Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6Y5Q7

Protein Details
Accession W6Y5Q7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
613-633ARPTSGKPPPNKRRRVRGGANBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
617-631SGKPPPNKRRRVRGG
Subcellular Location(s) mito 8.5, nucl 8, cyto_mito 8, cyto 6.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012420  Cbp4  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR011335  Restrct_endonuc-II-like  
IPR010994  RuvA_2-like  
IPR006167  XPF  
IPR047520  XPF_nuclease  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004520  F:DNA endonuclease activity  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG bze:COCCADRAFT_39284  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07960  CBP4  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20078  XPF_nuclease_XPF_euk  
Amino Acid Sequences MPSARTYIKAFSAGAVLCVGGPALVWYVTPTEEEIFKRYNPELQKKALAGREQRQKEFDAFVGQLKEAARSDKPIWTAQKEMDAKRSEAEQQARREERDAYAAESRRRQAEIRASAEITPISSHWSRAHGFQQDIFNELRGEDELVLLARGLGLLRIVTNLLHSYDAAGNNLILLVGADDRENVWIGEALAEHAAVSNAPKCRGLSLVNTDLMSVGTREKMYAQGGIFSITSRILIVDFLSGLLNPETVTGVVVLHAERVVATSLEAFILRIYRQKNKIGFLKAFSDTPEPFTSGFSPLTNMMKNLFLTKPALYPRFHVAVANSLEGRKKAEVIELEVPMTEAMQDIQNAVLACVEASISELKKGNPGLEVEDWTVDSALHKNFDQIIRRQLDPVWHRTTFKTRQVVRDLSLLRTILHALLTYDAVNFNKYLDTVLAASQPPPGSTKQNQSPWLFLDAADTIFTTAKRRVYTGKVSNADLANASNAVPESLEPVLEEFPKWTQLAEILQEIEQDAYLNPTPQDSSNGSILIMCGDQGTAAQLREYLQTMYVKPEGSADEDEEEYEPSAKFMMRRKLRNYLAWKRDFGKVSAALFSENQKAINNNTDKNAQSGARPTSGKPPPNKRRRVRGGANAAAGPSRGDTGAVRTAGDRDAHIASLMAELEPTEVEAAQKPGEVGLDPLENMESYYELFDMNSLIIIHPYSGDLDEHVLDETKPRYVIMYEPDAAFIRRIEVYRSSHTDRTVKVFFMYYGGSVEEQRYLSAVRREKDAFTRLIKERANMAFTQNPSVNLAPEESFLRTINTRIAGGGRLAATAEPPRVVVDVREFRSSLPSLLHGRSMVIVPCMLTVGDYVLTPQICVERKSIRDLIASFTNGRLFNQVESMTEHYKHPMLLIEFDQNKSFTLEPFTDFSAPAASSTNSAFSSATTPDLQSKLVMLTLAFPRLRIIWSSSPYQTAEIFAELKKQQDEPDPLRAVQLGLDPHLSGDEMRSFNQTSQDMLRALPGINENAVTTLMLQSENILEVANMSEREICWLVGTDVGRRAHRFLNRSVYEDVQLQVFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.17
3 0.15
4 0.12
5 0.11
6 0.1
7 0.05
8 0.05
9 0.05
10 0.06
11 0.06
12 0.06
13 0.07
14 0.09
15 0.1
16 0.11
17 0.12
18 0.12
19 0.17
20 0.19
21 0.22
22 0.24
23 0.25
24 0.3
25 0.3
26 0.36
27 0.41
28 0.5
29 0.51
30 0.54
31 0.58
32 0.56
33 0.61
34 0.6
35 0.58
36 0.57
37 0.6
38 0.65
39 0.66
40 0.68
41 0.64
42 0.61
43 0.56
44 0.51
45 0.43
46 0.38
47 0.32
48 0.32
49 0.31
50 0.27
51 0.27
52 0.24
53 0.25
54 0.22
55 0.25
56 0.22
57 0.26
58 0.29
59 0.31
60 0.34
61 0.38
62 0.44
63 0.44
64 0.46
65 0.42
66 0.49
67 0.51
68 0.51
69 0.52
70 0.48
71 0.45
72 0.42
73 0.43
74 0.39
75 0.4
76 0.46
77 0.45
78 0.48
79 0.57
80 0.6
81 0.59
82 0.56
83 0.51
84 0.44
85 0.43
86 0.38
87 0.32
88 0.36
89 0.39
90 0.43
91 0.46
92 0.48
93 0.45
