FuNGI

W6YSV3

Protein Details

Accession

W6YSV3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
100-119	LFHARQKIPQHQQHQQQFQQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 11, cyto 6, nucl 5, mito 2, pero 1, E.R. 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039900 Pat1-like IPR019167 PAT1_dom
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000290 P:deadenylation-dependent decapping of nuclear-transcribed mRNA
KEGG	bze:COCCADRAFT_25266 -
Pfam	View protein in Pfam PF09770 PAT1

Amino Acid Sequences

MSFFGFDTTLPRDQGHSTAAPGFGQHDAFAALGGGAADDDVIDFDDTYDGLGDQLDDDADDRNDDTFGDGPATQQSVGKHFDFAGQTSMVAGTIQEEQMLFHARQKIPQHQQHQQQFQQQQHQQQHQQQHQYQQRPPVPQASKPNRSGYESYKDPEYIPQLEARADIWGLKPKQPAAQRQPSPQPAAAAQMPAPTRKVMSMEEVEAMMRAQSLNSDARATPPAQQPPPQAFPGYPQQQYQQQGQFPQGQPQYPGMPGHIAPQILQRPQQQQQGMPPRHQQQLRAELPDQPVQSQSPQQPTILQRQRPHSNDPSAPQNQIQGSPAQPRQILQNPNRLAGQGQPMQPGPHRGQPGAHNRGPSFPGMVITHPEQLLQLSEAERAAFLEEDAKRAKRNHKIALLAKDNGLMTPQDKNFITRIQLQQLMTATGNLEERGPEAAIAEDFYYQVFSQIRGAPRHNPQQPASQFAQTYLFQTNNRFGARRHGRGGDNHMQRMEQQIQRAVEAAKARPKAKQLVVEGSLGKIAFSNSKTPRPLLNLKRPETNDKLPRHPRSSVADRKQTLRNIEAVYKTLMQMEDHERAMPMPIQENSPPEAIQAHMEWRSRIEVLHEQLWLNTRIMEPINPNTPHPFISILSHAKGKKVIPRLFRHINEQERITVVTMIVVHLDALSVVGQAIATPEEPLSAAIREEVDLFSQTVMSPIHAHISDAPLNIVIGLLGLVLDRTNLHVVARSRIGLTLLTFLISRAELLKQSAPEMVTDWQQWTGLYNRLFDVIEPVLPYLFPGSINDTDDMYIWQFLAAMGVGASPEQQQRLVLGVKDRVMETVSVSKALPPDMASARTANVNLFMRAIGLDVELLG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.29
3	0.25
4	0.24
5	0.25
6	0.25
7	0.23
8	0.21
9	0.21
10	0.18
11	0.17
12	0.14
13	0.12
14	0.12
15	0.12
16	0.11
17	0.09
18	0.06
19	0.06
20	0.06
21	0.05
22	0.04
23	0.04
24	0.03
25	0.03
26	0.03
27	0.04
28	0.05
29	0.06
30	0.06
31	0.06
32	0.07
33	0.07
34	0.07
35	0.08
36	0.06
37	0.06
38	0.06
39	0.06
40	0.06
41	0.06
42	0.06
43	0.05
44	0.06
45	0.09
46	0.09
47	0.1
48	0.1
49	0.1
50	0.11
51	0.11
52	0.12
53	0.11
54	0.11
55	0.13
56	0.12
57	0.12
58	0.15
59	0.16
60	0.15
61	0.16
62	0.17
63	0.19
64	0.24
65	0.24
66	0.22
67	0.21
68	0.26
69	0.25
70	0.25
71	0.23
72	0.19
73	0.18
74	0.17
75	0.17
76	0.12
77	0.1
78	0.08
79	0.07
80	0.09
81	0.09
82	0.09
83	0.09
84	0.09
85	0.11
86	0.16
87	0.14
88	0.18
89	0.27
90	0.27
91	0.34
92	0.41
93	0.48
94	0.55
95	0.63
96	0.66
97	0.66
98	0.75
99	0.78
100	0.8
101	0.76
102	0.75
103	0.73
104	0.71
105	0.73
106	0.69
107	0.69
108	0.69
109	0.71
110	0.7
111	0.7
112	0.74
113	0.71
114	0.75
115	0.7
116	0.71
117	0.72
118	0.72
119	0.69
120	0.69
121	0.67
122	0.63
123	0.62
124	0.62
125	0.57
126	0.56
127	0.62
128	0.63
129	0.65
130	0.64
131	0.69
132	0.62
133	0.63
134	0.61
135	0.56
136	0.54
137	0.49
138	0.46
139	0.42
140	0.4
141	0.35
142	0.35
143	0.34
144	0.29
145	0.26
146	0.27
147	0.25
148	0.24
149	0.24
150	0.19
151	0.15
152	0.13
153	0.13
154	0.13
155	0.21
156	0.22
157	0.27
158	0.3
159	0.3
160	0.37
161	0.42
162	0.5
163	0.51
164	0.59
165	0.6
166	0.64
167	0.71
168	0.7
169	0.68
170	0.59
171	0.51
172	0.41
173	0.4
174	0.34
175	0.26
176	0.21
177	0.21
178	0.21
179	0.2
180	0.21
181	0.17
182	0.17
183	0.17
184	0.19
185	0.16
