Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6Y9E5

Protein Details
Accession W6Y9E5    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-57PTPTPRSSTRKQVGKRELESLETPTQTKRQRKAPKATAKKGSAAHydrophilic
173-195TPSATVKKGRGRPKKTPQKELVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-54KRQRKAPKATAKKG
179-188KKGRGRPKKT
311-346AKRKAREEFLAAQQAAKREREEKKAKKLAKQAAKEA
393-427PERRGKTEEEKRKEKLNQHIKFLERTDKPAKDVKK
458-485LKGRQVEKRMVGKKGGVVRVGRMERRPH
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR013268  U3_snoRNA_assoc  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG bze:COCCADRAFT_6200  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08297  U3_snoRNA_assoc  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MVTTRGGTETPGAPTPTPRSSTRKQVGKRELESLETPTQTKRQRKAPKATAKKGSAAEPKGQEESADEPSQESSNDTSDTIAANAQEPEAPETPKQSGLPARRKSSPQVVVGADASDQSSNTVEKEDEVPSTVQNPAFYTPIQAPGSVYATPATRKRPEGSPTPKAKILNDQTPSATVKKGRGRPKKTPQKELVEAIDEVPSSTYESEMAPIPSQDTAPPSAQPEKAHMRFGSEEPASTPASPVMNKQGNKRYEAAEPVVEVSQADDDNDASDSDDEAPEVVTTAAASSKALAARAEADRAQKAQQAKEDAKRKAREEFLAAQQAAKREREEKKAKKLAKQAAKEAKAAATDAPSADQESDSEHPTQIDTSNGLLPDSLLATIDDQRPPTPPPERRGKTEEEKRKEKLNQHIKFLERTDKPAKDVKKGKLNVAVLAQQNKVMPPKVNRDSKNVREHWLKGRQVEKRMVGKKGGVVRVGRMERRPHGNRGFLKDGDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.35
3 0.37
4 0.39
5 0.41
6 0.46
7 0.49
8 0.59
9 0.63
10 0.66
11 0.69
12 0.75
13 0.8
14 0.81
15 0.78
16 0.75
17 0.67
18 0.62
19 0.56
20 0.52
21 0.46
22 0.39
23 0.37
24 0.33
25 0.4
26 0.44
27 0.51
28 0.52
29 0.58
30 0.67
31 0.76
32 0.83
33 0.85
34 0.87
35 0.89
36 0.91
37 0.9
38 0.83
39 0.79
40 0.71
41 0.68
42 0.66
43 0.6
44 0.57
45 0.52
46 0.52
47 0.48
48 0.45
49 0.37
50 0.3
51 0.3
52 0.29
53 0.25
54 0.22
55 0.2
56 0.22
57 0.22
58 0.2
59 0.18
60 0.14
61 0.14
62 0.15
63 0.15
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.12
68 0.12
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.12
75 0.16
76 0.17
77 0.19
78 0.18
79 0.21
80 0.23
81 0.25
82 0.24
83 0.24
84 0.3
85 0.37
86 0.46
87 0.51
88 0.54
89 0.56
90 0.6
91 0.61
92 0.63
93 0.6
94 0.52
95 0.5
96 0.45
97 0.41
98 0.38
99 0.32
100 0.22
101 0.16
102 0.14
103 0.09
104 0.08
105 0.07
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.1
110 0.09
111 0.1
112 0.13
113 0.14
114 0.13
115 0.14
116 0.15
117 0.14
118 0.16
119 0.17
120 0.15
121 0.14
122 0.15
123 0.15
124 0.16
125 0.15
126 0.16
127 0.14
128 0.2
129 0.2
130 0.18
131 0.17
132 0.18
133 0.2
134 0.17
135 0.17
136 0.11
137 0.12
138 0.16
139 0.19
140 0.24
141 0.26
142 0.29
143 0.32
144 0.37
145 0.4
146 0.47
147 0.51
148 0.55
149 0.58
150 0.58
151 0.59
152 0.54
153 0.51
154 0.5
155 0.48
156 0.45
157 0.41
158 0.38
159 0.35
160 0.36
161 0.37
162 0.28
163 0.25
164 0.2