94 0.47
95 0.44
96 0.44
97 0.48
98 0.5
99 0.48
100 0.48
101 0.46
102 0.43
103 0.43
104 0.35
105 0.26
106 0.19
107 0.14
108 0.17
109 0.16
110 0.19
111 0.19
112 0.24
113 0.25
114 0.28
115 0.35
116 0.35
117 0.36
118 0.37
119 0.42
120 0.37
121 0.39
122 0.35
123 0.29
124 0.24
125 0.21
126 0.18
127 0.12
128 0.13
129 0.11
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.07
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.08
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.1
151 0.12
152 0.16
153 0.16
154 0.16
155 0.15
156 0.13
157 0.13
158 0.13
159 0.1
160 0.05
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.07
169 0.08
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.08
184 0.11
185 0.14
186 0.15
187 0.18
188 0.18
189 0.19
190 0.22
191 0.22
192 0.24
193 0.29
194 0.31
195 0.31
196 0.31
197 0.29
198 0.27
199 0.24
200 0.18
201 0.12
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.11
207 0.14
208 0.15
209 0.18
210 0.16
211 0.16
212 0.16
213 0.17
214 0.16
215 0.13
216 0.13
217 0.1
218 0.1
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.06
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.08
258 0.13
259 0.17
260 0.25
261 0.3
262 0.38
263 0.41
264 0.46
265 0.52
266 0.54
267 0.52
268 0.47
269 0.47
270 0.41
271 0.38
272 0.34
273 0.31
274 0.25
275 0.27
276 0.25
277 0.22
278 0.2
279 0.22
280 0.21
281 0.19
282 0.19
283 0.15
284 0.15
285 0.16
286 0.19
287 0.18
288 0.17
289 0.15
290 0.16
291 0.17
292 0.19
293 0.16
294 0.15
295 0.16
296 0.17
297 0.2
298 0.24
299 0.27
300 0.25
301 0.27
302 0.3
303 0.3
304 0.29
305 0.26
306 0.21
307 0.23
308 0.24
309 0.23
310 0.19
311 0.18
312 0.19
313 0.19
314 0.21
315 0.15
316 0.15
317 0.14
318 0.17
319 0.17
320 0.2
321 0.24
322 0.21
323 0.21
324 0.19
325 0.19
326 0.14
327 0.13
328 0.08
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.03
344 0.04
345 0.07
346 0.07
347 0.09
348 0.11
349 0.11
350 0.15
351 0.16
352 0.16
353 0.15
354 0.16
355 0.17
356 0.17
357 0.19
358 0.16
359 0.15
360 0.14
361 0.13
362 0.12
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.1
367 0.11
368 0.11
369 0.12
370 0.15
371 0.19
372 0.23
373 0.23
374 0.3
375 0.32
376 0.32
377 0.32
378 0.3
379 0.34
380 0.34
381 0.38
382 0.35
383 0.34
384 0.35
385 0.37
386 0.45
387 0.44
388 0.47
389 0.49
390 0.47
391 0.52
392 0.56
393 0.56
394 0.49
395 0.48
396 0.42
397 0.35
398 0.33
399 0.27
400 0.21
401 0.19
402 0.18
403 0.11
404 0.1
405 0.08
406 0.06
407 0.07
408 0.07
409 0.06
410 0.06
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.06
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.11
427 0.11
428 0.11
429 0.12
430 0.13
431 0.17
432 0.21
433 0.28
434 0.33
435 0.38
436 0.44
437 0.43
438 0.43
439 0.38
440 0.38
441 0.31
442 0.23