186	0.2
187	0.2
188	0.2
189	0.2
190	0.19
191	0.18
192	0.16
193	0.14
194	0.09
195	0.07
196	0.05
197	0.04
198	0.05
199	0.08
200	0.1
201	0.11
202	0.13
203	0.12
204	0.15
205	0.18
206	0.18
207	0.22
208	0.27
209	0.33
210	0.34
211	0.39
212	0.42
213	0.46
214	0.49
215	0.44
216	0.38
217	0.31
218	0.32
219	0.37
220	0.37
221	0.33
222	0.3
223	0.32
224	0.37
225	0.4
226	0.42
227	0.38
228	0.35
229	0.35
230	0.37
231	0.42
232	0.36
233	0.41
234	0.37
235	0.33
236	0.32
237	0.32
238	0.31
239	0.25
240	0.25
241	0.18
242	0.17
243	0.16
244	0.17
245	0.17
246	0.15
247	0.14
248	0.19
249	0.23
250	0.23
251	0.27
252	0.29
253	0.33
254	0.38
255	0.44
256	0.4
257	0.38
258	0.45
259	0.51
260	0.49
261	0.47
262	0.48
263	0.47
264	0.53
265	0.52
266	0.49
267	0.46
268	0.53
269	0.51
270	0.49
271	0.45
272	0.42
273	0.44
274	0.43
275	0.36
276	0.26
277	0.25
278	0.22
279	0.23
280	0.23
281	0.25
282	0.26
283	0.27
284	0.26
285	0.3
286	0.32
287	0.41
288	0.43
289	0.44
290	0.43
291	0.5
292	0.58
293	0.57
294	0.61
295	0.57
296	0.55
297	0.53
298	0.5
299	0.51
300	0.45
301	0.43
302	0.36
303	0.33
304	0.28
305	0.26
306	0.24
307	0.18
308	0.18
309	0.22
310	0.23
311	0.22
312	0.21
313	0.21
314	0.26
315	0.31
316	0.37
317	0.35
318	0.43
319	0.41
320	0.42
321	0.42
322	0.36
323	0.3
324	0.24
325	0.26
326	0.21
327	0.21
328	0.21
329	0.22
330	0.23
331	0.23
332	0.26
333	0.22
334	0.23
335	0.24
336	0.22
337	0.24
338	0.31
339	0.4
340	0.42
341	0.41
342	0.39
343	0.37
344	0.39
345	0.38
346	0.3
347	0.22
348	0.14
349	0.15
350	0.13
351	0.13
352	0.13
353	0.13
354	0.15
355	0.13
356	0.13
357	0.11
358	0.1
359	0.1
360	0.08
361	0.08
362	0.06
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.07
367	0.06
368	0.06
369	0.05
370	0.04
371	0.1
372	0.1
373	0.12
374	0.15
375	0.16
376	0.19
377	0.24
378	0.32
379	0.35
380	0.42
381	0.46
382	0.48
383	0.54
384	0.56
385	0.58
386	0.55
387	0.46
388	0.4
389	0.35
390	0.3
391	0.23
392	0.18
393	0.11
394	0.08
395	0.12
396	0.12
397	0.13
398	0.14
399	0.15
400	0.16
401	0.17
402	0.18
403	0.19
404	0.21
405	0.21
406	0.25
407	0.23
408	0.23
409	0.22
410	0.21
411	0.15
412	0.13
413	0.1
414	0.08
415	0.08
416	0.07
417	0.06
418	0.05
419	0.06
420	0.06
421	0.06
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.05
427	0.05
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.05
432	0.05
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.1
437	0.13
438	0.17
439	0.2
440	0.22
441	0.25
442	0.31
443	0.39
444	0.41
445	0.41
446	0.39
447	0.45
448	0.44
449	0.44
450	0.4
451	0.34
452	0.3
453	0.26
454	0.27
455	0.19
456	0.2
457	0.16
458	0.16
459	0.15
460	0.17
461	0.19
462	0.19
463	0.2
464	0.19
465	0.18
466	0.27
467	0.33
468	0.35
469	0.35
470	0.36
471	0.38
472	0.4
473	0.48
474	0.46
475	0.43
476	0.41
477	0.38
478	0.33
479	0.31
480	0.34
481	0.32
482	0.24
483	0.22
484	0.25
485	0.25
486	0.25
487	0.25
488	0.2
489	0.17
490	0.17
491	0.18
492	0.2
493	0.24
494	0.25
495	0.27
496	0.3
497	0.33
498	0.34
499	0.37
500	0.34
501	0.35
502	0.36
503	0.35
504	0.31
505	0.25
506	0.23
507	0.17
508	0.14
509	0.09
510	0.08
511	0.09
