FuNGI

W6YUM0

Protein Details

Accession

W6YUM0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-25	GGRGGGRKPFRGKNKGGRGGG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
4-28	GGGRGGGRKPFRGKNKGGRGGGGGG

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001678 MeTrfase_RsmB/NOP2 IPR023267 RCMT IPR023270 RCMT_NCL1 IPR029063 SAM-dependent_MTases_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0016428 F:tRNA (cytosine-5-)-methyltransferase activity GO:0000049 F:tRNA binding
KEGG	bze:COCCADRAFT_35273 -
Pfam	View protein in Pfam PF01189 Methyltr_RsmB-F
PROSITE	View protein in PROSITE PS51686 SAM_MT_RSMB_NOP

Amino Acid Sequences

MGRGGGRGGGRKPFRGKNKGGRGGGGGGRDTRTEPWSTIERKNELFESYYRMGGFLDEAEFEEMWKALQADLPNSFRFTGTKSDALAVREIFKQRYVPAIASKHFEGKPVSPPEPVAAFPDELVWHMKTHKKIIRRHAPFADFQKFLVAEAASGNISRQEVVSMIPPHFLDVKPGMVVLDMCAAPGSKSAQLAEMIHGDEEERVQRVANGESVDLSADGDYSDDGRSTGLLIANDSDYKRAGMLVHQVKRLNFPNLIVTQHDASIFPSIELPSQGGKKQYLKYDRILADVPCSGDGTARKNPNVWQKWTPKDGLGLHGLQLRILFRGLQMLKKGGRMVYSTCSMNPVENEAVVAAAIEACGGNAKVKLVDCSDHLPNLKRKPGLNSWKVLDTSSVTAGGEKTAHMFTNWEAYQKARTKYETEEPERQFSTKVTPSCFPPIAKSEEERIPLEHCIRVYPHLQDTGGFFIAILEKLDDIKIAQLQSPETLNKGDRAQAETTTDSSVPTPAENVIEADATKTDTADDASDISAPLKRKLEETEDTEAPKKVKTDDAAENAVASAPATESVTNGSKSAVSKGASLKPENQNQAKEYFEYLSPDDATIASILDFFGIDERFPRDRFMVKNKEGLSLNKIYYTSAFAKTIISQNKDRGMKFIHCGVVMFVAHKIKDLDRTQAPWRLQNEGIRILEPWAKKRIVKLEKKETLHQLIREMFPKLPKEGDTGLGEVGEQLQKMDVGCCFVRVEKDEEQGIPFRMVLPLWRHPGSANLMVDKDDRKAMLLRLFNEKDTEIINHVADKAKAEMQAKEAEEAAEEAAEEAAEEANGSDKEGGVSLDAADGEDVKMGEDA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.7
3	0.76
4	0.77
5	0.84
6	0.85
7	0.79
8	0.72
9	0.65
10	0.61
11	0.54
12	0.46
13	0.38
14	0.3
15	0.3
16	0.29
17	0.27
18	0.25
19	0.26
20	0.25
21	0.24
22	0.26
23	0.34
24	0.38
25	0.43
26	0.48
27	0.5
28	0.49
29	0.53
30	0.5
31	0.44
32	0.41
33	0.35
34	0.35
35	0.32
36	0.32
37	0.27
38	0.26
39	0.23
40	0.2
41	0.19
42	0.13
43	0.11
44	0.09
45	0.11
46	0.13
47	0.13
48	0.12
49	0.13
50	0.11
51	0.1
52	0.11
53	0.1
54	0.08
55	0.12
56	0.13
57	0.16
58	0.22
59	0.26
60	0.26
61	0.27
62	0.28
63	0.25
64	0.25
65	0.24
66	0.26
67	0.27
68	0.29
69	0.28
70	0.31
71	0.33
72	0.34
73	0.34
74	0.28
75	0.26
76	0.28
77	0.31
78	0.29
79	0.29
80	0.3
81	0.27
82	0.33
83	0.33
84	0.3
85	0.34
86	0.38
87	0.38
88	0.39
89	0.4
90	0.41
91	0.39
92	0.39
93	0.36
94	0.33
95	0.39
96	0.42
97	0.42
98	0.36
99	0.37
100	0.36
101	0.34
102	0.31
103	0.26
104	0.21
105	0.19
106	0.18
107	0.19
108	0.16
109	0.15
110	0.18
111	0.15
112	0.14
113	0.19
114	0.25
115	0.27
116	0.37
117	0.41
118	0.46
119	0.53
120	0.63
121	0.69
122	0.7
123	0.74
124	0.73
125	0.71
126	0.69
127	0.69
128	0.65
129	0.54
130	0.47
131	0.44
132	0.35
133	0.32
134	0.28
135	0.2
136	0.13
137	0.13
138	0.14
139	0.09
140	0.09
141	0.09
142	0.08
143	0.09
144	0.09
145	0.08
146	0.08
147	0.08
148	0.09
149	0.15
150	0.16
151	0.16
152	0.18
153	0.18
154	0.19
155	0.21
156	0.2
157	0.18
158	0.17
159	0.18
160	0.16
161	0.16
162	0.15
163	0.13
164	0.13
165	0.08
166	0.1
167	0.08
168	0.08
169	0.08
170	0.09
171	0.08
172	0.1
173	0.12
174	0.1