443 0.19
444 0.14
445 0.13
446 0.11
447 0.09
448 0.07
449 0.08
450 0.08
451 0.09
452 0.11
453 0.14
454 0.15
455 0.17
456 0.2
457 0.24
458 0.32
459 0.36
460 0.4
461 0.39
462 0.39
463 0.41
464 0.37
465 0.33
466 0.24
467 0.18
468 0.11
469 0.09
470 0.08
471 0.05
472 0.05
473 0.05
474 0.04
475 0.04
476 0.06
477 0.06
478 0.06
479 0.05
480 0.06
481 0.07
482 0.08
483 0.08
484 0.06
485 0.07
486 0.09
487 0.09
488 0.08
489 0.07
490 0.08
491 0.09
492 0.09
493 0.09
494 0.08
495 0.08
496 0.08
497 0.08
498 0.07
499 0.06
500 0.05
501 0.04
502 0.06
503 0.06
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.08
508 0.08
509 0.11
510 0.1
511 0.12
512 0.13
513 0.13
514 0.12
515 0.11
516 0.11
517 0.08
518 0.07
519 0.05
520 0.04
521 0.03
522 0.03
523 0.03
524 0.04
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.06
530 0.07
531 0.08
532 0.07
533 0.08
534 0.1
535 0.1
536 0.13
537 0.13
538 0.13
539 0.12
540 0.13
541 0.12
542 0.13
543 0.13
544 0.11
545 0.1
546 0.1
547 0.11
548 0.1
549 0.09
550 0.07
551 0.08
552 0.07
553 0.06
554 0.06
555 0.07
556 0.1
557 0.16
558 0.25
559 0.31
560 0.37
561 0.42
562 0.5
563 0.53
564 0.57
565 0.61
566 0.61
567 0.63
568 0.6
569 0.58
570 0.52
571 0.54
572 0.47
573 0.39
574 0.33
575 0.27
576 0.24
577 0.23
578 0.21
579 0.16
580 0.16
581 0.17
582 0.16
583 0.13
584 0.13
585 0.12
586 0.13
587 0.14
588 0.21
589 0.22
590 0.2
591 0.22
592 0.25
593 0.24
594 0.25
595 0.25
596 0.18
597 0.17
598 0.2
599 0.2
600 0.2
601 0.21
602 0.21
603 0.28
604 0.34
605 0.38
606 0.42
607 0.51
608 0.58
609 0.67
610 0.76
611 0.74
612 0.79
613 0.82
614 0.83
615 0.8
616 0.78
617 0.77
618 0.7
619 0.64
620 0.53
621 0.44
622 0.35
623 0.28
624 0.18
625 0.1
626 0.07
627 0.05
628 0.06
629 0.06
630 0.08
631 0.12
632 0.12
633 0.12
634 0.11
635 0.13
636 0.14
637 0.14
638 0.11
639 0.1
640 0.11
641 0.1
642 0.1
643 0.09
644 0.08
645 0.08
646 0.08
647 0.05
648 0.04
649 0.04
650 0.05
651 0.04
652 0.04
653 0.04
654 0.04
655 0.05
656 0.06
657 0.07
658 0.07
659 0.07
660 0.07
661 0.07
662 0.07
663 0.07
664 0.06
665 0.07
666 0.07
667 0.07
668 0.07
669 0.07
670 0.06
671 0.06
672 0.06
673 0.05
674 0.05
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.05
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.05
687 0.05
688 0.05
689 0.06
690 0.06
691 0.06
692 0.06
693 0.06
694 0.07
695 0.07
696 0.08
697 0.08
698 0.08
699 0.07
700 0.1
701 0.11
702 0.11
703 0.11
704 0.11
705 0.11
706 0.11
707 0.14
708 0.15
709 0.18
710 0.18
711 0.18
712 0.2
713 0.2
714 0.19
715 0.17
716 0.13
717 0.11
718 0.11
719 0.12
720 0.13
721 0.18
722 0.21
723 0.26
724 0.32
725 0.35
726 0.36
727 0.39
728 0.41
729 0.37
730 0.4
731 0.37
732 0.31
733 0.27
734 0.25
735 0.21
736 0.18
737 0.17
738 0.11
739 0.1
740 0.1
741 0.1
742 0.1
