Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6Y8M3

Protein Details
Accession W6Y8M3    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-106DTELKRPQKKPAKKSVSIRAPTRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-98LKRPQKKPAKKS
172-176KKFGR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
KEGG bze:COCCADRAFT_89383  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MAGLTRKNVRPLLRSVNGKRYATEDDHEEPAGKRRADNMTIPAKQQEEIDINADPLSSDDELRAPPPRPAKSSKPTMPAPRTVDTELKRPQKKPAKKSVSIRAPTRGTYKNSQELQAGDGPTEDKENALASSQASVSDGPIQWGMEHVSQKNNKNAKGYGSKTKNIHEPVPKKFGRSPPKPAVRIYGSANQSKGKQPSQDSDSDSSVSMLDDDELQDLAEELGEPNLSDDDDLRRSKKAAKSAQLLKQLNSWKANNDPPSSQPDSSAAQEHLNEVSNYIERLPEIEEEGTRCPLCSHPVSPSDYWPFWTSKPKTVKHKSAFCHLHKKLSAQQSYISAGYPSINWSLLPRRLKSHKPTLRQILLNERPSPHRSRYEPVALTGKAASIPSKRTDLSPSQQAELEAYALDDRAAYPGYYGPHGRRLITENILDLLKEDIKGCGDAVVQASGVAAFVQQVMVPEAAVLLIMEDCSVGWEEAEAVREETYEMGVLVHEEIEDEVIAEESEEEDEY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.65
3 0.7
4 0.72
5 0.68
6 0.61
7 0.56
8 0.55
9 0.49
10 0.45
11 0.41
12 0.37
13 0.39
14 0.38
15 0.36
16 0.3
17 0.35
18 0.39
19 0.34
20 0.31
21 0.35
22 0.41
23 0.44
24 0.47
25 0.46
26 0.48
27 0.5
28 0.5
29 0.48
30 0.43
31 0.39
32 0.35
33 0.32
34 0.25
35 0.25
36 0.25
37 0.21
38 0.2
39 0.19
40 0.18
41 0.13
42 0.1
43 0.12
44 0.1
45 0.1
46 0.11
47 0.13
48 0.14
49 0.17
50 0.21
51 0.19
52 0.25
53 0.33
54 0.37
55 0.41
56 0.47
57 0.54
58 0.58
59 0.67
60 0.67
61 0.66
62 0.69
63 0.73
64 0.71
65 0.7
66 0.67
67 0.61
68 0.58
69 0.55
70 0.55
71 0.47
72 0.5
73 0.51
74 0.55
75 0.59
76 0.57
77 0.64
78 0.66
79 0.74
80 0.75
81 0.78
82 0.78
83 0.79
84 0.85
85 0.85
86 0.85
87 0.82
88 0.76
89 0.72
90 0.65
91 0.6
92 0.58
93 0.54
94 0.49
95 0.49
96 0.52
97 0.53
98 0.52
99 0.51
100 0.47
101 0.41
102 0.39
103 0.35
104 0.29
105 0.2
106 0.18
107 0.17
108 0.15
109 0.16
110 0.12
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.09
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.12
131 0.14
132 0.13
133 0.17
134 0.17
135 0.24
136 0.31
137 0.36
138 0.44
139 0.48
140 0.47
141 0.47
142 0.47
143 0.46
144 0.48
145 0.48
146 0.49
147 0.49
148 0.52
149 0.51
150 0.52
151 0.53
152 0.48
153 0.51
154 0.5
155 0.51
156 0.51
157 0.58
158 0.55
159 0.52
160 0.54
161 0.57
162 0.58
163 0.58
164 0.61
165 0.62
166 0.7
167 0.68
168 0.64
169 0.6
170 0.53
171 0.49
172 0.44
173 0.41
174 0.36
175 0.36
176 0.36
177 0.32
178 0.3
179 0.33
180 0.34
181 0.3
182 0.31
183 0.32
184 0.35
185 0.38
186 0.39
187 0.38
188 0.36
189 0.34
190 0.3
191 0.27
192 0.22
193 0.17
194 0.13
195 0.09
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.07
218 0.12
219 0.14
220 0.15
221 0.16
222 0.17
223 0.24
224 0.27
225 0.33
226 0.36
227 0.4
228 0.46
229 0.52
230 0.57
231 0.6
232 0.57
233 0.49
234 0.48
235 0.46
236 0.43
237 0.39
238 0.33
239 0.25
240 0.28
241 0.33
242 0.32
243 0.29
244 0.26
245 0.25
246 0.31
247 0.33
248 0.29
249 0.25
250 0.23
251 0.23
252 0.22
253 0.22
254 0.16
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.12
259 0.12
260 0.11
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.08
266 0.07
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.12
276 0.13
277 0.12
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.15
282 0.16
283 0.16
284 0.18
285 0.22
286 0.26
287 0.26
288 0.29
289 0.3
290 0.27
291 0.28
292 0.26
293 0.25
294 0.23
295 0.32
296 0.31
297 0.35
298 0.43
299 0.47
300 0.56
301 0.63
302 0.7
303 0.68
304 0.73
305 0.68
306 0.69
307 0.72
308 0.67
309 0.69
310 0.61
311 0.6
312 0.54
313 0.55
314 0.52
315 0.53
316 0.49
317 0.39
318 0.4
319 0.34
320 0.35
321 0.31
322 0.24
323 0.15
324 0.13
325 0.12
326 0.1
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.12
332 0.17
333 0.24
334 0.29
335 0.29
336 0.35
337 0.41
338 0.5
339 0.55
340 0.6
341 0.61
342 0.63
343 0.7
344 0.72
345 0.72
346 0.66
347 0.62
348 0.61
349 0.61
350 0.58
351 0.52
352 0.45
353 0.44
354 0.46
355 0.49
356 0.44
357 0.44
358 0.43
359 0.46
360 0.5
361 0.53
362 0.49
363 0.47
364 0.47
365 0.4
366 0.37
367 0.31
368 0.25
369 0.18
370 0.17
371 0.17
372 0.14
373 0.18
374 0.19
375 0.23
376 0.23
377 0.24
378 0.3
379 0.33
380 0.35
381 0.41
382 0.4
383 0.38
384 0.38
385 0.37
386 0.32
387 0.25
388 0.2
389 0.11
390 0.1
391 0.08
392 0.07
393 0.07
394 0.06
395 0.05
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.1
401 0.12
402 0.14
403 0.18
404 0.19
405 0.27
406 0.29
407 0.29
408 0.29
409 0.32
410 0.35
411 0.36
412 0.34
413 0.27
414 0.27
415 0.26
416 0.23
417 0.19
418 0.16
419 0.13
420 0.13
421 0.13
422 0.12
423 0.13
424 0.14
425 0.13
426 0.12
427 0.11
428 0.12
429 0.12
430 0.12
431 0.1
432 0.1
433 0.09
434 0.08
435 0.08
436 0.06
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.05
441 0.05
442 0.06
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.05
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.06
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.08
463 0.1
464 0.12
465 0.12
466 0.12
467 0.12
468 0.12
469 0.12
470 0.12
471 0.11
472 0.09
473 0.08
474 0.07
475 0.07
476 0.08
477 0.08
478 0.07
479 0.06
480 0.07
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.06
486 0.07
487 0.07
488 0.06
489 0.06
490 0.06