Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6XRH3

Protein Details
Accession W6XRH3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-31TDTGARPKKGPAKRKGNQKSLRERRDIDIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-26RPKKGPAKRKGNQKSLRER
739-749GRREKASVKKR
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, cyto 5.5, mito 4, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041667  Cupin_8  
IPR003347  JmjC_dom  
IPR015915  Kelch-typ_b-propeller  
IPR007213  Ppm1/Ppm2/Tcmp  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0032259  P:methylation  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG bze:COCCADRAFT_7829  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13621  Cupin_8  
PF13418  Kelch_4  
PF04072  LCM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51184  JMJC  
Amino Acid Sequences MVTDTGARPKKGPAKRKGNQKSLRERRDIDIMNTNDSSIVSKRSVSKLYLSHEPDFYEPFVPKFVRRNPLINRGYWLRMHAIEQAVHRFLKEENGKSKVVVNLGCGYDPLPFQFWHRYPSLAQSATFVDVDYPQLMEKKRDRMLSNDLLRNALLKTKLRQTEQPILLRSDGYMALGCDLKDLATLERVLRAEFDISATTILFVAEVSVTYMPLKDSDALIQWASTIGDARFCILEQYLPQGPEHPFAKTMLSHFDKLQASIKAVKLHSSLDQQAARFRNAGWPTLVMARNLWDLWSDDSFTPPSLRRTINATEPFDEWEEFALFGSHYFLLVASNMETQGSNEPIHEETTTRESANGTDAGSIILHCWKQHSDTTLTPRRFPAAFTLDKDTVALHGGQGTQTRLADMDMLRQDDSDQDRAVQPGNLLPTARMCHTITSMQDGEALLVGGRGSPTQACADCWLFKHGTWTKVDDLVPARYRHSAVAVQLGSGETYTHGVLVFGGKASDGTVLDANDYCALWTANTGWHSISVDGPHPSPRFGAATCTINSARNCGLLTGGGNESGVVVDDALWEWSISATPTPRVSFKDRTNDVRSSLTNSVHARIGSVLVPWNDALLMIGGVSKKHIHSLSDDFLLLTCKDTIIQVERPSMHVAPHMSWPLLVGVGAVSSSRDEIVLAGGGAVCFSMGSYWNQDPISILPGATQGAKSWRCVGPSQAGSGTAGTKGTGQANAAETRRDGRREKASVKKRPVMAARTADIQRSQVSSSDDFARLVASSKPAIITGLDIGPCTDLWTLDYLKEKIGPEREIVVHECSSDRMTFKDKNFSYVKKSTADFLDGIAKGSHEYLRAVSSSQPNKLPTKLEEDFPSISNDFRIPDVCDVVKENYHSSPLRISGPVTLWLHYDVLSNILCQVHGKKTLFLYPPSDVSLLDFPPGGSSSNTDVLTSKNHKLRRTHPHVASLAPGDILFIPPMWSHTATPEDGVSVAVNVFWKGLDKGYAAGKDVYGNRDLQAYENGRRDVEKIVRAFKDIPGDVSRFYLERLAGEILEKAQKMGVEKDVKHDEEKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.76
3 0.85
4 0.87
5 0.88
6 0.88
7 0.88
8 0.89
9 0.89
10 0.91
11 0.88
12 0.81
13 0.75
14 0.75
15 0.68
16 0.62
17 0.61
18 0.53
19 0.5
20 0.46
21 0.42
22 0.32
23 0.29
24 0.27
25 0.19
26 0.21
27 0.17
28 0.21
29 0.27
30 0.32
31 0.36
32 0.35
33 0.39
34 0.41
35 0.45
36 0.5
37 0.5
38 0.48
39 0.46
40 0.45
41 0.41
42 0.38
43 0.35
44 0.3
45 0.25
46 0.23
47 0.27
48 0.27
49 0.3
50 0.36
51 0.42
52 0.47
53 0.5
54 0.58
55 0.6
56 0.69
57 0.68
58 0.61
59 0.58
60 0.55
61 0.54
62 0.47
63 0.42
64 0.36
65 0.33
66 0.33
67 0.32
68 0.3
69 0.29
70 0.31
71 0.34
72 0.33
73 0.31
74 0.29
75 0.25
76 0.23
77 0.3
78 0.34
79 0.36
80 0.4
81 0.45
82 0.45
83 0.45
84 0.49
85 0.42
86 0.4
87 0.33
88 0.29
89 0.29
90 0.3
91 0.29
92 0.24
93 0.21
94 0.19
95 0.18
96 0.17
97 0.14
98 0.14
99 0.18
100 0.27
101 0.29
102 0.31
103 0.32
104 0.33
105 0.32
106 0.39
107 0.42
