Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6YFC1

Protein Details
Accession W6YFC1    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
366-391IETAVKKEVTKRKRIKKEPLPDESPIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
375-382TKRKRIKK
Subcellular Location(s) cyto 15, cyto_mito 11.333, cyto_nucl 9.333, mito 6.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
IPR012904  OGG_N  
Gene Ontology GO:0140078  F:class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0008534  F:oxidized purine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
KEGG bze:COCCADRAFT_29100  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
PF07934  OGG_N  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MALRAAEWHKLPTSLTELCIDTTLRCGQSFRWRKSAEGEWSAALHGRILSLRQDPQYLHYRAIYPSITTALPTPPPSNAPSVAPEEDDTLALVNHYFNLSPNLGHLYEQWAASDANFRKRAPKFTGIRILRQDAWEALIGFICSSNNNIGRISGMVHNLCLHYGPLIGHIDEVPYHDFPTPAALSGPDVEAHLMKLGFGYRAKYIAKTARIVSEDKGLKWLEDLSNPEYPQFGVEEKPAGDMLEGGREGYRKAHEELLALHGVGPKVADCVCLFGLGWSESVPVDTHVWQIAQRDYRFGKGKHSSLTAATYVAIGNLFRKLWGKEAGWAHSVLFTADLKAFSERVVAKVEVKEEVVIKKEDDETVIETAVKKEVTKRKRIKKEPLPDESPIVQVKQDPTRRSKRQRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.25
4 0.25
5 0.24
6 0.25
7 0.22
8 0.16
9 0.19
10 0.23
11 0.21
12 0.21
13 0.22
14 0.26
15 0.36
16 0.46
17 0.47
18 0.52
19 0.52
20 0.53
21 0.58
22 0.62
23 0.59
24 0.54
25 0.5
26 0.41
27 0.4
28 0.39
29 0.34
30 0.25
31 0.18
32 0.13
33 0.12
34 0.12
35 0.13
36 0.16
37 0.19
38 0.24
39 0.24
40 0.27
41 0.27
42 0.31
43 0.39
44 0.37
45 0.35
46 0.32
47 0.33
48 0.31
49 0.34
50 0.3
51 0.21
52 0.2
53 0.2
54 0.18
55 0.16
56 0.17
57 0.16
58 0.18
59 0.21
60 0.21
61 0.2
62 0.23
63 0.25
64 0.27
65 0.25
66 0.23
67 0.24
68 0.27
69 0.26
70 0.24
71 0.23
72 0.21
73 0.2
74 0.18
75 0.15
76 0.11
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.11
86 0.12
87 0.11
88 0.12
89 0.16
90 0.15
91 0.16
92 0.15
93 0.16
94 0.17
95 0.17
96 0.16
97 0.14
98 0.13
99 0.13
100 0.21
101 0.19
102 0.26
103 0.3
104 0.3
105 0.37
106 0.41
107 0.48
108 0.46
109 0.53
110 0.49
111 0.53
112 0.63
113 0.57
114 0.59
115 0.56
116 0.54
117 0.46
118 0.42
119 0.36
120 0.26
121 0.25
122 0.2
123 0.16
124 0.12
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.05
131 0.07
132 0.11
133 0.12
134 0.13
135 0.13
136 0.13
137 0.13
138 0.13
139 0.14
140 0.12
141 0.13
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.11
148 0.09
149 0.06
150 0.07
151 0.06
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.14
167 0.12
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.09
187 0.08
188 0.11
189 0.12
190 0.12
191 0.16
192 0.19
193 0.21
194 0.22
195 0.22
196 0.22
197 0.24
198 0.25
199 0.22
200 0.24
201 0.23
202 0.21
203 0.24
204 0.21
205 0.19
206 0.18
207 0.19
208 0.13
209 0.13
210 0.17
211 0.16
212 0.19
213 0.19
214 0.19
215 0.17
216 0.16
217 0.14
218 0.12
219 0.1
220 0.08
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.11
237 0.13
238 0.13
239 0.15
240 0.18
241 0.18
242 0.19
243 0.2
244 0.21
245 0.19
246 0.16
247 0.15
248 0.13
249 0.12
250 0.11
251 0.1
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.09
261 0.08
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.07
266 0.08
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.09
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.12
277 0.15
278 0.19
279 0.23
280 0.23
281 0.28
282 0.28
283 0.34
284 0.4
285 0.38
286 0.42
287 0.42
288 0.46
289 0.43
290 0.45
291 0.4
292 0.35
293 0.37
294 0.28
295 0.21
296 0.18
297 0.15
298 0.12
299 0.11
300 0.09
301 0.07
302 0.07
303 0.09
304 0.09
305 0.1
306 0.13
307 0.14
308 0.18
309 0.23
310 0.23
311 0.28
312 0.32
313 0.34
314 0.32
315 0.32
316 0.28
317 0.24
318 0.23
319 0.16
320 0.14
321 0.11
322 0.11
323 0.12
324 0.12
325 0.12
326 0.13
327 0.13
328 0.12
329 0.17
330 0.16
331 0.17
332 0.21
333 0.21
334 0.23
335 0.26
336 0.27
337 0.23
338 0.23
339 0.23
340 0.22
341 0.24
342 0.24
343 0.23
344 0.22
345 0.23
346 0.24
347 0.23
348 0.21
349 0.2
350 0.19
351 0.19
352 0.19
353 0.17
354 0.16
355 0.17
356 0.19
357 0.17
358 0.16
359 0.24
360 0.34
361 0.42
362 0.52
363 0.61
364 0.69
365 0.79
366 0.88
367 0.9
368 0.9
369 0.93
370 0.92
371 0.9
372 0.85
373 0.77
374 0.73
375 0.64
376 0.58
377 0.49
378 0.4
379 0.33
380 0.31
381 0.34
382 0.38
383 0.44
384 0.46
385 0.54
386 0.63
387 0.73