165 0.25
166 0.31
167 0.39
168 0.47
169 0.55
170 0.62
171 0.7
172 0.78
173 0.83
174 0.82
175 0.84
176 0.81
177 0.79
178 0.75
179 0.67
180 0.58
181 0.49
182 0.42
183 0.33
184 0.25
185 0.17
186 0.13
187 0.1
188 0.09
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.08
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.09
200 0.08
201 0.09
202 0.08
203 0.09
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.14
208 0.18
209 0.19
210 0.19
211 0.22
212 0.28
213 0.29
214 0.32
215 0.29
216 0.28
217 0.28
218 0.28
219 0.28
220 0.2
221 0.18
222 0.16
223 0.18
224 0.16
225 0.14
226 0.14
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.16
232 0.21
233 0.22
234 0.28
235 0.35
236 0.35
237 0.38
238 0.38
239 0.33
240 0.3
241 0.31
242 0.26
243 0.19
244 0.17
245 0.15
246 0.14
247 0.11
248 0.09
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.03
270 0.03
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.1
282 0.11
283 0.12
284 0.12
285 0.14
286 0.15
287 0.16
288 0.17
289 0.18
290 0.21
291 0.22
292 0.24
293 0.28
294 0.32
295 0.38
296 0.46
297 0.49
298 0.54
299 0.56
300 0.55
301 0.54
302 0.53
303 0.47
304 0.44
305 0.42
306 0.39
307 0.4
308 0.37
309 0.33
310 0.31
311 0.33
312 0.3
313 0.27
314 0.25
315 0.26
316 0.32
317 0.41
318 0.5
319 0.54
320 0.62
321 0.7
322 0.73
323 0.73
324 0.77
325 0.76
326 0.75
327 0.71
328 0.7
329 0.7
330 0.67
331 0.61
332 0.52
333 0.44
334 0.35
335 0.32
336 0.23
337 0.14
338 0.13
339 0.11
340 0.11
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.09
345 0.08
346 0.11
347 0.13
348 0.14
349 0.15
350 0.15
351 0.14
352 0.15
353 0.16
354 0.13
355 0.12
356 0.11
357 0.11
358 0.13
359 0.13
360 0.12
361 0.11
362 0.1
363 0.1
364 0.09
365 0.07
366 0.05
367 0.06
368 0.07
369 0.11
370 0.15
371 0.16
372 0.17
373 0.18
374 0.2
375 0.22
376 0.27
377 0.33
378 0.37
379 0.42
380 0.52
381 0.55
382 0.6
383 0.63
384 0.65
385 0.65
386 0.69
387 0.73
388 0.71
389 0.75
390 0.71
391 0.75
392 0.74
393 0.72
394 0.72
395 0.72
396 0.68
397 0.68
398 0.71
399 0.66
400 0.63
401 0.59
402 0.57
403 0.49
404 0.51
405 0.52
406 0.48
407 0.49
408 0.52
409 0.53
410 0.53
411 0.6
412 0.61
413 0.62
414 0.63
415 0.65
416 0.65
417 0.62
418 0.55
419 0.5
420 0.47
421 0.42
422 0.43
423 0.37
424 0.31
425 0.3
426 0.3
427 0.31
428 0.29
429 0.31
430 0.34
431 0.43
432 0.51
433 0.59
434 0.59
435 0.64
436 0.71
437 0.73
438 0.77
439 0.7
440 0.69
441 0.67
442 0.69
443 0.69
444 0.69
445 0.65
446 0.62
447 0.67
448 0.67
449 0.67
450 0.7
451 0.68
452 0.68
453 0.7
454 0.67
455 0.63
456 0.58
457 0.57
458 0.58
459 0.54
460 0.49
461 0.44
462 0.44
463 0.49
464 0.53
465 0.53
466 0.51
467 0.54
468 0.56
469 0.65
470 0.66
471 0.66
472 0.67
473 0.71
474 0.72
475 0.72
476 0.72