108 0.34
109 0.33
110 0.3
111 0.3
112 0.3
113 0.28
114 0.21
115 0.14
116 0.13
117 0.15
118 0.13
119 0.11
120 0.11
121 0.16
122 0.18
123 0.25
124 0.31
125 0.37
126 0.42
127 0.48
128 0.49
129 0.5
130 0.57
131 0.59
132 0.61
133 0.58
134 0.53
135 0.48
136 0.46
137 0.41
138 0.33
139 0.28
140 0.25
141 0.23
142 0.28
143 0.35
144 0.42
145 0.44
146 0.5
147 0.53
148 0.58
149 0.61
150 0.62
151 0.56
152 0.53
153 0.5
154 0.43
155 0.35
156 0.27
157 0.2
158 0.15
159 0.13
160 0.1
161 0.11
162 0.12
163 0.11
164 0.1
165 0.09
166 0.08
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.12
173 0.17
174 0.17
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.15
179 0.13
180 0.14
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.1
201 0.09
202 0.1
203 0.11
204 0.13
205 0.15
206 0.14
207 0.13
208 0.12
209 0.11
210 0.1
211 0.09
212 0.09
213 0.07
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.09
221 0.11
222 0.09
223 0.14
224 0.17
225 0.17
226 0.17
227 0.21
228 0.22
229 0.26
230 0.26
231 0.22
232 0.2
233 0.2
234 0.22
235 0.19
236 0.19
237 0.23
238 0.26
239 0.26
240 0.25
241 0.31
242 0.3
243 0.3
244 0.34
245 0.27
246 0.25
247 0.29
248 0.31
249 0.3
250 0.29
251 0.3
252 0.26
253 0.27
254 0.27
255 0.27
256 0.27
257 0.27
258 0.29
259 0.27
260 0.32
261 0.33
262 0.31
263 0.27
264 0.25
265 0.28
266 0.27
267 0.28
268 0.22
269 0.2
270 0.2
271 0.26
272 0.27
273 0.19
274 0.18
275 0.18
276 0.18
277 0.18
278 0.16
279 0.11
280 0.11
281 0.13
282 0.14
283 0.14
284 0.13
285 0.15
286 0.16
287 0.15
288 0.17
289 0.17
290 0.2
291 0.23
292 0.23
293 0.23
294 0.28
295 0.3
296 0.36
297 0.4
298 0.39
299 0.36
300 0.36
301 0.37
302 0.33
303 0.3
304 0.21
305 0.16
306 0.13
307 0.11
308 0.11
309 0.09
310 0.07
311 0.07
312 0.09
313 0.07
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.06
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.1
327 0.12
328 0.11
329 0.1
330 0.12
331 0.13
332 0.14
333 0.13
334 0.11
335 0.11
336 0.16
337 0.17
338 0.15
339 0.15
340 0.14
341 0.15
342 0.16
343 0.15
344 0.11
345 0.1
346 0.1
347 0.09
348 0.09
349 0.08
350 0.06
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.11
355 0.12
356 0.15
357 0.17
358 0.2
359 0.21
360 0.25
361 0.35
362 0.41
363 0.42
364 0.41
365 0.39
366 0.39
367 0.35
368 0.31
369 0.28
370 0.26
371 0.27
372 0.28
373 0.33
374 0.3
375 0.3
376 0.29
377 0.22
378 0.16
379 0.15
380 0.12
381 0.06
382 0.07
383 0.07
384 0.08
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.1
389 0.1
390 0.09
391 0.09
392 0.1
393 0.09
394 0.13
395 0.14
396 0.15
397 0.15
398 0.15
399 0.15
400 0.16
401 0.19
402 0.16
403 0.14
404 0.14
405 0.15
406 0.16
407 0.17
408 0.13
409 0.11
410 0.11
411 0.12
412 0.11
413 0.11
414 0.1
415 0.11
416 0.12
417 0.13
418 0.14
419 0.13
420 0.13
421 0.15
422 0.17
423 0.15
424 0.19
425 0.18
426 0.15
427 0.15
428 0.14
