Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6Y9X1

Protein Details
Accession W6Y9X1    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-74VAEDAPKKSKKSKKVEDSSDAPAVEAVEVKKEKKEKKDKKDKKSKKDKNNVEASATHydrophilic
76-105EAVEDAKKEKKEKKSKKSKKSKDVDDSEDABasic
133-169DATDAPAKKDKKKEKKEKKDKESKKSKKSKDDAKTEDBasic
194-227DLESKSEKKEKKDKKKDKKEKKEKKAKKSEDVETBasic
384-408ELEMKQSERKQKKEAKTGKKGEDAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-17KKRKRDT
20-32AEDAPKKSKKSKK
48-66KKEKKEKKDKKDKKSKKDK
81-97AKKEKKEKKSKKSKKSK
139-162AKKDKKKEKKEKKDKESKKSKKSK
199-221SEKKEKKDKKKDKKEKKEKKAKK
339-344KKEGRK
360-403RRSKIAAKNEKLHDERARDRVRKTELEMKQSERKQKKEAKTGKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG bze:COCCADRAFT_99231  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSKSKVDNVEKKRKRDTEVAEDAPKKSKKSKKVEDSSDAPAVEAVEVKKEKKEKKDKKDKKSKKDKNNVEASATEEAVEDAKKEKKEKKSKKSKKSKDVDDSEDAPAEEAALIDEMKKSENFISVNDDEPMPDATDAPAKKDKKKEKKEKKDKESKKSKKSKDDAKTEDTPMEDAAEEQNGTAEPAPVEANGVDLESKSEKKEKKDKKKDKKEKKEKKAKKSEDVETNGEASAETNGEAAAEDVEVTEEVNAEEAEEAEAAVEANQGRFIVFVGNLPYSATKEQIEKHFEKIKPSEIRLRTYKGSDKFMGTCFVEFDRFDRMVTCLKKYHHSVFPDPKKKEGRKINVELSAGGGGNSEVRRSKIAAKNEKLHDERARDRVRKTELEMKQSERKQKKEAKTGKKGEDAGAEEAEATEKPSEAETFGMNPARLAMMQGPQRPVHRSRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.78
3 0.76
4 0.75
5 0.76
6 0.74
7 0.72
8 0.69
9 0.65
10 0.64
11 0.6
12 0.55
13 0.56
14 0.59
15 0.6
16 0.67
17 0.76
18 0.78
19 0.84
20 0.88
21 0.85
22 0.81
23 0.77
24 0.7
25 0.59
26 0.48
27 0.38
28 0.29
29 0.22
30 0.2
31 0.14
32 0.17
33 0.21
34 0.22
35 0.29
36 0.37
37 0.45
38 0.52
39 0.64
40 0.67
41 0.75
42 0.85
43 0.89
44 0.92
45 0.95
46 0.95
47 0.95
48 0.96
49 0.95
50 0.95
51 0.95
52 0.94
53 0.93
54 0.92
55 0.83
56 0.75
57 0.65
58 0.58
59 0.5
60 0.39
61 0.29
62 0.19
63 0.17
64 0.14
65 0.14
66 0.1
67 0.12
68 0.18
69 0.22
70 0.29
71 0.37
72 0.47
73 0.58
74 0.69
75 0.76
76 0.82
77 0.88
78 0.92
79 0.95
80 0.95
81 0.95
82 0.94
83 0.93
84 0.92
85 0.88
86 0.84
87 0.78
88 0.7
89 0.61
90 0.52
91 0.41
92 0.31
93 0.23
94 0.16
95 0.11
96 0.07
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.09
105 0.1
106 0.11
107 0.15
108 0.15
109 0.15
110 0.22
111 0.21
112 0.23
113 0.22
114 0.2
115 0.16
116 0.17
117 0.17
118 0.11
119 0.1
120 0.09
121 0.08
122 0.14
123 0.14
124 0.18
125 0.25
126 0.28
127 0.35
128 0.45
129 0.55
130 0.61
131 0.72
132 0.78
133 0.82
134 0.9
135 0.94
136 0.95
137 0.95
138 0.95
139 0.94
140 0.94
141 0.94
142 0.93
143 0.92
144 0.92
145 0.9
146 0.89
147 0.88
148 0.87
149 0.85
150 0.84
151 0.79
152 0.76
153 0.71
154 0.62
155 0.55
156 0.45
157 0.36
158 0.26
159 0.21
160 0.14
161 0.1
162 0.08
163 0.08
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.06
183 0.08
184 0.09
185 0.1
186 0.17
187 0.21
188 0.29
189 0.39
190 0.49
191 0.58
192 0.69
193 0.78
194 0.83
195 0.91
196 0.94
197 0.95
198 0.96
199 0.96
200 0.96
201 0.96
202 0.96
203 0.94
204 0.94
205 0.93
206 0.89
207 0.86
208 0.81
209 0.77
210 0.73
211 0.68
212 0.59
213 0.49
214 0.43
215 0.33
216 0.27
217 0.2
218 0.12
219 0.08
220 0.06
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.04
238 0.04
239 0.03
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.11
266 0.11
267 0.12
268 0.11
269 0.13
270 0.17
271 0.23
272 0.3
273 0.29
274 0.34
275 0.41
276 0.41
277 0.45
278 0.44
279 0.47
280 0.45
281 0.47
282 0.5
283 0.46
284 0.5
285 0.49
286 0.5
287 0.45
288 0.44
289 0.48
290 0.43
291 0.45
292 0.41
293 0.39
294 0.37
295 0.35
296 0.34
297 0.27
298 0.23
299 0.19
300 0.18
301 0.17
302 0.15
303 0.15
304 0.17
305 0.17
306 0.17
307 0.16
308 0.17
309 0.23
310 0.25
311 0.28
312 0.27
313 0.29
314 0.35
315 0.4
316 0.45
317 0.44
318 0.47
319 0.52
320 0.58
321 0.67
322 0.71
323 0.67
324 0.68
325 0.72
326 0.73
327 0.73
328 0.73
329 0.72
330 0.72
331 0.77
332 0.75
333 0.7
334 0.65
335 0.55
336 0.46
337 0.37
338 0.27
339 0.2
340 0.13
341 0.08
342 0.11
343 0.11
344 0.12
345 0.13
346 0.14
347 0.16
348 0.19
349 0.28
350 0.32
351 0.42
352 0.5
353 0.56
354 0.63
355 0.66
356 0.73
357 0.66
358 0.66
359 0.63
360 0.6
361 0.59
362 0.6
363 0.64
364 0.61
365 0.62
366 0.63
367 0.63
368 0.6
369 0.6
370 0.6
371 0.56
372 0.6
373 0.61
374 0.59
375 0.62
376 0.65
377 0.69
378 0.68
379 0.68
380 0.69
381 0.74
382 0.78
383 0.79
384 0.83
385 0.83
386 0.85
387 0.89
388 0.86
389 0.83
390 0.76
391 0.68
392 0.63
393 0.56
394 0.48
395 0.39
396 0.32
397 0.24
398 0.22
399 0.2
400 0.14
401 0.12
402 0.09
403 0.09
404 0.1
405 0.11
406 0.12
407 0.12
408 0.13
409 0.13
410 0.15
411 0.19
412 0.23
413 0.21
414 0.2
415 0.2
416 0.2
417 0.18
418 0.18
419 0.17
420 0.19
421 0.26
422 0.31
423 0.35
424 0.38
425 0.42
426 0.46