Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YKE7

Protein Details
Accession W6YKE7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
300-322RDASVKRKTEEQQARPRQRFRGEHydrophilic
324-343VASTKKERIKQQGGKFKGKWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
315-346PRQRFRGEWVASTKKERIKQQGGKFKGKWGRK
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 8, mito 6, pero 5, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG bze:COCCADRAFT_88979  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MDSEGEKVLEGIFAVAKPANVSSADVLLKLQETFAPSATFAPLLRTQPKRTSKSSDQVFRLGHGGTLDPLAAGVLIVGIGRGTKHLSNYLSCNKTYETVVLFGASTDTYDCTGSITQEADYLHVTKELVDGKLGTFRGTIQQLPPLYSALKINGIKACEYARQGKDLPRDLESREMHVDECTLLEWYEPGQHDFAWPSKVEPASAPAAKIRLTVCSGFYVRSFAHDLGRACNTCSHMASLLRTQQADFTTSNPPEPSSLTSALTYADLEAGEHVWGPKLRPQLDRWVTAHPVVQGHVNGRDASVKRKTEEQQARPRQRFRGEWVASTKKERIKQQGGKFKGKWGRKLAADREANNTSDQPVVPVINDQKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.11
4 0.11
5 0.12
6 0.13
7 0.12
8 0.14
9 0.13
10 0.16
11 0.16
12 0.15
13 0.15
14 0.14
15 0.15
16 0.13
17 0.12
18 0.1
19 0.13
20 0.14
21 0.15
22 0.15
23 0.15
24 0.16
25 0.16
26 0.16
27 0.13
28 0.16
29 0.19
30 0.24
31 0.32
32 0.37
33 0.42
34 0.51
35 0.61
36 0.62
37 0.63
38 0.67
39 0.67
40 0.71
41 0.74
42 0.73
43 0.66
44 0.67
45 0.62
46 0.54
47 0.47
48 0.38
49 0.29
50 0.21
51 0.18
52 0.12
53 0.12
54 0.1
55 0.08
56 0.07
57 0.06
58 0.05
59 0.04
60 0.03
61 0.02
62 0.02
63 0.02
64 0.02
65 0.02
66 0.03
67 0.03
68 0.05
69 0.08
70 0.09
71 0.11
72 0.16
73 0.19
74 0.21
75 0.28
76 0.36
77 0.36
78 0.35
79 0.35
80 0.32
81 0.31
82 0.3
83 0.25
84 0.18
85 0.17
86 0.16
87 0.15
88 0.13
89 0.11
90 0.11
91 0.08
92 0.07
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.08
99 0.09
100 0.09
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.11
105 0.11
106 0.1
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.08
113 0.11
114 0.13
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.11
119 0.15
120 0.15
121 0.13
122 0.1
123 0.11
124 0.14
125 0.16
126 0.17
127 0.14
128 0.18
129 0.18
130 0.2
131 0.2
132 0.17
133 0.15
134 0.15
135 0.15
136 0.11
137 0.16
138 0.15
139 0.17
140 0.18
141 0.18
142 0.18
143 0.18
144 0.18
145 0.15
146 0.17
147 0.22
148 0.21
149 0.23
150 0.25
151 0.29
152 0.33
153 0.36
154 0.35
155 0.31
156 0.32
157 0.29
158 0.35
159 0.31
160 0.28
161 0.24
162 0.23
163 0.2
164 0.19
165 0.18
166 0.1
167 0.09
168 0.07
169 0.06
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.12
182 0.11
183 0.1
184 0.1
185 0.13
186 0.13
187 0.13
188 0.12
189 0.13
190 0.16
191 0.16
192 0.16
193 0.13
194 0.14
195 0.14
196 0.16
197 0.13
198 0.11
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.15
203 0.15
204 0.14
205 0.14
206 0.15
207 0.13
208 0.14
209 0.16
210 0.14
211 0.16
212 0.19
213 0.19
214 0.19
215 0.23
216 0.21
217 0.19
218 0.21
219 0.22
220 0.2
221 0.2
222 0.18
223 0.16
224 0.17
225 0.18
226 0.19
227 0.21
228 0.21
229 0.21
230 0.2
231 0.2
232 0.2
233 0.21
234 0.18
235 0.16
236 0.21
237 0.22
238 0.24
239 0.22
240 0.21
241 0.19
242 0.21
243 0.21
244 0.18
245 0.19
246 0.18
247 0.18
248 0.17
249 0.17
250 0.15
251 0.13
252 0.08
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.08
262 0.09
263 0.11
264 0.15
265 0.22
266 0.27
267 0.3
268 0.33
269 0.41
270 0.45
271 0.49
272 0.47
273 0.45
274 0.43
275 0.4
276 0.39
277 0.3
278 0.27
279 0.22
280 0.22
281 0.19
282 0.19
283 0.21
284 0.2
285 0.18
286 0.18
287 0.24
288 0.23
289 0.29
290 0.34
291 0.35
292 0.35
293 0.43
294 0.46
295 0.5
296 0.59
297 0.61
298 0.64
299 0.72
300 0.81
301 0.82
302 0.84
303 0.81
304 0.78
305 0.73
306 0.7
307 0.7
308 0.62
309 0.6
310 0.62
311 0.62
312 0.58
313 0.59
314 0.58
315 0.55
316 0.58
317 0.61
318 0.62
319 0.65
320 0.71
321 0.76
322 0.79
323 0.8
324 0.83
325 0.76
326 0.75
327 0.74
328 0.72
329 0.71
330 0.69
331 0.69
332 0.67
333 0.75
334 0.72
335 0.73
336 0.72
337 0.65
338 0.64
339 0.6
340 0.53
341 0.46
342 0.4
343 0.32
344 0.29
345 0.26
346 0.21
347 0.2
348 0.19
349 0.17
350 0.23