429 0.13
430 0.1
431 0.1
432 0.05
433 0.04
434 0.04
435 0.03
436 0.04
437 0.03
438 0.04
439 0.04
440 0.06
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.11
445 0.13
446 0.14
447 0.15
448 0.17
449 0.16
450 0.15
451 0.24
452 0.25
453 0.26
454 0.27
455 0.29
456 0.27
457 0.29
458 0.29
459 0.23
460 0.22
461 0.24
462 0.26
463 0.24
464 0.24
465 0.22
466 0.23
467 0.2
468 0.2
469 0.17
470 0.14
471 0.18
472 0.16
473 0.15
474 0.14
475 0.14
476 0.11
477 0.09
478 0.09
479 0.04
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.04
493 0.05
494 0.04
495 0.05
496 0.06
497 0.06
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.06
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.04
507 0.05
508 0.05
509 0.07
510 0.08
511 0.09
512 0.08
513 0.09
514 0.09
515 0.09
516 0.09
517 0.08
518 0.09
519 0.09
520 0.1
521 0.14
522 0.14
523 0.14
524 0.14
525 0.14
526 0.14
527 0.13
528 0.15
529 0.13
530 0.15
531 0.15
532 0.18
533 0.17
534 0.2
535 0.2
536 0.19
537 0.18
538 0.16
539 0.16
540 0.13
541 0.12
542 0.08
543 0.08
544 0.08
545 0.07
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.06
550 0.05
551 0.05
552 0.03
553 0.03
554 0.03
555 0.03
556 0.03
557 0.03
558 0.04
559 0.03
560 0.03
561 0.03
562 0.04
563 0.04
564 0.05
565 0.06
566 0.07
567 0.09
568 0.1
569 0.12
570 0.16
571 0.22
572 0.27
573 0.31
574 0.39
575 0.41
576 0.47
577 0.51
578 0.48
579 0.45
580 0.41
581 0.36
582 0.33
583 0.32
584 0.26
585 0.25
586 0.24
587 0.24
588 0.22
589 0.21
590 0.16
591 0.13
592 0.14
593 0.09
594 0.09
595 0.1
596 0.09
597 0.1
598 0.09
599 0.09
600 0.08
601 0.07
602 0.07
603 0.04
604 0.03
605 0.03
606 0.04
607 0.04
608 0.04
609 0.06
610 0.07
611 0.07
612 0.11
613 0.12
614 0.12
615 0.15
616 0.2
617 0.21
618 0.21
619 0.2
620 0.17
621 0.16
622 0.17
623 0.13
624 0.1
625 0.08
626 0.07
627 0.07
628 0.07
629 0.09
630 0.11
631 0.15
632 0.15
633 0.19
634 0.19
635 0.2
636 0.23
637 0.22
638 0.18
639 0.17
640 0.17
641 0.15
642 0.18
643 0.17
644 0.14
645 0.14
646 0.14
647 0.11
648 0.1
649 0.08
650 0.05
651 0.04
652 0.04
653 0.04
654 0.03
655 0.03
656 0.03
657 0.04
658 0.04
659 0.04
660 0.04
661 0.04
662 0.05
663 0.05
664 0.04
665 0.04
666 0.04
667 0.04
668 0.04
669 0.03
670 0.03
671 0.02
672 0.02
673 0.03
674 0.04
675 0.06
676 0.1
677 0.1
678 0.14
679 0.14
680 0.14
681 0.14
682 0.14
683 0.16
684 0.12
685 0.11
686 0.08
687 0.09
688 0.1
689 0.09
690 0.09
691 0.07
692 0.14
693 0.15
694 0.16
695 0.2
696 0.21
697 0.23
698 0.24
699 0.26
700 0.26
701 0.27
702 0.28
703 0.23
704 0.22
705 0.2
706 0.2
707 0.17
708 0.1
709 0.09
710 0.07
711 0.07
712 0.09
713 0.1
714 0.1
715 0.09
716 0.11
717 0.13
718 0.17
719 0.17
720 0.16
721 0.15
722 0.19
723 0.22
724 0.26
725 0.26
726 0.29
727 0.38
728 0.43
729 0.51
730 0.57
731 0.64
732 0.68
733 0.73
734 0.73
735 0.67
736 0.68
737 0.66
738 0.61
739 0.57
