Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YRJ9

Protein Details
Accession W6YRJ9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
320-351AEYAKRQVVSKERKQKKFQNKLEDLKKRTRVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
331-341ERKQKKFQNKL
343-347DLKKR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
KEGG bze:COCCADRAFT_32750  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
CDD cd21077  DBD_Rad14  
Amino Acid Sequences MSGRQATPPRATRSAGKLPPNPPTPEQIRRMEEARLKAKAAAQQAQSSSAPKTGEKRAYSSVTASQTPSTVRNAAAASPQKPDQNGFIQPPSNDYIQPAKKYARSDFIEYDFSKMTDTKGGFLSTADDPHNKAMWKGQPKEEQKPEGMTITEWERERIRRKLRANRAGPYEPGISILNTVNGKEEEDEEAALLEAAENAEIESGTFKGKYGDGKRDIKGKCRECSSLEIDWKWQDTFSISVCNACKEKLPDKYSLLTKTEARDDYLLTDPELKDEDLLPHLERPNPHKQFFHPMQLFLRLQVEAYAFSPAKWGSPEALDAEYAKRQVVSKERKQKKFQNKLEDLKKRTRVEAYKRARLAGDSDGVQFGQKIKGRYDRHEHEWGRSVLDPETGMTKKRCEECGMEVEELEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.61
3 0.62
4 0.63
5 0.64
6 0.7
7 0.7
8 0.67
9 0.59
10 0.6
11 0.59
12 0.6
13 0.62
14 0.61
15 0.59
16 0.57
17 0.57
18 0.57
19 0.55
20 0.55
21 0.54
22 0.49
23 0.46
24 0.44
25 0.46
26 0.44
27 0.44
28 0.42
29 0.39
30 0.41
31 0.4
32 0.42
33 0.39
34 0.35
35 0.3
36 0.27
37 0.26
38 0.24
39 0.29
40 0.33
41 0.4
42 0.41
43 0.44
44 0.46
45 0.48
46 0.47
47 0.45
48 0.42
49 0.38
50 0.37
51 0.34
52 0.29
53 0.26
54 0.27
55 0.26
56 0.23
57 0.21
58 0.19
59 0.2
60 0.2
61 0.2
62 0.25
63 0.29
64 0.27
65 0.29
66 0.31
67 0.31
68 0.32
69 0.33
70 0.3
71 0.29
72 0.32
73 0.32
74 0.33
75 0.33
76 0.32
77 0.34
78 0.32
79 0.29
80 0.24
81 0.23
82 0.29
83 0.31
84 0.33
85 0.34
86 0.36
87 0.38
88 0.43
89 0.43
90 0.43
91 0.41
92 0.44
93 0.43
94 0.42
95 0.44
96 0.39
97 0.39
98 0.31
99 0.27
100 0.23
101 0.2
102 0.18
103 0.18
104 0.18
105 0.16
106 0.17
107 0.18
108 0.16
109 0.16
110 0.18
111 0.13
112 0.15
113 0.16
114 0.16
115 0.17
116 0.19
117 0.22
118 0.18
119 0.18
120 0.22
121 0.28
122 0.35
123 0.38
124 0.43
125 0.49
126 0.55
127 0.64
128 0.64
129 0.6
130 0.53
131 0.52
132 0.45
133 0.37
134 0.32
135 0.22
136 0.18
137 0.17
138 0.19
139 0.17
140 0.17
141 0.19
142 0.25
143 0.32
144 0.39
145 0.44
146 0.49
147 0.58
148 0.66
149 0.74
150 0.78
151 0.76
152 0.73
153 0.72
154 0.65
155 0.57
156 0.49
157 0.4
158 0.29
159 0.26
160 0.21
161 0.13
162 0.13
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.1
169 0.11
170 0.1
171 0.11
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.08
176 0.08
177 0.07
178 0.06
179 0.05
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.02
185 0.02
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.07
196 0.14
197 0.17
198 0.25
199 0.31
200 0.36
201 0.37
202 0.45
203 0.45
204 0.47
205 0.53
206 0.51
207 0.48
208 0.47
209 0.48
210 0.42
211 0.46
212 0.42
213 0.38
214 0.35
215 0.32
216 0.31
217 0.29
218 0.28
219 0.23
220 0.18
221 0.13
222 0.11
223 0.12
224 0.1
225 0.12
226 0.11
227 0.14
228 0.15
229 0.17
230 0.17
231 0.16
232 0.18
233 0.2
234 0.26
235 0.32
236 0.34
237 0.36
238 0.38
239 0.42
240 0.43
241 0.42
242 0.38
243 0.32
244 0.31
245 0.29
246 0.32
247 0.28
248 0.25
249 0.22
250 0.21
251 0.21
252 0.22
253 0.2
254 0.15
255 0.18
256 0.17
257 0.17
258 0.18
259 0.15
260 0.13
261 0.13
262 0.14
263 0.11
264 0.13
265 0.13
266 0.15
267 0.17
268 0.2
269 0.22
270 0.27
271 0.36
272 0.41
273 0.43
274 0.42
275 0.43
276 0.5
277 0.51
278 0.55
279 0.46
280 0.43
281 0.42
282 0.45
283 0.42
284 0.34
285 0.31
286 0.21
287 0.19
288 0.18
289 0.16
290 0.11
291 0.11
292 0.15
293 0.13
294 0.13
295 0.15
296 0.14
297 0.15
298 0.15
299 0.15
300 0.12
301 0.13
302 0.15
303 0.14
304 0.15
305 0.14
306 0.14
307 0.16
308 0.16
309 0.16
310 0.15
311 0.14
312 0.15
313 0.2
314 0.3
315 0.37
316 0.45
317 0.55
318 0.65
319 0.73
320 0.81
321 0.86
322 0.87
323 0.88
324 0.87
325 0.87
326 0.86
327 0.87
328 0.89
329 0.88
330 0.84
331 0.82
332 0.83
333 0.74
334 0.7
335 0.69
336 0.68
337 0.68
338 0.72
339 0.71
340 0.72
341 0.7
342 0.68
343 0.59
344 0.51
345 0.45
346 0.38
347 0.32
348 0.25
349 0.24
350 0.23
351 0.22
352 0.2
353 0.18
354 0.15
355 0.2
356 0.22
357 0.23
358 0.28
359 0.38
360 0.43
361 0.51
362 0.59
363 0.58
364 0.62
365 0.7
366 0.66
367 0.63
368 0.66
369 0.59
370 0.52
371 0.48
372 0.43
373 0.33
374 0.33
375 0.26
376 0.19
377 0.25
378 0.23
379 0.26
380 0.27
381 0.31
382 0.37
383 0.42
384 0.45
385 0.43
386 0.46
387 0.47
388 0.52
389 0.51
390 0.44