175	0.11
176	0.12
177	0.13
178	0.15
179	0.15
180	0.15
181	0.15
182	0.13
183	0.12
184	0.12
185	0.11
186	0.09
187	0.1
188	0.1
189	0.1
190	0.09
191	0.09
192	0.11
193	0.13
194	0.14
195	0.15
196	0.14
197	0.13
198	0.13
199	0.13
200	0.12
201	0.1
202	0.09
203	0.06
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.06
210	0.05
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.07
215	0.08
216	0.09
217	0.09
218	0.1
219	0.1
220	0.11
221	0.14
222	0.13
223	0.12
224	0.11
225	0.11
226	0.1
227	0.1
228	0.1
229	0.1
230	0.19
231	0.26
232	0.3
233	0.34
234	0.37
235	0.37
236	0.42
237	0.44
238	0.39
239	0.31
240	0.28
241	0.29
242	0.28
243	0.29
244	0.25
245	0.23
246	0.19
247	0.19
248	0.18
249	0.13
250	0.12
251	0.13
252	0.12
253	0.1
254	0.11
255	0.1
256	0.11
257	0.11
258	0.11
259	0.11
260	0.13
261	0.15
262	0.17
263	0.2
264	0.25
265	0.29
266	0.36
267	0.41
268	0.43
269	0.44
270	0.49
271	0.46
272	0.43
273	0.41
274	0.33
275	0.28
276	0.25
277	0.22
278	0.15
279	0.14
280	0.12
281	0.12
282	0.14
283	0.17
284	0.22
285	0.26
286	0.26
287	0.27
288	0.33
289	0.41
290	0.45
291	0.45
292	0.47
293	0.51
294	0.56
295	0.59
296	0.55
297	0.45
298	0.45
299	0.4
300	0.34
301	0.29
302	0.23
303	0.21
304	0.22
305	0.21
306	0.16
307	0.16
308	0.13
309	0.1
310	0.1
311	0.09
312	0.06
313	0.13
314	0.14
315	0.16
316	0.17
317	0.2
318	0.21
319	0.22
320	0.24
321	0.18
322	0.18
323	0.17
324	0.18
325	0.17
326	0.19
327	0.18
328	0.16
329	0.18
330	0.17
331	0.16
332	0.14
333	0.15
334	0.12
335	0.11
336	0.11
337	0.09
338	0.08
339	0.07
340	0.06
341	0.03
342	0.02
343	0.02
344	0.02
345	0.02
346	0.02
347	0.03
348	0.03
349	0.04
350	0.04
351	0.05
352	0.06
353	0.07
354	0.09
355	0.09
356	0.1
357	0.11
358	0.14
359	0.15
360	0.16
361	0.18
362	0.22
363	0.27
364	0.32
365	0.35
366	0.34
367	0.35
368	0.38
369	0.46
370	0.51
371	0.48
372	0.46
373	0.43
374	0.43
375	0.42
376	0.36
377	0.27
378	0.19
379	0.16
380	0.13
381	0.12
382	0.09
383	0.09
384	0.08
385	0.08
386	0.07
387	0.06
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.08
393	0.07
394	0.14
395	0.14
396	0.13
397	0.13
398	0.13
399	0.21
400	0.25
401	0.28
402	0.24
403	0.25
404	0.27
405	0.3
406	0.37
407	0.37
408	0.38
409	0.44
410	0.43
411	0.44
412	0.43
413	0.39
414	0.33
415	0.26
416	0.25
417	0.22
418	0.22
419	0.22
420	0.22
421	0.24
422	0.28
423	0.29
424	0.24
425	0.22
426	0.23
427	0.25
428	0.25
429	0.24
430	0.23
431	0.25
432	0.27
433	0.25
434	0.22
435	0.2
436	0.21
437	0.21
438	0.18
439	0.15
440	0.14
441	0.14
442	0.15
443	0.16
444	0.16
445	0.16
446	0.16
447	0.16
448	0.15
449	0.15
450	0.15
451	0.13
452	0.11
453	0.09
454	0.08
455	0.08
456	0.08
457	0.07
458	0.05
459	0.05
460	0.05
461	0.05
462	0.05
463	0.04
464	0.05
465	0.07
466	0.07
467	0.09
468	0.09
469	0.1
470	0.11
471	0.12
472	0.12
473	0.11
474	0.13
475	0.12
476	0.13
477	0.14
478	0.16
479	0.16
480	0.19
481	0.19
482	0.18
483	0.2
484	0.19
485	0.19
486	0.17
487	0.15
488	0.12
489	0.12
490	0.12
491	0.1
492	0.09
493	0.08
494	0.07
495	0.08
496	0.07
497	0.08
498	0.07
499	0.07
500	0.07
501	0.06
502	0.06
503	0.06