740 0.52
741 0.45
742 0.44
743 0.42
744 0.37
745 0.31
746 0.28
747 0.22
748 0.2
749 0.19
750 0.16
751 0.19
752 0.19
753 0.2
754 0.22
755 0.21
756 0.2
757 0.19
758 0.17
759 0.13
760 0.13
761 0.12
762 0.11
763 0.11
764 0.11
765 0.11
766 0.11
767 0.11
768 0.1
769 0.09
770 0.09
771 0.1
772 0.1
773 0.09
774 0.1
775 0.1
776 0.09
777 0.1
778 0.09
779 0.07
780 0.08
781 0.11
782 0.11
783 0.13
784 0.18
785 0.17
786 0.18
787 0.22
788 0.22
789 0.25
790 0.29
791 0.28
792 0.25
793 0.28
794 0.28
795 0.27
796 0.28
797 0.26
798 0.21
799 0.2
800 0.19
801 0.17
802 0.18
803 0.17
804 0.16
805 0.15
806 0.21
807 0.26
808 0.29
809 0.38
810 0.36
811 0.41
812 0.46
813 0.47
814 0.49
815 0.47
816 0.48
817 0.41
818 0.42
819 0.39
820 0.36
821 0.35
822 0.27
823 0.23
824 0.26
825 0.22
826 0.23
827 0.19
828 0.17
829 0.15
830 0.16
831 0.16
832 0.11
833 0.11
834 0.11
835 0.13
836 0.13
837 0.14
838 0.17
839 0.25
840 0.28
841 0.31
842 0.35
843 0.37
844 0.4
845 0.42
846 0.41
847 0.35
848 0.39
849 0.37
850 0.37
851 0.36
852 0.37
853 0.36
854 0.32
855 0.34
856 0.26
857 0.24
858 0.22
859 0.2
860 0.16
861 0.16
862 0.17
863 0.15
864 0.17
865 0.2
866 0.18
867 0.19
868 0.21
869 0.22
870 0.23
871 0.23
872 0.23
873 0.21
874 0.26
875 0.26
876 0.24
877 0.25
878 0.25
879 0.26
880 0.24
881 0.24
882 0.22
883 0.23
884 0.28
885 0.25
886 0.23
887 0.22
888 0.22
889 0.22
890 0.19
891 0.18
892 0.12
893 0.14
894 0.13
895 0.12
896 0.13
897 0.12
898 0.12
899 0.13
900 0.17
901 0.19
902 0.26
903 0.28
904 0.29
905 0.31
906 0.39
907 0.4
908 0.4
909 0.39
910 0.34
911 0.35
912 0.34
913 0.32
914 0.24
915 0.24
916 0.24
917 0.2
918 0.18
919 0.16
920 0.13
921 0.14
922 0.15
923 0.13
924 0.11
925 0.13
926 0.16
927 0.21
928 0.21
929 0.2
930 0.2
931 0.2
932 0.28
933 0.31
934 0.35
935 0.37
936 0.43
937 0.49
938 0.56
939 0.64
940 0.67
941 0.71
942 0.73
943 0.7
944 0.73
945 0.69
946 0.63
947 0.57
948 0.47
949 0.38
950 0.28
951 0.23
952 0.16
953 0.14
954 0.14
955 0.1
956 0.08
957 0.09
958 0.09
959 0.12
960 0.15
961 0.16
962 0.16
963 0.2
964 0.23
965 0.22
966 0.24
967 0.22
968 0.18
969 0.16
970 0.16
971 0.12
972 0.09
973 0.08
974 0.08
975 0.08
976 0.08
977 0.08
978 0.07
979 0.1
980 0.1
981 0.12
982 0.13
983 0.13
984 0.16
985 0.22
986 0.23
987 0.23
988 0.23
989 0.22
990 0.25
991 0.28
992 0.29
993 0.25
994 0.25
995 0.23
996 0.25
997 0.25
998 0.22
999 0.27
1000 0.3
1001 0.34
1002 0.4
1003 0.41
1004 0.39
1005 0.39
1006 0.39
1007 0.38
1008 0.39
1009 0.4
1010 0.39
1011 0.45
1012 0.46
1013 0.49
1014 0.49
1015 0.45
1016 0.46
1017 0.4
1018 0.39
1019 0.36
1020 0.37
1021 0.33
1022 0.33
1023 0.32
1024 0.24
1025 0.24
1026 0.23
1027 0.19
1028 0.18
1029 0.2
1030 0.19
1031 0.17
1032 0.18
1033 0.18
1034 0.17
1035 0.22
1036 0.21
1037 0.18
1038 0.18
1039 0.2
1040 0.22
1041 0.24
1042 0.3
1043 0.33
1044 0.34
1045 0.42
1046 0.49
1047 0.5