743 0.1
744 0.11
745 0.1
746 0.1
747 0.1
748 0.1
749 0.14
750 0.21
751 0.26
752 0.25
753 0.3
754 0.32
755 0.34
756 0.39
757 0.39
758 0.36
759 0.34
760 0.4
761 0.39
762 0.44
763 0.43
764 0.38
765 0.4
766 0.38
767 0.37
768 0.3
769 0.31
770 0.29
771 0.29
772 0.33
773 0.27
774 0.25
775 0.25
776 0.25
777 0.22
778 0.17
779 0.18
780 0.14
781 0.14
782 0.14
783 0.13
784 0.13
785 0.13
786 0.15
787 0.14
788 0.15
789 0.17
790 0.16
791 0.15
792 0.15
793 0.15
794 0.14
795 0.14
796 0.14
797 0.11
798 0.1
799 0.1
800 0.09
801 0.1
802 0.12
803 0.12
804 0.1
805 0.11
806 0.11
807 0.12
808 0.12
809 0.12
810 0.18
811 0.25
812 0.27
813 0.29
814 0.29
815 0.29
816 0.34
817 0.33
818 0.25
819 0.19
820 0.21
821 0.23
822 0.24
823 0.25
824 0.2
825 0.19
826 0.19
827 0.19
828 0.16
829 0.12
830 0.11
831 0.1
832 0.1
833 0.1
834 0.08
835 0.07
836 0.06
837 0.06
838 0.06
839 0.06
840 0.07
841 0.09
842 0.09
843 0.09
844 0.1
845 0.14
846 0.16
847 0.18
848 0.22
849 0.26
850 0.28
851 0.35
852 0.38
853 0.34
854 0.36
855 0.35
856 0.36
857 0.33
858 0.33
859 0.27
860 0.25
861 0.28
862 0.24
863 0.24
864 0.23
865 0.2
866 0.18
867 0.21
868 0.19
869 0.16
870 0.19
871 0.23
872 0.23
873 0.23
874 0.24
875 0.24
876 0.25
877 0.23
878 0.21
879 0.21
880 0.19
881 0.2
882 0.22
883 0.27
884 0.28
885 0.3
886 0.31
887 0.26
888 0.26
889 0.25
890 0.24
891 0.16
892 0.19
893 0.19
894 0.2
895 0.21
896 0.24
897 0.22
898 0.21
899 0.21
900 0.18
901 0.17
902 0.15
903 0.15
904 0.12
905 0.13
906 0.13
907 0.15
908 0.13
909 0.14
910 0.13
911 0.12
912 0.14
913 0.14
914 0.16
915 0.15
916 0.16
917 0.2
918 0.21
919 0.2
920 0.18
921 0.18
922 0.16
923 0.15
924 0.14
925 0.09
926 0.13
927 0.15
928 0.2
929 0.19
930 0.19
931 0.2
932 0.21
933 0.22
934 0.2
935 0.24
936 0.25
937 0.28
938 0.33
939 0.33
940 0.35
941 0.35
942 0.35
943 0.28
944 0.24
945 0.22
946 0.19
947 0.2
948 0.17
949 0.23
950 0.22
951 0.25
952 0.25
953 0.26
954 0.27
955 0.34
956 0.42
957 0.4
958 0.48
959 0.48
960 0.46
961 0.45
962 0.42
963 0.34
964 0.26
965 0.25
966 0.18
967 0.16
968 0.17
969 0.15
970 0.15
971 0.15
972 0.14
973 0.1
974 0.12
975 0.16
976 0.17
977 0.18
978 0.22
979 0.23
980 0.25
981 0.31
982 0.28
983 0.26
984 0.27
985 0.3
986 0.27
987 0.25
988 0.25
989 0.21
990 0.2
991 0.2
992 0.19
993 0.17
994 0.17
995 0.17
996 0.15
997 0.15
998 0.15
999 0.12
1000 0.1
1001 0.1
1002 0.1
1003 0.1
1004 0.09
1005 0.1
1006 0.1
1007 0.11
1008 0.1
1009 0.08
1010 0.07
1011 0.08
1012 0.09
1013 0.11
1014 0.1
1015 0.11
1016 0.13
1017 0.13
1018 0.18
1019 0.19
1020 0.17
1021 0.16
1022 0.17
1023 0.17
1024 0.19
1025 0.2
1026 0.19
1027 0.25
1028 0.29
1029 0.33
1030 0.33
1031 0.37
1032 0.4
1033 0.46
1034 0.47
1035 0.48
1036 0.55
1037 0.53
1038 0.55
1039 0.55
1040 0.5
1041 0.45
1042 0.43
1043 0.36