504	0.06
505	0.06
506	0.05
507	0.05
508	0.06
509	0.06
510	0.06
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.06
515	0.07
516	0.1
517	0.11
518	0.14
519	0.16
520	0.16
521	0.18
522	0.21
523	0.27
524	0.27
525	0.31
526	0.33
527	0.32
528	0.34
529	0.34
530	0.33
531	0.28
532	0.26
533	0.21
534	0.18
535	0.2
536	0.2
537	0.23
538	0.27
539	0.3
540	0.31
541	0.29
542	0.27
543	0.23
544	0.21
545	0.15
546	0.09
547	0.06
548	0.03
549	0.04
550	0.05
551	0.05
552	0.05
553	0.08
554	0.11
555	0.11
556	0.11
557	0.11
558	0.12
559	0.13
560	0.15
561	0.16
562	0.14
563	0.17
564	0.21
565	0.27
566	0.29
567	0.3
568	0.35
569	0.39
570	0.44
571	0.49
572	0.49
573	0.46
574	0.45
575	0.45
576	0.39
577	0.33
578	0.29
579	0.23
580	0.19
581	0.19
582	0.18
583	0.17
584	0.16
585	0.15
586	0.14
587	0.12
588	0.11
589	0.08
590	0.07
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.04
595	0.04
596	0.04
597	0.06
598	0.06
599	0.06
600	0.08
601	0.13
602	0.16
603	0.17
604	0.19
605	0.2
606	0.24
607	0.31
608	0.39
609	0.44
610	0.44
611	0.5
612	0.49
613	0.51
614	0.49
615	0.45
616	0.41
617	0.36
618	0.34
619	0.29
620	0.28
621	0.24
622	0.22
623	0.24
624	0.22
625	0.2
626	0.2
627	0.18
628	0.19
629	0.21
630	0.28
631	0.29
632	0.3
633	0.31
634	0.35
635	0.43
636	0.46
637	0.44
638	0.41
639	0.4
640	0.39
641	0.38
642	0.39
643	0.33
644	0.29
645	0.29
646	0.25
647	0.23
648	0.19
649	0.17
650	0.15
651	0.16
652	0.15
653	0.17
654	0.18
655	0.17
656	0.25
657	0.26
658	0.29
659	0.3
660	0.34
661	0.38
662	0.44
663	0.44
664	0.43
665	0.43
666	0.41
667	0.42
668	0.42
669	0.41
670	0.39
671	0.38
672	0.32
673	0.3
674	0.28
675	0.3
676	0.28
677	0.29
678	0.29
679	0.31
680	0.33
681	0.39
682	0.47
683	0.52
684	0.59
685	0.64
686	0.69
687	0.74
688	0.77
689	0.77
690	0.74
691	0.72
692	0.68
693	0.59
694	0.54
695	0.5
696	0.49
697	0.45
698	0.4
699	0.34
700	0.35
701	0.36
702	0.33
703	0.31
704	0.29
705	0.31
706	0.3
707	0.32
708	0.28
709	0.26
710	0.23
711	0.2
712	0.19
713	0.14
714	0.15
715	0.11
716	0.09
717	0.08
718	0.08
719	0.09
720	0.1
721	0.12
722	0.1
723	0.13
724	0.13
725	0.14
726	0.15
727	0.16
728	0.2
729	0.21
730	0.27
731	0.27
732	0.3
733	0.32
734	0.32
735	0.33
736	0.32
737	0.31
738	0.26
739	0.22
740	0.19
741	0.17
742	0.16
743	0.19
744	0.22
745	0.27
746	0.33
747	0.34
748	0.34
749	0.33
750	0.38
751	0.38
752	0.39
753	0.34
754	0.3
755	0.3
756	0.31
757	0.34
758	0.3
759	0.26
760	0.22
761	0.2
762	0.2
763	0.23
764	0.26
765	0.3
766	0.33
767	0.34
768	0.41
769	0.43
770	0.42
771	0.41
772	0.36
773	0.3
774	0.27
775	0.27
776	0.2
777	0.21
778	0.2
779	0.19
780	0.21
781	0.24
782	0.22
783	0.22
784	0.22
785	0.22
786	0.26
787	0.28
788	0.28
789	0.28
790	0.33
791	0.33
792	0.31
793	0.28
794	0.23
795	0.21
796	0.2
797	0.17
798	0.1
799	0.09
800	0.08
801	0.07
802	0.06
803	0.06
804	0.05
805	0.05
806	0.05
807	0.05
808	0.05
809	0.09
810	0.09
811	0.1
812	0.1
813	0.1
814	0.11
815	0.12
816	0.12
817	0.09
818	0.1
819	0.08
820	0.09
821	0.09
822	0.08
823	0.08
824	0.08
825	0.08
826	0.09
827	0.09

W6YUM0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer