Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W6XMC8

Protein Details
Accession W6XMC8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
451-476GGGGKNKWNKGKGKYSRNQYSKNMDGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-246RKGRKRSR
443-465ERSYRGSGGGGGKNKWNKGKGKY
Subcellular Location(s) mito 17, mito_nucl 11.833, cyto_mito 10.833, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG bze:COCCADRAFT_30340  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MATSPKEGKKKVLEGIFAVNKTQWASSAGVLRDLQEHFARSSLLAPWLESQKRSLILSHAKQKHINNLKVKLGHGGTLDPMATGVLIVGLGRGTKCLQRFLECTKTYECVVLFGAATDSYDAVGKVVSKAPYEHVTKELVEEKLAQFRGKIMQKPSVFSALKVDGKKMYEYAREGKEIPEVAARPVEVEELELVEWMEPGSHEYAWPKEEVDGVEMEGAKKLLGIREEDAKIHANTMARKGRKRSRSPESDSVEGAGKQPKMPKSETEPAMSGALPSQDTPAEATETIQDDTTQAATDAALPTQENPETSSKETEVADQAQPSNEDSATFTQSSPQPPAARLRMTVTSGFYVRSLCHDLGLACSSLGLMSSLIRSRQGAYTLGQNVIELSDFESAEKWEPQLQQQLEEFMEKEGWEAEELEDEETWQAKKEERLSERKDEDRERSYRGSGGGGGKNKWNKGKGKYSRNQYSKNMDGGKKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.57
3 0.55
4 0.47
5 0.42
6 0.35
7 0.31
8 0.29
9 0.27
10 0.19
11 0.16
12 0.17
13 0.19
14 0.25
15 0.23
16 0.26
17 0.26
18 0.26
19 0.27
20 0.26
21 0.27
22 0.23
23 0.25
24 0.21
25 0.22
26 0.22
27 0.18
28 0.19
29 0.17
30 0.2
31 0.17
32 0.18
33 0.22
34 0.29
35 0.32
36 0.31
37 0.31
38 0.3
39 0.32
40 0.32
41 0.29
42 0.29
43 0.36
44 0.42
45 0.5
46 0.53
47 0.55
48 0.6
49 0.62
50 0.65
51 0.66
52 0.67
53 0.65
54 0.64
55 0.66
56 0.62
57 0.59
58 0.55
59 0.46
60 0.4
61 0.32
62 0.27
63 0.21
64 0.2
65 0.19
66 0.12
67 0.11
68 0.08
69 0.07
70 0.06
71 0.05
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.05
78 0.05
79 0.07
80 0.09
81 0.13
82 0.15
83 0.22
84 0.24
85 0.28
86 0.32
87 0.38
88 0.46
89 0.43
90 0.45
91 0.41
92 0.41
93 0.37
94 0.35
95 0.28
96 0.19
97 0.19
98 0.16
99 0.13
100 0.11
101 0.11
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.08
113 0.12
114 0.13
115 0.13
116 0.15
117 0.18
118 0.23
119 0.26
120 0.26
121 0.24
122 0.24
123 0.23
124 0.25
125 0.27
126 0.21
127 0.19
128 0.2
129 0.19
130 0.24
131 0.25
132 0.22
133 0.17
134 0.19
135 0.26
136 0.28
137 0.32
138 0.3
139 0.37
140 0.38
141 0.4
142 0.4
143 0.41
144 0.36
145 0.31
146 0.32
147 0.29
148 0.33
149 0.31
150 0.31
151 0.25
152 0.26
153 0.27
154 0.24
155 0.22
156 0.21
157 0.24
158 0.29
159 0.29
160 0.29
161 0.29
162 0.28
163 0.27
164 0.24
165 0.21
166 0.18
167 0.16
168 0.15
169 0.15
170 0.14
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.03
186 0.05
187 0.06
188 0.06
189 0.07
190 0.08
191 0.1
192 0.11
193 0.12
194 0.1
195 0.1
196 0.11
197 0.11
198 0.1
199 0.09
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.08
211 0.09
212 0.1
213 0.15
214 0.16
215 0.16
216 0.17
217 0.18
218 0.16
219 0.15
220 0.16
221 0.13
222 0.14
223 0.21
224 0.26
225 0.27
226 0.31
227 0.38
228 0.45
229 0.52
230 0.59
231 0.61
232 0.63
233 0.68
234 0.72
235 0.74
236 0.7
237 0.62
238 0.53
239 0.46
240 0.38
241 0.29
242 0.24
243 0.19
244 0.15
245 0.15
246 0.2
247 0.22
248 0.25
249 0.26
250 0.27
251 0.31
252 0.39
253 0.39
254 0.36
255 0.34
256 0.31
257 0.3
258 0.27
259 0.19
260 0.11
261 0.1
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.11
274 0.11
275 0.1
276 0.09
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.07
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.09
291 0.1
292 0.09
293 0.11
294 0.14
295 0.17
296 0.19
297 0.2
298 0.19
299 0.2
300 0.2
301 0.19
302 0.19
303 0.19
304 0.18
305 0.17
306 0.17
307 0.16
308 0.16
309 0.15
310 0.14
311 0.11
312 0.11
313 0.12
314 0.13
315 0.15
316 0.15
317 0.14
318 0.17
319 0.2
320 0.23
321 0.23
322 0.26
323 0.24
324 0.26
325 0.32
326 0.33
327 0.31
328 0.3
329 0.31
330 0.29
331 0.3
332 0.29
333 0.24
334 0.22
335 0.21
336 0.2
337 0.17
338 0.15
339 0.13
340 0.16
341 0.19
342 0.16
343 0.16
344 0.17
345 0.16
346 0.18
347 0.19
348 0.15
349 0.1
350 0.1
351 0.09
352 0.08
353 0.08
354 0.05
355 0.04
356 0.05
357 0.07
358 0.09
359 0.1
360 0.12
361 0.12
362 0.14
363 0.16
364 0.18
365 0.17
366 0.17
367 0.23
368 0.24
369 0.24
370 0.22
371 0.2
372 0.18
373 0.16
374 0.15
375 0.09
376 0.08
377 0.09
378 0.09
379 0.1
380 0.1
381 0.12
382 0.14
383 0.15
384 0.15
385 0.18
386 0.2
387 0.25
388 0.33
389 0.32
390 0.33
391 0.33
392 0.34
393 0.3
394 0.29
395 0.25
396 0.18
397 0.18
398 0.14
399 0.14
400 0.12
401 0.11
402 0.11
403 0.11
404 0.1
405 0.12
406 0.13
407 0.14
408 0.12
409 0.12
410 0.13
411 0.14
412 0.14
413 0.13
414 0.14
415 0.17
416 0.23
417 0.3
418 0.38
419 0.45
420 0.54
421 0.59
422 0.67
423 0.7
424 0.71
425 0.71
426 0.69
427 0.69
428 0.68
429 0.65
430 0.62
431 0.6
432 0.55
433 0.5
434 0.43
435 0.38
436 0.34
437 0.37
438 0.37
439 0.38
440 0.38
441 0.43
442 0.49
443 0.53
444 0.56
445 0.57
446 0.59
447 0.63
448 0.71
449 0.74
450 0.78
451 0.8
452 0.83
453 0.86
454 0.87
455 0.86
456 0.83
457 0.82
458 0.77
459 0.76
460 0.74