512	0.1
513	0.18
514	0.21
515	0.27
516	0.28
517	0.29
518	0.32
519	0.35
520	0.43
521	0.44
522	0.51
523	0.55
524	0.56
525	0.61
526	0.61
527	0.62
528	0.59
529	0.59
530	0.57
531	0.53
532	0.6
533	0.63
534	0.67
535	0.65
536	0.6
537	0.56
538	0.55
539	0.6
540	0.6
541	0.58
542	0.6
543	0.57
544	0.6
545	0.61
546	0.58
547	0.52
548	0.43
549	0.4
550	0.33
551	0.35
552	0.32
553	0.27
554	0.25
555	0.21
556	0.2
557	0.17
558	0.16
559	0.12
560	0.14
561	0.18
562	0.19
563	0.19
564	0.19
565	0.17
566	0.17
567	0.18
568	0.16
569	0.12
570	0.13
571	0.13
572	0.15
573	0.17
574	0.19
575	0.19
576	0.19
577	0.17
578	0.14
579	0.14
580	0.13
581	0.13
582	0.11
583	0.13
584	0.16
585	0.17
586	0.17
587	0.18
588	0.19
589	0.18
590	0.17
591	0.19
592	0.21
593	0.23
594	0.25
595	0.25
596	0.23
597	0.24
598	0.27
599	0.23
600	0.17
601	0.15
602	0.13
603	0.14
604	0.15
605	0.16
606	0.17
607	0.19
608	0.27
609	0.27
610	0.28
611	0.3
612	0.31
613	0.29
614	0.27
615	0.24
616	0.17
617	0.19
618	0.23
619	0.22
620	0.23
621	0.27
622	0.27
623	0.26
624	0.29
625	0.3
626	0.31
627	0.38
628	0.43
629	0.46
630	0.52
631	0.59
632	0.64
633	0.63
634	0.65
635	0.63
636	0.64
637	0.59
638	0.54
639	0.47
640	0.39
641	0.38
642	0.3
643	0.22
644	0.15
645	0.12
646	0.11
647	0.09
648	0.08
649	0.07
650	0.06
651	0.05
652	0.05
653	0.04
654	0.04
655	0.04
656	0.04
657	0.04
658	0.04
659	0.03
660	0.04
661	0.05
662	0.05
663	0.05
664	0.06
665	0.06
666	0.06
667	0.06
668	0.07
669	0.08
670	0.08
671	0.08
672	0.08
673	0.09
674	0.09
675	0.1
676	0.1
677	0.09
678	0.1
679	0.1
680	0.09
681	0.09
682	0.09
683	0.1
684	0.1
685	0.1
686	0.1
687	0.1
688	0.14
689	0.14
690	0.15
691	0.14
692	0.19
693	0.2
694	0.19
695	0.19
696	0.15
697	0.15
698	0.14
699	0.12
700	0.07
701	0.04
702	0.04
703	0.03
704	0.03
705	0.03
706	0.03
707	0.03
708	0.04
709	0.04
710	0.06
711	0.08
712	0.09
713	0.09
714	0.15
715	0.17
716	0.21
717	0.23
718	0.22
719	0.21
720	0.21
721	0.22
722	0.17
723	0.17
724	0.15
725	0.13
726	0.12
727	0.12
728	0.11
729	0.12
730	0.1
731	0.1
732	0.09
733	0.11
734	0.12
735	0.15
736	0.18
737	0.18
738	0.19
739	0.21
740	0.2
741	0.18
742	0.19
743	0.18
744	0.18
745	0.19
746	0.19
747	0.17
748	0.17
749	0.17
750	0.17
751	0.19
752	0.22
753	0.22
754	0.22
755	0.22
756	0.24
757	0.24
758	0.21
759	0.23
760	0.17
761	0.17
762	0.16
763	0.16
764	0.14
765	0.14
766	0.14
767	0.11
768	0.1
769	0.09
770	0.1
771	0.15
772	0.17
773	0.2
774	0.21
775	0.2
776	0.19
777	0.2
778	0.19
779	0.15
780	0.13
781	0.11
782	0.1
783	0.09
784	0.08
785	0.09
786	0.07
787	0.05
788	0.05
789	0.05
790	0.05
791	0.05
792	0.06
793	0.09
794	0.12
795	0.13
796	0.14
797	0.14
798	0.15
799	0.19
800	0.22
801	0.21
802	0.24
803	0.27
804	0.29
805	0.3
806	0.3
807	0.27
808	0.25
809	0.23
810	0.21
811	0.23
812	0.22
813	0.21
814	0.21
815	0.23
816	0.23
817	0.24
818	0.21
819	0.16
820	0.21
821	0.23
822	0.24
823	0.24
824	0.23
825	0.23
826	0.25
827	0.25
828	0.2
829	0.23
830	0.23
831	0.22
832	0.21
833	0.2
834	0.17
835	0.16
836	0.16
837	0.1
838	0.08

W6YSV3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer