Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6XYM2

Protein Details
Accession W6XYM2    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-128DKSAEASKGKKRKREKKEKDPNAPKKPLTBasic
242-263KAPSPPAKTPRKRQKTTPAVNGHydrophilic
300-323AAETPVKKDTKKKKEKAAPQPIAPHydrophilic
336-358EETVTTKKKTKSSRSTRNTEADGHydrophilic
369-393EKAEKAEKAGKEKKRDRSKRKADSSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
106-125SKGKKRKREKKEKDPNAPKK
249-254KTPRKR
306-316KKDTKKKKEKA
367-390KAEKAEKAEKAGKEKKRDRSKRKA
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 12.166, cyto_nucl 11.333, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG bze:COCCADRAFT_39005  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MAPPTKKKEATGDLMISTAEYKKTRDSVIASLHNLQAGLIHVQHGITDLLTNYRKHCASVLGGEEGEIPPFNDVAAVAASVMEAGRNAVDETKQVLAPVDKSAEASKGKKRKREKKEKDPNAPKKPLTAAFLYHQHARPIVKADLEAALPPGGQIEKNAVQLEVNKRWNELPEEEKEQWKASYRNSMEEYKAELAEYIANKGIKATELVEEDEGSDDADIEAEVGAADSDASSEDEEEAPAKAPSPPAKTPRKRQKTTPAVNGNSAPISIAPAATNSTPVPLPSARSSQAPVPAPTTTAAAETPVKKDTKKKKEKAAPQPIAPAPASPHEDEPVPEETVTTKKKTKSSRSTRNTEADGDKENAALEKAEKAEKAEKAGKEKKRDRSKRKADSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.39
3 0.3
4 0.25
5 0.2
6 0.18
7 0.18
8 0.19
9 0.24
10 0.28
11 0.3
12 0.32
13 0.34
14 0.35
15 0.42
16 0.45
17 0.43
18 0.43
19 0.42
20 0.38
21 0.33
22 0.27
23 0.2
24 0.16
25 0.14
26 0.11
27 0.11
28 0.11
29 0.11
30 0.11
31 0.12
32 0.1
33 0.08
34 0.09
35 0.08
36 0.15
37 0.19
38 0.21
39 0.21
40 0.27
41 0.28
42 0.28
43 0.28
44 0.26
45 0.25
46 0.28
47 0.29
48 0.25
49 0.24
50 0.23
51 0.23
52 0.19
53 0.17
54 0.12
55 0.1
56 0.08
57 0.08
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.04
70 0.03
71 0.04
72 0.04
73 0.05
74 0.05
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.11
79 0.13
80 0.13
81 0.12
82 0.14
83 0.14
84 0.15
85 0.16
86 0.15
87 0.13
88 0.14
89 0.15
90 0.18
91 0.21
92 0.25
93 0.32
94 0.4
95 0.46
96 0.54
97 0.64
98 0.7
99 0.77
100 0.84
101 0.86
102 0.87
103 0.93
104 0.94
105 0.95
106 0.95
107 0.95
108 0.93
109 0.9
110 0.79
111 0.71
112 0.65
113 0.57
114 0.49
115 0.4
116 0.32
117 0.28
118 0.32
119 0.31
120 0.31
121 0.29
122 0.27
123 0.28
124 0.26
125 0.25
126 0.24
127 0.23
128 0.19
129 0.17
130 0.17
131 0.16
132 0.15
133 0.13
134 0.09
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.06
142 0.09
143 0.11
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.14
148 0.19
149 0.25
150 0.27
151 0.3
152 0.28
153 0.29
154 0.3
155 0.31
156 0.3
157 0.26
158 0.23
159 0.22
160 0.28
161 0.29
162 0.3
163 0.29
164 0.27
165 0.25
166 0.26
167 0.25
168 0.2
169 0.28
170 0.27
171 0.3
172 0.32
173 0.34
174 0.3
175 0.28
176 0.29
177 0.21
178 0.2
179 0.16
180 0.12
181 0.1
182 0.11
183 0.11
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.09
188 0.1
189 0.09
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.09
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.08
201 0.06
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.02
212 0.02
213 0.02
214 0.02
215 0.02
216 0.02
217 0.03
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.11
231 0.16
232 0.21
233 0.26
234 0.34
235 0.45
236 0.52
237 0.62
238 0.7
239 0.76
240 0.74
241 0.78
242 0.8
243 0.8
244 0.81
245 0.8
246 0.78
247 0.7
248 0.68
249 0.6
250 0.5
251 0.39
252 0.31
253 0.21
254 0.11
255 0.11
256 0.08
257 0.08
258 0.06
259 0.07
260 0.09
261 0.08
262 0.1
263 0.08
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.13
268 0.12
269 0.16
270 0.17
271 0.21
272 0.21
273 0.22
274 0.24
275 0.24
276 0.3
277 0.29
278 0.27
279 0.26
280 0.25
281 0.25
282 0.23
283 0.22
284 0.15
285 0.13
286 0.12
287 0.12
288 0.16
289 0.17
290 0.19
291 0.22
292 0.24
293 0.26
294 0.36
295 0.45
296 0.52
297 0.61
298 0.67
299 0.73
300 0.81
301 0.88
302 0.9
303 0.9
304 0.86
305 0.78
306 0.77
307 0.68
308 0.62
309 0.51
310 0.41
311 0.32
312 0.3
313 0.31
314 0.25
315 0.26
316 0.23
317 0.24
318 0.23
319 0.24
320 0.23
321 0.2
322 0.18
323 0.16
324 0.17
325 0.24
326 0.28
327 0.3
328 0.33
329 0.38
330 0.46
331 0.55
332 0.64
333 0.67
334 0.74
335 0.8
336 0.83
337 0.85
338 0.85
339 0.82
340 0.74
341 0.69
342 0.62
343 0.55
344 0.5
345 0.45
346 0.37
347 0.3
348 0.27
349 0.22
350 0.19
351 0.16
352 0.13
353 0.14
354 0.17
355 0.2
356 0.2
357 0.24
358 0.31
359 0.32
360 0.38
361 0.42
362 0.44
363 0.51
364 0.6
365 0.64
366 0.68
367 0.74
368 0.77
369 0.81
370 0.88
371 0.88
372 0.9
373 0.93