.08
438 0.09
439 0.09
440 0.1
441 0.09
442 0.11
443 0.12
444 0.12
445 0.13
446 0.13
447 0.13
448 0.15
449 0.17
450 0.16
451 0.17
452 0.19
453 0.19
454 0.21
455 0.22
456 0.2
457 0.21
458 0.23
459 0.23
460 0.22
461 0.22
462 0.21
463 0.2
464 0.19
465 0.17
466 0.15
467 0.13
468 0.13
469 0.11
470 0.09
471 0.1
472 0.15
473 0.16
474 0.14
475 0.14
476 0.15
477 0.13
478 0.15
479 0.15
480 0.13
481 0.12
482 0.12
483 0.12
484 0.12
485 0.12
486 0.1
487 0.1
488 0.11
489 0.11
490 0.12
491 0.14
492 0.17
493 0.16
494 0.17
495 0.16
496 0.15
497 0.18
498 0.18
499 0.16
500 0.13
501 0.16
502 0.16
503 0.19
504 0.19
505 0.16
506 0.19
507 0.22
508 0.22
509 0.2
510 0.2
511 0.2
512 0.19
513 0.22
514 0.18
515 0.18
516 0.24
517 0.24
518 0.24
519 0.21
520 0.21
521 0.19
522 0.18
523 0.17
524 0.12
525 0.13
526 0.12
527 0.12
528 0.12
529 0.12
530 0.12
531 0.09
532 0.08
533 0.05
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.06
538 0.07
539 0.07
540 0.07
541 0.08
542 0.08
543 0.09
544 0.09
545 0.09
546 0.09
547 0.08
548 0.08
549 0.08
550 0.09
551 0.09
552 0.1
553 0.09
554 0.07
555 0.08
556 0.09
557 0.16
558 0.24
559 0.27
560 0.29
561 0.3
562 0.32
563 0.34
564 0.35
565 0.36
566 0.3
567 0.31
568 0.29
569 0.28
570 0.27
571 0.23
572 0.21
573 0.15
574 0.11
575 0.07
576 0.07
577 0.06
578 0.07
579 0.08
580 0.1
581 0.1
582 0.1
583 0.13
584 0.13
585 0.13
586 0.12
587 0.13
588 0.1
589 0.11
590 0.12
591 0.09
592 0.09
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.08
597 0.09
598 0.08
599 0.12
600 0.15
601 0.18
602 0.18
603 0.19
604 0.19
605 0.24
606 0.31
607 0.33
608 0.33
609 0.35
610 0.35
611 0.34
612 0.36
613 0.31
614 0.24
615 0.19
616 0.16
617 0.11
618 0.12
619 0.12
620 0.09
621 0.1
622 0.1
623 0.09
624 0.11
625 0.11
626 0.11
627 0.12
628 0.12
629 0.12
630 0.13
631 0.14
632 0.15
633 0.19
634 0.18
635 0.17
636 0.17
637 0.16
638 0.16
639 0.18
640 0.17
641 0.13
642 0.13
643 0.13
644 0.13
645 0.16
646 0.15
647 0.12
648 0.12
649 0.12
650 0.14
651 0.14
652 0.14
653 0.1
654 0.11
655 0.11
656 0.11
657 0.12
658 0.12
659 0.16
660 0.24
661 0.25
662 0.3
663 0.36
664 0.41
665 0.44
666 0.52
667 0.56
668 0.6
669 0.7
670 0.74
671 0.77
672 0.79
673 0.8
674 0.81
675 0.79
676 0.78
677 0.77
678 0.76
679 0.72
680 0.69
681 0.64
682 0.62
683 0.63
684 0.61
685 0.59
686 0.56
687 0.56
688 0.55
689 0.6
690 0.63
691 0.62
692 0.6
693 0.56
694 0.54
695 0.56
696 0.63
697 0.65
698 0.65
699 0.68
700 0.73
701 0.78
702 0.81
703 0.83
704 0.83
705 0.86
706 0.86
707 0.86
708 0.88
709 0.89
710 0.91
711 0.92
712 0.91
713 0.9
714 0.86
715 0.81
716 0.73
717 0.67
718 0.62